Комплексообразование фермента с ингибитором

Рассмотрим характер конформационных изменений, возникающих при комплексообразовании карбоксипептидазы А с субстратоподобным ингибитором [15]. В активном центре свободного фермента (см. рис. 5) имеется система водородных связей (пунктир), которая простирается от Aгg-145 через амидные связи полипептидной цепи (01и-155, А1а-154, 01п-249) и молекулу воды (она не указана на рис. 5) до фенольного гидроксила Туг-248. При контакте этого же фермента с квазисубстратом глицил- -тирозином (см. рис. 7) электростатическое взаимодействие свободной карбоксильной группы квазисубстрата с гуанидиновой группой Aгg-145 (пунктир) вызывает смещение последней на 2 А (по сравнению с ее положением в свободном ферменте). Более того, это смещение одного остатка влечет за собой нарушение всей системы водородных связей, что приводит к повороту боковой цепи Туг-248 с перемещением ее фенольного гидроксила на 12 А. В результате между ней и амидным атомом азота в молекуле квазисубстрата образуется водородная связь (пунктир на рис. 7). [c.24]

Влияние среды на гидрофобное взаимодействие активного центра химотрипсина с субстратами и ингибиторами. Исследование эффектов среды — это классический подход к изучению природы комплексообразования. В-приложении к химотрипсину результаты таких исследований подтвердили гидрофобный характер фермент-субстратных взаимодействий. [c.143]

Эта теория требует, чтобы промежуточный комплекс был реакционноспособным и нестабильным, и, следовательно, весьма маловероятно, чтобы какой-либо промежуточный комплекс удалось выделить и непосредственно изучить. С другой стороны, эта теория постулирует, что ингибиторы действуют, кроме того, путем комплексообразования с ферментом, давая относительно стабильные соединения. Успешное выделение и идентификация некоторых соединений ингибитор — фермент дают существенное подтверждение теории. Такие комплексы образуются между трипсином 114] или химотрипсином [15] и ингибитором следующего строения . 0 [c.112]

Этот метод основан на использовании специфичности взаимодействия, лежащего в основе биологической функции фермента. В качестве избирательного адсорбента используются иммобилизованные иа носителе ферменты или ингибиторы (лиганды). Иммобилизованный фермент избирательно связывает соответствующий ингибитор, а иммобилизованный ингибитор избирательно связывает соответствующий фермент. Связь между иммобилизованным ферментом и ингибитором осуществляется обычно за счет нековалентных связей разного типа (водородные связи, комплексообразование, межмолекулярные специфические и неспецифические взаимодействия). Контакты между молекулами данного фермента и соответствующего лиганда (ингибитора), обусловливающие высокую избирательность сорбции, программируются определенным пространственным расположением функциональных групп именно данного фермента, его уникальной геометрической и химической структурой. Фермент связывается с ингибитором по типу ключ — замок . В этом смысле говорят о комплементарности молекулярных структур иммобилизованного фермента и ингибитора. Десорбция фиксированного так фермента или ингибитора легко осуществляется обычно соответствующим изменением pH элюента. [c.249]

Химическая релаксация при комплексообразовании фермента с лигандом. Рассмотрим принципы релаксационной кинетики на примере простейшей реакции комплексообразования активного центра фермента с каким-либо лигандом А (субстратом, ингибитором, эффектором) [c.206]

При а = 1, Р = О, т.е. когда ингибитор связывается с фермент-субстратным комплексом так же эффективно, как и со свободным активным центром, но комплексообразование приводит к потере реакционной способности, имеем [c.204]

Как конкурентные, так и неконкурентные игибиторы могут быть обратимыми и необратимыми. Первые характеризуются равновесным комплексообразованием, вследствие чего при снижении концентрации ингибитора активность фермента восстанавливается. Вторые связываются с ферментом с образованием столь устойчивых комплексов, что их диссоциация с регенерацией свободного фермента црактически исключена. [c.431]

Очень важны каталитические реакции в биохимическом анализе. Многочисленные химические реакции, получившие название энзиматических (ферментативных), катализируются энзимами (ферментами) — природными катализаторами процессов, протекающих в живых организмах. Выделить эти природные катализаторы трудно, иногда невозможно, поэтому о концентрации их судят прежде всего по их каталитическому действию, по степени ускорения ими соответствующей химической реакции. Механизм действия катализаторов такого типа очень сложен, но, по-видимому, стадия комплексообразования на одном или нескольких этапах энзиматических реакций все-таки обязательна. Часто действие отдельных ионов металлов в биохимических реакциях близко к действию энзимов (сложные органические реакции декарбоксилирования щавелевой и уксусной кислот катализируются ферментами и ионами двухвалентных марганца, цинка, кадмия, никеля и др.). Такие реакции могут быть использованы также для определения отдельных ионов металлов. Чувствительность их невелика, но они позволяют определять ионы с заполненной электронной рболочкой (кальций, цинк, кадмий и др.). Некоторые типы металлов действуют как активаторы или ингибиторы ферментативных реакций. Это свойство металлов тоже используется в аналитической химии. [c.46]

Центры связывания гемина и нестероидных противовоспалительных препаратов на активном центре РСН-синтетазы взаимонезависимы. Как известно, простетической группой, осуществляющей окислительно-вос-становительный катализ в активном центре РСН-синтетазы, является гемин. Не заключается ли ингибирующее действие противовоспалительных лекарственных препаратов в вытеснении гемина из активного центра фермента Основанием для постановки этого вопроса является тот факт, что в комплексообразовании гемина принимает участие карбоксильная группа лиганда. Ответ на этот вопрос дает исследование зависимостей скоростей реакций от концентрации гемина при различных концентрациях ингибитора. [c.218]