Полицитидиловая кислота

Перекись водорода также является реагентом, чувствительным по отношению ко вторичной структуре. Так, модификация урацила в составе полиуридиловой кислоты резко замедляется в присутствии полиадениловой кислоты, тогда как на модификацию полицитидиловой кислоты полиадениловая кислота не влияет [c.479]

Данные по круговому дихроизму полинуклеотидов полиаде-ниловой кислоты (поли-А), полицитидиловой кислоты (поли-Ц) и полиуридиловой кислоты (поли-У) были впервые опубликованы Брамсом [12]. [c.244]

В целом, довольно правдоподобно выглядит версия, что первым репликатором была РНК. Эта гипотеза значительно выиграла бы, если бы мы могли собрать простую систему копирования в пробирке без использования белка. Для облегчения задачи мы могли бы начать с одной сформированной заранее нити РНК, имеющей несколько произвольную последовательность оснований, и попытаться создать ее комплементарную спутницу, доставив необходимые исходные материалы. Для проведения реакции нам обязательно понадобятся четыре их типа, а также химическая энергия в некоторой форме. Подобные эксперименты проводились до сих пор с довольно скромными успехами. Лучший по исполнению на сегодняшний день — это эксперимент, проведенный Лесли Оргелом и его коллегами, которые поли-Ц (полицитидиловую кислоту) в качестве шаблона (то есть РНК, каждое основание которой составляет цитозин) снабдили химически активированной формой Г, обычного комплемента Ц. В присутствии ионов цинка (Zn +) (ион, найденный во всех современных ферментах, которые полимеризируют нуклеиновую кислоту) Г медленно объединяются друг с другом в правильное соединение (называемое 3 -5 ) для образования поли-Г значительной длины. В инкубационной смеси можно обнаружить молекулы, насчитывающие 0 двадцати Г в ряд, а более длинные, вероятно, будут присутствовать в Количествах, не поддающихся современным методам обнаружения. Бо- [c.69]

Принципиальная возможность образования полинуклеотидов без участия ферментов была показана Г. Шраммом (G. S hramm). Образующиеся полимеры содержали от 60 до 200 нуклеотидов в цепи и имели молекулярную массу 15000—50000 Да. Так были получены полиадениловая, полиуридиловая, полицитидиловая кислоты и их сополимеры. [c.193]

Полиадениловая кислота в РНК из всей ядерной РНК Полицитидиловая кислота Полиинозиновая кислота [c.347]

Полицитидиловая кислота Полиинозиновая кислота Полирибоадениловая кислота То же Полиадениловая кислота То же Ацетилированная фосфоцеллюлоза То же Сефароза Метилендианилин-крахмал 6 6 6 6 1307 1223 [c.347]

Полиадениловая, полиуридиловая и полицитидловая кислоты могут быть получены при полимеризации, катализируемой РНК-полимеразой, в условиях синтеза с повторением (стр. 99), в качестве исходной матрицы могут быть использованы различные ДНК Для получения полигуаниловой кислоты используют синтез на матрице полицитидиловой кислоты . [c.105]

Нуклеотидный состав. Температура плавления двухспиральных полинуклеотидов зависит также от их состава. С увеличением содержания пар гуанин цитозин Гщ двухспиральных молекул линейно увеличивается 145,212,343-347 как показано на рис. 4.18 (ср. с данными о стабильности пар оснований, стр. 225). В качестве модели для установления зависимости Гт полинуклеотида от состава оснований можно использовать синтетические олигонуклеотиды. При наличии возможности образования трех водородных связей на пару оснований температура плавления соответствующих двухспиральных полинуклеотидов повышается. Тем не менее число водородных связей на пару оснований само по себе не определяет однозначно Тщ двухспирального полинуклеотида. Так, для двухспирального комплекса поли-2-аминоаденило-вой кислоты с полиуридиловой кислотой Гщ значительно ниже, чем для двухспирального комплекса полицитидиловой кислоты с полигуаниловой кислотой, хотя число водородных связей у них одинаково Этот эффект уже был отмечен при взаимодействии мономерных компонентов нуклеиновых кислот (см. стр. 227). [c.265]

Несмотря на то что по гидродинамическим свойствам полиадениловая и полицитидиловая кислоты в нейтральных и щелочных средах представляют собой статистические клубки 229-232 наличие гипохромного эффекта 232.233 кругового дихроизмаи дисперсии оптического вращения 2зе, 237 свидетельствует о том, что между основаниями в этих полинуклеотидах существуют взаимодействия. Кривые дисперсии оптического вращения и кругового дихроизма очень схожи с аналогичными кривыми для динуклеозидмонофосфатов (см. стр. 238), и это дает основание предположить, что в случае гомополимера водородные связи между основаниями не образуются. Расчеты кривых дисперсии оптического вращения для полиадениловой и полицитидиловой кислот, выполненные исходя из свойств динуклеозидфосфатов, дают результаты, согласующиеся с экспериментальными . Наиболее прямыми доказательствами односпиральной структуры этих полинуклеотидов является аналогия их свойств со свойствами полинуклеотидов, у которых невозможно образование водородных связей в силу замешения соответствующих водородов алкильными радикала-,vijj 71,239,2 g также результаты кинетических исследований реакции с формальдегидом [c.283]

В кислой области pH гидроксиламии проявляет определенную специфичность по отношению к вторичной структуре полинуклеотидов. Гидроксиламии не реагирует с нативной ДНКно с денатурированной ДНК и полицитидиловой кислотой реакция протекает, хотя и медленнее, чем с мономерами. Модификация гидроксиламином и 0-метилгидроксиламином широко применяется в биологических исследованиях, в особенности генетического характера (обзоры — см. ). Избирательность действия О-метил- [c.348]

Мягкие условия, используемые при окислении нуклеозидов моноперфталевой кислотой, позволяют успещно применить эту реакцию для модификации полинуклеотидов ззз, зез окисление полиадениловой кислоты этим реагентом при pH 7 до 20° С заканчивается за 1,5—2 ч. При использовании эквимольных количеств моноперфталевой кислоты достигается модификация 13% остатков аденозина, при использовании десятикратного (в мольном соотно-щении) избытка перкислоты степень модификации возрастает до 86%. Полицитидиловая кислота в этих условиях окисляется заметно медленнее полиадениловой, и степень модификации здесь ниже. [c.390]

Скорость реакции формальдегида с полинуклеотидами в большой степени зависит от вторичной структуры полимера реакция очень сильно замедляется или практически не протекает с двухцепочечными комплексами полинуклеотидов, стабилизованными водородными связями Ч Поэтому обработка формальдегидом широко используется в исследованиях вторичной структуры полинуклеотидов (см. гл. 4). Эта реакция была применена для изучения вторичной структуры полиадениловой и полицитидиловой кислот, а также для определения размеров и стабильности двухспиральных участков (см. также Денатурированная ДНК быстро реагирует с формальдегидом, причем продукт реакции теряет способность к ренатурации 4. Нативная ДНК, напротив, реагирует с формальдегидом крайне медленно анализ кинетики реакции показывает, что реакция начинается на дефектном участке двухспиральной структуры и концентрацию таких участков можно определить . Частичную денатурацию ДНК по специфическим участкам при действии формальдегида можно наблюдать под электронным микроскопом Модификация полинуклеотидов формальдегидом была применена и для некоторых функциональных исследований, в частности для изучения инактивации тРНК и для исследования изменения кодирующей способности полиадениловой кислоты в бесклеточной системе [c.412]

Механизм действия перекиси водорода неясен. При малых концентрациях перекиси водорода (10 —моль1л) существенную роль в этих реакциях играет образование радикалов, катализируемое соединениями переходных металлов, следы которых всегда присутствуют в реакционной смеси. Действительно, в присутствии такого комплексообразователя, как этилендиаминтетрауксусная кислота, расщепление остатков урацила и цитозина в полиуридиловой и. полицитидиловой кислотах прекращалось или по крайней мере резко замедлялось 1 . [c.478]

Связи МН+- -К в полупротонированной двойной спирали солей полицитидиловой кислоты находятся в очень сходных условиях. Водородные связи поляризуют друг друга настолько, что перенос протона происходит крайне редко. В этом случае наблюдается очень широкая полоса [236]. [c.299]

Многочисленными исследованиями было показано [262— 267], что молекулы соли полицитидиловой кислоты (полиЦ) в не слишком кислой среде образуют двойную спираль, при этом два остатка основания связаны посредством симметричного мостика ЫН+- -Ы между атомами N(1) азотистых оснований. [c.307]

Результат 156 [236]. Для полупротонированной полицитидиловой кислоты в противоположность тому, что было обнаружено для непротонированной кислоты, наблюдается оЧень широкая полоса, простирающаяся от полос колебаний группы ЫНг в сторону меньших волновых чисел вплоть до 2100 см . Это поглощение обусловлено водородными связями ЫН+- -М, между которыми действуют протонные дисперсионные силы, вызывающие уширение. Следует отметить, что эти водородные связи более или менее сильно поляризуются полями диполей гидратных молекул воды и ионов РОг основной цепи. Напряженность поля [c.307]

Что касается второй пары оснований гуанин-цитозин, то соответствующий комплекс не мог быть изучен из-за отсутствия полигуанина, и образование спиралей Крика—Уотсона было проверено вначале на полимере, содержащем сходное пуриновое основание, но лишенном первичной аминогруппы, — на гипоксантине. Его полимер — полиинозиновая кислота (поли-И) образует двойные спирали с полицитидиловой кислотой (поли-Ц). В этом случае также образуются по 2 водородные связи между пуриновыми и пи- римидиновыми основаниями [c.228]

Легко понять, что в этом случае обе полинуклеотидные цепи в комплексе параллельны, а не антипараллельпы, как в ДНК. Полицитидиловая кислота дает сама на себя биспиральные комплексы только в кислой среде, когда аминогруппы заряжены. По-видимому, в стабилизации этих комплексов участвуют также и ионные силы. Особый случай имеет место. при комплексообразо-вании двух цепей полп-А друг с другом. Подобные двойные спирали несколько большего диаметра, чем обычные спирали Крика—Уотсона, образуются в кислой среде начиная с pH 5. В нейтральной среде эти спирали расплавлены. Было показано, что начиная с pH 5 происходит присоединение протона к 1-му атому азота в пуриновом ядре. При этом в двойной спирали возникают гетерополярные связи между каждым анионом фосфатной группы одной цени и противолежащим катионом, локализованньш при Nl-пypинoвoгo ядра второй цепи. Это явление может быть названо внутренним солеобразованием. Оно приводит к чрезвычайной стабильности комплекса (поли-А) 3. Прп pH 4,25 его точка плавления близка к 90°. Далее структура этого комплекса своеобразна. Она была выяснена путем рентгеноструктурного анализа (Рич, Дэвис, Крик, Уотсон). Комплексообразованне основано на водородных связях, причем в этом случае водородные связи образуют также фосфатные группы в цепи главных валентностей с аминогруппами аденина [c.229]

Полицитидиловая кислота, как показал Фреско, также способна давать биспиральные комплексы в кислой среде, как и полиадениловая. Поли-Ц интересен тем, что он дает исключительно регулярные нити с богатой рентгенограммой. [c.233]

Маловероятно, чтобы водородная связь в водном растворе могла обеспечить стабильность нативных нуклеиновых кислот, и действительно, было показано, что устойчивость простой спирали полицитидиловой кислоты не изменяется в присутствии формальдегида, который связывается с основаниями нуклеотидов и должен понижать или исключать стабилизацию мен<моле-кулярной водородной связью [И]. Основная роль водородных связей в полинуклеотидах заключается в обеспечении специфичности, т. е. в определении того, какое взаимодействие основание — основание стерически разрешено и энергетически наиболее выгодно в структуре двойной спирали, которая удерживается за счет стекинга. [c.306]

Так, представилась возможность использовать для расшифровки генетического кода прямые химические методы, поскольку было очевидно, что состав кодонов других аминокислот можно выяснить, анализируя полипептиды, образующиеся на других искусственно синтезированных молекулах РНК. Так, вскоре было показано, что полицитидиловая кислота (поли-Ц) стимулирует синтез полипролина, полиадениловая кислота (по-ли-А) — синтез полилизина и, следовательно, триплеты ЦЦЦ и ААА кодируют соответственно пролин и лизин. (Ввиду некоторых структурных особенностей полигуаниловой кислоты этот полинуклеотид не мог быть проверен в данной системе, однако в последующих работах было показано, что ГГГ кодирует глицин.) [c.437]

Принципиальная возможность образования полинуклеотидов без участия ферментов была показана Г. Шраммом (G. S hramm). Синтез полинуклеотидов осуществляли путем фосфорилирования и конденсации нуклеотидов и нуклеозидов при температуре 60° и в присутствии фосфорилирующих агентов. Образующиеся полимеры содержали от 60 до 200 нуклеотидов в цепи и имели относительную молекулярную массу 15 000—50 000. Так были получены полиадениловая, полиуридиловая, полицитидиловая кислоты и -их сополимеры. Таким образом, экспериментально показано, что в условиях первобытной Земли был возможен химический синтез биологически важных соединений (мономеров и полимеров), послуживших исходным материалом для построения всех организмов. [c.168]

Свойством полинуклеотидных молекул является способиость к точному воспроизведению, основанная на принципе структурной ком-плементарности. В модельных опытах было показано, что полинуклео-тидная цепь может служить матрицей, связывающей свободные нуклеотиды. При смешивании АМФ с полиуридилоеой кислотой свободные молекулы АМФ связываются с остатками полиуридило вой кислоты при помощи водородных связей между комплементарными основаниями. В результате возникала спиральная структура. Точно так же наблюдали формирование устойчивой комплементарной спирали при смешивании полицитидиловой кислоты с гуанозинмонофосфатом. Для синтеза комплементарных полинуклеотидов необходимо было, чтобы между связанными с матрицей мононуклеотидами образовались меж-нуклеотидные связи. Экспериментально была показана принципиальная возможность возникновения таких связей без какого-либо участия ферментов. Таким образом, полинуклеотиды могли служить матрицей для неферментативного синтеза (Комплементарных полинуклеотидов. [c.174]

Модуляторы биологических реакций (МБР), используемые для усиления иммунного ответа на опухоли, подразделяются на четыре группы. В общем случае, бактериальные продукты обладают адъювантными функциями по отношению к макрофагам (см. гл. 17 и 19) различные синтетические полимеры, нуклеотиды и полинуклеотиды индуцируют образование и выделение ИФ введенные цитокины непосредственно действуют на макрофаги и НК-клетки разнообразные гормоны, в том числе тимуса, могут усиливать активность Т-клеток. (ДЭМА - дивиниловый эфир малеинового ангидрида ФНО - фактор некроза опухолей поли-(1 С) - полиинозиновая и полицитидиловая кислоты). [c.388]