Полинуклеотиды спиральные комплексы

У полинуклеотидов и спиральных комплексов, кроме гипохромизма при Ямакс, возникающего в результате упаковки друг над другом л—>л хромофорных единиц, гиперхромный эффект проявляется и при более длинных длинах волн. Такое увеличение оптического поглощения (при 280—300 мр) замечено у нескольких спиральных полинуклеотидных комплексов. Этот эффект является дополнением к гиперхромизму, обнаруженному ранее у олиго- [c.635]

Далее оказалось, что простые полинуклеотидные цепочки обладают способностью давать значительно большее разнообразие спиральных комплексов, чем природные сополимеры сложного состава. Так, цепи составленные из одних пиримидиновых полинуклеотидов, дают спиральные комплексы сами с собой. Это явление не противоречит теории, так как условия для образования водородных связей между основаниями здесь налицо [c.229]

При наличии достаточного количества данных о температуре плавления и стехиометрии спиральных комплексов как функции внешних условий можно построить фазовую диаграмму состояний полинуклеотида. Такая диаграмма полезна в двух отношениях. Во-первых, экспериментатор может для проверки легко определить состояние системы для любых произвольных условий. Во-вторых, физические эффекты, ответственные за фазовые переходы, иногда можно легко оценить, исходя из поведения фазовых границ. Рассмотрим смесь ро1у(гА) и ро1у(ги). В этом случае существуют три основных параметра, влияющих на состояние системы температура, концентрация соли и соотношение между компонентами смеси, и могут происходить четыре реакции [c.270]

Ионогенные группы пуриновых и пиримидиновых оснований в ДНК и синтетических полинуклеотидах принимают участие в образовании водородных связей, стабилизующих спиральную стрзгктуру молекул [10]. Эти связи могут образовываться лишь в случае неионизованных групп, так что в спиральной конформации ионизация почти не осуществляется (исключением являются комплексы молекул полиадениловой кислоты полиА-(-полиА). Температура плавления ДНК и двуспиральных комплексов полиадени- [c.29]

Рассмотрим теперь кривые титрования ДНК и синтетических полинуклеотидов. На рис, 6 представлена кривая титрования ДНК и комплекса полиУ-ЬполиА при щелочных pH. Видно, что, как указывалось выше, спиральные молекулы практически не ионизуются в весьма широком интервале pH, а при значениях pH, соответст-вующйх переходу в конформацию клубка, степень ионизации резко возрастает. Кривая титрования денатурированной ДНК гораздо более полога и соответствует обычной кривой титрования молекул полиэлектролита, не претерпевающих конформационных переходов. Значение pH, при котором происходит резкое возрастание заряда молекулы, является функцией температуры (рис. 3), что соответствует зависимости температуры плавления двойной спирали от pH (рис. 4). Кривые титрования зависят от ионной силы, что связано в первую очередь с аналогичной зависимостью температуры плавления. Уменьшение ионной силы смещает pH перехода при заданной температуре в сторону нейтральных pH. Так, для ДНК при 23° С pH перехода равно 2,6 при ионной силе 0,20 и pH 3,7—4,0 при ионной силе 0,07. [c.31]

Допустим, что полипептиды образуются из аминокислот (в присутствии конденсирующего агента, например полифосфата) на би-спиральных молекулах полинуклеотидов как на поверхности гетерогенного катализатора. Третичная структура образующихся полипептидов должна быть комплементарна к биспирали, т. е. такие белки должны иметь форму чехла . Напомним, что третичная структура биспиралей имеет стандартную форму и не зависит от последовательности нуклеотидов. На этом этапе белки-чехлы могут выполнять различные функции. Во-первых, они играют защитную роль, предохраняя биспираль ДНК от гидролиза. Во-вторых, и это главное, белки-чехлы могут играть роль фермента-репликазы. Для этого необходимо, чтобы комплементарное.соответствие между чехлом и ДНК было недостаточно полным. В этом случае молекула-чехол, располагаясь на биспирали, будет иметь механически напряженную структуру и тем самым будет способствовать репликации ДНК ). Важную роль при этом играет периодическое изменение внешних условий (например, температуры), обсуждавшееся в работе [6]. Изменение конформации, вызванное изменением условий, способствует расплетанию биспирали и репликации. Возврат к более комплементарной конформации препятствует репликации и тем самым способствует защите комплекса. Отсюда следует, что белки-чехлы могут обладать существенно различной (в том числе и отрицательной) репликазной активностью . Однако для дальнейшей эволюции достаточно, чтобы некоторые из них функционировали как репликазы. Подчеркнем еще раз, что эта функция белка образовалась не случайно — она вполне закономерно следует из способа его синтеза. [c.28]

Строение пар оснований в случае протонированных полинуклеотидов рассмотрено в гл. 22. Эти пары и соответствующие спирали имеют оси симметрии С2, параллельные спиральным осям. Poly (I) образуют тройную спираль с осями j, также параллельными спиральным осям. Такая симметрия возможна только для параллельных полинуклеотидных цепей. Известно множество других трехцепочечных структур, в которых дополнительная цепь образует пары оснований с одной или двумя обычными цепями антипараллельной уотсон-криковской спирали. Такие структуры наблюдаются главным образом в гомополимерных комплексах. Схемы спаривания оснований в двух трехцепочечных структурах приведены на рис. 22.14. [c.177]

Особый интерес представляют работы [57] по связыванию нуклеиновых оснований с линейным полиэтиленимином с помощью оптически активной вставки . Результатом введения хиральных центров должна стать спиральная структура макромолекул поликатионных САНК в комплексе друг с другом или с полинуклеотидами. Были синтезированы САНК общей формулы (1.21), содержащие несколько рядом расположенных хиральных центров [58] аналогично моделируемым нуклеиновым кислотам [c.29]

Спиральная структура образуется при одновременной координации органической макромолекулы на активные центры ассоциатов положительной и отрицательной полярности, отличающиеся друг от друга периодами кристаллической решетки. При этом в силу образования прочной сложноэфирной связи возникает структурное несоответствие между про-тонодонорными центрами связи и протоноакцепторными связями нуклеотидов, которые координируются на активных центрах ассоциата, имеющего положительную полярность заряда. Так как параметры решетки ассоциатов существенно отличаются, то для создания линейной структуры полинуклеотид свертывается в спираль. Для раскрытия спирали белковый комплекс должен выделить один из ассоциатов воды (положительного или отрицательного знака заряда). В этом случае макромолекула становится линейной в силу нематического характера водных ассоциатов. [c.153]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология