Цитидин фосфат расщепление

Ферменты, как правило, работают в определенном диапазоне pH и. чарактери-зуются некоторым оптимальным значением pH, при котором при прочих равных условиях скорость реакции имеет наибольшее значение. Причины такого характера зависимости можно пояснить на примере кинетики гидролиза цитидин-2, 3 -фосфата, катализируемого панкреатической рибонуклеазой. Как следует из рис. 60, изображающего активный центр фермента на второй стадии реакции расщепления РНК, каталитически активной является форма фермента, у которой остаток имидазола, принадлежащий Н1з-12, протонирован и способен подать протон на атом 2 -0 циклофосфааного фрагмента, а остаток имидазола, принадлежащий Н18-119, не протонирован и способен принять протон у атакующей 212 [c.212]

В опытах на Е. соН и клетках асцитной опухоли установлено, что при добавлении к культуральной среде специфически меченной глюкозы распределение метки в рибозе и в дезоксирибозе не соответствовало действию механизма, предусматривающего участие дезоксирибоальдолазы, но было совместимо с предположением, что рибоза и дезоксирибоза имеют общего предшественника. При исследовании бактерий и животных получены данные, что рибоза нуклеозидов и нуклеотидов превращается в дезоксирибозу без расщепления углеродной цепи. Например, бесклеточные экстракты Е. соН превращают цитидин-5-фосфат в дезоксицитидин-5-фос-фат. Для этого превращения необходимо присутствие Mg, АТФ и НАД-Нг. [c.144]

Под действием пиримидил-РНК-азы расщепляются фосфодиэфирные связи, образованные производными уридина и цитидина, а также фосфодиэфиры некоторых редких компонентов РНК, в частности псевдоуридина, 5,6-дигидроуридина и риботимидина . Вопрос о влиянии пр ироды пиримидинового кольца нуклеозида на скорость реакции, катализируемой пиримидил-РНК-азой, рассмотрен в обзоре Витцеля °2 (см. также При расщеплении РНК под действием пиримидил-РНК-азы образуется смесь З -фосфатов пиримидиннуклеозидов и олигонуклеотидов, терминированных остатком пиримидин-З -фосфата. Скорость ферментативной реакции сильно зависит от природы отщепляющегося остатка и конформации полинуклеотида (см. стр. 291) можно осуществить специфическое частичное расщепление полинуклеотидов в условиях, когда скорость процесса уменьшена. [c.70]

В качестве второго центра, подвергающегося электрофильной атаке (помимо МНг-группы), при этом выступает С-5 пиримидинового ядра, в результате чего образуется новая углерод-углерод-ьая связь. Структура продукта реакции ХУ1 согласуется с данными УФ-, ИК- и ЯМР-спектров она подтверждена также рядом химических превращений. Реакция гладко протекает при комнатной температуре и нейтральных значениях pH. В случае цитидин-2, 3 -циклофосфата образование продукта завершается за 18 ч. Цитидин и цитидии-2 (3 )-фосфат реагируют несколько медленнее. Продукт реакции устойчив в щелочной среде. Это дает принципиальную возможность осуществить специфическую модификацию РНК по остаткам цитидина после обработки полимера нингидрином и последующего выдерживания при pH 9 (для расщепления продуктов типа ХУ, образующихся из гуанозиновых остатков). [c.416]

Скорость расщепления урацильного ядра максимальна при pH 10, при дальнейшем возрастании pH скорость реакции уменьшается (см. рис. 7.3). Расщепление цикла представляет собой реакцию второго порядка, которая, поскольку обычно используются большие избытки гидроксиламина, может быть приближенно представлена как реакция первого порядка по уридину со скоростью, пропорциональной концентрации гидроксиламина в реакционной среде. При pH 10 для 10 М раствора гидроксиламина величина константы скорости реакции расщепления составляет примерно 1 ч (при 37°С) °. Скорость модификации цитозинового ядра в этих условиях значительно ниже к моменту, когда с 6 М раствором гидроксиламина реагирует 95% уридина, цитидин модифицируетсявсего лишь примерно на 8% . Таким образом, при pH 10 (в сравнительно мягких условиях) реакция с гидроксиламином довольно специфична по отношению к уридину (из обычных нуклеозидов). Конечными продуктами реакции уридина и его фосфатов с гидроксиламином является оксазолон-5 LXX (аналог пиразолона-5) и оксим рибозы LXXI или рибозофосфата, получающийся из промежуточно образующейся рибозилмочевины за счет обменной реакции с гидроксиламином Реакция протекает, вероятно, по механизму, аналогичному реакции с гидразином, и [c.468]

Существенно, что последняя реакция деструкции неспецифична и наблюдается для всех нуклеозид-2 (3 )-фосфатов. Быстрее всего разрушается уридин-2 (3 )-фосфат за 100 ч при pH 7 и 50° С исчезает 79% исходного нуклеотида. В тех л<е условиях цитидин-2 (3 )-фосфат расщепляется на 53% гуанозин-2 (3 )-фосфат — на 25% и аденозин-2 (3 )-фосфат — на 6%- Вследствие этого применение периодатного окисления для специфического расщепления остатков псевдоуридина в тРНК не представляется возможным [c.611]

Панкреатич. Р. отличается от многих белков высокой стабильностью — она способна выдерживать непродолжительное кипячение в кислой среде. Оптимум активности фермента лежит при pH 7,7. Панкреатич. Р. специфически расщепляет рибонуклеиновую к-ту и нек-рые синтетич. полирибонуклеотиды, не действуя на дезоксирибонуклеиновую к-ту. Под действием панкреатич. Р. подвергаются расщеплению не все фосфодиэфирные связи в молекуле рибонуклеиновой к-ты, а только связи между остатком фосфорной к-ты, соединенным с 3 -гидроксилом рибозы пиримидинового нуклеотида (уридина или цитидина) и 5 -гидроксилом соседнего пуринового или пиримидинового нуклеотида. Катализируемая панкреатич. Р. реакция протекает в две стадии на первой стадии происходит разрыв связи между 3 -фосфатом пиримидинового нуклеотида и 5 -гидроксилом соседнего нуклеотида с переносом освобождающейся связи остатка фосфорной к-ты на 2 - гидроксил пиримидинового нуклеотида, в результате чего образуется циклич. 2, З -нуклеотид. На второй стадии фосфатная группа из положения 2 циклич. нуклеотида переносится на воду, в результате чего образуется З -нуклеотид. Сум- [c.337]

Действие панкреатической рибонуклеазы . Рибонуклеаза относится к ферментам, имеющим многофункциональную природу активного центра. Для рибонуклеазы характерно выполнение двух функций гидролазной и трансферазной. Рассмотрим механизм действия панкреатической рибонуклеазы, катализирующей гидролитическое расщепление рибонуклеиновой кислоты, иа примере гидролиза эфира цитидин-З -фосфата. [c.241]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология