Полные структуры

Многие простые гетерополисахариды в действительности являются протеогликанами, в которых концевое звено полисахарида ковалентно присоединено через 0-гликозидную связь к сериновому остатку в белке [39—43]. Так, полная структура хондроитинсульфата имеет следующий вид [c.117]

Полная структура конканавалина А была установлена методом рентгеноструктурного анализа [93, 94] (рис. 5-7). Этот белок представляет собой тетрамер, состоящий из субъединиц с мол. весом 27 500. При рН 5,8 он диссоциирует на димеры. Строение конканавалина А не совсем обычно, поскольку он не содержит а-спиральных участков. Каждый мономер состоит из 237 остатков, 57% которых образуют трехслойную р-структуру (рис. 5-7, В). Белок не связывает углеводы до тех пор, пока не будут заняты два участка, связывающие металл. Возможно, что для образования участка, связывающего углевод, необходимо конформационное изменение белка, которое происходит только в процессе его связывания с ионами. [c.379]

Метод химической ионизации состоит в образовании ионов под действием других ионов, генерируемых в отдельной камере. При химической ионизации положительных ионов генерируемые ионы представляют собой доноры протонов, которые при столкновении с молекулами анализируемых веществ отдают )1м протон, образуя при этом псевдомолекулярные ионы (М+Н)+- По последним можно устанавливать молекулярную массу компонентов в смеси. Аналогично происходит образование отрицательных ионов с акцепторами протонов (С1 , ОН- и др.). Анионная химическая ионизация (с 0Н ) была применена для анализа 17 образцов нефтей с целью идентификации их месторождений. Для описания конкретной нефти бралось 30 характеристичных пиков (для сокращения процесса анализа) [204]. Химическая ионизация с положительными ионами позволяет определить тип азотсодержащих соединений в нефтях [205]. Недостатком метода является его малая эффективность для определения полной структуры или даже элементов структуры компонентов ввиду малой степени фрагментации, отсутствию данных по закономерностям химической ионизации многих классов соединений, встречающихся в нефтях. Однако сочетание этого метода с другими методами масс-спектрометрии может дать полезные сведения для анализа нефтей. Например, распад ионов, полученных при химической ионизации смеси углеводородов и серусодержащнх соединений с выделением частицы 5Н (масса 33) был применен при анализе на приборе ударной активации [206]. [c.136]

Система уравнений (VII.23) дает полную структуру математического описания пиролиза. Ее решение численными методами с последующим определением параметров модели и моделированием нроцесса может быть осуществлено, обычными методами (см. главы V и VI). Применительно к модели (VII.23) программы расчетов описаны в работе [541. [c.261]

Разновидности расчетов. При реализации поверочных расчетов многие элементы полной структуры (см. рис. 8) могут отсутствовать. Вариантов ограниченных поверочных расчетов также много. Структура-минимум должна содержать Б1 —Б5, Б8, Б9, Б20 — Б22. [c.43]

Достоинством такого типа моделирования по методу Монте-Карло прежде всего является то, что он не зависит от расчетов энергии. Были проведены тесты, показавшие, что для достаточно большого числа генерированных завершенных структур, скажем 50, почти всегда найдется структура, которая была бы рассчитана методом минимизации энергии. Кроме тоге, получают спектр полных структур, которые при желании могут быть классифицированы в соответствии с их энергией или частотой появления. [c.526]

Задача установления строения смешанных биополимеров гораздо сложнее. Она включает установление строения полисахаридных цепей как одну из подчиненных задач. А в целом надо еще узнать природу и структуру неуглеводной части молекулы, способ присоединения одной части к другой и места присоединения. Так, для установления полкой структуры рассмотренных выше группоспецифических гликопротеинов необходимо узнать структуру полисахаридных цепей, способ, с помощью которого они связаны с полипептидной цепью, структуру узлов связи, Структуру полипептидной цепи и, наконец, места присоединения в этой цепи. Это весьма значительная по объему работа. Не случайно после двух десятилетий интенсивных усилий нескольких крупных лабораторий мира полная структура этих биополимеров все еще не установлена (хотя ее основные черты и многие детали уже известны). [c.49]

Одно из удивительных свойств В12 состоит в способности образовывать алкильные производные [256]. До открытия Баркером витамина В12 считалось, что связь Со — Со должна быть непрочной, если вообще существует. Это первый и единственный пример устойчивого в воде природного металлорганического соединения. Его полная структура установлена в 1956 г. на основании кристаллографических работ Ходжкин и более ранних химических исследований Тодда и Джонсона. Полный синтез этого соединения осуществлен в начале 70-х гг. общими усилиями Вудворда и Эшен-мозера. [c.381]

Для каждой из нижеприведенных сокращенных структур нарисуйте соответствующие полные структуры, показывающие все атомы и связи. [c.255]

Тот эксперимент со спиновой развязкой, который мы хотели бы провести, выглядит следующим образом. Пусть спектрометр в автоматическом режиме делает дискретную развертку частоты развязки при прохождении через интересующую нас область частот. Пусть для каждого значения частоты развязка осуществляется абсолютно селективно, а результат ее однозначно проявляется в какой-то области спектра,, 0се эти эксперименты соберем в одном месте, для того чтобы могла быть иепосредственно отображена полная структура спиновой связи. Пусть эксперимент проходит быстро и с высокой чувствительностью. [c.267]

Полная структура грамицидина S — полипептида со свойствами антибиотика — была установлена следующим образом [c.1067]

На основании полученных данных полную структуру дигидрата уранилнитрата можно представить следующим образом [256] [c.87]

Такая структура имеет молекулярный вес 201, которому (с учетом возможности перемещения водорода) соответствует упомянутый выше интенсивный ион. Удвоение молекулярного веса дает величину 404—406, так что для установления полной структуры необходимо идентифицировать ионы, отвечающие остатку в 178—180 единиц. Масс-спектр содержит интенсивные ионы с М/е = 175, 177 и 91, но количество возможных вариантов образования этих ионов очень велико, и присутствие подобных ионов вряд ли может служить убедительным доказательством того, что. неизвестный остаток представляет собой единое целое или состоит из двух эквивалентных остатков. [c.75]

Полная структура представляется в виде таблицы с обозначениями атомов и их координат. Полная структура объединяет данные о ковалентном и пространственном строениях. Ковалентная структура определяет обозначения данного атома, а геометрическая — его координаты. Атомы водорода с их единственным электроном проявляются обычно на карте электронной плотности настолько слабо, что их можно идентифицировать лишь в очень редких случаях. Однако положения атомов водорода определяются в достаточно хорошем приближении по координатам неводородных атомов, к которым они присоединены. [c.160]

Представление полной структуры [c.161]

Огромные таблицы, в которых записана полная структура, воспринимать очень трудно очевидно, что они должны быть представлены в другой, более доступной форме. В этом разделе описаны все использующиеся сейчас способы представления полной белковой структуры. [c.161]

Точные молекулярные модели громоздки, но удобны. Самым удобным представлением молекулярной структуры пока еще остается трехмерная модель. Такая модель незаменима при постановке любых экспериментов, основанных на знании полной структуры белка. В частности, она наиболее адекватна для поиска центров связывания субстратов и эффекторов. Однако такие модели громоздки и к тому же стоят очень дорого, чем и объясняется их сравнительно малая распространенность. [c.161]

С момента рождения модели Уотсона-Крика структуры ДНК до появления третичной структуры первой молекулы нуклеиновой кислоты прошел 21 год. Будем ли мы столь же долго ждать установления первой полной структуры вируса [c.66]

Основным методом определения структуры индивидуальных компонентов нефти в последнее десятилетие стал метод хромато-масс-спектрометрии, сочетающий в себе высокую эффективность разделения методом газожидкостной хроматографии и возможность определения полной структуры органических соединений методом масс-спектрометрии. Большинство данных по определению индивидуальных компонентов нефти было получено именно этим методом. Как отмечалось выше, предварительное разделение на классы соединений (например, удаление аренов или концентрирование алканов) существенно облегчает задачу. Знание индивидуального состава фракций нефти необычайно важно для-разработки методик выделения интересных, порой необычных соединерий (так было с адамантаном, положившим начало новой области органической химии), методик переработки нефтяного сырья, установления важных деталей происхождения и изменения нефти и др. [c.137]

Ввиду периодического рас-полол<ения частиц в простран-стБеннон решетке, в ней вси -да можно выбрать параллелепипед, при помощи которого строится полная структура кристалла. Это достигается параллельным переносом такого параллелепипеда вдоль его ребер на длины ребер. Параллелепипед минимального размера, при переносах которого получается полная структура кристалла, называется элементарной ячейкой. [c.84]

Из этих превращений можно бьло сделать вывод о полной структуре октулозы V [c.548]

После определения последовательности в каждой цепи нужно было еще установить, какие полуцистиновые остатки связаны между собой. Санжер решил эту проблему (1955) частичным гидролизом инсулина в таких условиях, в которых связь S—S остается незатронутой. Образовавшиеся цистинпептиды, без отделения от других компонентов, фракционировали и окисляли до цистеиновых пептидов. Цистеино-вые пептиды каждой фракции отделяли электрофорезом и идентифицировали. Таким образом была выяснена полная структура этого белкового гормона (см. Схему ва стр. 699). [c.698]

Наличием полиеновой сопряженной системы двойных связей объясняют красную окраску соединения. Таким образом, на основании рентгеноструктурных исследований и данных по химическому поведению была установлена полная структура и пространственная формула гексакарбоно-вой кислоты (VIII), содержащая частично гидрированную тетрапирроль-ную циклическую систему коррина и координационно связанный кобальт. [c.683]

На рис. 9-21 приводится структура алмаза по Шубникову и Копцику [20]. Ее можно рассматривать как совокупность двух гранецентрирован-ных кубических подрешеток, смещенных друг относительно друга на 1/4 пространственной (телесной) диагонали куба. Каждая из двух подрешеток принадлежит к пространственной группе Р43т и, кроме того, имеется несколько операций, переводящих одну подрешетку в другую. Полная структура алмаза имеет пространственную группу РсВт, где обозначает алмазную плоскость. [c.431]

Если мы проанализируем полную структуру любого фосфоглицерида, то обнаружим одно из самых ярких свойств этого класса природных соединений — бифильность их по отношению к растворителям, к жидкофазной среде. Длинноцепочечные алкильные радикалы жирнокислотных фрагментов обладают выраженной липофильнос-тью, тогда как фосфатное звено, вместе с остатком второй спиртовой компоненты проявляет сильно выраженную [c.125]

СТРУКТУРА ВЫСШЕГО ПОРЯДКА. Ни одно из крупных научных открытий последних лет не было овеяно такой славой, как начало расшифровки структуры ДНК. Идентификация гена классической генетики постепенно приводит к тому, что генетика из чисто биологической науки становится достоянием химии, биохимии, биофизики и других естественных наук. В популярном виде история ДНК изложена в интересной книге лауреата Нобелевской премии Джеймса Уотсона . Полная структура хотя бы одной молекулы ДНК все еш е не выяснена, может быть, потому, что ее размеры столь велики, а ведь длина молекулы ДНК, например кишечной палочки Es heri hia oli (бактерии, обитаюш ей в толстой кишке человека), в развернутом виде достигает 1 мм. [c.481]

В 1968 г. Р. Холли был удостоен Нобелевской премии за установление структуры аланиновой тРНК дрожжей. Поскольку молекулы тРНК отличаются сравнительно небольшими размерами, многие лаборатории заняты выяснением полной структуры различных транспортных рибонуклеиновых кислот. [c.494]

Средняя межфазная кривизна поверхности Жидкость—пар. Определение средней межфазной кривизны J проводилось методом течения газа с использованием уравнений (19) и (20). Метод основан на предпосылках, изложенных ранее (см. стр. 255), что в изотропных пористых средах стационарное кнудсеновское течение газа зависит от поровых шеек, тогда как при нестационарном кнудсеновском течении на течение газа влияет полная структура пор. Эта разница в кнудсеновском течении газа приводит к различным пористостям для двух типов течения для стационарного и ф для нестационарного. Если концепции этих пористостей объединить с теорией запаздывания времени Баррера по способу Гуднайта и соавт. [34, 35], можно получить уравнение (13) [c.261]

Таким образом, в предложенной формуле допущена условность, доказать или опровергнуть которую достаточно трудно, хотя и не невозможно. Предложенная структура деградированной арабовой кислоты послужила основой для обсуждения полной структуры полимера. Для этого было необходимо установить места связи ячейки деградированной арабовой кислоты, которая является центральной частью молекулы полимера, с остатками арабинозы, рамнозы и галактозы, которые отрываются от основной цепи при частичном автогидролизе. [c.168]

У людей с активным геном Se (от англ. se retion — секреция) гликопротеиды, несущие антигены групп кровч, секретируются в слюну и другие жидкости. Растворимые антигены групп крови удалось выделить в больших количествах из кист яичников, что позволило определить их структуру. Предполагаемая полная структура антигена Le , [c.376]

Инсулин открыт в 1921 г. Бантингом (лауреат Нобелевской премии 1923 г.) и др. как гормон поджелудочной железы, уменьшающий гипергликемию при диабете. Очистка и кристаллизация проведены в 1926 г. Абелем, а в 1955 г. Сенгер опубликовал полную структуру инсулина. (Это выдающееся достижение в 1958 г. также было отмечено Нобелевской преми ей.) И наконец, в 1969 г. лауреат Нобелевской премии Кроуфут-Ходжкин с помощью рентгеноструктурного анализа установила пространственную структуру молекулы инсулина (рис. 2-42). [c.263]

К середине 1940-х годов пептидная теория белков Фишера и Вальд-шмидт-Лейтца была почти повсеместно принята. Встал вопрос о точном знании деталей химического строения, т.е. о конкретном порядке расположения аминокислот в белковых цепях. Впервые такое сложное исследование удалось провести в течение десятилетия (1945-1954 гг.) ф. Сенгеру, определившему аминокислотную последовательность инсулина. Вторым белком была рибонуклеаза А. Полная структура этого фермента расшифрована С. Муром, К. Хирсом и У. Стейном (1960 г.). Вскоре идентификация химичекого строения белков стала производиться с помощью автоматических секвенаторов и приобрела рутинный характер. Однако достижения в решении первой фундаментальной задачи проблемы белка не принесли удовлетворения. Сначала не вызывало сомнений, что химические и физические свойства белков получат свое объяснение, как только станет известно химическое строение их молекул. Однако основанная на опыте всей органической химии и биохимии надежда на то, что установление химического типа и строения молекул окажется достаточным для понимания хотя бы в общих чертах их специфического функционирования, не оправдалась. Тем самым определение структуры из конечной цели исследования превратилось в необходимый для последующего изучения белков начальный этап. Утвердилась мысль, что химическая универсальность и практически необозримое многообразие свойств соединений этого класса при строгой специфичности его отдельных представителей связаны с особенностями пространственных структур белковых молекул. [c.67]

Полная структура ДНК была установлена Д. Уотсоном и Ф. Криком в 1953 г. на основании определения химического состава и данных рентгеноструктурного анализа. Оказалось, что молекула ДНК состоит из двух спиралей, имеющих одну и ту же ось и противоположные направления. Сахарофосфатный остов располагается по периферии двойной спирали, а азотистые основания находятся внутри. Остов содержит ковалентные фосфодиэфир-ные связи, а обе спирали между основаниями соединены водородными связями и гидрофобными взаимодействиями. Водородные связи между основаниями строго специфичны, и этот факт имеет очень большое значение как для структуры ДНК, так и для ее биологической функции. Эти связи были открыты и изучены Э. Чарга( зфом в 1945 г. и получили название принципа комплементарности, а особенности образования водородных связей между основаниями называются правилами Чаргаффа. [c.45]

Полную структуру обычно записывают в виде таблицы, включающей все атомные координаты. В этой таблице каждый атом описывается своим внутренним обозначением в пределах данного остатка, а также названием остатка и его порядковым номером (например, 0=2 01и-131). В некоторых случаях указывается также подвижность атомов в кристалле белка. Все эти сведения собраны в банке данных о белках [390], откуда они предоставляются по запросам в виде записей на магнитной ленте. Чтобы использовать эти данные, обычно нужно состав11ть собственную программу для ЭВМ. [c.161]

ТОЛЬКО на специальных изображениях отдельных участков молекулы. Постоянно пополняющаяся коллекция стереопроекций различных частей всех известных полных структур белков приводится в атласе микрофишей АМ50М [401]. Несмотря на большую детализацию (около 10 изображений на молекулу), Атлас АМЗОМ дает только стандартные проекции. Более разносторонняя информация [c.169]

Макеты можно эффгктивно использовать для представления стереохимических данных. Помимо общей информации, т. е. обозначений атомов и их координат, при описании полной структуры белка обычно приводят целый ряд важных дополнительных сведений, касающихся водородных связей и других видов невалентных взаимодействий между атомными группами скелета и боковыми цепями, а также данных о любом взаимодействии полипептидной цепи (включая ковалентное) с простетическими группами, кофакторами, субстратами, металлами и другими лигандами, молекулами воды и т. д. Обычно эти сведения объединены в дпинный перечень, из которого по мере необходимости извлекается нужная информация. Значительно лучшей формой записи в некоторых случаях могут, однако. [c.170]

Независимо от этих исследований был достигнут прогресс в двух других родственных областях знаний. В 1Й47 г. Либих выделил субстанцию из экстрактов мышц быка [5], которую он назвал инозиновой кислотой . Позднее было показано, что это вещество содержит фосфор в виде остатка фосфорной кислоты и — через 60 лет после его открытия — сахар с пятью углеродными атомами, являющийся пентозой. Левин и Жакоб первоначально назвали этот сахар карнозой впоследствии его идентифицировали как ранее неизвестное вещество — Д-рибозу [6]. Это позволило установить полную структуру инозиновой кислоты как гипо-ксантинрибозид-5 -фосфат (1). [c.33]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология