Лидерные пептиды

Образование альтернативных шпилек в лидерной области, от которых зависит терминация в аттенюаторе, определяется тем, как транслируется лидерная РНК (рис. 96). Эта РНК кодирует так называемый лидерный пептид, содержащий два триптофановых остатка подряд. Ес 1и этот пептид не транслируется, то вторичная структура РНК формируется по мере ее роста и выхождения из транскрипционного комплекса сначала формируется шпилька 1 2, что делает невозможным образование шпильки 2 3, а затем шпилька 3 4, что приводит к терминации синтеза РНК- Если в клетке имеется недостаток триптофана, то рибосома, транслирующая лидер- [c.158]

Какова функция лидерного пептида Он содержит два триптофановых остатка, расположенных непосредственно друг за другом. Триптофан является редкой аминокислотой в составе белков . соИ, поэтому трудно себе представить, чтобы такое расположение было обусловлено простой случайностью. О его значении свидетельствуют [c.192]

Последовательность лидерного пептида [c.197]

Рис. 15.10. Последовательности лидерных пептидов оперонов, контролирующих биосинтез аминокислот, содержат множество кодонов для аминокислот, регулирующих оперон.

Сигнальная гипотеза была проверена и в генетических, и в биохимических экспериментах. Доказана ее справедливость и для растительных, и для животных клеток. Эта гипотеза подтверждается и для случая переноса белков через плазматическую мембрану прокариот. Более того, N-концевые лидерные пептиды были обнаружены не только у секреторных белков, но и у предшественников белков плазматической мембраны и лизосом, которые также переносятся с помощью ЭР. Как отмечалось ранее, сигнальная роль этих лидерных пептидов была напрямую продемонстрирована с использованием техники рекомбинантных ДНК при присоединении сигнальных последовательностей к белкам, в норме их лишенных полученные гибридные белки направлялись в ЭР. [c.44]

Роль лидерного пептида [c.138]

Многие из вновь синтезированных белков, предназначенных для внутренней мембраны, матрикса и межмембранного пространства, имеют на своем N-конце лидерный пептид, который во время транспортировки отщепляется специфической протеазой, находящейся в матриксе. Для переноса белков в эти три митохондриальных компартмента необходима энергия электрохимического протонного градиента, создаваемого на внутренней мембране. Механизм переноса белков для наружной мембраны иной в этом случае не требуется ни затрат энергии, ни протеолитического расщепления более длинного белка-предшественника. Эти и другие наблюдения позволяют думать, что все четыре группы митохондриальных белков транспортируются в органеллу с помощью механизма, схематично представленного на рис. 9-69 и 9-70. Предполагается, что все белки, кроме тех, которые предназначены для наружной мембраны, включаются во внутреннюю мембрану в результате процесса, требующего затраты энергии и происходящего в местах контакта наружной и внутренней мембран. По-видимому, после этого первоначального включения белка в мембрану он подвергается протеолитическому расщеплению, которое приводит к изменению его конформации в зависимости от того, как изменится конформация, белок либо закрепляется в мембране, либо выталкивается в матрикс или в межмембранное пространство (рис. 9-70). [c.65]

Аттенюаторы могут регулироваться и в зависимости от уровня нуклеозидтрифосфатов. Например, в >1/г-опероне в лидерной РНК возможно образование двух шпилек, одна из которых является тер.минаторной. Первая от промотора шпилька вызывает при низкой концентрации СТР паузу транскрипции в результате рибосома, сннтезир ющая лидерный пептид, догоняет РНК-полимеразу и [c.160]

Аттенюатор может регулироваться и без участия рибосом (или, говоря осторожнее, без трансляции лидерной РНК). Так, лидерная РНК триптофанового оперона Вас. subiilis не кодирует лидерного пептида. Тем не менее эффективность терминации в аттенюаторе зависит от концентрации триптофана. Предполагается, что баланс в образовании терминаторной и антитерминаторной шпильки в лидерной РНК определяется специальным белком, присоединяющимся к лидерной РНК и блокирующим образование антитерминаторной шпильки. [c.161]

Рнс. 96. Влияние рибосомы, транслирующей лидерный пептид, на прохождение РНК-полнмеразой аттенюатора [c.160]

Обычно транспорт белков через клеточную мембрану обеспечивают N-концевые аминокислотные последовательности, называемые сигнальными пептидами (сигнальными последовательностями, лидерными пептидами). Иногда удается сделать белок секретируемым, присоединив к кодирующему его гену нуклеотидную последовательность, ответственную за синтез сигнального пептида. Однако простое наличие сигнального пептида не обеспечивает эффективной секреции. Кроме того, Е. соН и другие грамотрицательные микроорганизмы обычно не могут секретировать белки в окружающую среду из-за наличия наружной мембраны. Есть по крайней мере два способа решения этой проблемы. Первый - использование грамположитель-ных про- или эукариот, лишенных наружной мембраны, второй - создание грамотрицательных бактерий, способных секретировать белки в среду, с помощью генной инженерии. [c.126]

Во время транспорта белка в нем образуются дисульфидные связи, происходят протеолитическое расщепление и другие посттрансляцион-ные модификации, так что в некоторых случаях в среду попадает уже активный белок. Лидерный пептид обеспечивает проникновение белка через цитоплазматическую мембрану и секрецию, при этом сам он отщепляется дрожжевой эндо-протеиназой, узнающей дипептид Lys-Arg. Поз- [c.139]

Синтез бычьего лизоцима С2 Способность Р. pastoris секретировать гетерологичный белок исследовали в системе с использованием кДНК бычьего лизоцима С2, кодирующей полноразмерный белок и его собственный лидерный пептид. Бычий лизоцим - это желудочный фермент, разрушающий клеточные стенки бактерий он устойчив к протеазам и сохраняет активность в узком диапазоне pH, что позволяет использовать его в качестве добавки к кормам жвачных животных для улучшения пищеварения. [c.142]

Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид (Signal peptide) N-концевой участок белковой молекулы длиной 15—30 аминокислот, обеспечивающий секрецию белка (перенос через мембрану). После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы. [c.560]

На рис. 15.6 показано, что в эту область входит сайт связывания с рибосомами, в котором за кодоном AUG следует область из 13 кодонов. Транслируется ли эта область в лидерный пептид Хотя продукт не был обнаружен in vivo, его отсутствие могло объясняться просто его нестабильностью. Известно, что этот сайт связывания с рибосомами является функционально активным, поскольку в тех случаях, когда он слит со структурным геном, поддерживает эффективную трансляцию. [c.192]

При таких условиях рибосомы, по-видимому, инициируют трансляцию лидерного пептида, но останавливают ее, когда достигают кодонов триптофана. Исходя из последовательности нуклеотидов в мРНК, можно предположить, что такая задержка рибосом в свою очередь может влиять на терминацию в аттенуаторе. [c.192]

В присутствии триптофана рибосомы способны синтезировать лидерный пептид. Они продолжают передвигаться вдоль лидерной области мРНК к кодону UGA, расположенному между областями 1 и 2. Как показано на рисунке, продвигаясь к этой точке, рибосомы переходят в область 2 и предотвращают ее спаривание. Тогда область 3 может спариться с областью 4, образуя шпилечную структуру терминатора. При таких условиях РНК-полимераза терминирует процесс транскрипции в аттенуаторе. [c.192]

Некоторые мутации в лидерной области усиливают эффект терминации в аттенуаторе. Они могут препятствовать снятию терминации при голодании по триптофану. Одна из таких мутаций дестабилизирует спаривание между областями 2 и 3. В результате область 3 приобретает возможность спариться с областью 4 и образовать шпилечную структуру терминатора даже в тех случаях, когда клетки голодают по триптофану. Другая мутация изменяет инициирующий кодон AUG лидерного пептида, предотвращая в результате трансляцию. Наблюдаемое в результате увеличение эффективности терминации свидетельствует о том, что транскрипция с проскакиванием аттенуатора зависит от способности транслировать лидерную область. [c.193]

Такой эффект объясняется присутствием аттенуатора в пределах лидерной области, расположенной между промотором и первым структурным геном. Так же как и в случае триптофанового оперона, в аттенуаторе имеется терминирующая последовательность, которой предшествует последовательность лидерного пептида. Область лидерного пептида содержит семь последовательных кодонов для гистидина, как это показано на рис. 15.10. Иные вторичные структуры лидерной области мРНК могут быть записаны таким образом, что рибосома, останавливающаяся в гистидиновых кодонах, предотвращает образование терминирующей структуры шпильки. [c.194]

На рис. 41.12 представлены аминокислотные последовательности лидерных пептидов, предсказанные по соответствующим нуклеотидным последовательностям, для нескольких других оперонов Е, oli и Salmonella typhimurium. Из рисунка видно, что в лидирующей последовательности существенно превалирует именно та аминокислота, ферменты биосинтеза которой кодируются данным опероном. [c.119]

На участке Тгр-промотора РНК-полимераза, свободная от контроля со стороны репрессора, начинает транскрипцию оперона и доходит до 90-го нуклеотида (рис, 41,10), где она делает временную остановку. Во время этой паузы к образовавшемуся 5 -концу лидерного транскрипта в области 27—29 стартового кодона AUG прикрепляется рибосома, происходит трансляция лидерного пептида длиной 14 аминокислот. Начиная с положения 54, в транскрипте последовательно расположены два триптофановых кодона, поэтому для продолжения трансляции необходимо присутствие тРНК " , Следует отметить, что триптофан — относительно редкая аминокислота, Еще реже два остатка триптофана располагаются друг за другом в составе полипептидов. [c.118]

Смотреть страницы где упоминается термин Лидерные пептиды: [c.158] [c.159] [c.160] [c.159] [c.160] [c.395] [c.408] [c.57] [c.194] [c.195] [c.196] [c.43] [c.119] [c.119] [c.119] [c.120] [c.120] [c.120] [c.195] [c.119] [c.119] [c.119] [c.120] [c.120]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология