Белки связывающиеся с ДНК

Последовательности этих двух областей частично гомологичны у нескольких белков, связывающихся с ДНК, в том числе у БАК, ас-репрессора и нескольких фаговых репрессоров. Контакты между а-спиралью-3 и ДНК осуществляются с помощью водородных связей, устанавли- [c.215]

Сайт специфические белки связывающиеся с ДНК [c.114]

Особый белок (раскручивающий цепи) осуществляет плавление ДНК. Кроме того, особый класс белков, связывающихся с ДНК, удерживает нити ДНК разделенными. Это так называемые белки, дестабилизирующие двойную спираль. Благодаря действию всех этих белков на ДНК образуется участок локальной денатурации и две вилки , в которых в дальнейшем и происходит репликация (рис. 6.13). [c.129]

Некоторые физические свойства ДНК в растворе плавно меняются при небольших изменениях внешних условий. Эти изменения не связаны ни с разрывом водородных связей, ни с другими сопряженными с денатурацией спирали явлениями. Они отражают скорее всего сдвиг равновесной конформации двойной спирали внутри данного структурного семейства при изменениях концентрации соли или температуры. Для некоторых регулярных последовательностей, таких, как синтетические полинуклеотиды, содержащие только с1А в одной цепи и только с1Т — в другой, определенные структуры оказываются более предпочтительными. Возможно, наличие таких последовательностей в природных ДНК приводит к локальным изменениям структуры. Это могло бы объяснить, как белки, связывающиеся с ДНК, узнают определенные участки двойной спирали без разделения цепей, необходимого для взаимодействия с основаниями. [c.176]

Взаимодействие удаленных друг от друга белков позволяет многим белкам, связывающимся с ДНК, влиять на транскрипцию одного гена. Это весьма гибкая система взаимодействующие регуляторные белки не обязательно должны занимать строго определенное положение друг относительно друга или относительно начала регулируемого гена. Кроме того, поскольку поверхность регуляторного белка, которая взаимодействует с другими белками, отлична от поверхности, контактирующей с ДНК, могут существовать белки с разной специфичностью связывания с ДНК, но с одинаковыми поверхностями, участвующими в белок-белковых взаимодействиях. С другой стороны, может оказаться, что есть белки, которые связываются с одними и теми же участками на ДНК, но поверхности, участвующие во взаимодействии с другими белками, у них различаются. [c.148]

Факторы транскрипции должны выполнять по крайней мере две важные функции связываться со специфическими последовательностями ДНК и влиять на инициацию транскрипции. Опыты с разнообразными белками, связывающимися с ДНК, показали, что специфичность связывания определяется кооперативными аддитивными взаимодейст- [c.125]

О. Неправильно. Считается, что G-островки в промоторах генов домашнего хозяйства существуют потому, что сайт-специфические белки, связывающиеся с ДНК, защищают их от метилирования в клетках зародышевых линий. [c.415]

Хроматография на ДНК-целлюлозе в первую очередь используется для очистки белков, связывающихся с ДНК. Смесь белков и буфере с низкой ионной силой (условия связывания белков с ДНК) пропускают через колонку. Затем колонку промывают для удаления несвязанных белков и элюируют в градиенте возрастания ионной силы. Белки при этом элюируются в порядке З еличения прочности связывания. [c.215]

Рис. 15.19. Регуляторные белки, связывающиеся с ДНК, обладают общими структурш.1ми особенностями. А. Вторичная структура белка его и субъединицы репрессора с1 характеризуются наличием пары одинаково расположенных а-спиральных участков (а2 и аЗ). Б. Ориентация пары а-спиралей обеспечивает точное структурное соответствие размерам и форме больщой бороздки двойной спирали ДНК, где происходит специфическое взаимодействие определенных оснований и аминокислотных остатков. Таким образом, достигается специфичность связывания белка с определенной последовательностью ДНК. (По Вашг R. Т. et ai, 1982. Nature 298, 447.)

ДНК эукариотических клеток имеет столь большую длину, что риск ее запутывания или разрыва очень велик. Вероятно, по этой причине в процессе эволюции возникли гистоны - характерные для эукариот белки, связывающиеся с ДНК и скручивающие ее в компактные и более удобные для ряда клеточных процессов хромосомы (рис. 1-29). Уплотнение хромосом является существенной частью подготовки эукариотических клеток к делению (рис. 1-30). ДНК всех эукариот (за одним небольшим исключением) связана с гистонами. Об исключительно важном значении этих белков свидетельствует тот факт, что они ведут себя крайне консервативно в процессе эволюции некоторые из гистонов гороха идентичны (с точностью до аминокислоты) соответствующим гистонам коровы. [c.40]

Информация, хранящаяся в ДНК, организуется, реплицируется и считывается разнообразными белками, связывающимися с ДНК (ДНК-связанные белки). Некоторые из этих белков связываются по всей длине молекулы относительно неспецифически и участвуют в ее упаковке, не мешая при этом функционированию других белков. Эти упаковывающие белки будут обсуждены ниже (см. разд. 9.1.17). Другие белки объединяются с определенными короткими последовательностями ДНК. которые часто в ходе эволюции оказываются в различных геномах консервативными (см. рис. 10-34). Такие сайт-специфические ДНК-связывающие белки имеют самые разнообразные функции. Некоторые из них, вероятно, участвуют в сворачивании длинной молекулы ДНК с образованием различных доменов, другие способствуют инициации репликации ДНК многие из них контролируют транскрипцию генов. Каждый тип клеток многоклеточного организма содержит разнообразную смесь таких регуляторних белков. Действуя совместно, они определяют характер экспрессии различных генов (см. разд 10.2.8). [c.101]

Наиболее изученные структурные белки хромосом - это несомненно гистоны, которые имеются только в эукариотическвх клетках. Количество их в клетках столь велико, что у эукариот принято делить белки, связывающиеся с ДНК, на два класса гистоны и негистоновые белки хромосом. Комплекс обоих классов белков с ядерной ДНК клеток эукариот известен под названием хроматин. Гистоны присутствуют в таких огромных количествах (около 60 млн. молекул каждого типа на клетку по сравнению с 10000 на клетку для типичного сайт-специфического белка), что их общая масса в хромосоме примерно равна содержанию ДНК. [c.110]

Гистоны представляют собой небольшие осибвные белки, связывающиеся с ДНК в хроматине. Они содержат относительно много положительно заряженных аминокислот, которые обеспечивают известную рлектростатическую стабилизацию хроматина путем взаимодействия с отрицательно заряженными фосфатами ДНК. [c.54]

Каждый из указанных элементов энхансера SV40 наряду с другими 1<ис-действующими регуляторными последовательностями представляет собой сайт связывания одного или нескольких факторов транскрипции. По-видимому, все белки, связывающиеся с ДНК, и вспомогательные белки, участвующие в белок-белковых взаимодействиях, формируют комплекс, который активирует РНК-полимеразу II с тем, чтобы она могла шшциировать транскрнп- [c.53]

Как объяснить участие широко распространенных белков, связывающихся с ДНК, в специфичной для клеток печени экспрессии промоторов гена ALB Возможно, в основе этого феномена лежат особенности присоединения неспецифических факторов, а именно-их связывание по соседству с белком HNF-1, специфичным для клеток печени. Другое возможное объяснение заключается в том, что DE-связывающие белки являются гепатоцитспеци-фичными факторами транскрипции, относящимися к семействам С/ЕВР и NF-1. Напомним в связи [c.67]

Ж. В клетках эукариот содержится большой набор , представляющих собой белки, связывающиеся с ДНК и специфичные к определенной нуклеотидной последовательности их основная функция состоит во включении и выключении генов. [c.159]

О. СО-островки в промоторных областях генов доманшего хозяйства сохранились в ходе эволюции благодаря тому, что сайт-специфические белки, связывающиеся с ДНК, защищают 5-метилцитозин в этих островках от случайного дезаминированш и превращения в Т-нуклеотиды. [c.172]

Метод впервые был применен Брюсом Альбертсом для обнаружения белков, связывающихся с ДНК, в Е. oli, инфицированной фагом Т4 (рис. 8-25). [c.215]

Впервые сайт-специфические белки, связывающиеся с ДНК, были обнаружены у бактерий. С помощью генетического анализа у этих микроорганизмов удалось доказать существование регуляторных белков, таких как репрессор 1ас-оперона, репрессор бактериофага лямбда и сго-белок. Эти белки были выделены при последовательном фракционировании клеточных экстрактов на хроматографических колонках, а специфически связывающие их участки ДНК определены методом футприн-тинга (см. разд. 4.6.6). Аналогичными методами были выделены и охарактеризованы пфвые сайт-специфические ДНК-связывающие белки у эукариот Т-антиген вируса ЗУ4о, фактор транскрипции ТРИМ и рецептор стероидного гормона. [c.103]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология