Конформация спиральная

Очень гибкие цепи могут свертываться в шарообразные частицы -глобулы (см. 5.3.2). В растворах гибкие цепные макромолекулы образуют клубки (статистические клубки) - беспорядочно свернутые цепи (см. рис. 5.2, в). Наряду с беспорядочными конформациями глобулы или статистического клубка могут существовать упорядоченные конформации -спиральные или складчатые, фиксированные нехимическими внутримолекулярными связями, например водородными. Образующуюся при [c.121]

Рассмотрим молекулу поликислоты, которая в неионизованном состоянии находится в упорядоченной конформации (будем условно называть эту конформацию спиральной). Для такой молекулы свободная энергия спирали меньше свободной энергии клубка. По мере увеличения pH в области, близкой к значению рК, полная свободная энергия клубка и спирали начинает убывать за счет электростатической свободной энергии, причем, как указывалось выше, убывание для клубка большее. В результате отличие между свободными энергиями клубка и спирали уменьшается, и при некотором значении pH становится равным нулю. Это значение pH, определяющее среднюю точку конформационного перехода, соответствует такой разности электростатических свободных энергий спирали и клубка, которая компенсирует разность свободных энергий двух конформаций незаряженной макромолекулы. При этом чем ниже температура при прочих равных условиях, т. е. чем больше разность свободных энергий незаряженных клубка и спирали, тем больше значение pH при переходе. При дальнейшем изменении pH свободная энергия клубка становится меньше свободной энергии спирали и молекула принимает в основном конформацию клубка. Конформационный переход может наблюдаться также при изменении температуры в среде с фиксированным значением pH. При этом для поликислоты чем больше [c.21]

Имеются сообщения о том, что ряд других биологических молекул, существующих в конформации спиральных клубков, могут образовывать жидкие кристаллы. Обзор реологических свойств изотропных растворов ДНК дан Робинсом [23]. В этом обзоре рассмотрены три аспекта течения неньютоновское течение, методы измерения вязкости и деградация. Предпринимались также попытки использовать резкое изменение вязкости с уменьшением 7 для получения данных о жесткости молекул. При изучении градиентной зависимости вязкости Айзенберг [24] сделал вывод о том, что молекула ДНК лучше всего описывается моделью гауссовой цепи с внутренней вязкостью. [c.261]

Рис. 32. Предложенные конформации спиральных участков цепи главных валентностей изотактического винилового полимера.

Более поздние исследования Миллера с соавторами [37], выполненные на растворах ПБГ в диметилформамиде, позволили уверенно сказать, что в общем случае форма экспериментальной диаграммы состояния (см. рис. П1.1,б) практически полностью отвечает теоретической. Это касается не только узкой двухфазной области, но и наличия верхней критической температуры смещения в области II (см. рис. П1.1,а), благодаря чему распад системы на две анизотропные фазы неизбежен. Различия диаграмм, построенных Миллером и Флори, в общем-то несущественны. При их рассмотрении следует обратить внимание на снижение угла наклона границ узкой двухфазной области к оси концентрации для экспериментальной диаграммы по сравнению с теоретической. Причиной этого может быть отличие конформаций спиральных молекул ПБГ от формы жесткого стержня, их частичная проницаемость, зависимость степени анизометрии от температуры и полидисперсность реального полимера. В последнем случае условия, необходимые для перехода в анизотропное состояние различных по длине цепи фракций, неодинаковы, вследствие чего область перехода по шкале концентраций более размыта. [c.157]

Возможно существование нескольких различных спиральных структур, возникающих при образовании водородных связей между структурными элементами пептидной связи (NH- и СО-группы), из которых наиболее известна а-спнраль (рис. 3-14) с параметрами п = 3,6, i = 0,15 нм и h = Oi54 нм. В случае а-спирали за счет внутримолекулярных водородных связей образуется 13-членная кольцевая структура. Правильно назвать такую структуру можно так а(3,6)з)-спираль. Другими упорядоченными конформациями спирального типа для остова молекулы белка являются Зю-спираль, 7г(4,4) -спираль и 7(5,117)-спираль. [c.378]

В настоящее время накоплено много фактов о роли взаимодействий неполярных боковых групп в стабилизации структуры глобулярных белков. Относительное число аминокислот с неполярными боковыми цепями велико (30—50% от общего числа боковых остатков), поэтому энергетический вклад гидрофобных взаимодействий в стабилизацию белковой структуры достигает значительной величины. Внутримолекулярные гидрофобные взаимодействия и их влияние на конформацию спиральных полиаминокислот рассмотрены в работе Шераги и Немети [10]. В сс-спнрали данная боковая цепь может взаимодействовать с аминокислотным остатком в следующем витке, т. е. с третьим или четвертым остатком вдоль цепи, давая дополнительный вклад в стабилизацию а-спи- [c.18]

Высокое значение определяется деформациями валентных узлов и межатомных С-С связей в полимерных цепях, полностью состоящих из транс-последовательностей. Величины Е иСу полиэтилена существенно ниже, поскольку эти величины зависят и от ван-дер-ваальсовых (дисперсионных) сил. Величины Еу рассчитанные для изотактических полиолефинов, невелики из-за конформации спиральных цепей макромолекул. [c.248]

Если же атомы водорода заместить другими, более объемистыми атомами или группами, в цепи появляются значительные напряжения. Например, в поливинилхлориде отталкивание атомов водорода и хлора становится уже очень большим, и молекула принимает спиральную конформацию вследствие враш,ения вокруг ординарных связей С—С главной цепи атомы хлора и водорода расходятся на расстояния, близкие к равновесным (ван-дер-ваальсовым) радиусам. Таким образом, чтобы ослабить напряжения, цепь принимает спиральную конформацию. Спиральная конформация характерна для таких полимеров, как полипропилен, полистирол и т. д. Естественно, что эти полимеры должны быть стереорегулярными для осуществления процесса кристаллизации. [c.60]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология