Статистическое рассмотрение беспорядочной цепи

Статистическое рассмотрение беспорядочной цепи [c.91]

Ниже дается статистическое рассмотрение процессов деструкции и сшивания полимеров эти процессы представляют особый интерес при исследовании действия излучений высокой энергии. Выведенные соотношения одинаково приложимы к любым другим процессам, в которых происходят беспорядочные разрывы цепей и сшивание, например к вулканизации серой, перекисями и другими агентами, к деструкции и сшиванию, сопровождающим окисление, и т. п. Нам представляется желательным привести эти соотношения в систематическом порядке на данной стадии изложения, а не относить их в раздел обсуждения экспериментальных работ. [c.85]

Перебор всех возможных состояний полимерной белковой цепи и нахождение среди них глобальной конформации, вообще говоря, невозможны не только для человека с его вычислительной техникой сегодняшнего дня и сколь угодно отдаленного будущего, но и для самой природы. Во всяком случае, природа избрала для этого совершенно иной механизм сборки белка, которому, возможно, отвечает бифуркационный процесс, постулируемый термодинамической теорией, рассмотренной в предыдущем разделе. Согласно теории свертывание белковой аминокислотной последовательности обладает двойственным характером. С одной стороны, весь процесс, начиная с состояния флуктуирующего статистического клубка и до конечной трехмерной структуры, осуществляется исключительно по беспорядочно-поисковому механизму. Иначе он не мог бы быть самопроизвольным. С другой стороны, структурная организация белка является детерминированным процессом, протекающим по определенному пути со строго последовательным рядом стадий. В противном случае сборка белковой цепи не совершалась бы столь быстро и безошибочно. [c.103]

Итак, завершено рассмотрение опытных данных Крейтона о механизме сборки трипсинового ингибитора. Оно основывалось на неравновесной термодинамической модели, физической теории структурной самоорганизации и конкретных результатах априорного расчета конформационных возможностей полипептидной цепи и геометрии нативной трехмерной структуры белка. Общим итогом анализа является адекватное естественному процессу ренатурации представление всего пути свертывания белка -от состояния статистического клубка до строго детерминированной нативной конформации макромолекулы. К принципиальным результатам рассмотрения следует, по-видимому, отнести выявление причин и количественное теоретическое обоснование возможности спонтанной, быстрой и безошибочной сборки флуктуирующей беспорядочным образом белковой цепи. [c.482]

При теоретическом рассмотрении образования сетки обычно предполагают, что поперечные связи беспорядочно распределены по объему образца. Однако нет никакой необходимости вводить какие-либо ограничения, касающиеся взаимных конформаций полимерных цепей в момент возникновения сетки. Хотя обычные сетки образуются из статистически свернутых полимерных клубков, этот вариант представляет собой лишь частный случай. [c.153]

Первым, уже рассмотренным примером инверсий являются вероятностные построения, на основании которых мы пришли к лемме о равновесном распределении живых цепей. В сущности, сама лемма является воплощением принципа инверсии, поскольку в ней утверждается, что любой процесс, в котором сосуществуют реакции роста и обрыва цепей, приводит к распределению вида Напомним, что при доказательстве этого утверждения рассматривались два противоположных, казалось бы, процесса статистический распад бесконечно длинной цепи и реальный рост цепей из мономера при наличии реакций ограничения роста. Несмотря на кажущуюся противоположность, оба процесса приводят к одному и тому же распределению, а значит, статистически эквивалентны. Инверсия заключалась здесь в том, что вместо рассмотрения суперпозиции процессов роста и обрыва мы разделили их во времени, допустив, что вначале потенциальная цепочка полностью заполимеризовалась, а затем претерпела беспорядочный распад. [c.47]

В связи с приведенным выше рассмотрением проблемы беспорядочной цепи может быть выдвинуто одно довольно важное общее критическое замечание, ато рассмотрение основывается на методах, которые являются обычными для статистической термодинамики, но которые в принципе пригодны только для систем, содержащих очень большое количество элементов. Например, при рассмотрении молекулярных систем обычно имеют в виду объемы, содержание молекул в которых вьфажается числами порядка [c.96]

В процессах денатурации и ренатурации аминокислотной последовательности проявляется прямая связь между химическим и пространственным строением молекулы белка. Переход беспорядочно флуктуирующей белковой цепи в детерминированную трехмерную структуру и обратный процесс - переход нативной конформации белка в состояние статистического клубка есть не что иное, как формирование и разрушение тех самых внутриостаточных и межостаточных взаимодействий валентно-йесвязанных атомов, теоретическому рассмотрению и априорному расчету которых были посвящены предшествующие главы книги. Очевидно, изучение механизмов денатурации и ренатурации представляется совершенно необходимым для познания принципов структурной организации белковых макромолекул. С другой стороны, любая теоретическая разработка проблемы пространственного строения белков не может считаться завершенной без описания и аргументированной трактовки особенностей уникального процесса свертывания аминокислотной последовательности в высокоорганизованную структуру. [c.471]

Во всех рассмотренных выше процессах образования собственных кристаллов-зародышей участвовали макромолекулы в расплавах и растворах, находящиеся в недеформированном состоянии- Энтропи молекул в таких фазах с беспорядочной структурой максимальна. Конформация молекул в них лу-чше всего соответствует модели статистического клубка. Деформация макромолекулы до более вытянутой конформации также способствует образованию зародышей и крис таэлизации. Более вытянутые цепи должны иметь меньшую энтропию и лишь незначительно отличаться по энтальпии. В связи с этим температура плавления полимера, равная [c.94]

Теория двойного лучепреломления Куна и Грюна. Теоретическое рассмотрение зависимости между деформацией и двойным лучепреломлением в каучуке было проведено KynOiM и Грюном [80], которые исходили из статистической теории, обсужденной в гл. IV и VI. Они рассматривают сначала оптические свойства изолированной длинноцепочечной молекулы, которая для удобства теоретического анализа считается, как и раньше, цепью одиночных, беспорядочно соединенных звеньев. Единственные дополнительные характеристики, которые необходимо было ввести, связаны с оптическими свойствами звеньев цепи. Они представлены в теории Куна и Грюна двумя поляризуемостями oTi и Й2, соответственно параллельному и перпендикулярному направлениям относительно звена. [c.129]