Генерации структур программа

Программа предварительного вывода, определяющая набор фрагментов, которые могут входить в состав исследуемой молекулы, является входом следуюш,ей программы — программы генерации структур, являющейся центральной в любых методах эвристического программирования. В одной из первых работ для упрощения задачи генерации структурных изомеров, отвечающих заданной брутто-формуле, предполагалось, что в скелете молекулы содержится не более 19 атомов углерода, азота, кислорода [69]. В состав молекулы могли входить также несколько одновалентных заместителей (хлор, фтор и т. д.). Валентность всех атомов принималась минимальной, а структура органического соединения представлена в виде матрицы смежности Наг/II [c.50]

Выходная информация программы генерации структур является входной информацией для программы предсказателя. Предсказатель определяет пики важнейших ионов гипотетических структур и оставляет или исключает эти структуры из рассмотрения путем сравнения известного и предсказанного масс-спектров. Ранжирование структур-кандидатов, оставленных программой предсказателя, осуществляется с помощью программы Счетная функция каждой структуре ставится в соответствие некоторое число — значимость, определяемое по совпадению пиков наиболее важных ионов гипотетического и исследуемого масс-спектров. Наиболее подходящей считается та структура, для которой найденное число является максимальным. [c.51]

Важным аспектом глобальной энергетики атмосферы является проблема возрастающего влияния аэрозольного загрязнения, обусловленного деятельностью человека, на климат, концентрацию атмосферного аэрозоля и его оптические свойства. Комплексные программы аэрозольно-радиационных экспериментов, проведенных в последние годы в различных районах земного шара, показали, что аэрозоль способен существенно поглощать солнечное излучение и оказывать значительное влияние на структуру радиационного баланса атмосферы. Актуальное значение имеет проблема влияния пылевых выносов на радиационный режим атмосферы над континентами и океанами. Чрезвычайно сложной задачей является учет радиационного фактора в генерации и трансформации поля атмосферного аэрозоля. Поэтому необходимо изучение корреляционных связей лучистого, конвективного и турбулентного [c.4]

Молекулярное моделирование. Необходимо проводить различие между моделированием статических, жестких структур и динамическим представлением подвижных структур. Для первого имеется много прикладных программ, однако программное обеспечение, дающее высокий уровень диалогового режима, может быть достигнуто лишь на ПРС высокого уровня. Такая программа должна обладать следующими характеристиками иметь графический ввод в виде двумерного рисунка с генерацией соответствующей трехмерной структуры давать изображение молекул, содержащих до 1000 атомов, в виде стержневых, шаростержневых и заполняющих пространство моделей, которыми можно управлять в реальном масштабе времени удалять закрытые от наблюдателя поверхности и показывать тени. Цель проекта состоит в развитии ПРС высокого уровня как независимых инструментов для молекулярного моделирования, которые бы имели высокую ценность для обучения и исследовательской работы. Однако в области динамического моделирования остается сделать еще очень многое. Компьютерная графика представляет собой идеальный инструмент для визуализации изменений в системе как функции времени, в особенности это относится к взаимным смещениям атомов в молекуле. Поэтому она должна в первую очередь использоваться для иллюстрации механизмов некоторых фундаментальных реакций, таких, как перечисленные ниже. [c.149]

В настоящее время в литературе имеется [23] сравнительно много результатов подсчета числа изомеров как с помощью теоремы Пойа, так и на основе итерационного подхода. Подсчет изомеров в ациклических рядах обсуждается в работе Рида [562], а для циклических соединений — в статье Балабана [563]. Все больше подсчетов в последнее время проводится на ЭВМ отметим, например, программы для подсчета числа изомеров алканов [564] и координационных соединений [565]. Кроме подсчета на ЭВМ проводится также исчерпывающее конструирование возможных изомеров— см., например, процедуру [566] для ациклических структур, или программу [567] для генерации как циклических, так и ациклических изомеров. Программы этого типа важны для поиска молекулярной структуры, согласующейся с экспериментальными данными [568]. [c.142]

В системах с переменной структурой происходит генерация управляющей программы в зависимости от типа решаемой задачи. Обычно в таких системах используется проблемно-ориентированный язык, который либо интерпретируется непосредственно в исполнительный код, либо процедурно-ориентированный язык, который далее транслируется, редактируется и выполняется. В та- ких системах в оперативную память загружаются только те части управляющей программы, которые нужны для решения данной задачи. Такие системы обладают очевидными преимуществами, однако их разработка требует больших затрат. [c.149]

В процессе построения проверки связности проводилась многократная операция логического сложения строк матрицы при этом сокращается машинное время, необходимое для генерации структурных изомеров заданной брутто-формулы. Входной информацией программы генерации структур [64] является, во-первых, набор запрещенных структурных фрагментов, т. е. фрагментов, неприемлемых с точки зрения химической теории, во-вторых, набор фрагментов, которые могут входить в состав структур, построенных программой. Построение структур осуществляется из суператомов , которые являются либо функциональными группами, либо атомами. Число структурных изо- [c.50]

В настоящее время на базе обобщенной функциональной структуры интеллектуализированной системы генерации схем неоднородных ХТС разработан интерактивный комплекс программ автоматизированного синтеза (ИКПАС) высокоэффективных ХТС производств хлорорганических продуктов, который реализует эвристическо-эволюционный метод [50, 163]. Комплекс функционирует в режиме машинных директив, что делает излишним лингвистический разбор директив, порождаемых ЛПР. [c.143]

Программная реализация любого этапа ДЭП-процедуры представляет собой операцию означивания атрибутов определенного РЯ, которая автоматически выполняется с помощью блока вывода решений (БВР), программно реализованного в структуре инструментальной ЭС Экран-ХТС (см. гл. 2) н предназначенного для анализа УЗ и выбора ПП с выполнимыми условными частями. БВР — это управляющая программа, реализующая прямую стратегию поиска решения от исходных данных к цели , используя для поиска заключений правил стратегию лучевого ветвления на ДВР (см. разд. 6.4). Означенный РК превращается во фрейм-пример (/л), пересылаемый в рабочую базу знаний (РБЗ), предназначенную для хранения отдельных фактов, /г, сетей /г, необходимых для генерации семантического решения данной ИЗС. РБЗ генерируется каждый раз при функционировании ДЭП-процедуры, в отличие от БЗ, которая существует автономно и модифицируется независимо от функционирования процедуры [130]. [c.287]

Следующий этап исследований QSAR заключается в генерации и дизайне новых структур с заданными свойствами/активностью на базе построенных моделей структура-свойство/активность . Для этой цели был нами разработан ряд методов и компьютерных программ. [c.113]

Жесткость дифференциальных уравнений химической кинетики приводит к необходимости использования специальных методов интегрирования. В этих методах наряду с вычислением правой части дифференциальной задачи обычно используют матрицу Якоби, что в случае достаточно сложной химической реакции требует от вычислителя больших (даже огромных) затрат времени на получение элементов этой матрицы и составление подпрограмм . ее вычисления. В то же время правая часть задачи и матрица Якоби имеют достаточно простую структуру относительно концентраций реагентов. Это определяет целесообразность создания генерирующей программы, которая использует в качестве входных данных описание кинетической схемы, близкое к естественному. В настоящее время существует много программ такого типа (см., например, [1—12]), но некоторые из них являются труднодоступными . Кроме того, часть этих программ ориентирована на конкретные методы интегрирования, что является их существенным недостатком. Широкий набор решаемых задач, требование к точности и времени вычисления решения предполагают использование различных методов, а также их комбинацию в процессе решения. В [12] приведены формулы, достаточно удобные для генерации подпрограмм вычисления правой части и матрицы Якоби дифференциальных уравнений химической кинетики в случаях изотермического и неизотермического реактора постоянного объема. В настоящее время на базе ИХКиГ СО АН СССР и Вычислительных центров СО АН СССР городов Новосибирска и Красноярска разработан комплекс программ, который позволяет автоматизировать процесс решения прямой кинетической задачи. Комплекс написан на языке ФОРТРАН IV и ориентирован на работу в операционных системах Рафос и К8Х-11М. [c.54]

Программа генерации структурных изомеров первоначально была применена для идентификации ациклических соединений, содержащих водород, углерод, азот и кислород [66]. Построение структуры циклических изомеров предусматривало разделение эмпирической формулы на циклические и ациклические компоненты, построение циклических радикалов (суператомов), генерирование возможных структур (с использованием алгоритма построения ациклических изомеров). Для учета симметрии молекул, содержащих циклы, применяется аппарат теории групп 70]. [c.51]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология