Уникальные гены

Уникальные гены и генные семейства [c.77]

Сколько уникальных генов экспрессируется [c.232]

Первое предположение, касающееся этой части генома, состоит в том, что основная часть функции кодируется несколькими генами, а не уникальным геном, как казалось ранее. Второе предположение заключается в том, что значительное количество ДНК не несет кодирующей функции, находясь либо внутри генов (в виде интронов), либо между ними (поскольку кластеры генов могут быть достаточно протяженными и при этом находиться на значительном расстоянии друг от друга). Это чрезвычайно большое количество ДНК только косвенным образом связано с фунционированием генов. [c.280]

Примерно 70% ДНК самых разнообразных эукариот представляет собой уникальные последовательности. Как расположены эти уникальные гены относительно повторяющихся последовательностей Анализ эукариотических хромосом различными методами показал, что уникалыше последовательности обычно чередуются с умеренно повторяющимися последовательностями, длина которых в типичном случае составляет 300 пар оснований. Существует несколько тысяч различных умеренно повторяющихся последовательностей. Они повторяются в геноме несколько сот раз и в совокупности составляют 20% ДНК. Функция рассеянных, умеренно повторяющихся последовательностей ДНК неизвестна. Возможно, они служат участками связывания специфических регуляторных макромолекул, которые могут контролировать транскрипцию соседних уникальных структурных генов. [c.145]

Число фрагментов (независимых клонов), необходимое для создания библиотеки, гарантированно представляющей все уникальные гены, обратно пропорционально среднему размеру клонируемых фрагментов и прямо пропорционально общему количеству генов данного организма. Числа, приведенные выше, даны для библиотек с 99%-ной вероятностью представляющих полный геном при размере клонируемых фрагментов 2-10 пар нуклеотидов. Различия в необходимом числе индивидуальных клонов отражают различную степень сложности геномов соответствующих организмов. [c.42]

Рис. 4.37. Нормальные глобиновые гены человека. Цепи Р-, 5-, 8- и -глобинов кодируются уникальными генами. Гены, кодирующие цепи а-и у-глобинов, дуплицированы. Две у-цепи-продукты генов НЬ у и НЬ°у-отличаются друг от друга по одному аминокислотному остатку.

Обнаружение множественных копий транскриптов гена в цитоплазме фиксированных клеток в отличие от выявления уникальных генов сравнительно слабо зависит от удельной актив- [c.306]

В мозге млекопитающих экспрессируется несколько десятков тысяч уникальных генов, из которых не менее половины имеют мозгоспецифический характер экспрессии. [c.36]

Любой индивидуальный ген занимает лишь небольшую часть генома живого организма. В то же время размер генома даже наиболее просто организованных бактерий в среднем составляет 2-106 П.О., а суммарный размер молекул ДНК, составляющих гаплоидный геном человека и высших животных, по крайней мере, на три порядка больше. Из этого следует, что уникальные гены, представленные в гаплоидном геноме только одной копией, затеряны среди других последовательностей генома, и для работы с индивидуальными рекомбинантными ДНК требуется их очистка от ненужного генетического материала. Такая задача в генной инженерии решается через создание репрезентативных (представительных) клонотек последовательностей нуклеотидов ДНК или, иначе говоря, клонотек генов. [c.155]

Многие белки, синтезирующиеся в больших количествах, кодируются уникальными генами [c.144]

Аналогичный прием был использован для исследования экспрессии уникальных генов яйцевода [Mizuno, Сох, 1979]. Здесь вели отбор меркурированной ядерной РНК. Варьируя продолжительность инкубации с большим избытком меркурированной РНК, при помощи колонки тиол-сефарозы можно отделять фрагменты ДНК, кодирующие редко или обильно представленные мРНК [Bajwa et al., [c.439]

Расчеты показывают, что для специфичного связывания с геном в геноме, иап(жмер для бактериофага >., достаточна длина 12 нуклеотидных звеньев, последовательность 15 звеньев идентифицирует уникальный ген в дрожжевом геноме, а 18—20-членные олигонуклеотиды используют для поиска генов в банке генов млекопитающих. [c.379]

РНК- (или ДНК-) зонд участвует в реакции так, как если бы он просто входил в состав фракции последовательностей, с которой он транскрибировался. Эту фракцию выявляют, сравнивая кривую гибридизации радиоактивного зонда с кривой реассоциации всей ДНК. Поэтому значения при которых гибридизуется меченая РНК, могут быть использованы для определения частот повторяемости соответствующих последовательностей генома. Когда зондом служит индивидуальная мРНК, она гибридизуется при единственном значении СоЬ/г, зависящем от частоты повторяемости гена или генов, представляющих ее в геноме. Для уникального гена эта величина будет такой же, как для неповторяющейся ДНК, в то время как для повторяющихся генов будет наблюдаться соответствующее уменьшение значения При использовании популяции молекул мРНК каждая мРНК гибридизуется при определенном значении Со х/г так, что кривая в целом представляет собой сумму кривых гибридизации индивидуальных компонентов. Такую кривую можно разложить на составляющие ее компоненты так же, как и кривую реассоциации самой ДНК генома. [c.231]

Аналогичная проблема возникает при исследовании уникальных генов. В случае генов, которые транскрибируются не непрерывно, проблема заключается в том, что в клеточной популяции в каждый данный момент транскрибируются только некоторые гены. Для того чтобы преодолеть эту трудность, сравнивают сумму гибриди-зующихся с зондом последовательностей в мономерных фрагментах и в целой ДНК. При использовании зондов, соответствующих индивидуальным генам или популяциям мРНК (или в этом случае сателлитной ДНК), одни [c.380]

Какого бы типа векторные плазмиды ни использовались, для эффективного инициациирования тракскрипции необходимо, чтобы в их составе присутствовал дрожжевой промотор. Чаще всего используют гликолитические промоторы. Поскольку ферменты гликолиза, несмотря на то что они кодируются уникальными генами, составляют от 1 до 5% суммарного клеточного белка, можно было предположить (и зто оказалось верно), что промоторы соответствующих генов относятся к разряду сильных промоторов. Другое необходимое условие успешной экспрессии — это эффективное терминирование транскрипции. Дрожжевые клетки обычно узнают терминаторные последовательности млекопитающих, однако с точки зрения оптимизации системы имеет смысл ввести в вектор дрожжевой терминатор (рис. 7.1). Промотор и терминатор разделены уникальным сайтом рестрикции, что позволяет реализовать стандартный путь создания рекомбинантной конструкции с интересующим структурным геном. [c.215]

Обмен и функции нуклеиновых кислот клеток нервной системы характеризуются особенным разнообразием экспрессируемых уникальных генов. Среди них есть гены, определяющие синтез большого числа нейроспеиифических белков. Временные и стабильные перестройки систем экспрессии генов являются важным элементом механизмов памяти и других высших функций центральной нервной системы. [c.6]

В этом случае в принципе подходят общие приемы фотографирования, гибридизации и блотинга. Однако необходимы некоторые модификации для увеличения интенсивности сигнала и для уверенной гибридизации с уникальными генами млекопитающих (табл. 11). Процедура блотинга более капризна , чем процеду- [c.78]

Можно посчитать, что при обычной гибридизации in situ с использованием меченного тритием зонда с удельной радиоактивностью 10 распад./мин на 1 мкг уникальный ген размерами около 10 пар оснований обеспечит образование одного зерна серебра на автографе после 100 дней экспозиции. Это. безусловно, слишком долгий срок, неприемлемый еще и из-за неблагоприятного отношения сигнал/шум в этих условиях. [c.306]

ПИЮ ДНК на фоне 1 мкг неспецифической ДНК или (с помопдью ОТ-ПЦР) небольшое количество РНК, образовавшейся в результате транскрипции уникального гена. Поскольку метод не требует полного разрушения клеток или тканей, что необходимо для проведения гибридизации по Саузерну или Северного (Northern) блоттинга, с помощью ПЦР in situ удается идентифицировать и локализовать клетки, обладающие исследуемыми последовательностями, и определить их количество. [c.214]

Геиы сывороточного альбумина и а-фетопротеина. У зародышей млекопитающих среди белков сыворотки крови преобладает а-фетопротеин, а после рождения основным белком становится сывороточный альбумин (разд. 8.3.д). Оба белка синтезируются в печени и каждый из них кодируется уникальным геном. У мыщей эти два гена сцеплены с образованием тандема длиной 15 т.п.н. тандем локализован в хромосоме 5, причем альбуминовый ген находится перед геном а-фетопротеина. Хотя эти гены значительно дивергировали и не гибридизуются, по своей структуре они достаточно сходны и можно предположить, что они образовались в результате тандемных реитераций и последующей дивергенции. Например, положение четырнадцати вставочных последовательностей и длины пятнадцати экзонов в обоих генах очень близки (структура гена а-фетопротеина показана на рис. 9.20./1). У человека два упомянутых гена, сцепленных с третьим членом семейства [геном витамин D-свя-зывающего плазматического белка-группоспецифичного компонента (G )], локализованы в длинном плече хромосомы 4. [c.184]

Вирусы имеют уникальный геном, так как содержат либо ДНК, либо РНК. Поэтому различают ДНК-содержащие и РНК-содержащие вирусы (табл. 2.1). Они обычно гаплоидны, т.е. имеют один набор генов. Геном вирусов представлен различными видами нуклеиновых кислот дву нитчатыми, однонитчатыми, линейными, кольцевыми, фрагментированными. Среди РНК- [c.37]

Существование у эукариот повторяющихся генов и их чередование с уникальными генами не имеют никаких аналогий у прокариот. Еще одно удивительное отличие в организации генома - присутствие у высших эукариот вставочных последовательностей практически во всех генах, кодирующих белки. Как уже обсуждалось (разд. 26.12), эти вставочные последовательности интроны) транскрибируются вместе с кодирующими последовательностями экзонами), а затем удаляются в процессе образования зрелой мРНК. Число интронов в изученных до сих пор разорванных генах колеблется от 2 до 17 (табл. 29.5 и рис. 29.27). Некоторые интроны имеют большую длину. Например, ген -глобина мыши содержит нитрон длиной 550 пар оснований, т.е. он длиннее, чем его экзоны. Два фрагмента иммуноглобулинового гена разделены еще более длинным нитроном-длиной 1250 пар оснований. В неко- [c.145]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология