Гипохромный эффект

Спирализация ДНК отчетливо проявляется в ее спектральных свойствах — в эффекте гипохромизма в области собственного поглощения азотистых оснований при 2600 А (см. стр. 288—290). Интенсивность полосы поглощения 2600 А у двуспиральной нуклеиновой кислоты значительно меньше, чем у денатурированной формы. Степени спиральности ДНК и РНК определяются по гипохромному эффекту без труда. [c.498]

Определите батохромный, гипсохромный и гипохромный эффекты в терминах энергетических изменений и вероятностей переходов. [c.395]

Гипохромный эффект был детально изучен и экспериментально, и теоретически. Исследована зависимость эффекта от окружающей среды, от pH и ионной силы. [c.144]

Для ДНК гипохромный эффект больше, чем для РНК, а для двухцепочечных полимеров больше, чем для одноцепочечных. [c.144]

Нейтральная молекула НвЬ содержит три недиссоциированные кислотные группы, депротонизация которых при уменьшении кислотности среды до рН=4 осуществляется в первую очередь с образованием НбЬ-, Н Ь -, НзЬ -и не приводит к сдвигу максимума поглощения, как и рассмотренный выше процесс их протонирования При переходе к аниону НгЬ (до pH=8) происходит значительный батохромный сдвиг максимума поглощения, окраска становится красной в случае ксиленолового оранжевого (2 3.34) или синей в случае метилтимолового синего (2.2.35). Дальнейшая диссоциация с образованием иона НЬ5- сопровождается гипохромным эффектом для ксиленолового оранжевого и гипсохромным для метилтимолового синего (переход окраски от синей к серо-желтой). Диссоциация последнего протона приводит к образованию аниона Ь -, окраска которого аналогична окраске иона НгЬ - [1, 76]. [c.259]

Зависимость гипохромного эффекта от длины цепи была изучена в [72], зависимость от ионной силы — в [73]. В табл. 5.2 приведены данные, характеризующие гипохромизм полиаминокислот [51]. [c.288]

Температурная зависимость поглощения УФ-света при 260 нм (длина волны, при которой свет поглощается нуклеиновыми кислотами эффективнее всего) называется кривой плавления (рис. 2-28). В нативном состоянии нуклеиновые кислоты поглощают свет менее интенсивно, чем в денатурированном. Этот так называемый гипохромный эффект (гл. 13, разд. Б.4.Д) обусловлен стэкинг-взаимодействием между основаниями, плотно уложенными стопками в структуре нативной молекулы. Температура плавления, Т л, — это точка, при которой прирост поглощения составляет половину максимального (рис. 2-28). Чем выше ОС-содер-жание нуклеиновой кислоты, тем более устойчива она к денатурации, причем зависимость Т л от ОС-содержания почти линейна. Для раствора, содержащего 0,15 М КаС1 + 0,015 М цитрата натрия, pH 7,0, справедливо уравнение (2-15). Точное соотношение между ОС-содержани-ем ДНК и Тпл очень сильно зависит от ионного состава и pH среды [87, 88]. [c.142]

Введение насыщенных заместителей приводит обычно к некоторому сдвигу полос поглощения в сторону больших (батохромный эффект) или меньших (гипсохромный эффект) длин волн, увеличивает (гипер-хромный эффект) или уменьшает (гипохромный эффект) их интенсивность, но не меняет в большинстве случаев основных особенностей спектра, характерных для данного хромофора. [c.382]

При медленном охлаждении денатурированной ДНК нити ассоциируют и исходная структура молекулы восстанавливается, что сопровождается гипохромным эффектом. При охлаждении смеси двух денатурированных ДНК разного происхождения наряду с исходными образуются гибридные моле- [c.9]

Гипохромный эффект непосредственно зависит от содержания (А + Т)-пар. [c.144]

Влияние на положение и интенсивность полосы поглощения хромофора могут оказывать и функциональные группы, которые сами не поглощают при Я, > 200 нм, но обладают неподеленными электронными парами, т. е. несвязывающими электронами. Таковыми группами, называемыми ауксохромными, являются —ОН, —-ЫНг, —С1, —8Н и др. Ауксохромные группы обычно вызывают батохромный и гиперхромный эффекты, хотя в отдельных, более редких, случаях возникают гипсохромный и гипохромный эффекты, Т. е. смещение полосы в коротковолновую часть спектра и понижение ее интенсивности. Если свободная электронная пара ауКсо-хромной группы принимает участие в постороннем процессе, на- [c.166]

Гипохромный эффект. В квантовой механике взаимодействие света с веществом связано с определенным для каждого вещества вектором называемым моментом перехода. Величина и направление этого вектора зависят от волновой функции состояния, в котором электрон находился до взаимодействия (основное состоя ние), и от волновой функции состояния, в которое электрон перешел под влиянием светового кванта (возбужденное состояние). [c.236]

Наличие гипохромного эффекта свидетельствует о взаимодействии оснований, однако его отсутствие еще не означает, что взаи- [c.237]

Процесс присоединения экстралигандов сопровождается сдвигом полос поглощения относительно исходного ванадилпорфирина. На рис.22 приведен типичный спектр ванадилпорфирина до и после обработки растворами реагентов. Из представленных данных видно, что в спектре обработанного ванадилпорфирина наблюдается гипохромный эффект (уменьшение эффективности полосы поглощения) и батохромный сдвиг этой полосы (сдвиг поглощения в сторону более длинных волн), что характерно для явления экстракоординации [111]. [c.144]

Если в белках максимум низкоэнергетической полосы поглощения соответствует Я. г280 нм, то для полинуклеотидов Я,тах = 260 нм (38 500 см ). При исследовании оптических свойств нуклеиновых кислот особенно важной характеристикой является гипохромный эффект. В то время как поглощение денатурированного полинуклеотида примерно равно суммарному поглощению его компонентов, при образовании двухцепочечной структуры с укладкой оснований одно над другим поглощение при 260 нм уменьшается на 34%. Это явление лежит в основе оптического метода исследования плавления полинуклеотидов (рис. 2-28). Физическая природа гипохромного эффекта кроется во взаимодействии тесно уложенных одно над другим пар оснований (стэ-кинг-взаимодействие) [38]. [c.22]

Детальное исследование термодинамики переходов спираль — клубок проведено а простейших моделях — на олигорибоадени-ловых кислотах [111, 112]. При низких pH олигоаденины образуют двойные спирали, начиная с тетрануклеотида. Возможные модели спаривания тринуклеотидов, предложенные в работе [111], показаны на рис. 8.22. Вообш,е говоря, число разных двойных спиралей с п связанными парами при данной степени полимеризации N равно (N — п1) . Переходы изучались по гипохромному эффекту при 2650 А для М от 6 до 10. Образование двойной спирали из двух цепей характеризуется двумя константами—константой нуклеации р и константой роста спирали S. Константа s = exp(—AH/RT + kS/R). Константа равновесия для перехода две цепи двойная спираль равна [c.518]

На существование таких взаимодействий в растворах олигонуклеотидов указывают отклонения их физико- имических характеристик от аналогичных характеристик, наблюдаемых для смеси мономерных компонентов, состав которых идентичен нуклеотидному составу олигонуклеотидов. Твк, коэффициент моляриой эк-стинкции олиго- и полинуклеотидов меньше, чем сумма коэффициентов молярных экстинкций входящих в него мономеров (этот эффект называется гипохромным эффектом). [c.335]

Подобные множители входят в выражения для всех свойств, которые определяются локальными корреляциями в полуразбавленных растворах в хороших растворителях теплоты смешения, величины гипохромного эффекта в оптическом спектре и т.д. Было бы желательно дальнейшее экспериментальное изучение подобных эффектов. [c.84]

Из графика для кривой gn/gao второго приближения очевидно, что, начиная с п = 12, кривая изменяется очень медленно, т. е. практически достигает насыщения. Это означает, что при наличии спирали, состоящей из четырех витков, граничными эффектами можно пренебречь при вычислении оптической активности, отнесенной на мономерное звено. Весьма интересно, что этот вывод теории хорошо согласуется с результатами работы Рича и Тиноко [10] по влиянию длины спирали на гипохромный эффект. [c.133]

Важным свойством Н. к. является гипохром-ный эффект — уменьшение уд. экстинкции в полосе поглощения, когда ДНК находится в регулярной спиральной конфигурации, по сравнению с экстинк-цией в состоянии аморфного клубка. По значению гипохромного эффекта (он может достигать 40—45%) можно приближенно оценивать степень регулярности или степень спиральности ДНК. Следует только учитывать, что гипохромный эффект обусловлен параллельным расположением плоскостей молекул гетероцик- [c.193]

Следить за плавлением ДНК можно по исчезновению гипохромного эффекта или вращения плоскости поляризации, а также по падению характерпстич. вязкости р-ра. Цепи ДНК сильно повышают вязкость р-ра вследствие своей вытянутой формы. Переход спираль — клубок вызывает резкое уменьшение вязкости. ДНК в состоянии клубков наз. денатурированной. Как правило, она теряет при денатурации свою функциональную биологич. активность. [c.193]

Гипсохромный и гипохромный эффекты наблюдаются при введении между азометиновыми системами в молекулах IV метиленовой группы, прерывающей цепь сопряжения. Атомы кислорода и серы, разделяющие эти системы, вызывают аналогичные эффекты, но проявляющиеся в меньшей степени из-за электронодонорного влияния мостика . При введении NH-гpyппы — мостика с еще более сильными электронодонорными свойствами — гипсохромный эффект, связанный с разрывом цепи сопряжения, полностью перекрывается батохромным влиянием мостиковой группировки [42]. [c.66]

Пространственные затруднения у тетрабромпроизводного (X), ослабляя электронное взаимодействие между аминным и альдегидным ароматическими ядрами, обусловливают гипсо- и гипохромный эффекты [48]. [c.67]

Спектроскопии 2-фенилиндена и его гетероциклических аналогов посвящена работа [8]. Эти системы рассматриваются как л-изоэлектрон-ные т/закс-стильбену. При этом этиленовый мостик жестко фиксирован в пятичленном цикле. Гетероатом оказывает заметное влияние на положение максимума поглощения, смещая его гипсохромно при переходе от 2-фенилиндола к 2-фенилбензо-фурану и далее — к 2-фенилбензо-тиофену. Одновременно с батохромным смещением у 2-фенилбензотио-фена наблюдается гипохромный эффект. [c.76]

Гинохромные эффекты в динуклеозидмонофосфатах различного состава хорошо известны 5-62 3 хабл. 4.9 в качестве примера приводятся процентная гипохромия и процентный гипохромизм всех 16 возможных обычных динуклеозидмонофосфатов при трех значениях pH Видно, что во всех случаях наблюдается заметное понижение адсорбции УФ-света по сравнению с составляющими мономерами. Если оба основания в динуклеозидфосфате при данном pH заряжены одинаково, можно ожидать, что взаимодействия между ними не будет из-за отталкивания одноименных зарядов. И действительно, в большинстве случаев, наблюдается уменьшение гипохромных эффектов при протонировании или депротонировании обоих оснований в динуклеозидмонофосфате, хотя имеются и не совсем понятные исключения, когда гипохромия при этом возрастает (UpU и GpU при pH 7 и 11,5 соответственно). [c.237]

Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.22 , c.42 ]

Экспериментальные методы в химии полимеров - часть 2 (1983) -- [ c.221 ]

Экспериментальные методы в химии полимеров Ч.2 (1983) -- [ c.221 ]

Современная аналитическая химия (1977) -- [ c.138 ]

Энциклопедия полимеров Том 3 (1977) -- [ c.2 , c.389 ]

Энциклопедия полимеров Том 2 (1974) -- [ c.389 ]

Энциклопедия полимеров Том 3 (1977) -- [ c.2 , c.389 ]

Биохимия нуклеиновых кислот (1968) -- [ c.55 ]

Органическая химия нуклеиновых кислот (1970) -- [ c.236 ]

Химия полимеров (1965) -- [ c.112 ]

Физические методы исследования в химии 1987 (1987) -- [ c.308 ]

Химия красителей (1981) -- [ c.14 , c.24 ]

Введение в химию и технологию органических красителей Издание 3 (1984) -- [ c.24 ]

Химия красителей Издание 3 (1956) -- [ c.21 ]

Введение в химию и технологию органических красителей (1971) -- [ c.19 ]

Химия азокрасителей (1960) -- [ c.242 , c.244 ]

Гены (1987) -- [ c.35 ]

Введение в химию и технологию органических красителей Изд 2 (1977) -- [ c.22 ]

Биофизическая химия Т.2 (1984) -- [ c.57 , c.58 ]

Методы практической биохимии (1978) -- [ c.146 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология