Структурные флуктуации

Изолированные молекулы белка претерпевают большие структурные флуктуации. При любом термодинамическом описании структуры белка необходимо иметь в виду, что отдельная белковая молекула с окружающим ее растворителем представляет собой очень малую систему [419]. При данной температуре среднеквадратичное значение флуктуаций энергии бЯ системы составляет согласно [420] [c.180]

Имеющиеся данные по рассеянию нейтронов не дают каких-либо доказательств наличия значительного числа "газообразных" мономеров. В лучшем случае мономеры существуют только как неустойчивые или переориентирующиеся молекулы, вызывающие структурные флуктуации в ассоциированных образованиях. [c.250]

Как и в случае общепринятого рассмотрения критических флуктуаций, полезно ввести корреляционную длину I, характеризующую гомогенность системы [12]. В данном контексте дает средний линейный размер участка с аномально высокой (или низкой) концентрацией структурных единиц, определяющих значение Т. С уменьшением температуры переохлажденной жидкости I растет, принимая бесконечно большие значения при Тк- Поскольку структурные флуктуации являются одновременно флуктуациями плотности, в принципе было бы возможно обнаружить их и измерить размеры в сильно переохлажденной жидкости такими, например, методами, как светорассеяние или малоугловое рентгеновское рассеяние. Однако осуществить подобные измерения практически чрезвычайно трудно. [c.28]

Функции корреляции. Рассмотрим теперь динамические корреляции флуктуаций растворенного вещества. Функция времени корреляции для структурных флуктуаций растворенного вещества определяется как [c.35]

ВО время структурных флуктуаций частей и участков глобулы. Это находит свое отражение в зависимости квантового выхода от температуры [c.270]

Подобные структурные флуктуации позволяют низкомолекулярным тушителям флуоресценции, в частности кислороду, диффундировать во внутренние области белка, дезактивируя возбужденные состояния. [c.270]

Материальные точки моделируют атомы, т — их массы, Fj — действующие на них силы. Координаты и скорости всех частиц в исходный момент времени определяют ее поведение в последующие моменты времени. Современные ЭВМ позволяют проводить численное интегрирование таких уравнений для нескольких сотен или тысяч атомов на временах до 10 с. Получающиеся траектории движения всех атомов дают совокупную картину развития структурных флуктуаций во времени. В рассматриваемой механической системе в процессе ее движения сохраняется полная энергия. Температура определяется по теореме о равном распределении кинетической энергии по степеням свободы [c.309]

На рис. 21.18 представлены данные такого рода. Из верхнего графика видно, что площадь пика, присутствующего в спектре денатурированной формы, плавно возрастает с увеличением температуры. Однако пики, соответствующие -2-протонам имидазольных групп в нативной молекуле, меняются не согласованно. Особенно хорошо видно, что в окрестности His денатурация происходит при более низкой температуре, чем в окрестности His . Эти и другие данные относительно изменения химических сдвигов наводят на мысль, что денатурация не является простым процессом, включающим лишь два состояния. В то же время различие между ним и наблюдаемым процессом может быть связано лишь с небольшими структурными флуктуациями. Как бы то ни было, приведенные результаты иллюстрируют возможности метода ЯМР при получении детальной информации. помогающей решить эту сложную проблему. [c.233]

Особенностью поведения сложных систем в состояниях, далеких от равновесия, являются интенсивные процессы самоорганизации, вероятностное поведение многих параметров. Жизнеспособность той или иной системы зависит от ее способности к самоорганизации — адекватной реакции на происходящие изменения на различных структурных уровнях. Вводимые в небольшом количестве в систему новые составляющие приводят к возникновению новой сети реакций между ее компонентами. Новая сеть реакций начинает конкурировать со старым способом функционирования системы. Если система структурно устойчива относительно вторжения новых единиц, то новый режим функционирования не устанавливается, а сами единицы инноваторы погибают. Но если структурные флуктуации приживаются , то вся система перестраивается на новый режим функционирования ее активность подчиняется новому синтаксису [176]. [c.176]

В связи с этим Е. А. Порай-Кошиц [4, стр. 19] указывает, что расчет интенсивностей для полностью беспорядочной сетки и для сетки, в которой упорядоченность флуктуирует в пространстве, не позволит обнаружить никакого различия между кривыми в области обычных углов распределения. В этом случае и теория и эксперимент усредняют структурные флуктуации. Напротив, в области малых углов можно получить известную разницу в ходе кривых, обусловленную небольшим различием в электронных плотностях разноупорядоченных областей сетки. [c.94]

Другие примеры [4, 5, 9, 13—20] стационарная симметрия любого кристалла есть результат усреднения по времени искаженных колебаниями решетки диссимметричных мгновенных состояний. Сегнетоэлектричес-кий кристалл, разбитый на домены, стремится сохранить и даже увеличить симметрию параэлектрической фазы на уровне доменной структуры (симметризации выражаются здесь в дроблении макроскопических размеров образца минимальными периодами повторяемости доменной структуры). Вблизи полиморфного фазового перехода у любого кристалла наблюдаются структурные флуктуации, представляющие собой форму существования высокосимметричной фазы внутри низкосимметричной, и наоборот. Диссимметризация кристалла точечными дефектами сопровождается образованием их симметричных ассоциаций (кластеров) при этом в кристаллических матрицах при стремлении систем к равновесию наблюдается симметризация дислокационных ансамблей, ориентировок твердофазных выделений и т. д. [c.58]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология