Ковалентно замкнутая кольцевая

Важнейший параметр каждой кольцевой ковалентно замкнутой молекулы ДНК — порядок зацепления двух одноцепочечных колец, в ней. Он обозначается как Lk (или а) и в первом приближении равен числу пересечений одной полинуклеотидной цепи с другой в двуспиральном кольце (рис. 18). Lk, таким образом, имеет целочисленные значения. Самое важное, L/г — величина постоянная (инвариантная) для данной ковалентно замкнутой кольцевой ДНК-Если такая ДНК находится в так называемом релаксированном состоянии, т. е. без всякого напряжения может быть расположена в одной плоскости, то Lk=Tw, где Tw (обозначаемое также Р ) равно числу витков в двойной спирали данной ДНК. [c.31]

ДНК может находиться в линейной или кольцевой форме (рис. 1.9). Бактериальные плазмиды, хромосомы некоторых бактерий, большинство митохондриальных и хлоропластных ДНК, геномы вирусов млекопитающих представлены единственной ковалентно замкнутой кольцевой дуплексной молекулой ДНК. Хромосома бактериофага на разных стадиях жизненного цикла существует то как линейная молекула, то как замкнутая кольцевая [c.45]

Кроме линейных молекул ДНК существуют ковалентно замкнутые кольцевые молекулы, например однонитевая циркулярная ДНК фага фХ-174 [46] и ее двунитевая репликативная форма [47]. Ковалентно замкнутыми, циркулярными молекулами являются ДНК фага Я [48—51] и митохондриальная ДНК. Эти свойства молекул ДНК влияют на их поведение при фракционировании на колонках. [c.69]

Ковалентно замкнутая двухцепочечная кольцевая ДНК значительно отличается от линейных или открытых кольцевых молекул того же размера и состава азотистых оснований. Для разрушения ковалентно замкнутых кольцевых цепей требуются гораздо большие усилия, чем для разрушения линейной или открытой кольцевой струк- [c.56]

Образец ДНК денатурируют обработкой щелочью. Затем pH доводят до значения, при котором быстро ренатурируют ковалентно замкнутые двухцепочечные кольца, но линейные цепи ренатурируют медленно. Смесь фильтруют. Двухцепочечные кольца проходят через фильтр, а единичные линейные цепи задерживаются на поверхности фильтра. Таким образом получают очищенную фракцию кольцевых двухцепочечных ДНК. / — ковалентно замкнутые двухцепочечные кольца 5 —линейная двухцепочечная ДНК 3 — денатурированные ковалентно замкнутые кольцевые ДНК 4 — денатурированные (одио цепочечная) линейная ДНК 5 — денатурированные цепи остаются на фильтре 6 — очищенные кольцевые ДНК. [c.162]

Важнейший параметр каждой кольцевой ковалентно замкнутой молекулы ДНК — порядок зацепления двух одноцепочечных колеа в ней. Он обозначается как Lk (или а) и в первом приближении равен числу пересечений одной полинуклеотидной цепи с другой двуспиральном кольце (рис. 18). Lk, таким образом, имеет целочисленные значения. Самое важное, Lk—величина постоянная (инвариантная) для данной ковалентно замкнутой кольцевой ДНК- [c.31]

Известны три типа двухцепочечных кольцевых ДНК- Первый из них — ковалентно замкнутая кольцевая ДНК. Такие ДНК имеют сравнительно небольшой молекулярный вес.Примером указанных ДНК служат нуклеиновые кислоты вирусов полиомы и ЗУ 40, репликативная форма ДНК бактериофага ФХ174 В их молекулах обе полинуклеотидные цепи не имеют ни единого разрыва, поэтому любое изменение вторичной структуры, связанное с изменением количества остатков на один виток спирали, влечет за собой перестройку третичного строения ДНК. [c.47]

ДНК> модель разматывающегося рулона — система представлений, предложенная для объяснения репликации ковалентно замкнутых кольцевых ДНК. Модель разматывающегося рулона возникла благодаря открытию (+)-цепей ДНК. превосходящих по длине зрелый вирусный геном, (—)-цепеЙ в виде ковалентно замкнутых одноцепочечных колец, а также длинных (- -)-цепей с З -гидроксильным концом, лежащим на матричном кольце, и свободным 5 -гидроксильным концом, выходящим В раствор. Эта модель довольно удачно объясняет строение реплицирующёйся ДНК некоторых бактериофагов (ФХ174, Т4 к) и кишечной палочки, состоящей из двух ковалентно замкнутых кольцевых цепей. В этой структуре (+)-цепь в определенной точке разрывается эндонуклеазой. При этом освобождаются З -гидрокснльная и -фосфатная группы. 5 -Фосфатная группа прикрепляется к какому-то участку мембраны, а цепь начинает наращиваться с З -гидроксильного конца, достраиваясь на матрице (—)-цепи, которая при этом продолжает оставаться замкнутой. В таком виде она представляется бесконечной матрицей в виде кольца. [c.52]

Ковалентно замкнутая кольцевая двухцепочечная ДНК — особый тип макромолекулярной организации ДНК. Например, ДНК вируса полиомы и ЗУ 40 вируса, а также двухцепочечная репликативная форма ДНК бактериофага ФХ174. Такие ДНК характеризуются сравнительно небольшой мол. массой. Обе цепи в их молекулах не имеют ни одного разрыва, вследствие чего любое изменение спирали влечет за собой перестройку третичной структуры. [c.56]

Суперспнральиая ДНК — один из типов макромолекулярной организации ДНК, характерный для некоторых вирусов и фагов. Эти ДНК имеют относительно небольшую мол. массу (см. Ковалентно замкнутая кольцевая двухцепочечная ДНК), [c.82]

В живых организмах широко распространены циклические двунитчатые ДНК [50, 50а, 506, 51]. Впервые они были обнаружены в вирусах полном Далбеко и Вогтом [52] и Вейлем и Виноградом [53] в 1963 г. Все эти ДНК существуют в виде ковалентно замкнутых кольцевых двунитчатых молекул без концевых цепей [52—54]. [c.30]

Многие методы, применяемые в настоящее время для выделения плазмидной ДНК, основываются на ее су-перспиральной ковалентно замкнутой кольцевой структуре. Согласно всем этим методикам, необходим лизис [c.128]

Молекулы плазмидной ДНК, полученные из клеток бактерий, представляют собой двухцепочечные ковалентно замкнутые кольцевые структуры, не имеющие свободного конца, вокруг которого они могли бы раскручиваться. Бромистый этидий, относящийся к ряду фенатридиновых красителей, связывается с ДНК и РНК и тормозит функционирование нуклеиновых кислот [5, 15]. Клетки лизируют и лизаты наносят на градиенты хлористого цезия, содержащие бромистый этидий. При высокоскоростном центрифугировании ДНК седименти- [c.145]

Молекулы плазмидных ДНК могут обнаруживаться как в кольцевой, так и в линейной двухиепочечных формах. Нативная плазмидная ДНК, выделяемая из клеток с помощью мягких методов, представляет собой сверхскрученные ковалентно замкнутые кольцевые молекулы. Если происходит разрыв одной нити ДНК, возникают открытые кольцевые, или релаксирован-ные, молекулы. При двунитевых разрывах образуются линейные формы (рис. 10). Огромные молекулы ДНК хромосом при разрушении клеток обычно многократно разрываются и образуют линейные фрагменты. Один из методов выделения плазмид- [c.87]

Плазмиды. Как уже отмечалось, (см. гл. 2), плазмиды представляют собой внехромосомные генетические элементы, которые встречаются во многих видах бактерий. Они существуют обычно в виде ковалентно замкнутых кольцевых суперспиральных молекул ДНК, что является физической особенностью, которая лежит в основе ряда методов очистки плазмид. В качестве векторов используются обычно небольшие плазмиды размером до 15— 20 т. п. о., чаще всего от 2 до 10 т. п. о. [c.143]

Пример 7-А. Очистка ковалентно замкнутой кольцевой ДНК-Некоторые штаммы бактерий и ряд клеток животных содержат ковалентно замкнутую кольцевую двухцепочечную ДНК, поли-муклеотидные цепи которой не содержат разрывов (гл. 1). Такая ДНК часто присутствует только в виде небольшой части общей ДНК. Если ДНК обработать щелочью, водородные связи разрушатся и образуются однотяжевые цепи однако в случае, когда ДНК представляет собой ковалентно замкнутые кольца, цепи остаются физически связанными. После нейтрализации раствора [c.160]

Отделение ковалентно замкнутых кольцевых молекул ДНК от линейной ДНК или ДНК, содержащей одноцепочечные разрывы, с помощью центрифугирования в s l в присутствии бромида этидия или иодида пропидия. Бромид этидия (рис. 11-47) способен прочно связываться с ДНК в концентрированных растворах солей, в результате чего плотность ДНК понижается приблизительно на 0,15 г/см . Это связывание осуществляется путем вставок между парами оснований ДНК, поэтому по мере увеличения количества связываемого бромида этидия молекула ДНК все более разворачивается. Это вызвано тем, что ковалентно замкнутые кольцевые молекулы ДНК не имеют свободных кон- [c.340]

К- и Р-факторы представляют собой ковалентно замкнутые кольцевые молекулы двухцепочечной ДНК. Оба они содержат гены, обеспечиваюшие их репликацию в виде автономных плазмид и их перенос при контакте с соответствуюшими реципиентами. К-факторы несут также гены резистентности к антибиотикам. Одни такие гены изменяют реакцию клетки на антибиотик, другие индуцируют образование белков, вызываюших деградацию или модификацию определенных антибиотиков. Например, одна из К-плазмид кодирует Р-лактамазу, обес- [c.206]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология