Синтез Патерсона

Поэтому распределение межатомной функции Р и, у, w) в основном задается именно этими ] эИ соответствует такой идеализированной структуре, а отклонения от нее обнаруживаются с трудом. Если же для синтеза Патерсона использовать только I F сверхструктурных линий, то обнаруживаются именно эти отклонения. [c.195]

Международный союз кристаллографов публикует списки кристаллографических программ [42], в которых приводятся цель программы, язык, на котором она составлена, и указывается, на какой машине она была использована (гл. 6). В случае и метода тяжелого атома, и прямых методов общие процедуры очень похожи. Данные приводятся к виду, удобному для введения необходимых поправок к первоначально измеренным интенсивностям. В методе тяжелого атома поправленные интенсивности используют для расчета либо двух проекций, либо трехмерного синтеза Патерсона, необходимых для определения положения тяжелого атома в элементарной ячейке. После этого структурным факторам можно приписать фазы, провести расчет синтеза Фурье и получить тем самым трехмерную карту распределения электронной плотности, на которой должны быть видны, помимо тяжелого атома, и другие легкие атомы. [c.141]

Расчет синтеза Патерсона — [c.142]

Трехмерный синтез Патерсона дает трехмерное распределение векторов для всей элементарной ячейки кристалла. За исключением тех мест, где значения UVW определяют вектор между двумя атомами, величина Р (UVW) будет равна нулю. При некоторых условиях, которые будут описаны в следующих разделах, из таких векторных диаграмм можно определить часть или даже все координаты атомов кристаллической структуры. [c.150]

Если построить синтез Патерсона для кристалла, содержащего тяжелые атомы, то максимумы, соответствующие векторам между тяжелыми атомами, будут гораздо больше по сравнению с максимумами, соответствующими всем другим векторам. Большие максимумы могут возникать также из-за перекрытия нескольких малых пиков, однако с этим приходится иметь дело при анализе проекций, а не трехмерного синтеза Патерсона. [c.151]

Примеры определения координат атомов с помощью синтезов Патерсона [c.155]

Для устранения таких трудностей были разработаны различные методы наиболее распространенным является использование обостренных функций Патерсона с вычитанием нулевого максимума. В обостренном синтезе Патерсона атомы проявляются как точки с постоянной рассеивающей силой, равной атомному номеру I. Как говорилось выше, для нормального атома рассеивающий [c.162]

Модуль величины определяется через модуль его возводят в квадрат и используют в качестве коэффициентов для членов ряда Патерсона таким путем и получают карту обостренного синтеза Патерсона. [c.163]

Так же как при синтезе Патерсона, обычно рассчитывают синтез Фурье только для независимой части элементарной ячейки, содержащей информацию об электронной плотности всей кристаллической структуры. Если для получения фаз структурных факторов применяют метод тяжелого атома, то необходимые исходные данные для синтеза Фурье могут быть рассчитаны на основании результатов, найденных после уточнения параметров тяжелых атомов. При использовании прямых методов с помощью синтеза Фурье получают -карты (см. далее раздел Прямые методы ). [c.170]

Проекции Патерсона были рассчитаны вдоль всех кристаллографических осей, т. е. вдоль направлений [100], [010] и [001]. Ожидаемые большие пики, относящиеся к векторам между атомами таллия, были обнаружены только на последней из них, анализ которой показал, что на двух других проекциях эти пики находятся в начале координат. На рис. 63 изображена проекция вдоль направления [0011 для половины элементарной ячейки пики таллий — таллий обозначены буквой А, большой пик В возникает за счет центрирования верхней и нижней граней ячейки. Сечение = О полного трехмерного синтеза Патерсона представлено на рис. 64, на котором четко видны пики А тяжелых атомов. Нетрудно показать, что координаты атома таллия (в долях [c.173]

Величины структурных факторов получают из измерений интенсивности после введения поправок на фактор Лорентца и поляризации, на поглощение и экстинкцию, а для фотографических данных — также поправки Филлипса на форму пятен. Фазы наблюдаемых структурных факторов находят математическим путем, используя прямые методы, или с помощью синтезов Патерсона и Фурье, если применяется метод тяжелого атома. [c.180]

Обычно их получают в отпечатанном виде, а также в виде перфоленты или перфокарт, формат которых удобен для работы с последующими программами. Можно также хранить полученные данные на магнитной ленте или диске в виде, удобном для дальнейшего их использования. Необходимо на выходе иметь величины и Рд первая используется в синтезе Патерсона, вторая — в синтезе Фурье. Полезным дополнением к этой информации яв- [c.230]

ПРОГРАММА СИНТЕЗА ПАТЕРСОНА [c.233]

Обычно для расчетов синтезов Патерсона и Фурье используется одна и та же программа. Однако для большей ясности мы рассмотрим каждую из программ отдельно. [c.233]

Объем выходных данных зависит от того, рассчитывается ли полный синтез Патерсона или его проекция. В первом случае получают сечения, перпендикулярные определенной оси, и если, например, задан интервал 1/30 по этой оси, то на печати должно быть получено 31 сечение при этом сечения О и 30 одинаковы. Каждое сечение состоит из прямоугольной сетки точек, общим числом 31 X 31. В каждой точке печатается численное значение величины Р X YZ). [c.235]

По форме эти данные аналогичны результатам расчета по программе синтеза Патерсона с той лишь разницей, что синтез Фурье дает трехмерную карту электронной плотности в реальном пространстве. [c.238]

Эту программу можно использовать сначала для уточнения положения тяжелого атома, которое найдено из синтезов Патерсона, а затем для более важного общего уточнения полной структуры. Степень совпадения наблюдаемых и вычисленных структурных факторов является критерием правильности окончательной структуры. [c.240]

Пример использования синтезов Патерсона и Фурье — структура диэтил (салицилальдегидато) таллия (П1) [83]. Эта специфическая структура была расшифрована для нестандартной пространственной группы С1, т. е. С-гра-нецентрированной ячейки триклинного кристалла с центром симметрии. В элементарной ячейке содержится четыре формульные единицы (2 (С7Н5О2) Т1. [c.173]

Диэтил(салицилальдегидато)таллий (III) [100] является комплексным соединением, асимметричная единица которого содержит один атом таллия (тяжелый атом), два атома кислорода и одиннадцать атомов углерода. Структура была решена с помощью методов Патерсона и Фурье. Трехмерный синтез Патерсона позволил однозначно определить положение атома таллия в центросимметричной элементарной ячейке. Параметры ячейки (в А и градусах) и координаты атомов (в долях параметров) были следующими [c.191]

В случае миоглобина для приготовления изоморфных производных была применена другая процедура [135]. Миоглобин кристаллизовали в присутствии различных неорганических ионов, включающих тяжелые атомы, например Hglf". После этого получали рентгенограммы с целью убедиться, что в дифракционных картинах чистого белка и его модифицированного аналога с металлом действительно происходит изменение интенсивности некоторых отражений. На картах разностного синтеза Патерсона в независимой области проявлялся только один пик это означало, что ионы металлов присоединяются специфически к молекуле белка. [c.218]

При расчете синтеза Фурье используются как величины, так и фазы структурных факторов. В результате получается трехмерная контурная карта распределения электронной плотности, на которой должен быть виден каждый атом элементарной ячейки (по возможности также, и атомы водорода, содержащие лишь один электрон). Если пространственная группа рассматриваемой структуры цен-тросимметри на, то фазы структурных факторов будут либо +1, либо —1. Если определение структуры проводят с применением метода тяжелого атома, на первых стадиях структурного анализа получают координаты тяжелого атома из синтеза Патерсона. Далее приписывают фазы каждому структурному фактору в предположении, что в интенсивность рассеяния преобладающий вклад вносит тяжелый атом. Отсюда с помощью синтеза Фурье можно определить положение легких атомов в структуре.. [c.236]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология