Конформации цепи со спиральным расположением

В соответствии с терминологией, предложенной Линдер-стрём-Лангом [ ], можно сказать, что молекулы обычных полимеров в растворе не обладают вторичной структурой, тогда как молекулы биологически активных полимеров и их синтетических аналогов могут ее иметь. При этом первичной структурой макромолекулы называется число и расположение химических связей в молекуле, а вторичной — регулярная пространственная спиральная структура с определенной периодичностью, стабилизуемая водородными связями. Исследованию вторичных структур биологически активных макромолекул посвящено громадное количество работ, в которых были определены параметры спиральных конформаций для большого числа синтетических полипептидов и полинуклеотидов, а также для природных нуклеиновых кислот и белков. В последнем случае, наряду с вторичной структурой, большую роль играет также третичная структура молекул, т. е. взаимное расположение спиральных и неспиральных участков, обусловленное взаимодействием боковых групп цепи, в частности, связями 5—8. Наиболее известные примеры вторичных сгруктур представляют собой а-спираль Полинга — Кори [2> ] для полипептидов и двойная спираль Крика — Уотсона [ ] для дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Эти структуры [c.291]

Четкие результаты для большого числа белков, играющих жизненно важную биологическую роль, связанную с их нерастворимостью и механическими свойствами, были получены с помощью дифракции рентгеновских лучей, и эти результаты являются примером раннего использования техники, которая в последующее время была усовершенствована настолько, что с ее помощью были установлены полные структуры ряда кристаллических глобулярных белков. Растянутая или р-форма кератина демонстрирует пример р-слоев как с параллельным, так и с антипараллельным расположением пептидных цепей (см. рис. 23.7.4). Так, в фиброине щелка найдено только параллельное расположение этих цепей с близким к планарному расположением слоев, тогда как в кератине имеет место складчатая структура. Нерастянутая или а-форма кератина является примером а-спирали в ее наиболее компактной форме, в которой пять оборотов правой спирали включают 18 остатков аминокислот — следовательно, система может быть описана как спиральная конформация с шагом в 3,6 остатка. Из рассмотрения молекулярных моделей видно, что предпочтительна правая спиральность, поскольку по сравнению с положением в левой спирали полипептида, образованного из остатков -аминокислот, боковые радикалы в правой спирали располагаются наружу от оси спирали, так что дестабилизирующие отталкивания, затрагивающие, в частности, карбонильные группы, сводятся к минимуму (см. рис. 23.7.3). [c.428]

Конформация плоского зигзага в макромолекуле полиэтилена может легко осуществляться благодаря тому, что атомы водорода малы по размерам их ван-дер-ваальсовый радиус составляет 0,12 нм (1,2 А). При замещении атомов водорода др. атомами или группами, напр, атомами хлора [радиус 0,18 нм (1,8 А)] или фтора [радиус 0,15 нм (1,5 А)], в большинстве случаев цепь уже не может сохранить плоскую конформацию, поскольку большие атомы вызывают значительные напряжения в макромолекуле. Поэтому большинство полимерных макромолекул имеет спиральную конформацию. В этом случае период идентичности может включать один или неск. витков спирали. Напр., у макромолекулы политетрафторэтилена, имеющей форму слегка закрученной спирали, при темп-ре ниже 20 С период идентичности [равный 1,68 нм (16,8 А)] включает шесть витков спирали, на к-рых расположено тринадцать звеньев СРа- В интервале темп-р 20—30 °С цепь слегка раскручивается, так что на период идентичности приходится пятнадцать звеньев. Форма макромолекулы политетрафторэтилена близка к цилиндрической. При темп-ре выше 30 °С структура становится частично беспорядочной цепи, не нарушая взаимного расположения, согласованно колеблются или вращаются вокруг своих осей. [c.591]

Первая попытка состоит в классификации белков в соответствии с особенностями их вторичной и третичной структуры. Согласно этой классификации среди глобулярных белков вьщеляют 4 класса а, Р, а+Р и а/р. К классу а-белков относятся глобулярные белки, содержащие только а-спиральные конформации в количестве не менее 60% от составляющей их полипептидной цепи к классу р-белков—содержащие только Р-структуры в виде, как правило, не менее двух антипараллельных цепей к классу а+Р-белков—содержащие те и другие структуры в пределах одной и той же полипептидной цепи, причем один домен собран из а-структур, а другой—из Р-структур к классу а/Р-белков—содержащие многочисленные а- и Р-структуры, либо чередующиеся вдоль полипептидной цепи, либо расположенные так, что один или несколько р-слоев окружены несколькими а-спиралями каждый. Домены у ос/р-белков составлены, как правило, из а- и Р-структур (рис. 40). [c.81]

На устойчивость двойной спирали в растворе влияют многочисленные факторы. Образование упорядоченных структур является экзотермическим процессом, и поэтому спирали стремятся расплавиться при повышении температуры растворов ДНК. Из числа сил, стабилизующих нативную форму, водородные связи и диполь-дипольные взаимодействия между пуриновыми и пиримидиновыми остатками, упакованными в двойную спираль [344], должны приводить к выделению тепла. В то же время следует ожидать, что гидрофобное взаимодействие будет эндотермическим. Значение гидрофобного взаимодействия иллюстрируется тенденцией водных растворов ДНК к денатурации при добавлении органических растворителей с большими неполярными остатками [345]. Как и следовало ожидать, высокая плотность заряда, обусловленная ионизованными фосфатными остатками, расположенными вдоль цепи ДНК, обусловливает неустойчивость спиральной конформации. В результате этого добавление умеренных количеств электролитов должно стабилизовать нативную форму ДНК, что и было обнаружено при добавлении таких солей, как галогениды щелочных или щелочноземельных металлов [346, 347]. Если определить температуру плавления (Г ) как температуру, при которой изменения в спектре, характеризующие денатурацию, происходят на 50%, то Т- , по-видимому, будет иметь примерно линейную зависимость от логарифма концентрации катионов щелочных металлов. В типичном случае повышается от 36 до 82° при увеличении концентрации ионов натрия с 0,0003 до 0,1 н. Увеличение концентрации соли приводит также к сужению интервала температур, в котором происходит переход спираль — клубок. В отношении стабилизации спиральной конформации особенно эффективны некоторые двухвалентные иопы, образующие специфические комплексы с фосфатными группами основной цепи ДНК (например, Mg +). Нуклеиновая кислота как бы образует стехиометрические комплексы с этими катионами, причем Тт таких комплексов высока даже при очень слабой ионной силе. При всех условиях переход спираль — клубок происходит в удивительно узком температурном интервале, причем 90% изменений, как правило, происходит в интервале менее 10°. [c.127]

Дальнейшее исследование инфракрасных спектров поглощения и их дихроизма показало, что синтетические полипептиды, состоящие из остатков Ь-аминокислот, у которых водород р-уг-лерода замещен на какие-либо другие группы, имеют большей частью неспиральную конформацию. В табл. 1 аминокислоты были расположены в порядке, соответствующем их тенденции образовывать в полипептидах а-спиральные или неспиральные структуры. Так, поли-Ь-лейцин образует а-спираль, а поли-Ь-ва-лин — складчатую р-структуру. Тот факт, что полипептиды, образованные из этих весьма похожих друг на друга аминокислот, имеют столь различные структуры, указывает на существенную зависимость вторичной структуры от свойств аминокислотных остатков, входящих в полипептидную цепь. Вполне возможно, что степень спирализации некоторого участка белка зависит от числа и порядка расположения аминокислот, способствующих образованию спиральной конформации. [c.256]

Данные ЯМР о преобладании в цепях изотактического полистирола спиральной конформации 3i согласуются с данными УФ-и ИК-спектроскопии и другими доказательствами [33—39]. Доказательство методом УФ-спектроскопии [35, 36] основывается на наблюдении отчетливого уменьшения коэффициента экстинкции ароматической полосы в ближней УФ-области для изотактического полимера по сравнению с атактическим, что соответствует взаимодействию фенильных групп при регулярном слоистом расположении, имеющем место в спирали 3i. Доказательство методом ИК-спектроскопии более косвенное [33, 34, 37]. Кобаяси и др. [37] наблюдали, что ИК-полосы, связанные со спиральными конформациями, заметно уменьшаются при повышении температуры, причем ДЯ для этого эффекта составляет не менее 1,5 ккал/моль. Хотя этот эффект еще не имеет полной интерпретации, он, несомненно, отражает заметное укорочение средних размеров спиральных (3i) областей при высоких температурах. [c.208]

Возвращаясь к полипептидным цепям, отметим, что поскольку для них электростатические взаимодействия близко расположенных заряженных групп различаются для спиральной и клубкообразной конформаций, то кривые титрования последних также должны различаться. В частности, из приведенных выше оценок расстояний между близкими заряженными группами в спиральной и клубкообразной цепях следует, что при данном значении pH спиральная макромолекула должна быть заряжена в меньшей степени, чем клубкообразная. Поэтому, очевидно, что в области перехода спираль—клубок, инициируемого изменением pH раствора, степень ионизации макромолекулы должна сравнительно резко возрастать. Связь между степенью ионизации молекулы, претерпевающей кон-формационный переход, и степенью ионизации двух предельных конформаций может быть легко вычислена для случая абсолютно кооперативной системы. Из формул (10.11), [c.339]

Фактически одновременно Натта 71 и Миллер описали форму изотактического полипропилена, которая не была ни аморфной, ни явно кристаллической. Дифракционная картина волокна давала период идентичности 6,50 А, т. е. тот же, что и для кристаллической формы. Натта сделал вывод, что полимерные цепи в этой форме имеют ту же спиральную конформацию (З1), что и в кристаллической моноклинной форме (см. стр. 173), но что существует беспорядочная упаковка энантиоморфных цепей в гексагональном расположении. Он назвал этот случай мезоморфной смектической модификацией изотактического полипропилена. Описывая ту же форму несколько иначе, Миллер пришел к выводу, что эта форма, названная некристаллической , характеризуется наличием агрегатов молекул (или сегментов молекул),в которых отдельные части индивидуальных молекул сохраняют спиральную структуру, характерную для кристалла, но в которых недостаточно, либо нет совсем, порядка в поперечном направлении, необходимого для того, чтобы быть названным кристаллическим . [c.183]

Механические релаксационные свойства кристаллического полипропилена и частично кристаллического полиэтилена схожи. В кристаллическом и частично кристаллическом полипропилене обнаруживаются три абсорбционных максимума, обычно называемые а-, р- и у-максимумами. Интенсивность поглощения в области высокотемпературного ос-максимума непосредственно связана с содержанием кристаллических областей в полимере. Очевидно, что этот максимум не появляется в спектре полностью аморфного полипропилена. Молекулярная и кристаллическая структуры полипропилена и полиэтилена существенно различны. Содержание метильных групп в полипропилене очень велико (одна метильная группа приходится на каждые три углеродных атома основной цепи). Это обусловливает спиральную конформацию макромолекул. В этом полимере изменения кристалличности связаны главным образом с пространственным расположением метильных групп. Вследствие различии в строении полимеров характер максимумов поглощения в полипропилене и в полиэтилене совершенно различен как по положению на температурной шкале, так и по интенсивности. Эти же различия приводят к тому, что изменение кристалличности полипропилена по-иному отражается на его релаксационных свойствах, чем в случае полиэтилена. [c.355]

В первом случае рост макромолекулы контролируется кристаллической решеткой. Кристаллографические данные подтверждают соответствие образующейся полимерной цепи расположению мономерных молекул в кристалле. Переход мономер — полимер сопровождается лишь незначительным перемещением молекул в решетке. Мономерные молекулы уложены здесь в стопки одна на другую. В таких колонках мономерных молекул раскрытие цикла каждого мономера вызывает его небольшое вращение, что обусловливает возникновение спиральной конформации образующейся макромолекулы. [c.93]

Удовлетворение этих достаточно жестких требований в сочетании с плотной нерегулярной конфигурацией и при отсутствии большого числа остатков в конформациях с высокой энергией обусловливает уникальный характер белковой глобулы. Определенная конформация данной полипептидной цепи в глобулярном белке является в этом смысле действительно исключительным явлением, а не просто одной из многих возможных конформаций, лишь слегка различающихся по энергии. Согласованность ближних и дальних взаимодействий обеспечивает направленный характер самосборки глобулы при зарождении элементов будущей вторичной структуры уже на ранних стадиях сворачивания. Для обеспечения этого необходимо, чтобы в цепи возникали регулярные (а- и -) участки, имеющие хотя бы одну непрерывную гидрофобную поверхность. Это условие является грубым . Более тонкие свойства структуры функциональных белков связаны с определенным расположением остатков на поверхности для топографической совместимости белков вторичной структуры, с наличием гидрофобных и гидрофильных поверхностей на разных сторонах некоторых а-спиральных участков. [c.215]

Банн 28 одним из первых сделал попытку использовать химические све.яения для выбора возможной структуры. Сопоставляя строение полимерных молекул со строением уже изученных молекул, содержащих ковалентные связи, он пришел к заключению, что предпочтительными в таких молекулах являются конформации со спиральным расположением цепи. Используя это предположение, он смог предсказать конформации, возможные для насыщенных молекул, и периоды идентичности, которые для них следует ожидать. Несколько позже Натта с сотрудниками прн рассмотрении общих правил, определяющих конформации линейных полимерных цепей, высказали аналогичные предположения. Они постулировали для изолированной цепи с осевой ориентацией, что конформация цепи в кристалле должна приближаться к конформации, имеющей минимум потенциальной энергии (постулат минимума энергии). Согласно этому постулату, длины связей, углы между ними, ван-дер-ваальсовы расстояния и т. д. должны быть для полимеров приблизительно теми же, что и для более простых модельных соединений. [c.169]

Рентгеноструктурные исследования показали, что каждая полипептидная цепь тропоколлагена тоже представляет собой спираль, хотя ее периодичность и размеры весьма отличаются от соответствующих параметров а-спирали. Полипептидная цепь тропоколлагена образует левую спираль, на один виток которой приходится только три аминокислотных остатка. Поскольку в коллагене присутствует много остатков пролина и гидроксипролина, что придает цепи жесткую изогнутую конформацию, три спиральные полипептидные цепи плотно обвиты одна вокруг другой. Они соединены между собой также поперечными водородными связями. Кроме того, в коллагене обнаружены ковалентные связи необьиного типа, образующиеся между двумя остатками лизина, находящимися в соседних цепях (рис. 7-15). Расположенные рядом друг с другом троноколлагеновые тройные спирали тоже соединены поперечными связями. Тропоколлаген практически нерастяжим вследствие очень плотной скрученности его тройных спиралей, а также из-за наличия поперечньгх связей. Тропоколлаген содержит боковые угле- [c.179]

Интересные результаты были получены при исследовании связывания катионов со стереорегулярной полиметакриловой кислотой. Катион Си + был прочнее связан с изотактическим полиионом [869], а ионы магния образовывали более устойчивый комплекс с синдиотактическим полимером [870]. Эти результаты позволяют предположить, что в образовании хелатов участвуют карбоксильные группы, которые удерживаются на строго определенном расстоянии друг от друга за счет предпочтительной конформации цепи главных валентностей. Тогда относительная устойчивость комплекса должна зависеть от геометрии хелата, характерного для данного катиона. Значение предпочтительной конформации цепи главных валентностей было убедительно нродемонстрировано в случаях, когда полимер может подвергаться переходам спираль — клубок. Связыванию катионов щелочноземельных металлов с поли-а-Ь-глутаминовой кислотой, несомненно, благоприятствует спиральная конформация полимерной кислоты [871]. Наоборот, Mg + связан более слабо с нативной спиральной формой ДНК, хотя эта форма связывает Na+ гораздо сильнее, чем денатурированная нуклеиновая кислота [872]. Другая интересная проблема возникает, если связанным компонентом является органическая молекула, имеющая две катионные группы. В этом случае вполне возможно, что расположение катионов в малых молекулах будет совпадать с расположением анионных групп в полимере, и такое соответствие должно приводить к исключительно прочному взаимодействию. По-видимому, такой эффект наблюдался для хон-дроитинсульфата-А [873] и гиалуроновой кислоты [874], которые образуют прочные комплексы с кураре [c.316]

Статистический подход позволяет рассчитать относительную частоту появления каждого аминокислотного остатка в цепи и повторных появлений одних и тех же сочетаний аминокислотных остатков. Таким методом в некоторых белках выявляются многократно повторяющиеся регулярные последовательности. Так, например, в тропоколлагене каждый третий остаток — глицил, после которого следуют пролил или оксипролил. В а-цепи фибриногена 31% всех аминокислот — это серин, глицин и пролин в составе одних и тех же повторяющихся сочетаний. Регулярные последовательности, включающие глицин и пролин, характерны и для других белков, таких как склеропротеины, кератины, двухцепочечный фиброин шелка. С одной стороны, эти последовательности оптимальны для образования правой а-спиральной конформации цепи и упорядоченного расположения гидрофильных и гидрофобных участков на гранях этой спирали (см. рис. 4, раздел 1.2.3). С другой стороны, [c.76]

Таким образом даже в линейных низкомолекулярных углеводородах с малыми боковыми группами корреляция между соседними вращениями играет большую роль, и условие (1.28) не выполняется. Это тем более должно быть справедливо для полимерных цепей с массивными привесками (полнизо-бутилен, полистирол и т. д.), конформации которых, как показывают расчеты и исследование моделей (см. гл. 3), определяются главным образом взаимодействием между их массивными привесками. Указанное обстоятельство подтверждается резким различием в конформациях изо- и синдиотактических цепей типа (— Hj— HR—) в кристаллическом состоянии, обусловленным различным взаимным расположением массивных групп. Кроме того, спиральная кристаллическая конформация изотактических цепей соответствует существенно различным углам поворота двух соседних связей. Вместе с-тем.если предположить независимость вращенийвокруг соседних связей, то, как отмечалось в связи с уравнением (1.21), эти углы должны были быть равны по величине и противоположны по знаку [ 2]. [c.42]

Простейшим примером макромолекул с регулярно расположенными боковыми цепями различной длины являются изотактические полиалке-ны-1. Для ряда изотактических полиаженов-1 были определены температуры плавления [26, 152]. Эти результаты, дополненные измерениями Трафара и др, [ 148], суммированы в табл. 10.10. Довольно высокие температуры плавления начальных членов ряда резко уменьшаются при увеличении длины боковых цепей. Полигептен-1 кристаллизуется в спиральную конформацию (разд. 2.4.2). При увеличении длины боковых цепей резко возрастают трудности эффективной упаковки элементов [c.441]

Результаты всех описанных выше исследований приводят к заключению, что молекула РНК представляет собой одиночную цепочку с нерегулярно расположенными спиральными областями различной длины, суммарная протяженность которых составляет несколько больше поло ины всей длины молекулы. Шпилькообразные повороты цепочки приводят к образованию спиральных участков с антипараллельным направлением цепей (аналогичной структурой обладает ДНК и комплексы гомополирибонуклеотидов). Хотя в РНК переходы из менее упорядоченной в более упорядоченную спиральную конформацию обратимы, идентичны ли спиральные участки новой и исходной конформаций, неизвестно. Существование широкой области переходов связано с наличием коротких, неравномерно распределенных спиральных участков различной длины и стабильности (различие в стабильности обусловливают вариации относительного числа прочно связанных пар оснований). За счет гибких сочленений вся цепь многократно свертывается, благодаря чему образуется компактная конформация, подобная конформации глобулярных белков. Следует отметить, однако, что спиральные участки РНК значительно стабильнее аналогичных участков в белках. Ни одна белковая молекула не смогла бы сохранить свою спиральную структуру при тех силах электростатического отталкивания, которые возникают в РНК нри нейтральных pH из-за наличия отрицательно заряженных фосфатных групп. Двухвалентные катионы существенно уменьшают величину этого электростатического эффекта в РНК. Хотя РНК в природе обычно встречается в комплексах с белками (см. гл. XX), имеются данные, что опи-санные выше упорядоченные формы встречаются также и in vivo. [c.353]

Наконец, третья особенность этой конформации состоит в том, что боковые радикалы аминокислот обращены наружу. Не принимая непосредственного участия в построении углеродного скелета а-спирали, эти радикалы могут способствовать созданию напряжений, несовместимых со спиральной конфигурацией, и разрыву водородных связей, т. е. образованию аморфных участков. Поэтому структура а-спирали позволяет получить максимальную изменяемость белковой структуры и, следовательно, обеспечить исключительное разнообразие химической специфичности белков. Расположение боковых радикалов аминокислот весьма существенно и с другой точки зрения. Если мы представим себе а-спи-раль, построенную из природных -аминокислот (рис. 19), то при 1шправлении вращения слева направо (правая спираль) все боковые цепи будут располагаться вдоль оси от С-конца к Ы-коп-цу, т. е. в направлении, обратном направлению полипептидной цепи. Если же спираль левая, то боковые радикалы будут направлены вдоль оси по направлению полипептидной цепи. Так как на каждый виток спирали приходится 3,6 таких радикалов, то их упаковка и взаимодействие для каждого типа спирали будут совершенно различны. При этом необходимо учесть, что именно это взаимодействие и определяет выбор направления вращения спирали. К сожалению, теория Полинга и Крика не. может ничего сказать о том, каково должно быть это направление, поскольку для построения модели оно совершенно безразлично. Для большинства исследованных полипептидов оказалось, что природные аминокислоты образуют правые спирали они же были обнаружены и в ряде белков. [c.98]

Полосы регулярности. Закономерная упорядоченная последовательность мономерных единиц М образует регулярную цепь, которая может иметь конформацию плоского зигзага или, как эт>.> и бывает в большинстве случаев, спиральную конфо >мацию. При этом с помощью винтовой трансляции мономерньш звенья могут быть переведены друг в друга. Колебательный спектр такой цепи описан в разд. 3. Согласно приведенным там правилам отбора в ИК-спектре проявляются только такие колебания, при которых соседние звенья колеблются в фазе или же сдвиг по фазе равен углу закручивания спирали. Для любого нерегулярного расположения есть бесконечное число сдвигов по фазе. Положение и интенсивность полосы зависят от строения соседних групп и от взаимодействия между ними. Поэтому есть различие между ИК-спектром длинной регулярной цепи, где проявляются только дискретные фазовые сдвиги, н ИК-спектром нерегулярной цепи, в котором полосы шире. Было предложено обозначать как полосы регулярности, те полосы поглощения, которые зависят от регулярной конформации макромолекулы [1897]. [c.94]

Структура поливинилиденфторида. Поливинилиденфторид, в элементарном звене которого содержатся два асимметрично расположенных атома фтора, занимает промежуточное положение в ряду полиэтилен — ПТФЭ. Это выражается, в частности, в относительной легкости перехода его молекулярных цепей из спиральной в плоскую зигзагообразную конформацию и даже в возможности одновременного существования макромолекул с различными конформациями в одном образце. Наиболее подробные исследования структуры ПВДФ проведены в последнее время Е. Л. Гальпериным и Б. П. Космыниным [47]. [c.458]

Таким образом, цепь главных валентностей полимера не имеет пептидных атомов водорода и не может образовывать внутримолекулярных водородных связей. Тем не менее поли-Ь-пролин может существовать в виде н естких спиральных конформаций. Действительно, две такие конформации со спиралями, свернутыми в противоположных направлениях, могут быть стабилизованы в соответствующих растворителях. Доуни и Рендал [327], а также Качальский с сотр. [328] пришли к выводу, что поли-Ь-пролин —- форма, устойчивая в смеси пропанола и 10%-ной уксусной кислоты,— содержит правые спирали с двумя а-углеродами, присоединенными к пептидной связи в 1 цс-конформации. Полагают, что в поли-Ь-пролинеП, устойчивом в большинстве растворителей (воде, уксусной кислоте и т. д.), два соседних а-углерода располагаются в /тгракс-положении по отношению друг к другу, а цепи закручиваются в левые спирали, которые почти на 70% длиннее цепей формы I. На рис. 38 показано расположение атомов в участке цепи, имею- [c.123]

Превращения в спиральную конформацию приводят к ярко выраженному гипохромному эффекту также и в случае нуклеиновых кислот и полинуклеотидов. Сравнительно давно было показано [504], что оптическая плотность (с пиком при 259 м 1) дезоксирибонуклеиновой кислоты на 25—37% ниже оптической плотности сметанных нуклеотидов, полученных в результате каталитического щелочного гидролиза главной полимерной цепи. Однако причина этого изменения стала очевидной лишь после того, как была установлена структура двойной спирали молекулы ДНК. В этой структуре основные хромофоры располагаются параллельно друг другу под прямыми углами, и Тиноко [505] показал, что такое расположение должно привести к наблюдаемому гипохромному эффекту. Это явление наиболее удобно изучать на синтетических полинуклеотидах, цепи которых состоят из звеньев лишь одного типа. Фельсенфельд и Рич [364] обнаружили, что смешение растворов полиадениловой]и полиуриди-ловой кислот, приводящее, как известно, к образованию биспиральной структуры, сопровождается ярко выраженным понижением максимальной оптической плотности при 259 м 1. Таким образом, спектрофотометрическое титрование является удобным методом установления стехиометрии реакции (рис. 62). Позднее было показано [360], что изменения [c.175]

Белок полосы III из мембраны эритроцитов человека представляет собой трансмембранный белок с молекулярной массой около 100 кДа (примерно 800 аминокислотных остатков). Это транспортный белок, две молекулы которого образуют анионный канал для ионов СГ и НСО3, пассивно перетекающих через мембрану в соответствии с градиентами их концентраций [242-244]. Полипептидная цепь белка в а-спиральной конформации несколько раз пронизывает бислой около трети его цепи с N-конца помещена в цитоплазму, а короткий С-концевой участок расположен во внеклеточном пространстве (рис. 1.6). Для того чтобы понять механизм функционирования транспортного белка полосы III, как и механизмы действия других мембранных белков, необходимо знать трехмерную структуру молекулы в условиях липидного бислоя. Для получения такой информации требуется, на первый взгляд, почти невозможное. Во-первых, необходимо отделить трансмембранный белок от липидов и других мембранных белков, не повредив его молекулярной трехмерной структуры, что очень трудно. Во-вторых, из выделенных белковых молекул следует получить, не нарушив их пластической, легко деформирующейся при изменении внешних условий структурной организации, высокоупорядоченный монокристалл требуе-мых размеров, что не всегда удается даже в случае водорастворимых [c.58]

В табл. III.36 приведены энергетические характеристики двух тетра-Пептидов, содержащих одни и те же остатки и обладающих одинаковой по составу основной цепью. Тетрапептиды отличаются только порядком расположения аминокислот в цепи в первом случае - это Phe-Trp-Leu-Ala, а во втором - Leu-Ala-Phe-Trp. Этого обстоятельства оказалось Достаточно для существенного изменения конформационных возможностей Тетрапептида. Из представленных в табл. III.36 результатов расчета 1000 вариантов всех структурных типов каждого фрагмента видно, что у Первого тетрапептида неоспоримым энергетическим преимуществом 9бладает а-спиральная оптимальная конформация. Лучший вариант второго структурного типа fef) уступает ей 4,2 ккал/моль. Конформации с [c.397]

Смотреть страницы где упоминается термин Конформации цепи со спиральным расположением: [c.166] [c.312] [c.357] [c.371] [c.250] [c.316] [c.288] [c.316] [c.392] [c.194] [c.194] [c.113] [c.420] [c.149] [c.17] [c.230] [c.261] [c.349] [c.268] [c.257] [c.259] [c.288] [c.316] [c.392]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология