Полицитидиловая кислота, структур

Перекись водорода также является реагентом, чувствительным по отношению ко вторичной структуре. Так, модификация урацила в составе полиуридиловой кислоты резко замедляется в присутствии полиадениловой кислоты, тогда как на модификацию полицитидиловой кислоты полиадениловая кислота не влияет [c.479]

Несмотря на то что по гидродинамическим свойствам полиадениловая и полицитидиловая кислоты в нейтральных и щелочных средах представляют собой статистические клубки 229-232 наличие гипохромного эффекта 232.233 кругового дихроизмаи дисперсии оптического вращения 2зе, 237 свидетельствует о том, что между основаниями в этих полинуклеотидах существуют взаимодействия. Кривые дисперсии оптического вращения и кругового дихроизма очень схожи с аналогичными кривыми для динуклеозидмонофосфатов (см. стр. 238), и это дает основание предположить, что в случае гомополимера водородные связи между основаниями не образуются. Расчеты кривых дисперсии оптического вращения для полиадениловой и полицитидиловой кислот, выполненные исходя из свойств динуклеозидфосфатов, дают результаты, согласующиеся с экспериментальными . Наиболее прямыми доказательствами односпиральной структуры этих полинуклеотидов является аналогия их свойств со свойствами полинуклеотидов, у которых невозможно образование водородных связей в силу замешения соответствующих водородов алкильными радикала-,vijj 71,239,2 g также результаты кинетических исследований реакции с формальдегидом [c.283]

В кислой области pH гидроксиламии проявляет определенную специфичность по отношению к вторичной структуре полинуклеотидов. Гидроксиламии не реагирует с нативной ДНКно с денатурированной ДНК и полицитидиловой кислотой реакция протекает, хотя и медленнее, чем с мономерами. Модификация гидроксиламином и 0-метилгидроксиламином широко применяется в биологических исследованиях, в особенности генетического характера (обзоры — см. ). Избирательность действия О-метил- [c.348]

Скорость реакции формальдегида с полинуклеотидами в большой степени зависит от вторичной структуры полимера реакция очень сильно замедляется или практически не протекает с двухцепочечными комплексами полинуклеотидов, стабилизованными водородными связями Ч Поэтому обработка формальдегидом широко используется в исследованиях вторичной структуры полинуклеотидов (см. гл. 4). Эта реакция была применена для изучения вторичной структуры полиадениловой и полицитидиловой кислот, а также для определения размеров и стабильности двухспиральных участков (см. также Денатурированная ДНК быстро реагирует с формальдегидом, причем продукт реакции теряет способность к ренатурации 4. Нативная ДНК, напротив, реагирует с формальдегидом крайне медленно анализ кинетики реакции показывает, что реакция начинается на дефектном участке двухспиральной структуры и концентрацию таких участков можно определить . Частичную денатурацию ДНК по специфическим участкам при действии формальдегида можно наблюдать под электронным микроскопом Модификация полинуклеотидов формальдегидом была применена и для некоторых функциональных исследований, в частности для изучения инактивации тРНК и для исследования изменения кодирующей способности полиадениловой кислоты в бесклеточной системе [c.412]

Легко понять, что в этом случае обе полинуклеотидные цепи в комплексе параллельны, а не антипараллельпы, как в ДНК. Полицитидиловая кислота дает сама на себя биспиральные комплексы только в кислой среде, когда аминогруппы заряжены. По-видимому, в стабилизации этих комплексов участвуют также и ионные силы. Особый случай имеет место. при комплексообразо-вании двух цепей полп-А друг с другом. Подобные двойные спирали несколько большего диаметра, чем обычные спирали Крика—Уотсона, образуются в кислой среде начиная с pH 5. В нейтральной среде эти спирали расплавлены. Было показано, что начиная с pH 5 происходит присоединение протона к 1-му атому азота в пуриновом ядре. При этом в двойной спирали возникают гетерополярные связи между каждым анионом фосфатной группы одной цени и противолежащим катионом, локализованньш при Nl-пypинoвoгo ядра второй цепи. Это явление может быть названо внутренним солеобразованием. Оно приводит к чрезвычайной стабильности комплекса (поли-А) 3. Прп pH 4,25 его точка плавления близка к 90°. Далее структура этого комплекса своеобразна. Она была выяснена путем рентгеноструктурного анализа (Рич, Дэвис, Крик, Уотсон). Комплексообразованне основано на водородных связях, причем в этом случае водородные связи образуют также фосфатные группы в цепи главных валентностей с аминогруппами аденина [c.229]

Маловероятно, чтобы водородная связь в водном растворе могла обеспечить стабильность нативных нуклеиновых кислот, и действительно, было показано, что устойчивость простой спирали полицитидиловой кислоты не изменяется в присутствии формальдегида, который связывается с основаниями нуклеотидов и должен понижать или исключать стабилизацию мен<моле-кулярной водородной связью [И]. Основная роль водородных связей в полинуклеотидах заключается в обеспечении специфичности, т. е. в определении того, какое взаимодействие основание — основание стерически разрешено и энергетически наиболее выгодно в структуре двойной спирали, которая удерживается за счет стекинга. [c.306]

Свойством полинуклеотидных молекул является способиость к точному воспроизведению, основанная на принципе структурной ком-плементарности. В модельных опытах было показано, что полинуклео-тидная цепь может служить матрицей, связывающей свободные нуклеотиды. При смешивании АМФ с полиуридилоеой кислотой свободные молекулы АМФ связываются с остатками полиуридило вой кислоты при помощи водородных связей между комплементарными основаниями. В результате возникала спиральная структура. Точно так же наблюдали формирование устойчивой комплементарной спирали при смешивании полицитидиловой кислоты с гуанозинмонофосфатом. Для синтеза комплементарных полинуклеотидов необходимо было, чтобы между связанными с матрицей мононуклеотидами образовались меж-нуклеотидные связи. Экспериментально была показана принципиальная возможность возникновения таких связей без какого-либо участия ферментов. Таким образом, полинуклеотиды могли служить матрицей для неферментативного синтеза (Комплементарных полинуклеотидов. [c.174]