Метилированные нуклеотиды в тРН

Размер окисного кольца м о ц о с а х а р и д а. Этот вопрос строения нуклеотидов решался обычными методами химии углеводов, подробно рассмотренными в другом разделе этой книги (стр. 33 и далее). Для решения этого вопроса нуклеозид метилировался, метильное производное (XI) подвергалось гидролизу и выделенный после гидролиза метилированный моносахарид (XII) окисляли. [c.194]

Метилирование специфических остатков цитозина. Как правило, метилирование происходит по положению 5 остатков цитозина (5-теС) в динуклеотиде 5 -СО-3. (У высших растений иногда метилируется крайний 5 -цитозин в тринуклеотиде 5 - NG-3, где N-любой нуклеотид.) Напомним, что у позвоночных динуклеотид СО встречается с частотой примерно в пять раз меньшей, чем это следует из нуклеотидного состава ДНК (разд. 1.1). Так, при случайном распределении оснований и ОС-содержании ДНК млекопитающих 40% частота, с которой встречаются СО-динуклеотиды, должна быть равна примерно 0,04-такой же величине, как и для динуклеотидов ОС. Однако в действительности она составляет 0.008. [c.140]

Для рестриктаз третьего класса участок узнавания не обязательно должен быть симметричным, а расщепление происходит иа расстоянии 24 — 27 нуклеотидов от участка узнавания. Так же как рестриктазы первого класса, они содержат в одном комплексе и рестриктирующую. и метилирующую активности и требуют для рестрикции присутствия АТР. Пример последовательности, узнаваемой рестриктазой Есок1. относящейся к третьему классу, приведен [c.310]

По-видимому, наиболее важным открытием из сделанных когда-либо в биологии было установление того факта, что рассмотренный выше или какой-либо другой процесс копирования уже существуюш их белковых цепей вообще не протекает в организме и что информация о последовательности аминокислот в молекулах ферментов хранится в хромосомах и используется (но терминологии, применяющейся в вычислительной технике) для программирования в белоксиитезирующих системах (рибосомах), обеспечивая правильное воспроизведение последовательности аминокислот. Эта программа хранится не в виде аминокислотной последовательности полипептидных цепей и не в какой-либо иной форме, имеющей прямое структурное или химическое сходство с рассматриваемой аминокислотой, а в виде кода, записанного на лентах нуклеиновой кислоты, при этом каждой аминокислоте соответствует определенное, состоящее из трех букв, кодовое слово (кодон), которое по своей химической структуре не имеет ничего общего с данной аминокислотой. Таким образом, последовательность аминокислот в полипептидной цепи фермента закодирована в виде последовательности нуклеотидов в полинуклеотидной цепи нуклеиновой кислоты. Буквы кодона не следует понимать как некие символы, записанные на бумаге, они представлены пуриновыми или пиримидиновыми основаниями. Записывая нуклеотидные последовательности, принято обозначать нуклеотиды первыми буквами их химического названия например, кодон для метионина представляет собой последовательность из трех нуклеотидов— аденина, урацила и гуанина — и записывается AUG. Информация о последовательности аминокислот в белках хранится в хромосомах, точнее, в молекуле дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Последняя отличается от рибонуклеиновой кислоты (РНК) тем, что содержит восстановленный сахар (дезоксирибозу) и метилированные урациловые группы (иногда бывают метилированы и другие основания). [c.6]

Точная функция необычных нуклеотидов в молекулах тРНК неизвестна, но имеются данные, что, чем меньше метилирована тРНК, тем менее она активна и специфична [3903] . [c.31]

Единственный промежуточный рибонуклеопротеин, который можно выделить, представляет собой отдельную частицу, содержащую большинство белков. Мы уже упоминали, что в состав такой частицы входит 168-РНК, представленная незрелой формой, имеющей несколько дополнительных нуклеотидов. На этой стадии рРНК метилирована только частично. Вероятно, конформационные изменения рРНК сопряжены с удалением дополнительных последовательностей и с метилированием только после этого оставшиеся белки могут войти в со- [c.110]

КЭП. Структура на 5 -конце эукариотических мРНК образуется после транскрипции за счет присоединения 5 -конца гуа-нинового нуклеотида к концевому основанию мРНК. Эта структура может быть метилирована по крайней мере по той молекуле гуанина, которая присоединилась. Кэп имеет следующее строение "G ppp Np... [c.522]

Для нормального функционирования аппарата исправления ошибок, связанных с включением неправильных нуклеотидов, необходимо располагать механизмом, позволяющим отличать новосинтезированную цепь ДНК от родительской матричной цепи. В противном случае с вероятностью 1/2 будет происходить исправление нуклеотида в родительской цепи, приводящее к закреплению потенциально мутагенной ошибки, допущенной ДНК-полимеразой. Вероятно, для установления различий между родительской и дочерней цепями ДНК в Е. соИ используется метилирование аденина в последовательности GAT . Эта палиндром-ная последовательность обычно метилирована в обеих цепях родительской ДНК. При полуконсервативной репликации метилированной ДНК образуется дочерняя ДНК, в которой одна цепь, пришедшая от родительской ДНК, метилирована, а новообразованная цепь в течение некоторого времени после выхода из области репликативной вилки остается неметилированной. Следует заметить, что метилирование новообразованной цепи ДНК осуществляется ферментом, отличным от метилаз, входящих в систему рестрикции—модификации, обсуждавшуюся в гл. 9. Бактерии dam , дефектные по метилированию аденина в результате нарушения синтеза соответствующей метилазы характеризуются повышенной частотой спонтанных мутаций, что подтверждает гипотезу об участии метилазы dam в системе исправления ошибок репликации. [c.123]

Рестрицирующие ферменты. Эндонуклеазы, распознающие специфическую последовательность нуклеотидов в ДНК и осуществляющие затем двухцепочечный разрез в ее молекуле. ДНК организма, 1] одуцирующего такой фермент, обычно модифицирована по участку узнавания эндонуклеазой, чтобы предотвратить расщепление собственной ДНК. Модификация осуществляется модифицирующим ферментом, который узнает специфическую последовательность и метилирует в ней определенный нуклеотид. [c.314]

Рис. 10-44. А. Образование 5-метил-цитозина происходит при метилировании цитозина в молекуле цепи ДНК. У позвоночных этот процесс ограничен цитозиновыми остатками (С), находящимися в составе последовательности G, К. Синтетический нуклеотид, содержащий основание 5-азацитозин (5-aza- ), не может метилироваться Более того, если небольшие количества 5-aza- включаются в ДНК, они подавляют

Автоматическое наследование 5-метил-С ставит проблему курицы и яйца на какой стадии происходит первое метилирование у позвоночных Установлено, что при введении неметилированной ДНК в оплодотворенную яйцеклетку мыши почти все G-сайты этой ДНК метилируются (хотя существует одно важное исключение, описанное ниже). Таким образом, большая часть генома млекопитающих может оказаться сильно метилированной. Поскольку известно, что в норме поддерживающая метилаза не способна метилировать ДНК, лишенную метальных групп, остается предположить, что в яйцеклетке должен присутствовать другой фермент учреждающая метилаза. Вероятно, выполнив свою функцию, она исчезает, а за сохранение метилированных нуклеотидов в ДНК клеток развивающихся тканей отвечает уже другая, поддерживаюшая метилаза. [c.217]

В мозговом слое надпочечников содержатся хромаффинные гранулы — органеллы, способные к биосинтезу, поглощению, запасанию и секреции катехоламинов. Помимо катехоламинов в состав этих гранул входит ряд других веществ, в том числе ATP-Mg , ДБГ, Са+ и белок хромогранин А. Катехоламины поступают в гранулы с помощью АТР-зависимого мехатшзма транспорта и связываются с нуклеотидом в соотношении 4 1 (гормон АТР). Норадреналин запасается в этих гранулах, но может выходить из них и метилироваться образующийся в результате адреналин включается в новую популяцию гранул. [c.223]

Рестрикция (разрезание) выделенной из клеток ДНК осуществляется ферментами — рестрикционными эндонуклеазами (рестриктазами). Эти ферменты вступают в реакцию с определенными участками ДНК, так называемыми сайтами узнавания, которые в клетке обычно бывают защищены специальными группировками (метилированы). После обработки ДНК эндонуклеазами фрагменты имеют так называемые липкие концы рестрик-тазы разрезают две цепи ДНК не в одном месте, а в двух разных местах, в результате чего одна из цепей оказывается длиннее другой на несколько нуклеотидов. Свободные нуклеотиды мо1ут спариваться с комплементарны.ми нуклеотидами другого фрагмента ДНК с липкими концами. Благодаря этому, ДНК из различных источников может объединяться, образуя рекомбинантные молекулы. Это свойство рестрикционных фрагментов ДНК ис-нoль yeт( я в генной инженерии для со 1дания искусственных векторов на основе бактериальных плазмид, или фагов. [c.67]

Рестриктазы проявляют специфичность и по отношению к местоположению модифицированных оснований в узнаваемой последовательности нуклеотидов. Во всех исследованных случаях было обнаружено, что метилирование, осуществляемое штаммо-специфической метилазой, защищает ДНК от расщепления сопряженной рестриктазой [98, 252, 319]. Этот тип модификации Макклеландом [252] был назван врожденным ( og-nate ). В настоящем обзоре для его обозначения будет принято название — каноническое метилирование. Оно проявляется в метилировании симметрично расположенных строго определенных оснований в каждой цепи узнаваемой последовательности нуклеотидов. Например, специфическая метилаза Нра II метилирует внутренний цитозин в последовательности 5 С С GG в [c.47]

Смотреть страницы где упоминается термин Метилированные нуклеотиды в тРН: [c.82] [c.133] [c.82] [c.202] [c.328] [c.31] [c.105] [c.386] [c.386] [c.269] [c.25] [c.123] [c.25] [c.50] [c.59] [c.24] [c.41] [c.42] [c.145] [c.476] [c.216] [c.129] [c.220] [c.148]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология