Паттерсона функция радиальная

РАСЧЕТ РАДИАЛЬНОЙ ФУНКЦИИ ПАТТЕРСОНА ПО ДАННЫМ РАССЕЯНИЯ В РАСТВОРЕ [c.426]

РИС. 14.12. Функции Паттерсона, которые можно рассчитать по данным рассеяния в растворе. А. Линейная трехатомная молекула. Б. Функция Паттерсона для структуры, представленной на фрагменте А. В. Сферическое усреднение функции Паттерсона, показанной на фрагменте Б. Обратите внимание, как резко падает плотность с увеличением радиуса. Г. Радиальное сечение сферически-усредненной функции Паттерсона для молекулы, показанной и А.Д. Радиальная функция Паттерсона для данной молекулы. Эта функция получается, если умножить на функцию, представленную на предыдущем фрагменте. Обратите внимание, что теперь относительные высоты пиков в точках а и 2л пропорциональны относительным вероятностям существования в молекуле межатомных расстояний а к 2а. [c.427]

Физический смысл этой функции в том, что она описывает относительную вероятность существования в объекте областей электронной плотности, разделенных расстоянием г. Таким образом, она по своей сути подобна функции Паттерсона, пики которой отвечают максимумам электронной плотности, разделенным вектором г. В некоторых случаях интерпретировать радиальную функцию Паттерсона достаточно легко (см. рис. 14.12, Д). [c.427]

При исследовании макромолекул в растворе методы, использующие рассеяние, имеют дело со сферически-усредненными структурами. Все виды рассеяния рентгеновское, нейтронное и рассеяние света — описываются одними и теми же основными уравнениями. По интенсивности рассеяния при нулевом угле можно определить молекулярную массу. Угловая зависимость интенсивности рассеяния вблизи нулевого угла дает.радиус инерции исследуемого объекта. Измерения рассеяния в широкой области углов могут быть использованы для расчета радиальной функции Паттерсона объекта. Эта функция дает вероятность нахождения внутри объекта двух точек, разделенных расстоянием г. Сравнение расчетной и эспериментальной картин рассеяния позволяет выбрать наиболее подходящую из возможных моделей структуры. [c.450]

РИС. 14.21. Радиальные функции Паттерсона. [c.451]

Дж. Бернал в конце 1930-х годов предложил два подхода к решению проблемы фаз в рентгеноструктурном анализе белков [180]. Оба они включали функцию Паттерсона и основывались на изменении интенсивностей отраженных рентгеновских лучей, которое обнаруживалось даже при небольших модификациях кристаллов. Первый из них, так называемый метод набухания и усадки, пытался в течение ряда лет использовать Перутц для определения фаз в дифракционной картине гемоглобина [181-187]. Заметного успеха в решении проблемы добиться не удалось. Тем не менее в этих работах Перутца были получены интересные данные, касающиеся внутреннего устройства гемоглобина. В частности, результатом наблюдения изменения интенсивностей дифракционных рефлексов, происходящего из-за диффузии солей в жидкость при кристаллизации белка, явилось правильное определение внешнего очертания полипептидной цепи макромолекулы. Полученное представление подтверждено изучением дифракционных картин кристаллических форм с разной упаковкой молекул. У. Брэггом и М. Перутцем обнаружено соответствие между рентгеновской дифракцией а-кератина и паттерсоновским синтезом гемоглобина [188, 189]. Пространственная векторная карта свидетельствовала о присутствии в структуре стержней протяженностью не менее 10,0 A, разделенных между собой фрагментами в 5,0 A. Был сделан вывод о том, что форма этих стержней соответствует структуре полипептидной цепи а-кератина. Подобные стержни вскоре были найдены Кендрью в миоглобине [190, 191]. После открытия Полингом радиальной усредненной векторной плотности пат1ерсоновского синтеза было высказано предположение, что гемоглобин представляет собой ансамбль а-спиралей. [c.43]

На интуитивном уровне весьма трудно почувствовать физический смысл функции <Я(г)>. Г ораздо более удобной в этом отношении является радиальная функция Паттерсона и(г). По аналогии с уравнением (14.39) имеем [c.426]

Заметим, что величину jjiS) можно подвигнуть синус-преобразованию Фурье. По аналогии с тем, чтр мы показали в этой главе ранее, такое преобразование приводит к радиальной функции Паттерсона [c.445]

На рис. 14.21 представлены гипотетические радиальные функции Паттерсона, рассчитанные по данным нейтронного рассеяния для пар дейтерированных рибосомных белков. Используя эти функции и полагая, что белки являются либо вытянутыми эллипсоидами, либо сферами, постройте детальную картину частицы, где учитывалась бы форма отдельных белков и их взаимное расположение. Белков всего четыре. Цифрами возле каждой кривой обозначены соответствующие их пары. [Если встретятся затруднения, посмотрите работу Moore Р. В., Engelman D. М., J. Mol. Biol., 112, 228 (197 .] [c.451]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология