Двухцепочечные полинуклеотидные комплексы

Двухцепочечные полинуклеотидные комплексы обычно настолько стабильны при комнатной температуре, что определить относительную прочность различных пар оснований довольно трудно. Чтобы выявить эти различия, необходимо дестабилизировать двойную спираль. Чаще всего при количественных исследованиях для этого повышают температуру. Поглощение раствора гомополимерного комплекса при изменении температуры резко возрастает при определенной для каждого комплекса температуре. Получаемая кривая плавления полностью обратима. Отметим, что при температурах, лежащих ниже области резкого перехода, поглощение образца остается постоянным, а при температурах выше этой области в некоторых случаях лишь слабо меняется. Из этого наблюдения как такового можно сделать вывод, что структура двойной спирали и одиночных цепей при этих температурах не меняется. [c.267]

При использовании других бактериальных РНК-полимеразных систем оказалось, что продукт состоит частично из ДНК— РНК-комплексов, которые диссоциируют при нагревании до 100 В растительных экстрактах (изолированный хроматин из зародышей гороха) РНК остается связанной в ДНК — РНК-белковые комплексы и освобождается в форме, доступной действию рибонуклеазы, только после предварительной обработки дезоксирибонуклеазой или после нагревания до 60" в течение короткого времени оказалось, что в этом комплексе отношение РНК к ДНК равно 1 2. Так как температура диссоциации комплекса ниже температуры денатурации ДНК, пришли к заключению, что освобождение РНК (и ДНК) из комплекса происходит вследствие денатурации белка. Однако вероятно также, что трехцепочечный полинуклеотидный комплекс должен быть менее устойчивым, чем двухцепочечный комплекс. [c.320]

Определение содержания ДНК на одну вирусную частицу показывает, что обычно в состав частицы входит либо одна молекула ДНК, либо один двухцепочечный комплекс. Естественно поэтому ожидать, что препараты ДНК, выделенные из вирусов, будут индивидуальными в химическом смысле молекулами ДНК или по крайней мере комплексами из двух индивидуальных молекул. Это предположение оправдывается во многих случаях, причем иногда удается после разрушения двухцепочечного комплекса разделить с помощью равновесного центрифугирования индивидуальные полинуклеотидные цепи. [c.32]

Первый метод, известный обычно под названием гибридизация 2 , основан на следующем принципе. Если нагреть двухспиральный комплекс ДНК выше его температуры плавления и медленно охлаждать смесь полученных одноцепочечных полимеров в присутствии другого одноцепочечного полинуклеотида, наряду с восстановлением исходного комплекса происходит образование некоторого количества гибридного двухцепочечного комплекса, т. е. комплекса, в состав которого входят полинуклеотидные цепи, принадлежавшие ранее различным макромолекулам. Такой комплекс образуется тем в большей степени, чем больше в цепи добавленного полимера нуклеотидных последовательностей, [c.61]

Сильная зависимость хода реакции с карбодиимидом СП от вторичной структуры и ограничение действия нуклеаз после модификации позволяют использовать реакцию с этим карбодиимидом для обнаружения полинуклеотидных участков, на которых происходит разрущение двухцепочечного комплекса при частичной денатурации ДНК 2. После обработки ДНК карбодиимидом СП, а затем панкреатической ДНК-азой и фосфодиэстеразой змеиного яда удается выделить длинные олигонуклеотиды, возникающие из дефектных участков полимера. [c.385]

После того как РНК-полимераза продвинулась далее по матрице, в оставленном позади нее расплетенном участке восстанавливается двухцепочечная структура ДНК, а РНК вытесняется в виде свободной полинуклеотидной цепи. В каждый данный момент транскрипции около 50 последних рибонуклеотидов растущей цепи находится в комплексе с ДНК и ферментом. Связанный с ферментом участок матрицы, в котором расплетаются цепи ДНК и происходит синтез РНК, иногда называют точкой роста (хотя этот термин чаще используют при описании процесса репликации). [c.136]

Для многих ДНК характерно существование в виде комплексов, образующихся из двух полинуклеотидных цепей, которые стабилизируются водородными связями. Такие нуклеиновые кислоты называются двухцепочечными (двухнитевыми). Как показали на основе рентгеноструктурного анализа и химических данных Д. Уотсон и Ф. Крик (1953), двухцепочечные нуклеиновые кислоты в пространстве образуют структуру двойной спирали (рис. 102), [c.716]

Для ДНК характерно существование в растворах в виде комплексов, образующихся из двух полинуклеотидных цепей, которые стабилизуются за счет взаимодействия комплементарных оснований различных цепей и гидрофобного взаимодействия между основаниями в одной и той же цепи. Такие комплексы называют двухцепочечными, двухнитевыми или двухтяжевыми, [c.28]

При алкилировании ДНК под действием иприта бис-(гуанил)-этильные производные образуются за счет остатков гуанина, содер-л<ащихся в различных цепях двухцепочечного комплекса Вследствие этого уже при очень малой степени алкилирования ДНК теряет способность к денатурации с полным расхождением цепей. Аналогичная картина наблюдается и в начальной стадии реакции ДНК с бис-( -хлорэтил)-метиламином При более высокой степени алкилирования производные типа X VH, по-видимому, образуются в заметно больших количествах за счет алкилирования соседних остатков гуанина в одной и той же полинуклеотидной цепи [c.380]

Дезаминированию под действием азотистой кислоты могут быть подвергнуты и остатки нуклеозидов в составе полинуклеотидов. Подобраны условия, в которых достигается полное дезаминирование ДНК при этом, однако, в значительной степени происходит расщепление N-гликозидных связей пуриновых дезоксинуклео-тидных звеньев. Отмечена и другая побочная реакция при обработке ДНК азотистой кислотой получены доказательства образования небольшого количества ковалентных связей между комплементарными полинуклеотидными цепями, входящими в состав двухцепочечного комплекса ДНК Природа этой реакции не выяснена возможно, что она состоит в алкилировании остатка нуклеозида (сближенного пространственно с нуклеозидом, который претерпевает дезаминирование) под действием промежуточно образующегося диазосоединения (ср. алкилирование диазометаном— стр. 359). Полного дезаминирования РНК удается добиться при действии нитрита натрия в ледяной уксусной кислоте при этом происходит заметная деградация полимера за счет расщепления фосфодиэфирных связей. В более мягких условиях обработки, когда побочные реакции сводятся к минимуму, протекает лишь частично дезаминирование ДНК и РНК. При этом происходит некоторое изменение относительной реакционной способности оснований, входящих в состав полимера, по сравнению со свободными нуклеотидами (табл. 6.3). [c.419]

Изучение кинетики образования трехцепочечного комплекса из смеси двухцепочечного полиаденилил-полиуридилового агрегата и полиуридиловой кислоты показало, что для двухвалентных катионов реакция имеет второй порядок, т. е. на каждый триплет приходится два катиона. Хотя такие катионы, как магний и марганец, заметно эффективны, они не являются уникальными, поскольку трехцепочечный комплекс образуется также и в растворах хлористого натрия достаточно высокой концентрации. Главная роль катионов, вероятно, заключается в понижении электростатического отталкивания между отрицательно заряженными фосфатными группами в трех полинуклеотидных цепях. Более высокая эффективность двухвалентных катионов по сравнению с одновалентными является, по-видимому, следствием различных констант диссоциации металлфосфатных солей. [c.541]