Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Триплеты терминирующие

    ОТКРЫТАЯ РАМКА СЧИТЫВАНИЯ. Состоит из ряда триплетов, кодирующих аминокислоты не содержит каких-либо терминирующих кодонов эта последовательность потенциально может транслироваться в белок. [c.524]

    Комплекс [Ф — М — РНК] перемещается с малой части на крупную и садится на п-место. Переход требует затраты энергии, доставляемой гуанозинтрифосфатом (он действует подобно АТФ). Эти процессы носили подготовительный характер. Теперь, когда место а свободно, на него помещается одна из т-РНК со своим грузом какой-либо аминокислоты — и начинается собственно синтез полипептидной цепи. Между концевой аминокислотой [ФМ-РНК] и вновь прибывшей аминокислотой образуется пептидная связь, м-РНК делает шаг вперед , и поэтому место а на рибосоме освобождается ему соответствует теперь уже другой кодон на матричной РНК, и к этому кодону прикрепляется т-РНК, достав шая соответствующую аминокислоту. Например, если на рибосоме свободен кодон ААГ, то на него садится т-РНК с триплетом (антикодоном) УУС. Этот антикодон отвечает аминокислоте — фенилаланину (см. приложение табл. 3), и она входит в состав синтезируемого белка. Снова сдвиг м-РНК, освобождается очередной кодон на м-РНК, пусть это будет, скажем, ЦЦГ к этому кодону может прикрепиться т-РНК, имеющая антикодон ГГЦ. Этот триплет отвечает аминокислоте глицину. Следовательно, в синтезируемой белковой цепи рядом с фенилаланином станет глицин. Соединение аминокислот будет происходить до тех пор, пока на м-РНК не обнаружится бессмысленный кодон (терминирующий), например УАА. Он не соответствует ни одной аминокислоте и играет роль точки, если сравнить белковую цепь с длинной фразой. Постепенное наращивание белковой цепи показано подробнее на цветной таблице П1, где намечен контур рибосомы, но не изображены а и п-места и комплекс ФМ = РНК, играющий роль инициатора синтеза. На рисунке 47 рибосома показана в виде объемного тела. Молекула м-РНК изображена в виде полосы, прикрепленной к [c.169]


    Кодон — триплет нуклеотидов, кодирующий определенную аминокислоту или комплиментарный терминирующей сигнал. [c.462]

    Только 61 триплет кодирует аминокислоты. Остальные три триплета являются терминирующими кодонами, функция которых-прекращать белковый синтез. Им даны случайные названия, отражающие историю их открытия. Триплет UAG называется амбер-ко доном UAA-охра-кодоном и иногда называемый опал-кодо- [c.85]

    КОДОН. Триплет нуклеотидов, соответствующий определенной аминокислоте или терминирующему сигналу. [c.522]

    Одно из, очевидных ограничений заключается в том, что нуклеотидный текст кодирующей области должен допускать представление в виде последовательности триплетов (кодонов), не содержащих терминирующих троек ТАА, TAG, TGA. В этой последовательности частоты встречаемости синонимических кодонов должны соответствовать аминокислотному составу белковой молекулы. [c.82]

    Сведения о последовательности оснований в нуклеиновых кислотах позволяют глубже понять как биологические, так и физические свойства РНК и ДНК. Поскольку генетический код известен, почти всегда можно установить, какая белковая последовательность должна синтезироваться под контролем конкретной нуклеотидной последовательности. Единственная неопределенность имеется в выборе рамки считывания, или фазы триплет-ного кода. Здесь, однако, имеются лишь три возможности, и обычно только при правильном выборе рамки можно получить относительно протяженную последовательность между инициирующим и терминирующим кодонами. Поскольку этих кодонов несколько, а тройки букв образуют всего 64 кодона, случайная последовательность или последовательность с неправильной фазой будет кодировать скорее всего только короткие фрагменты полипептидной цепи между каждыми инициирующими и терминирующими кодонами. [c.158]

    Такое последовательное считывашр и трансляция рибосомой заключенного в мРНК кода продолжается до тех пор, пока процесс не доходит до одного из стоп-кодонов (терминирующих кодонов). Такими кодонами служат триплеты УАА, УАГ и УГА. На этом этапе полипептидная цегп>, первичная структура которой была [c.173]

    Аминокислотная последовательность условного пептида и кодирующие ее триплеты, включая терминирующий кодон [c.426]

    В случае MS2 РНК после терминации трансляции каждого из перечисленных цистронов происходит, по-видимому, диссоциация рибосом от матрицы. Каждый цистрон в соответствующий момент начинает транслироваться в результате независимой инициации свободными рибосомами из среды. Однако ситуация с L-цистроном, очевидно, другая. По каким-то структурным причинам не удается получить эффективной ассоциации рибосом с инициаторным районом L-цистрона на MS2 РНК. Полагают, что инициация трансляции L-цистрона может иметь место вследствие время от времени происходящего спонтанного сдвига рамки (-И) при трансляции конца С-цистрона рибосомами в этом случае рибосомы терминируют на триплете UAA, отстоящем на три нуклеотида к 5 -концу от инициирующего кодона L-цистрона, и, не успев соскочить с матрицы, реинициируют на первом близлежащем триплете AUG (см. рис. 7). Естественно, что продукция L-цистрона должна быть маленькой, как это и есть на самом деле. [c.236]


    Следует специально указать на случаи, когда инициация происходит особенно далеко от 5 -конца цепи мРНК. Так, инициирующий кодон AUG полиовирусной РНК расположен на расстоянии 743 нуклеотида от 5 -конца, и ему предшествуют восемь AUG триплетов во всех трех фазах считывания Эти предшествующие AUG триплеты, однако, находятся не в подходящем структурном окружении (см. выше), а кроме того, вслед за большинством из них на небольших расстояниях имеются терминирующие триплеты, прерывающие трансляцию, если бы она была на них инициирована. Таким образом, даже в рассматриваемом случае [c.254]

    Кодон терминации обязательно присутствует в конце кодирующей части каждой природной мРНК. Иногда можно видеть даже тандем терминирующих кодонов, например в конце цистрона белка оболочки бактериофага MS2, где за терминирующим кодоном UAA следует триплет UAG (см. рис. 6). [c.265]

    Надо сказать, что вне фазы (рамки) считывания триплеты UAA, UAG и UGA в пределах кодирующей последовательности мРНК встречаются существенно чаще, чем в фазе считывания, где имеется, как правило, всего один терминирующий кодон на всю кодирующую последовательность. Поэтому обычно случайный сдвиг рамки в процессе элонгации не может привести к синтезу очень длинного неправильного полипептида и чаще всего приводит к скорой терминации этой неправильной трансляции. В некодирующих участках мРНК, включая межцистронные участки полицистронных РНК, частота терминирующих триплетов обычно также высока. [c.265]

    Терминирующий триплет в рамке считывания может появиться в кодирующей части мРНК в результате мутации. Например, замена G на А в триптофановом кодоне (UGG) приводит к появлению либо UAG, либо UGA замена С на U в глютаминовых кодонах (САА и AG) приводит к появлению либо UAA, либо UAG. Такие мутации называются бессмысленными (nonsense) появление UAG обозначается как янтарная мутация, UAA — охровая , а UGA — опал . Эти мутации приводят не к замене [c.265]

    Проблема специфического фактор - кодонового взаимодействия, вместо кодон-антикодонового взаимодействия, очень интересна. Поразительно, что белок тоже узнает именно триплет нуклеотидов, и узнавание имеет такую же высокую степень специфичности. Более того, при наличии супрессорной тРНК, комплементарной терминирующему кодону, аминоацил-тРНК и фактор терминации равноправно конкурируют за посадку в А-участок рибосомы. Использование различных модифицированных нуклеотидных остатков в терминирующих кодонах указывает на то, что специфичность RF в узнавании кодона очень напоминает специфичность Уотсон — Криковского спаривания оснований, включая Криковское неоднозначное спаривание ( wobble ). Безусловно, структура белкового антикодона представляет собой очень интригующую и важную задачу, в том числе для решения общих проблем белок-нуклеинового узнавания. [c.267]

    Наконец рибосома присоединила последнюю аминокислоту, полностью закончив синтез полипептида, кодируемого мРНК. О терминации полипептида сигнализирует один из трех терминирующих кодонов мРНК, расположенный непосредственно за кодоном последней аминокислоты. Терминирующие триплеты UAA, UAG и UGA не кодируют никакую аминокислоту. Их называют бессмысленными триплетами (нонсенс-триплетами). Первоначально они были обнаружены при исследовании изменения одного-единственного нуклеотида в некоторых кодонах, соответствующих определенным аминокислотам. Это изменение приводило к возникновению нонсенс-мутанитов Е.соИ, для которых была характерна преждевременная терминация синтеза полипептидных цепей. С помощью таких нонсенс-мутантов, по- [c.941]

    Терминация полипептидной цепи. Необходимые факторы РК-1 воспринимает триплеты УАА и УАГ РК-2 воспринимает УАА и У ГА ГТФ. Терминирующие кодоны (бессмысленные, нонсенс-кодоны) не имеют для себя аминоацил-тРНК. Кодоны, поступив в А-участок, воспринимаются факторами РК-1 или РК-2, которые индуцируют пептидилэстеразную активность, вследствие чего отщепляется синтезировавшийся полипептид. Весь комплекс трансляции диссоциирует на составные части. В цитоплазме клеток прокариот с помощью фермента деформилазы происходит отщепление формильной группы от Л -концевого формилметионина синтезированного полипептида часто после завершения синтеза в цитоплазме клеток отщепляется УУ-концевой метионин от синтезированного полипептида (у прокариот и эукариот). На основе взаимодействия радикалов аминокислотных остатков полипептидной цепи спонтанно формируются вторичная, третичная, а у олигомерных белков и четвертичная структуры. [c.317]

    Митохондриальная транслирующая система тоже имеет общие черты с бактериальными белоксинтезирующими системами рибосомы митохондрий чувствительны к антибактериальным антибиотикам, синтез белка начинается с N-формилметионина. Однако есть и существенные различия. Самые поразительные из них выявляются при сопоставлении нуклеотидных последовательностей митохондриальных генов с аминокислотной последовательностью кодируемых ими белков. Например, триплет UGA, который служит в универсальном генетическом коде терминирующим кодоном, в митохондриях млекопитающих и дрожжей кодирует триптофан. Кроме того, отличаются значения нескольких других кодонов, причем здесь есть даже различия между кодами, действующими в митохондриях млекопитающих и дрожжей (табл. 9-4). Эти последние различия обусловлены особенностями митохондриальных тРНК, которые кодируются митохондриальным геномом и свойства которых мы подробнее рассмотрим позже. Почему генетический код в митохондриях отличен от кода бактерий и эукариот, пока не ясно. [c.58]


    Экспериментальная расшифровка кодонов была продолжена в лабораториях М. Ниренберга, С. Очоа, X. Маттеи и Н. Корана (США). К настоящему времени код полностью расшифрован — вскрыты последовательности нуклеотидов всех кодонов аминокислот (см. табл. 12). Установлено 64 кодона. Из 64 возможных триплетов 61 имеет смысл , т. е, кодирует ту или иную аминокислоту, 3 кодона бессмысленны . Это терминирующие кодоны УАА и УАГ и бессмысленные сочетания с пока неизвестной функцией У ГА. [c.287]

    Рамка считывания, содержащая последовательную серию кодонов, соответствующих аминокислотной последовательности, называется открытой. До сих пор мы говорили о кодовых значениях, имея в виду открытую рамку считывания, начинающуюся с какой-то фиксированной точки. Но в чем состоит стартовый сигнал Точно так же, как нонсенс-кодоны используются для терминации белкового синтеза, другой набор кодонов служит для его запуска. Общим сигналом инициации является соответствующий метионину кодон AUG в комбинации с предшествующей ему последовательностью, нужной для прикрепления рибосом к мРНК. В некоторых случаях для инициации используется также кодон GUG, который вопреки коду транслируется как метионин, а не как ва-лин. Таким образом, кодирующая область состоит из кодона AUG (или GUG), следующей за ним серии триплетов, составляющих открытую рамку считывания, и оканчивается терминирующими кодонами UAA, UAG и UGA. [c.63]

    Аналогичное кодон-антикодоновое взаимодействие обнаруживается в случае одной из эукариотических тРНК. Бычья печень содержит тРНК, аминоацилирован-ную серином. Ее антикодоном является триплет ""ССА, который, согласно гипотезе неоднозначного соответствия, может отвечать на триптофановый кодон UGG. Но фактически он узнает только терминирующий кодон UGA. Таким образом, ""С специфически взаимодействует с А. Поэтому в рассмотренном случае использование триплета UGA в качестве терминирующего кодона, возможно, является определенным видом супрессии. [c.99]

    ТЕРМИНИРУЮЩИЙ КОДОН. Один из трех триплетов UAG(amber), VAA(o hre) или UGA, вызывающих терминацию синтеза белка их также называют бессмысленными кодонами. [c.527]

    В прокариотах нуклеотидная последовательность транслируемой области начинается с инициирующего кодона (АТС, реже GTG и очень редко других триплетов) и заканчивается одним из терминирующих кодонов TGA, ТАА или TAG. Инициирующему кодону предшествует так называемый инициирующий сигнал, обеспечивающий правильное прикрепление матричной РНК к рибосоме. Эта сигнальная последовательность длиной 6-8 нуклеотидов состоит преимущественно из А и G и узнается частично комплементарной ей последовательностью 16S-pPHK 30S субъединицы. Инициирующий и терминирующий кодоны лежат в одной "рамке считывания", т.е. число нуклеотидов в разделяющем их фрагменте кратно трем. Каждый из последовательно считываемых за инициирующим кодоном триплетов нуклеотидов (вплоть до терминирующего) определяет, согласно таблице генетического кода, очередной аминокислотный остаток синтезируемой полипептидной цепи. [c.81]

    На уровне 0,5, так же как и в п.3.3, сплошньми линиями отмечены цепочки триплетов, не содержащие терминирующих кодонов. [c.105]

    Белок-кодирующая часть мРНК ограничена инициирующим (обычно — AUG, реже — GUG или UUG) и терминирующими (UAA, UAG и UGA) кодонами. Триплет AUG кодирует метионин, но в начале синтезируемои полипептидной цепочки он определяет постановку измененной аминокислоты — формилметионина. В готовом белке эта аминокислота деформилируется или вообще отщепляется. [c.20]

    Правило оптимальности кодонов распространяется и на терминирующие триплеты в активно экспрессирующихся i Hax предпочтительно используется кодон UAA. [c.322]

    Триплетность Кодовое число равно 3. Три нуклеотидных остатка (триплет) кодируют одну аминокислоту. Терминирующие триплеты — УДА, УАГ, УГА не кодируют аминокислоты и являются сигналами к прекращению синтеза белка [c.74]

    К перечисленным пяти свойствам кода следует добавить еще помехоустойчивость, наличие в нем знаков пунктуации (инициирующие и терминирующие триплеты), серийносвязанность (см. серии кодонов в табл. 23), симметричность [c.298]


Смотреть страницы где упоминается термин Триплеты терминирующие: [c.173]    [c.175]    [c.318]    [c.256]    [c.484]    [c.232]    [c.268]    [c.173]    [c.175]    [c.318]    [c.558]    [c.942]    [c.950]    [c.179]    [c.85]    [c.98]    [c.82]    [c.270]    [c.122]    [c.84]    [c.98]    [c.41]    [c.10]   
Биохимия (2004) -- [ c.452 , c.453 , c.460 , c.467 ]




ПОИСК







© 2025 chem21.info Реклама на сайте