ДНК денатурированная, расстояние

В связи с проблемой установления нуклеотидной последовательности в полинуклеотидах очень большой длины, подобных ДНК, большие перспективы имеют, по-видимому, методы, основанные на применении электронной микроскопии. Расстояние между основаниями в полинуклеотидной цепи денатурированной ДНК составляет около 7 А. Можно надеяться, что применение электронных микроскопов с достаточно высокой разрешающей способностью позволит непосредственно увидеть отдельные нуклеиновые основания в полинуклеотидной цепи и определить таким образом последовательность мономерных звеньев. Возможность реализации та- [c.82]

В то время как фибриллярные белки обнаруживают правильную периодичность лишь в одном или двух направлениях (см. гл. IX), многие из растворимых белков могут быть получены в форме настоящих трехмерных кристаллов. Исследование таких кристаллов при помощи старого способа рентгеновского анализа давало меньше типичных пятен интерференции, чем исследование волокон или денатурированных белков в виде порошков. Причина такого неожиданного результата заключалась в том, что старый метод анализа в рентгеновских лучах обнаруживал только те периодичности, расстояния между которыми были невелики, но не те, которых можно было ожидать в больших молекулах. [c.63]

Пятна интерференции, полученные в этих первых анализах, обусловлены периодичностью аминокислотных остатков вдоль пептидной цепочки [61] или периодичностью в расстояниях между параллельными пептидными цепочками внутри белковой молекулы. Так все денатурированные белки дали пятна интер- [c.63]

Протоны также обладают спином и поэтому в магнитном поле ориентируются в одном из двух возможных направлений, соответствующих двум различным уровням энергии. Расстояние между этими уровнями примерно в 1000 раз меньше, чем в случае свободных электронов. Протонный, или ядерный, магнитный резонанс (ЯМР) обычно наблюдают в области радиочастот 10 гц. Результирующее поле, в котором находится тот или другой атом водорода, зависит от магнитных полей окружающих его атомов, и поэтому с помощью спектров ЯМР часто оказывается возможным определять число ядер водорода, находящихся в том или ином окружении. О характере окружения судят по спии-сииновому взаимодействию соседних ядер. Для проведения измерений требуется, чтобы концентрация атомов водорода составляла М. Большая часть белковых молекул не может следовать за изменениями электромагнитного поля, происходящими с частотой порядка 10 гц. Вследствие этого полосы в спектрах ЯМР у белков довольно широки. В денатурированном белке отдельные группы меньше связаны внутримолекулярными взаимодействиями и в большей степени способны к переориентировке за время жизни возбужденного состояния протона, вследствие чего они находятся в более однородном поле по--этому- деаатурадид- белка сопровождается сужением пол ос в спектрах ЯМР. [c.182]

Интересные результаты были получены при исследовании связывания катионов со стереорегулярной полиметакриловой кислотой. Катион Си + был прочнее связан с изотактическим полиионом [869], а ионы магния образовывали более устойчивый комплекс с синдиотактическим полимером [870]. Эти результаты позволяют предположить, что в образовании хелатов участвуют карбоксильные группы, которые удерживаются на строго определенном расстоянии друг от друга за счет предпочтительной конформации цепи главных валентностей. Тогда относительная устойчивость комплекса должна зависеть от геометрии хелата, характерного для данного катиона. Значение предпочтительной конформации цепи главных валентностей было убедительно нродемонстрировано в случаях, когда полимер может подвергаться переходам спираль — клубок. Связыванию катионов щелочноземельных металлов с поли-а-Ь-глутаминовой кислотой, несомненно, благоприятствует спиральная конформация полимерной кислоты [871]. Наоборот, Mg + связан более слабо с нативной спиральной формой ДНК, хотя эта форма связывает Na+ гораздо сильнее, чем денатурированная нуклеиновая кислота [872]. Другая интересная проблема возникает, если связанным компонентом является органическая молекула, имеющая две катионные группы. В этом случае вполне возможно, что расположение катионов в малых молекулах будет совпадать с расположением анионных групп в полимере, и такое соответствие должно приводить к исключительно прочному взаимодействию. По-видимому, такой эффект наблюдался для хон-дроитинсульфата-А [873] и гиалуроновой кислоты [874], которые образуют прочные комплексы с кураре [c.316]

Если ДНК находится в растворе, одноцепочечные разрывы (ники) возникают случайно. В ДНК, находящейся на нуклеосомах, такие разрывы могут быть образованы с помощью ферментов, но только в определенных точках. Разрывы образуются через определенные промежутки так, что при электрофорезе денатурированной ДНК получается лестница. В экспериментах этого типа фрагменты денатурированной ДНК могут соответствовать расстоянию от конца нуклеосомы до места разрыва или могут быть образованы в результате двух внутренних разрывов. Настоящие точки разрыва можно установить, используя концевую радиоактивную метку с последующей радиоав-тографической идентификацией фрагментов. Как показано на рис. 29.12, будут обнаружены только фрагменты с концевой меткой. (Этот метод аналогичен методу секве-нирования, показанному на рис. 3.4, или методу отпечатков-рис. 11.4.) [c.365]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология