РНК-полимераза ТАТА-последовательность

ТАТА-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ (БЛОК ХОГНЕССА). А—Т-богатая семичленная последовательность, находящаяся на расстоянии около 25 п. н. перед стартовой точкой каждой транскрипционной единицы, транскрибируемой РНК-полимеразой II вероятно, необходима для такого расположения фермента, при котором он может осуществлять правильную инициацию. [c.527]

Рассмотренные эксперименты убедительно свидетельствуют о том, что район, содержащий ТАТА-последовательность, образует функционально важные контакты с РНК-полимеразой II, необходимые для ориентации фермента в положении, позволяющем ему начать транскрипцию с правильной точки. Точное функциональное значение более отдаленных участков, отмеченных на рис. 16.4, представляется не столь очевидным. Соблюдение фиксированного расстояния между дистальными участками и ТАТА-последовательностью не является необходимым условием эффективной транскрипции (вспомним, что расстояние между участками — 10 и - 35 в прокариотических промоторах, напротив, является критическим). Об этом свидетельствуют результаты экспериментов, отраженные на рис. 16.5. Транскрипционная активность некоторых мутантов указывает на то, что РНК-полимераза II не образует контактов с дистальными последовательностями и ТАТА-последовательностью одновременно и что другие компоненты, влияющие на транскрипцию, не имеют специфического сродства к дистальным участкам, а вступают во взаимодействие с РНК-полимеразой, зафиксированной в области ТАТА-последовательности. Если бы такие контакты были необходимы, то изменение расстояния между соответствующими участками (см. рис. 16.5) оказывало бы существенное влияние на эффективность транскрипции. Возможное функциональное значение дистальных последовательностей будет обсуждаться в дальнейшем. [c.213]

У многих эукариотических генов, кодирующих белки и транскрибируемых РНК-полимеразой II, непосредственно перед сайтом инициации транскрипции находится последовательность, называемая ТАТА-бокс . [c.198]

Таким образом, представленные результаты свидетельствуют о том, что так же, как и в случае прокариотических генов, участки ДНК, пред-ществующие последовательностям эукариотических генов, необходимы для регуляции экспрессии этих генов. Однако в отличие от прокариотических генов некоторые из этих участков могут использоваться для регуляции структуры хроматина, в то время как другие могут участвовать в регуляции структуры самой ДНК, выступая в качестве необходимых компонентов в процессе точного взаимодействия РНК-полимеразы с ТАТА-последовательностью перед началом транскрипции гена. [c.223]

Синтез первичных транскриптов. Вскоре после попадания вирусной ДНК в клеточное ядро начинается транскрипция района EIA (рис. 159). Этот район содержит регуляторные элементы, в частности ТАТА-последовательность и энхансер, обеспечивающие эффективное считывание при помощи РНК-полимеразы II. После процессинга первичных транскриптов (см. с. 305), выхода образовавшихся мРНК в цитоплазму и их трансляции появляется несколько [c.303]

Промотор содержит последовательность, обогащенную нуклеотидами Т и А (ТАТА-последовательность), узнаваемую белком ТАТА-фактором. РНК-полимераза присоединяется к промотору, если ТАТА-последовательность связана с ТАТА-фактором. Матрицей для синтеза РНК служит одна из цепей ДНК промотор с ТАТА-фактором обеспечивают узнавание РНК-полимеразой транскрибируемой цепи ДНК и первого нуклеотида транскрибируемого гена. Связывание РНК-полимеразы с промотором и вызванные этим конформационные изменения повышают сродство РНК-полимеразы к факторам инициации. Присоединение этих факторов приводит к локальному расхождению нуклеотидных цепей ДНК расхождение включает около 10 нуклеотидных пар, т. е. примерно один виток спирали. [c.128]

Активация промотора происходит с помощью белкового фактора (ТАТА-фактора), который получил свое название потому, что взаимодействует со специфической последовательностью нуклеотидов промотора ТАТА. Присоединение ТАТА-фактора облегчает взаимодействие промотора с РНК-полимеразой. Присоединение РНК-полимеразы к промотору увеличивает сродство фермента к факторам инициации (А, В), которые инициируют раскручивание примерно одного витка двойной спирали ДНК. [c.69]

Кроме факторов, необходимых для функционирования энхансеров и различающихся для разных генов, в транскрипции большинства клеточных и вирусных генов класса II участвуют дополнительные белки, которые помогают направлять РНК-полимеразу II к соответствующим сайтам инициации. Вопрос о том, находятся ли эти белки среди субъединиц, которые обычно бывают связаны с РНК-полимеразой II, или они относятся к числу вспомогательных факторов транскрипции, которые присоединяются и отсоединяются во время инициации, пока не решен. Относительная эффективность формирования комплекса инициации и его стабильность зависят от присутствия ТАТА-подобной последовательности в окрестности пары оснований [c.54]

Все эти регуляторные элементы позволяют хозяйской РНК-полимеразе II осуществить эффективную транскрипцию ранних генов вскоре после попадания ДНК этого вируса в клеточное ядро. В результате процессинга ранних транскриптов (см. с. 302) образуются мРНК для ранних белков, а затем и сами эти белки. Один из них — Т-антиген — играет центральную роль в последующей перестройке транскрипции вирусного генома. Он вызывает ряд эффектов. Во-первых, взаимодействует с участками вирусной ДНК, связывающими Т-антиген (сильнее всего с участком и слабее всего с участком ]11 см. рис. 158). В результате угнетается транскрипция ранних генов, в том числе и гена, кодирующего Т-антиген, Таким образом, Т-антиген проявляет здесь свойства репрессора, синтез которого подчиняется транскрипционной аутогенной регуляции. Впрочем, транскрипция ранних генов на поздней стадии прекращается не полностью. Она продолжается, хотя и со значительно. меньшей эффективностью, но при этом стартовая точка транскрипции заметно смещается, так что ТАТА-элемент оказывается теперь внутри транскрибируемой последовательности (рис. 158). Механизм, обеспечивающий позднюю транскрипцию ранней области с новой стартовой точки, не расшифрован. [c.301]

Последовательности ТАТА и ЦААТ в зоне промотора способствуют правильному расположению РНК-полимеразы на матрице ДНК. Энхансеры, локализованные на значительном удалении от зоны промотора, участвуют в регуляции процесса транскрипции. Сразу после начала транскрипции первый нуклеотид с 5 -конца подвергается модификации (метилированию гуанина), которая называется кэпированием. Поэтому первый нуклеотид, стартовая точка гена, называется кэп-сайт. Сигнал ААТААА (последняя последовательность, кодируемая РНК-полимеразой) способствует блокированию З -конца мРНК. [c.459]

Мы точно не знаем, какая особенность последовательности ДНК в пределах этой границы необходима для узнавания РНК-полимеразой. Поскольку стартовая точка далеко не всегда попадает в эту область, можно заключить, что от геометрии комплекса зависит, в каком месте происходит инициация. Возможно, когда фермент связывается слева от стартовой точки, комплекс способен вытягиваться по направлению хода транскрипции. Блок ТАТА всегда расположен внутри промоторной области его особое значение для транскрипции подтвердилось в опытах с введением двух мутаций в ген, кодирующий ко-нальбумин у цыпленка. Замена Т в третьей позиции блока Хогнесса на G приводит к возникновению мутации, сильно ослабляющей транскрипцию гена. Эффект этот обусловлен не просто изменением состава пар оснований, так как замена, приводящая к появлению А, оказывает такое же действие (при этом только изменяется ориентация пары Т—А). Следовательно, важное значение имеет, видимо, точная последовательность блока ТАТА. Как было показано, этой области достаточно для инициирования транскрипции in vitro. Об этом свидетельствует тот факт, что последовательность положения от — 32 до — 12, относящаяся к области поздних генов транскрипционной единицы аденовируса, встроившись в различные участки ДНК бактериальной плазмиды, способна инициировать транскрипцию на расстоянии 30 п. н. от места своего включения. [c.150]

Рядом со стартовой точкой расположена область, содержащая блок ТАТА. В результате делеции этой области процесс выбора стартовой точки приобретает более неусгойчивый характер, хотя наблюдаемое при этом подавление транскрипции относительно невелико. Поэтому значение данной последовательности, вероятно, состоит в такой фиксации РНК-полимеразы, при которой она может инициировать транскрипцию в надлежащем сайте. Это согласуется с имеющимися данными о существовании промоторов, исходно лищенных последовательности ТАТА. В результате синтезируемые мРНК могут начинаться более чем в одной точке вместо обычной ситуации, когда используется единственная стартовая точка. [c.153]

Важным фактором транскрипции для многих промоторов РНК-полимеразы II служит TFI1D. Он представляет собой большой белковый комплекс, который обычно называют ТАТА-фактор, так как он может связываться с консервативной АТ-богатой последовательностью, называемой ТАТА-бокс, которая расположена примерно за 25 нуклеотидов до сайта начала транскрипции. Механизм действия ТАТА-фактора, стимулируюшего транскрипцию полимеразой IL представлен на рис. 9-69 [c.147]

Рис. 9-69. Минимальные условия для узнавания промотора молекулой эукариотической РНК-полимеразы II. Чтобы промотор был узнан полимеразой, необходимо, чтобы фактор связывания с ТАТА-боксом (TFIID) образовал стабильный транскрипционный комплекс Консенсусная последовательность ТАТА-бокса следующая T82AQ7T93A85 (А или Т)8з числа указывают на вероятность (в процентах) присутствия указанного

Рис. 2.90. Единичная нуклеотидная цепь ДНК с характерной специфической последовательностью оснований. На 5 -конце, где начинается транскрипция, обозначены два характерных участка СААТ и ТАТА (80 и 30 п.н.). По аналогии с бактериальным геномом предполагают, что последовательность СААТ служит сайто.м узнавания для РНК-полимеразы, а участок ТАТА является промоторным для индуцируемой полимеразой транскрипции. ДНК транскрибируется в комплементарную последовательность РНК, включая интроны. Затем РНК подвергается процессингу, интроны удаляются, 5 -конец кэпируется , а З -конец закрывается последовательностью poly А. После этого созревшая мРНК проходит через ядерную мембрану и прикрепляется к рибосоме, где генетическая информация транслируется в белковую последовательность.

ЦИИ. Точная транскрипция с этого сайта определяется прилежащей 5 -последовательностью, расположенной на участке 32—16 нуклеотидов от точки инициации. Этот участок содержит последовательность ТАТААААС, которая отчетливо гомологична функционально родственному Прибнов-боксу (ТАТААТ), расположенному обычно на расстоянии около 10 пар оснований от точки начала синтеза прокариотических мРНК. РНК-полимераза II, вероятно, связывается с ДНК в области ТАТА-бокса и начинает синтез РНК примерно через 32 нуклеотида — у остатка тимидина, находящегося в окружении пуриновых нуклеотидов (рис. 39.7). Таким образом, ТАТА-бокс, вероятно, является именно тем сигналом, который указывает, где должна начаться транскрипция. [c.86]

Пока остается нерешенным главный вопрос каков механизм влияния кислых доменов активации на транскрипцию Поскольку уже упоминавшиеся домены активации функционируют в самых разных гетерологичных системах (например, в клетках Drosophila, растений, дрожжей и млекопитающих), они, по-видимому, взаимодействуют с каким-то одним компонентом комплекса транскрипции. Так, активация могла бы происходить в результате связывания кислых доменов с основными гистонами в нуклеосомах, которое влияет на поведение кислых доменов при их взаимодействии с промоторами. Не исключено также, что домены активации контактируют с основным доменом РНК-полимеразы II или одного из белков комплекса транскрипции и стимулируют сборку этого комплекса или повышают его активность. Полученный с помощью ДНКазы I отпечаток транскрипционного комплекса в области ТАТА-блока изменяется, когда по соседству связываются факторы транскрипции млекопитающих. Аналогичные изменения в отпечатке наблюдаются в том случае, когда рядом с ТАТА-блоком находится последовательность UASgal а ДНК-связывающий домен GAL4 присоединяется к встроенному в ДНК синтетическому сегменту. [c.135]

Ранний промотор вируса 8У40 устроен относительно сложно. Он содержит характерный для эукариотических промоторов ТАТА-бокс (блок Хогнесса) на расстоянии 30 пн от точки инициации транскрипции (см. 4.1). Дополнительные элементы промотора расположены на расстоянии 115 пн от точки инициации и представляют собой три прямых повтора последовательности длиной 21 пн (рис. 14.2). С этой областью связывается клеточный фактор 8Р1. Затем 8Р1 взаимодействует с другими белками, в результате чего формируется комплекс, необходимый для эффективной транскрипции РНК-полимеразой II. [c.354]

Смотреть страницы где упоминается термин РНК-полимераза ТАТА-последовательность: [c.48] [c.85] [c.297] [c.46] [c.49] [c.209] [c.191] [c.86] [c.85] [c.64] [c.54] [c.54] [c.89] [c.167] [c.258] [c.55] [c.147] [c.191] [c.144] [c.157] [c.26]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология