фланкирующий участок

Рис. 8.7. Полиморфизм длины рестрикционных фрагментов 5 -фланкирующего участка гена инсулина человека. Указано место вставок длиной 1,5 и 3,4 кЬр. Рге — участок, кодирующий аминокислотную последовательность, примыкающую к К-концу проинсулина, которая, видимо, способствует его секреции в эн-доплазматйческий ретикулум В, С и А — последовательности, кодирующие В-цепь, конвекторный пептид и А-цепь инсулина. Заштрихованный участок — интрон (гл. 7).

Рис. 25.11. В популяциях человека широко представлены 9 гаплотипов семейства Р-глобинов. Можно выделить два больших сегмента в последовательности 5 -участок включает гены г, 7, и фР З -участок состоит из гена Р и фланкирующей последовательности длиной 18 т.п.н. Три распространенных типа последовательности 5 -участка обозначены

Влияние нуклеотидных последовательностей, фланкирующих участок узнавания [c.88]

Следующие пары олигонуклеотидов - один достраивающий ген слева, другой справа -последовательно добавляют в смесь до тех пор, пока не будет синтезирован весь ген. Длина этих олигонуклеотидов обычно бывает равна 50 звеньям. Каждый блок ПЦР состоит из двадцати 4-минутных раундов. Для синтеза гена длиной 1000 п. н. нужно 10 блоков , так что ген можно получить в течение одного дня. При этом, как и в случае синтеза генов другими методами, последнюю пару нуклеотидов (т. е. 5"- и 3 "-концы) можно снабдить дополнительными последовательностями, фланкирующими кодирующий участок и облегчающими последующее встраивание гена в вектор. [c.102]

Делеции, приводящие к возникновению р°-форм талассемии, суммированы на рис. 21.5. В некоторых (редких) случаях затрагивается только ген р-глобина. Тогда делеция охватывает участок размером 600 п. н., начиная со второго интрона и кончая З -фланкирующими участками. В других случаях делеция затрагивает несколько генов. [c.272]

Относительно мутантов типа 47 было показано, что они представляют собой делеции многих последовательных пар нуклеотидов. Исследование рекомбинации двойных г//-мутантов показало, что такие мутации как бы вырезают из генетической карты участки, расположенные между фланкирующими генетическими маркерами, это неудивительно, поскольку у таких мутантов физически отсутствует участок ДНК между этими маркерами (рис. 6.5). [c.165]

Профаг Р1 является обладателем еще одной системы сайт-специфической рекомбинации в составе фаговой ДНК имеется участок (С-сегмент), который в одних молекулах ДНК имеет одну ориентацию, а в других — другую. За инверсию отвечает продукт фагового гена ein, работающий аналогично продукту гена сге, с той лишь разницей, что узнает предназначенные для него сайты, фланкирующие С-сегмент, в инвертированной взаимной ориентации. Био-тоги-ческий смысл инверсии сегмента ДНК рассмотрим на примере другого умеренного фага Ми, у которого тоже есть инвертируемый сегмент. [c.106]

При амплификации с помощью ПЦР используют два олигонуклеотидных праймера (затравки), фланкирующие интересующий нас участок ДНК процесс амплификации заключается в повторяющихся циклах температурной денатурации ДНК, отжига праймеров с комплементарными последовательностями и последующей достройки полинуклеотидных цепей с этих праймеров ДНК-полимеразой (рис. 1). Праймеры ориентированы таким образом, что синтез с помощью полимеразы, протекает только между ними, удваивая количество копий этого участка ДНК. [c.176]

В процессе синтеза вырожденных олигонуклеотидов, кодирующих исследуемые пептиды, на каждой стадии используют индивидуальные нуклеотиды для кодонов инвариантных аминокислот, фланкирующих вариабельный участок пептида, а также эквимолярные смеси нуклеотидов для участков, кодирующих случайные последовательности. Образовавшийся в итоге набор вы- [c.340]

Один из множества Х-векторов для клонирования имеет два 7/иН1-сайта, фланкирующих участок длиной 20 т. п. н. При гидролизе очищенной фаговой ДНК рестриктазой ВатШ образует- [c.72]

Транскрипция во многом сходна с репликацией. Матрицей при синтезе РНК служит определенный участок одной из цепей ДНК. РНК-полимераза копирует этот участок, последовательно соединяя друг с другом с помощью 3 —5 -фосфо-диэфирных связей рибонуклеотиды в соответствии с правилом комплементарности (рис. 3.9). В ходе транскрипции новосинтезированная молекула РНК отсоединяется от ДНК, и двойная спираль ДНК восстанавливается. Чтобы обеспечить транскрипцию только отдельных сегментов ДНК, должны существовать некие сигнальные последовательности, указывающие, где начинается (инициируется) транскрипция и где она останавливается (терминируется). Сигнал инициации обычно располагается перед кодирующей последовательностью, а сигнал терминации — вслед за ней. Участок ДНК, предшествующий транскрибируемому гену, называется 5 -фланкирующей последовательностью, а расположенный за ним — З -фланкиру-ющей. [c.35]

Для выделения растительных промоторов из некоторых видов растений использовали специализированные так называемые промотор-направленные векторы и систему трансформации на основе Ti-плазмид Agroba terium. Суть подхода состоит в следующем. Репортерный ген без промотора встраивают сразу за правой фланкирующей последовательностью вектора на основе Ti-плазмиды, и после переноса Т-ДНК в хромосому растения он оказывается в окружении растительной ДНК. Если Т-ДНК встроится в промоторный участок функционального гена, то произойдет транскрипция репортерного гена. Для идентификации растительных промоторов в качестве репортерного гена можно использовать ген [c.383]

Нуклеотидные последовательности в местах соединения экзонов и интронов весьма консервативны и практически одинаковы во всех генах ядерных мРНК почти у всех изученных видов (табл. 8.4). 5 -сайт сплайсинга чаще всего фланкирует последовательность RG (где R-пурин), а З -сайт-всего один остаток G. Тем не менее последовательности, фланкирующие интроны извне, могут значительно варьировать, а мутации в них никогда не предотвращают сплайсинг, хотя и могут влиять на его скорость. Нуклеотидные последовательности, фланкирующие интроны изнутри, отличаются больщим постоянством. Первыми двумя нуклеотидами на 5 -конце интрона в РНК почти всегда являются GU (исключение, ОС, встречается всего в двух случаях) следующие четыре нуклеотида могут немного варьировать, но. по-видимому, канонической является последовательность AGU. Замена остатка G или и в месте сочленения обычно блокирует сплайсинг, а замены соседних оснований влияют на сплайсинг по-разному. Указанные щесть нуклеотидов на 5 -конце интрона и определяют специфическую функцию 5 -сайта сплайсинга. Даже криптические (скрытые) сайты сплайсинга (разд. 8.5.е), которые используются только иногда или в тех случаях, когда основные сайты повреждены или пропущены, содержат элемент GU на 5 -конце вырезаемой последовательности. На З -конце интрона всегда находится пара AG, перед которой в интронах млекопитающих чаще всего находится богатый пиримидином участок (Y NYAG). Мутации, приводящие к замене константных А и G на другие основания, также блокируют сплайсинг в этом сайте. [c.105]

Множественные гены и псевдогены мяРНК. В геноме многоклеточных организмов присутствует множество сегментов ДНК, которые гибридизуются с иЬ, и2-, из-, и4-, и5-, иб- и и7-мяРНК или с соответствующими кДНК (табл. 9.4). Одни такие сегменты диспергированы, а другие сгруппированы (обычно в тандемные повторы). Как и в случае генов 58-рРНК, соответствующий кодирующий участок может входить в состав длинного сегмента ДНК, который образует повторяющуюся единицу. Как правило (хотя и не всегда), функциональные гены организованы в кластеры, а псевдогены диспергированы. Кодирующие последовательности функциональных генов комплементарны последовательностям соответствующих мяРНК. Функциональные гены данной мяРНК обычно имеют сходные последовательности, фланкирующие кодирующий участок и содержащие регуляторы транскрипции (разд. [c.169]

Участие РНК-посредника в транспозиции Ту-элемента получило еще более убедительное подтверждение в опытах с использованием повторно модифицированного донора Ту. В его центральный участок е был встроен интрон из неродственного дрожжевого гена вместе с короткими участками фланкирующих его жзонов. Обычно Ту-элементы не содержат интронов. Не содержал интрона и [c.254]

Структура процессированных псевдогенов малых ядерных РНК млекопитающих. В процессированных псевдогенах 1Л типа а отсутствуют последовательности, находящиеся на З -конце функциональных генов 1Л и самой 1Л-РНК. С укороченным З -концом соседствует короткий А-богатый участок, хотя соответствующая 01-РНК не заканчивается таким участком. Процессированные псевдогены 1Л типа Ь не укорочены, заканчиваются А-богатым участком и фланкированы прямыми повторами длиной 20 п.н. или менее. Процессированные псевдогены Ц2 тоже укорочены с З -конца и фланкированы прямыми повторами длиной около 20 п. н. Процессированные псевдогены иЗ укорочены с З -конца на 69-70 нуклеотидов длина РНК составляет 210 нуклеотидов. Некоторые из них фланкированы прямыми повторами длиной 16-20 п.н. (тип с), у других такие повторы отсутствуют (тип с1). [c.270]

Изменения нуклеотидной последовате.аьности. Амплифицированная единица содержит помимо самого гена еще и другие последовательности Обычно амплифицированные сегменты содержат регуляторные последовательности, которые фланкируют транскрипционную единицу, кодирующий участок, интроны, а также другие протяженные последовательности. Повторяющиеся единицы образуют тандем, а некоторые из них содержат инвертиро- [c.308]

Особый интерес векторная система фага фСЗ 1 представляет для метода мутационного клонирования. Этот метод разработали К. Чей-тер и К. Брутон в 1983 г., использовав в качестве вектора фаг фСЪ, у которого в геноме делетирован участок aft. Такой фаг способен интегрировать свою ДНК в бактериальную хромосому только за счет клеточной системы общей рекомбинации по областям гомологии. На основе векторного фага может быть создан банк генов любого штамма Streptomy es. Гибридными фагами инфицируют клетки и селектируют лизогенные клоны, имеющие нарушения определенного хромосомного гена. Мутация происходит в том случае, когда гибридный фаговый геном интегрируется в целевой ген за счет клонированного в его составе фрагмента хромосомной ДНК. Фаговое потомство мутантных штаммов, образуемое при вырезании профага по фланкирующим гомологичным повторам, содержит в составе генома клонируемые фрагменты. С помощью данного методического приема удается достаточно просто выделять различные гены бактерии-хозяина. [c.278]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология