Селективное расщепление молекулы на фрагменты

Селективное расщепление молекулы на фрагменты (несколькими разными способами), выделение и исследование фрагментов. [c.66]

СЕЛЕКТИВНОЕ РАСЩЕПЛЕНИЕ МОЛЕКУЛЫ НА ФРАГМЕНТЫ [c.79]

Ценность биогенетической информации для выяснения строения природных соединений заключается прежде всего в том, что идентификация в молекуле неизвестного вещества определенных звеньев его простейщих биогенетических предшественников (с помощью меченых соединений) позволяет соотнести данное вещество с той или иной биогенетически родственной ему группой соединений. Затем меченый метаболит подвергают селективному расщеплению до перекрывающихся фрагментов, корреляция специфических активностей которых резко ограничивает число возможных альтернативных комбинаций и может привести к однозначному определению углеродного скелета метаболита. Такой подход к определению строения дает особенно хорошие результаты в случае метаболитов, образовавшихся из нескольких предшественников. [c.369]

Последние достижения в технике селективного гидролиза, разделения и идентификации позволили определить структуру целого ряда биологически активных полипептидов. Структуры некоторых полипептидов с небольшим молекулярным весом уже полностью подтверждены синтезом, для полипептидов с большим молекулярным весом эта задача еще не решена. Применительно-к полимерным молекулам метод гидролитического расщепления дает ценные сведения только о структуре малых фрагментов, для характеристики же молекулы в целом пока приходится ограничиваться данными физико-химических методов. [c.384]

Заключительный этап работы при выяснении порядка следования аминокислотных остатков в белковой молекуле—воссоздание первичной структуры белка на основании данных о последовательности их расположения в пептидах, полученных при селективном гидролизе. Так как избирательное расщепление пептидных связей при исследовании первичной структуры белков ведут не менее чем двумя агентами, обеспечивающими разрыв пептидных связей в разных точках полипептидной цепи, то первичные структуры того и другого набора полученных пептидов неизбежно перекрываются. Это открывает возможность воссоздания первичной структуры белка (рис. 28). Если при посредстве секвенатора удалось выяснить чередование аминокислотных звеньев в фрагментах белковой молекулы значительного размера, то это существенно упрощает процесс воссоздания ее первичной структуры. [c.59]

Следует подчеркнуть, что до сих пор нее успехи в этой области ограничивались дизайном упрощенных аналогов, способных воспроизводить только само расщепление ДНК природными прототипами. Между тем, структуры всех ендииновых антибиотиков содержат также домены, составляющие элементы систем доставки агента к мишени и его селективного связывания с этой мишенью (см. выше). Функционирование этих систем управляется гораздо более прихотливыми взаимодействиями между вовлеченными в события молекулами, которые пока затруднительно недвусмысленно интерпретировать в терминах причины и следствия (ср. обсуждегаде вопросов молекулярного узнавания в разд. 4.2.3). Поэтому рациональный дизайн структурных фрагментов, котор7а1е следует присоединить к молекуле аналога с тем, чтобы он и в этом отношении функционировал подобно природному образцу, представляет несраБненно более трудную задачу. Пока что достижения в этом направлении не слишком выразительны и основаны главным образом на чисто эмпирическом варьировании природы привесков (таких, как ароматические циклы или углеводные остатки) [40Ь]. Тем не менее, есть все основания ожидать, что накопление экспериментальных данных в конечном итоге принесет реальный прорыв в понимании основных особенностей явлений молекулярного узнавания и связывания, что сделает возможным создание более изощренных моделей, наделенных способностью к специфическому связыванию с ДНК. [c.532]

Из очерченных выше основных особенностей взаимодействия 293 с ДНК можно извлечь важные заключения. Сложная молекула антибиотика состоит из нескольких легко различимых фрагментов, каждый из которых ответственен за определенные аспекты общей работы по расщеплению ДНК. Тет-расахаридный домен обеспечивает доставку антибиотика к мишени (гидро-фильность, и за счет этого совместимость с водными фазами организма) и селективное связывание с определенным сайтом ДНК. Сопряженный евди-иновый фрагмент в составе десятичленного цикла представляет собой своего рода боеголовку , вызывающую расщепление ДНК. Спусковой механизм этой боеголовки — аллилтиолатный фрагмент, представленный своей латентной формой — трисульфидом, что обеспечивает предохранение от спонтанного инициирования взрыва боеголовки , т. е. преждевременного осуществления циклизации Бергмана вне контакта с ДНК, скажем, в процессе доставки к мишени. В структуре других антибиотиков ендииновой группы также можно обнаружить молекулярные устройства, выполняющие аналогичные функции (см. ниже). [c.523]

Вкратце рассмотрим a +.Mg + ATPaay мембраны саркоплазматического ретикулума, биохимические особенности которой подробно охарактеризованы. Молекула фермента состоит иэ одной полипептидной цепи (AI 100 000), возможно, это протеолипид. Частичное расщепление трипсином показало, что обе функции —гидролиз АТР и транспорт ионов — осуществляются на разных участках одной и той же полипептидной цепи. Фрагмент триптического расщепления с М 30 000 содержит участок, который, как и в Na+,K+-Ha o e, кратковременно фосфорилируется АТР другой фрагмент с М 20 000 может быть встроен в искусственную липидную мембрану с появлением селективной кальциевой проводимости. Возможно, что он представляет собой ионофор [9]. При этом, однако, не выяснен механизм сопряжения энергии гидролиза АТР с ионным транспортом. [c.179]

С появлением методологии генной инженерии метод локализованного мутагенеза становится доступным для широкого круга микроорганизмов. В наиболее простом варианте клонированный фрагмент ДНК, ограниченный удобными сайтами рестрикции, может быть выделен и подвергнут мутагенезу in vitro. Вследствие проведения реакции in vitro дозы мутагена могут быть достаточно высокими, что сильно повышает частоту мутагенеза. Такой подход использован при создании штамма-продуцента гомосерина (см. гл. 4). Для получения стабильных неревер-тирующих мутаций в определенном гене можно применить метод инсерционного локализованного мутагенеза. С этой целью инактивируемый ген клонируют на плазмиде и встраивают в него детерминант устойчивости к антибиотику (рис. 29). Затем компетентные клетки трансформируют сконструированной гибридной плазмидой (или полученной при ее расщеплении линейной молекулой ДНК), содержащей указанный детерминант, фланкированный последовательностями, гомологичными хромосомному гену. В результате двойного кроссинговера происходит интеграция гена лекарственной устойчивости в гомологичный район хромосомы. Искомые трансформанты отбирают на селективных [c.160]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология