Клеверного листа структура

Рис. 3.4.2. Структура клеверного листа транспортных РНК.

Рис. 3-17. Вторичная структура тРНК из дрожжей (структура клеверного листа).

Вторичная структура тРНК формируется за счет образования максимального числа водородных связей между внутримолекулярными комплементарными парами азотистых оснований. В результате образования этих связей полинуклеотидная цепь тРНК закручивается с образованием спирализованных ветвей, заканчивающихся петлями из неспаренных нуклеотидов. Пространственное изображение вторичных структур всех тРНК имеет форму клеверного листа (рис. 14.7). [c.186]

Последовательность оснований и структура клеверного листа [c.47]

Конформация тРНК. Транспортные РНК выполняют в клетках разнообразные функции. Однако основная их задача заключается в осуществлении трансляции. В 1965 г. Р. Холли установил первичную структуру тРИК из дрожжей. Тогда же, исходя из представления, что наиболее стабильное состояние тРНК соответствует образованию максимально возможного количества водородно-связанных пар оснований, а также основываясь на экспериментальных данных по неравномерному гидролизу молекулы рибонуклеазами, Р. Холли предложил модель вторичной структуры тРНК необычной формы — с чередующимися одно- и двухцепочечными участками — и назвал эту структуру клеверным листом (рис. 197). [c.343]

Наиболее тщательно изучена структура низкомолекулярной тРНК. Во всех этих молекулах существуют двухцепочечные участки, стабилизированные водородными связями с образованием трех шпилек, к которым иногда добавляется четвертая. ( клеверный лист ). Структура одной из тРНК установлена методом рентгеноструктурного анализа [72—74] (рис. 2-24). Нерегулярность и сложность формы молекулы ставит ее в один ряд с молекулами глобулярных белков. Обратите внимание на расположенный в нижней части рисунка антикодон (триплет оснований), структура которого обеспечивает спаривание с тремя основаниями кодона, детерминирующего определенную аминокислоту, в данном случае фенилаланин. [c.134]

Хотя тРНК содержит значительное количество двуспиральных участков, структура ее существенно отличается от структуры двуспиральной ДНК или гибрида ДНК — РНК. Молекулярная масса тРНК, ( 25 ООО) значительно ниже, чем у других полинуклеотидов она обладает структурой клеверного листа [20], содержащей в заметной доле одноцепочечные участки. Четыре руки молекулы образуют два двуспиральных участка, направленных друг к другу под углом 90°, а трехмерная структура по форме напоминает букву L [21]. [c.116]

На рис. 15-8, Л приведено общепринятое изображение молекулы тРНК в виде клеверного листа . Трехмерная структура тРНК, определенная независимо двумя группами исследователей [61, 62], схема-матически показана на рис. 15-8, Б, [c.218]

Шггалька-двутяжевая спиральная структура, образующаяся в результате комплементарного спаривания оснований (А с и и О с С). Шпильки и соединяющие их однотяжевые участки РНК укладываются в компактную третичную структуру. Для тРНК вторичная структура имеет характерную форму, к-рую наз. клеверным листом . [c.298]

Известны нуклео1идные последовательности более чем 120 тРНК. Они имеют похожие вторичные структуры, условно названные структурами клеверного листа. [c.389]

Игра в тРНК или как делать клеверные листья выглядит следующим образом. Каждому игроку дается случайная последовательность из N единиц, принадлежащих к четырем классам — А, "У, Г, Ц, и тетраэдрическая кость, каждая грань которой соответствует одной из этих букв. Игроки бросают кость по очереди и, заполняя определенное место в последовательности выпавшей буквой, каждый игрок стремится получить двухцепочечную структуру с максимальным числом пар АУ и ГЦ. Игра окончена, когда один из игроков объявляет, что он получил полную структуру. Побеждает игрок, набравпгий к этому моменту максимальное число очков. Очки засчитываются за пары можно, например, давать два очка за пару ГЦ и одно очко за АУ. Пары можно образовывать, лишь если имеется непрерывная последовательность 2 ГЦ или ГЦ, 2 АУ или 4 АУ (правило кооперативности). Для каждой петли в структуре должны оставаться неспаренными не менее 5 положений (ср. рис. 8.8). Игрок бросает кость для любого заранее им объявленного положения в последовательности. При = 80 действительно всегда получается структура типа клеверного листа с 3—4 лепестками. Шпилька, имеющая только одну петлю, содержит максимальное число оснований, которые могут спариваться. Однако клеверный лист дает возможность испытать гораздо большее число комбинаций, так как отдельные лепестки можно сдвигать независимо и с самого начала возможно гораздо большее число комбинаций. Природа, видимо, играет в эту игру с давних времен ,— пишет Эйген. Игра сходного типа может быть, по-видимому, разработана и при решении задачи о взаимосвязи первичной и пространственной структур белка ( 4.6). [c.271]

Петли, находящиеся на шпильках, символизируют структуру клеверного листа шпильки и петли образуют в каждом отдельном случае своеобразную руку . Анти-кодоновая и Т Опетля состоят из 7 оснований каждая, дигидроурациловая из 7 — 10 и экстра-петля из 4—21 основания последняя образует вариабельную руку . [c.390]

Впервые правомерность филогенетического подхода была продемонстрирована при изучении структуры тРНК- Оказалось, что вторичная структура любых тРНК независимо от вариаций в их нуклеотидных последовательностях описывается универсальной моделью клеверного листа . Еще более впечатляют результаты применения этого подхода к рибосомным РНК, когда из многих сотен расчетных моделей удалось выбрать по одной для РНК каждого типа . Как осуществляется такой выбор на уровне отдельных элементов вторичных структур РНК, показано на рис. 21, а на рис. 22 демонстрируется подобие вторичных структур РНК-компонента рибонуклеазы Р (о его ферментативной активности см. в гл. VIII). [c.38]

Различные их виды оказались поддающимися очистке с помощью хроматографии и позднее—расшифровке последовательности. Обнаружено, что помимо большого сходства в последовательностях, все молекулы тРНК имеют общую структуру клеверного листа (см. главу 22.1, структура (50) . Во всех без исключения случаях они содержат на З -конце последовательность [c.206]

Данные о структуре тРНК свидетельствуют о том, что нативные молекулы тРНК имеют примерно одинаковую третичную структуру, которая отличается от плоской структуры клеверного листа большой компактностью за счет складывания различных частей молекулы. Следует указать на существование у ряда вирусов (реовирус, вирус раневых опухолей растений и др.) природных двухцепочечных РНК, обладающих однотипной с ДНК структурой. При физиологических значениях pH среды, ионной силы и температуры создаются условия для образования в одноцепочечных матричных и рибосомных РНК множества участков с двойной спиралью ( шпильки ) и дальнейшего формирования комплементарных участков, определяющих в известной степени жесткость их третичной структуры (рис. 3.4). В настоящее время получены доказательства значимости ван-дер-ваальсовых (диполь-дипольных и лондоновских) связей между азотистыми основаниями в стабилизации общей пространственной конфигурации нуклеиновых кислот. [c.113]

Теоретический анализ кривых плавления тРНК вновь подтверждает структуру клеверного листа [64, 77]. [c.576]

Структура тРНК, специфичной к тирозину, представлена в виде <клеверного листа> на рис. 132. Основное отличие заключается в увеличении дополнительной петли. [c.439]

Обише закономерности, найденные для структуры тРНК, по-видимому, реализуются и в других одноцепочечных полинуклеотидах. Те из них. для которых уже определены первичные структуры, могут быть представлены как образования с чередующимися двух- и одноцепочечными участками. Например, молекулы рибо-сомных 5S РНК имеют вторичные структуры, сходные с клеверным листом тРНК. Значительно более сложно выглядят структуры высокомолекулярных рибосомных или вирусных РНК (рис. 199). Несомненно, что такие РНК находятся в компактной форме, как это следует из их гидродинамическ 1х свойств, одиако детали пространственной организации пока неизвестны. [c.344]

Рис. 15.13. Структуры клеверного листа и последовательности оснований алани-новой (а) и фенилаланиновой (б) тРНК дрожжей.

Смотреть страницы где упоминается термин Клеверного листа структура: [c.38] [c.219] [c.623] [c.133] [c.53] [c.34] [c.35] [c.246] [c.41] [c.61] [c.110] [c.269] [c.570] [c.574] [c.575] [c.576] [c.97] [c.125] [c.187] [c.344] [c.344] [c.404] [c.430] [c.431] [c.930] [c.930] [c.931]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология