Фрагменты ферментов

Ной пространственной конформации беЛковой молекулы и состоят из аминокислотных остатков, не расположенных последовательно в полипептидной цепи, но благодаря укладке последней пространственно сближенных. В отличие от них линейные детерминанты представляют собой пептидные сегменты из 5—8 аминокислотных остатков. При изучении антигенной структуры фермента определяют структуры его антигенных детерминант путем изучения взаимодействия антител с пептидными фрагментами фермента. [c.326]

В физиологических системах pH среды составляет около 7,4 значительная концентрация протонированного и нейтрального имидазолов обеспечивает такое же значение. Таким образом, в состав активных фрагментов ферментов входят частицы, которые могут действовать и как кислоты, и как основания. [c.345]

После того как проведен подобный анализ всех фрагментов, становится ясно, что каждый фрагмент, полученный из исходных А-фрагментов под действием фермента В, можно также обнаружить в образцах, содержащих фрагменты, полученные в результате расщепления исходных В-фрагментов ферментом А. В геле, содержащем все продукты двойного расщепления (правый гель на рис. 3.2), каждый фрагмент встречается один раз. Эти данные позволяют однозначно расположить на карте сайты рестрикции. [c.45]

К числу основных достоинств этого метода иммобилизации можно отнести его простоту и универсальность (возможность включения не только индивидуальных ферментов, но и полиферментных систем, клеток и клеточных фрагментов, ферментов, предварительно иммобилизованных каким-либо иным способом, и т.п.). Применение систем мембранного типа позволяет получать иммобилизованные препараты с высоким содержанием включенного фермента например, в каждый грамм волокон, изготовляемых методом влажного прядения, можно включить свыше 200 мг фермента. Иммобилизованные в мембранных системах ферменты в значительной степени сохраняют свою каталитическую активность, а их стабильность часто существенно возрастает. Эффект стабилизации обеспечивается, в частности, за счет исключения деградации ферментов под действием микроорганизмов, которые не могут проникнуть сквозь мембрану. Кроме того, благодаря высокому отношению поверхности к объему и малой толщине мембраны удается избежать значительных диффузионных ограничений скорости ферментативных реакций. [c.72]

Фермент-зависимые метки (ФЗМ)—это вещества, которые можно количественно определять с помощью ферментативных реакций. К ФЗМ относятся субстраты, кофакторы, простетические группы, модуляторы ферментов (т. е. ингибиторы или активаторы), фрагменты ферментов, апоферменты и ферменты. [c.11]

В области синтеза белковых веществ за последние годы достигнуты блестящие результаты. Помимо полного синтеза антибиотика грамици дина синтезирован инсулин, осуществлен полный синтез фермента рибо-нуклеазы А. Синтезированный фермент имеет 78% активности природного фермента. Синтезирован пептидный фрагмент фермента N-aцeтил-глюкозаминидазы — лизоцима, структура которого была полностью установлена ранее (см. рис. 56). Синтезированный пептидный фрагмент, проявляет до 25% активности природного лизоцима. [c.377]

Различные комбинации разных видов взаимодействия можно использовать в ионообменной хроматографии (последняя строка VII содержит обычные межнонные взаимодействия). Из таблицы видно, что во многих вариантах хроматографии взаимодействия разных видов используются одновременно. Высокая специфичность аффинной хроматографии, по-видимому, основана именно на этом (наряду с необходимым для нее соответствием геометрического и химического строения подходящих фрагментов ферментов и их иммобилизованных ингибиторов). [c.26]

Установить однозначно, сушествуют ли состояния молекул, отличные от нативного и денатурированного, часто бывает весьма трудно, но все же, правильно подобрав методы исследования и систему, эту задачу можно решить. Мы уже обсуждали случаи, когда с помощью кинетических измерений и метода ЯМР удавалось обнаружить наличие более чем двух состояний. Для рибонуклеазы было показано, что процесс ренатурации состоит из двух стадий быстрой и медленной. Возникает вопрос не переходят ли некоторые типы денатурированных молекул в ходе быстрой стадии в состояние, в котором у них имеются упорядоченные участки, служащие центрами нуклеации при ренатурации В этом отношении представляют интерес данные, полученные Анфиисеном и др. при исследовании стафилококковой нуклеазы (149 остатков см. Sa hs et al., 1972). Используя иммунологический подход, они обнаружили, что изолированный фрагмент фермента (51 остаток) может принимать конформацию, похожую на ту, которую этот же фрагмент имеет в составе интактной молекулы. Интерпретация этих данных показала, что изолированный участок может переходить в конформацию N, подобную нативной переход в эту конформацию характеризуется константой равновесия (N )/(U) (где U — конформации статистического клубка), примерно равной 10 . Это в свою очередь позволяет предположить, что некоторые типы денатурированных молекул легко переходят в состояния, в которых у них имеются упорядоченные участки с теми же конформациями, что и в иативной структуре. [c.235]

Хотя кинетические аспекты Са-АТФазы исследованы достаточно детально, полный механизм функционирования фермента может быть установлен лишь на основании знания его первичной структуры, во многом детерминирующей более высокие уровни организации белка. Работу по выяснению первичной структуры Са-АТФазы саркоплазматического ретикулума скелетной мышцы путем анализа аминокислотных последовательностей отдельных фрагментов фермента осуществляли в течение ряда лет в нескольких группах США, Канады и Великобритании и ученые, казалось бы, были совсем близки к решению поставленной задачи. Из 1017 аминокислотных остатков, составляющих молекулу АТФазы, в общую последовательность не было включено лишь 180 аминокислот (G. Allen et al., 1980). Область белка с неустановленной первичной структурой являлась крайне [c.64]

Работа по проверке взаимного расположения функционально важных доменов АТФазы осуществляется в нескольких направлениях. Так, на основании результатов Д. МакЛеннана и сотрудников (1986) (рис. 22) функциональные центры АТФазы локализованы на различных триптических фрагментах фермента и отделены друг от друга десятками и сотнями аминокислотных остатков однако, входя в состав активного центра, они должны быть пространственно близки. Эта близость может обеспечиваться наличием петель полипептидной цепи в цитоплазматическом домене фермента. [c.67]

Зональная седиментация ДНК-полимеразы I Е. соИ, выделенной из дикого штамма (Л) и из штамма, синтезирующего только фрагмент фермента ( , в градиенте сахарозы 5--207о. [c.315]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология