Коэффициент седиментации компактных форм ДНК

Следует также отметить данные табл, 16 и 17, показывающие, что глобулярные белки имеют компактные и относительно симметричные формы. Он были получены в водных солевых растворах, имеющих величины pH, близкие к изоэлектрическим точкам белков. Эксперименты, проведенные в других условиях, показывают, что компактные формы легко теряются, на это указывают заметные изменения коэффициента диффузии. Два примера таких изменений будут даны на рис. 110 и 111 в связи с соответствующими изменениями коэффициентов седиментации [c.416]

Большая часть литературы по этому вопросу посвящена нативным белкам. Эти соединения характеризуются наличием вторичной и третичной структуры, которая, за немногими исключениями, достаточно устойчива и компактна. Многие гликонротеины, сходные с простыми белками и содержащие относительно мало углеводов (такие, как овальбумин и у-гло-булин), с точки зрения исследования физико-химическими методами могут рассматриваться как белки. Исследование многих более распространенных гликонротеинов, в которых гетерополисахаридный компонент составляет большую, часто превалирующую часть молекулы, представляет некоторые трудности. Тем не менее для гликонротеинов этого типа без каких-либо предположений о форме молекулы и изменений в теоретической обработке был определен молекулярный вес, хотя на практике в растворах таких гликонротеинов, даже нри большом разбавлении, сохраняется значительное межмолекулярное взаимодействие, что делает экстраполяцию менее надежной. Серьезные трудности могут возникать также и при обычном определении нолидиснерсности таких гликопротеинов по молекулярным весам. Более того, необходимо также но возможности охарактеризовать распределение по молекулярным весам или коэффициентам седиментации. При использовании в качестве одного из первичных параметров величины характеристиче- [c.55]

НО 2,5 [19]. Препараты, полученные осаждением сульфатом аммония, гетерогенны. Спиро [14] показал, что величина молекулярного веса при pH 3,2, рассчитанная по данным седиментации и вязкости, близка к величине молекулярного веса, измеренного при нейтральном pH, так как характеристическая вязкость при pH 3,2 ниже, чем при нейтральном pH, что компенсирует увеличение коэффициента седиментации. Автор считает, что изменение параметров связано с тем, что молекула фетуина в кислой среде имеет более компактную форму. С другой стороны, Грин и Кэй [19] наблюдали повышение приведенной вязкости при низких значениях pH до максимальной величины при pH 2. Используя метод Арчибальда для определения молекулярного веса, эти авторы показали, что при измерении в буфере глицин — НС1 (pH 3,5) препараты, полученные методом осаждения сульфатом аммония, имеют более высокий молекулярный вес (95 ООО), чем препараты, полученные осаждением спиртом (71 ООО). Это указывает на возможность ассоциации молекул. Средняя величина молекулярного веса (44 300), полученная этими авторами при нейтральных значениях pH, хорошо согласуется с величиной, полученной Дейчем, а также с величиной (44 600), найденной Кэем и Маршем [20] методом светорассеяния. [c.60]

Гиббонс [84] предположил, что групповые вещества, выделенные из кисты яичника, могут рассматриваться как гомологичные полимеры, так как они значительно отличаются друг от друга по молекулярному весу, но имеют сходный химический состав. Подставив полученные ранее величины коэффициента седиментации и молекулярных весов этих веществ в соог ветствующие уравнения, Гиббонс показал, что форма молекул групповых веществ должна представлять неупорядоченный клубок. Позднее Крит и Найт [85] подробно изучили отношение концентрационно зависимого коэффициента Ks к характеристической вязкости [т1[ для высокоочищенных, легко растворимых групповых веществ. Величина К5 [ц оказалась постоянной и равной 1,5. Сравнив эту величину с величино11 С5/[т]] = 1,6 0,26, полученной для большого ряда синтетических полимеров, с молекулами в виде неупорядоченного клубка [86] и приняв во внимание, что для многих известных белков с компактной упаковкой и приближенно сферической формой величина А"8/[г ] близка 1,6, авторы пришли к выводу о приближенно сферической форме молекул групповых веществ крови. В дальнейшем из рассмотрения величин характеристической вязкости для сильно развернутых молекул Крит и Найт [851 заключили, что молекулы групповых [c.175]

В природе найдено уже большое число кольцевых ДНК к ним относятся многие ДНК животного происхождения, а также бактериальные и вирусные, плазмидные и митохондриальные ДНК. Большинство из них не являются одноцепочечными (как ДНК фХ174), не имеют разрывов в одиночных цепях и неспособны находиться в равновесии с линейными формами (как ДНК фага X). Напротив, они представляют собой кольцевые двухцепочечные ДНК с совершенно целыми цепями. Такие структуры называют замкнутыми кольцевыми двухцепочечными всякую кольцевую форму с одним разрывом или более в одиночных цепях называют открытой кольцевой двухиепочечной формой. Замкнутую и открытую структуры нетрудно различить опытным путем (рис. 24.2). Допустим, что мы поместили нашу ДНК в щелочной раствор. В любой открытой структуре при высоком значении pH связи между цепями ДНК разорвутся. Даже при наличии одного разрыва в одной из цепей концы последней смогут вращаться относительно другой цепи, и в результате эти две одиночные цепи разойдутся. При центрифугировании в щелочном растворе кольцевой двухцепочечной молекулы с разрывом в одной из цепей мы обнаружим линейную цепь и одноцепочечное кольцо. При высоком значении pH может произойти разрыв водородных связей между основаниями и в замкнутой двойной спирали, но в этом случае два образовавшихся одноиепочечных кольца не смогут разделиться. Действительно, как мы увидим далее, они остаются настолько переплетенными, что образуется клубок из спутанных одиночных цепей ДНК. Такой весьма компактной структуре отвечает большой коэффициент седиментации, и ее легко отличить от любых свободных одноцепочечных форм. [c.387]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология