Карбонил пептидной связи

Пептиды и белки обладают сильным избирательным поглощением в области 210—220 нм. Однако при этом нельзя работать в буферных растворах, включающих карбонил со держащие соединения. Еще более чувствительным является определение пептидов при 192—194 нм, однако при измерении в этой области можно использовать лишь водные растворы фторидов щелочных металлов. По этой причине спектрофотометрическое определение белков в области ниже 210 нм используется крайне редко (лишь в специальных случаях ГПХ). По чувствительности определение белков при 210 нм сопоставимо с колориметрическим методом Лоури, Например, сывороточные белки определяли в концентрации 2 мкг/мл [79]. Поглощение при 210 нм характерно для пептидной связи, и, следовательно, белки имеют одинаковые коэффициенты экстинкции (табл. 35.8). [c.457]

Уменьшение количеств отдельных аминокислот в облученном коллагене изменяется в зависимости от условий облучения, однако, обобщая все имеющиеся данные, можно сделать вывод, что наибольшему разрушению подвергаются фенилаланин, тирозин и гистидин лейцин, изолейцин, валин, серин и треонин почти совершенно не разрушаются под действием излучения. Эти результаты, полученные при облучении коллагена, отличаются от эффектов, наблюдаемых при облучении кератинов и других белков, богатых цистином. В фенилаланиновых, тирозиновых и гистидиновых остатках могут образовываться положительно заряженные центры или участки, обладающие недостатком электронов, которые могут создаваться при непосредственном взаимодействии с частицами высоких энергий или в результате реакций с электрофильными частицами, образующимися в среде под действием излучения. Как указывалось ранее, пептидный карбонил может внутримолекулярно взаимодействовать с этими положительно заряженными центрами, расположенными в боковых цепях, образуя неустойчивые циклические промежуточные продукты, которые затем распадаются, образуя продукты деструкции. Этим предположением может быть объяснено разрушение под действием излучения аминокислотных остатков фенилаланина, тирозина и гистидина. Но лейцин, изолейцин и валин имеют такое строение, которое пространственно затрудняет атаку образованных ими пептидных связей, и этим, в частности, может быть объяснена их устойчивость к действию реакционноспособных осколков, образующихся в среде под действием излучения. [c.436]

Наиболее известный элемент вторичной структуры полипептидов — правая а-спираль. Она довольно точно воспроизведена на рис. 2.23И. Основные характеристики спирали на один виток приходится 3,6 аминокислотных остатка на один остаток спирали приходится 1,5 А, шаг спирали 3,6 1,5 = 5,4 А. Диаметр спирали без учета боковых групп составляет примерно 6 А. Каждый карбонил пептидной группы (без учета концевых эффектов) в а-спирали служит акцептором при образовании водородной связи для донора N—Н пептидной группы, отстоящей от него на расстоянии четырех остатков. Таким образом, если расположить а-спираль Н-концом вверх, а С-концом вниз (как изображено на рис. 2.23И), то все С—О-группы будут направлены вверх, а все N—Н-группы — вниз. [c.89]

Инфракрасные спектры, вязкость и количество концевых групп NH2 и СООН при у-облучении поли-ъ-капроамида. Радиационное окисление поли-е-капроамида сопровождается разрушением связей С—Н метиленовых групп, как это видно из уменьшения интенсивности симметричных и антисимметричных валентных колебаний в областях 2870 и 2940 сж . Вместе с тем уменьшается интенсивность полосы поглощения амида I в области 1550 см— (деформационные колебания N —Н и валентные С —N пептидной группы), валентных колебаний карбонила в области 1650 см- и валентных колебаний N —Н пептидных групп в области 3300 M i [91. [c.375]

Карбонил разрушаемой пептидной группы 2п2+ Протяженность и направленность координационной связи [c.103]

Картер и Краут показали, что весьма распространенная вытянутая конформация полипептидных цепей (р-складчатая структура по Полингу и Кори) соответствует стабильной правозакрученной двойной спирали, т. е. существует двойная полипептидная спираль. Ее шаг и радиус примерно такие же, как и у двойной спирали нуклеиновых кислот. Авторы весьма тщательно построили пространственные молекулярные модели и увидели, что полипептидная двойная спираль в точности комплементарна двойной спирали РНК, причем полипептидная двойная спираль точно входит в малую бороздку двойной спирали РНК. В результате образуются водородные связи между 2 -0Н Группами рибозы (что, по-видимому, и объясняет особые свойства РНК, у ДНК нет этого гидроксила) и кислородом карбонила пептидной связи. Авторы отмечают, что такую точную комплементарность ста- бильных конформаций РНК и полипептидов вряд ли можно считать простым совпадением. Они предположили, что обе эти двойные спирали взаимно катализировали сборку друг друга из активированных предшественников на ранних стадиях эволюции. В самом деле, комплементарное соответствие двух двойных спиралей представляется весьма важным, но оно обеспечивает ускорение синтеза лишь основных каркасов — полипептидного и полинуклеотидного, тогда как для преодоления обсуждаемого нами кризиса на начальной стадии биологической эволюции необходимо установление полного однозначного соответствия определенных аминокислотных и нуклеотидных радикалов. Для этого нужно, чтобы взаимная полимеразная активность поли- [c.59]

Края антипараллельных ( -структур образованы особым видом вторичной структуры, которой называется -изгибом (реверсивным поворотом). р-Изгибы образуются четырьмя последовательно расположенными аминокнслотнымн остатками, как правило, образующими водородную связь 4- 1. Анализ показывает, что возможны даа основных вида (З-изгнбов (так называемые изгибы типа I и II, рис. 40), отличающихся ориентацией пептидного карбонила по отношению к средней плоскости 10-членного цикла. р-Й гибы — характерный элемент пространственной структуры природных и сиитети ческих олигопептидов, как линейных, так и циклических. Фрагмент 1 -структуры из двух антипараллельных цепей с [5-изгибом часто на-зыввют -шпилькой . [c.93]