Транскрипция стартовая точка

Репрессор регулирует активность трех промоторов фага, из которы.х два, Рям и Рр, располагаются рядом. Транскрипция с промоторов Рк.ц и Рн идет в противоположных направ-лениях.. Между стартовыми точками этих промоторов располагаются три участка связывания репрессора Ок,, Ор. и Ор, (рис. 88). Участок Ор, перекрывается с участком связывания РНК-полимеразы с промотором Ррм. поэтому связывание репрессора с Ой, мешает связыванию РНК-полимеразы с Рк.м н тем самым подавляет транскрипцию. [c.145]

Сердцевина содержит, в частности, многие десятки молекул вирус-специфической ДНК-зависимой РНК-полимеразы. Этот крупный многокомпонентный фермент распознает промоторы ранних генов. Промоторы сильно обогащены А-Т-парами и удалены от стартовой точки транскрипции примерно на 30 п. н, клеточные РНК-полимеразы эти промоторы не узнают . Регуляторные элементы типа энхансеров в геноме вируса осповакцины не описаны. [c.307]

Как уже говорилось, в случае фагов Т4 и А, в некоторых генах транскрипционной матрицей служит одна из двух комплементарных цепей ДНК, а в некоторых генах —другая. Кроме того, как мы уже упоминали, предвосхищая содержание гл. XX, разные гены бактериального генома транскрибируются с совершенно различной скоростью. Поэтому маловероятно, что РНК-полимераза начинает транскрипцию фаговой или бактериальной ДНК с какой-то одной уникальной точки или же, наоборот, неупорядоченно со многих случайных участков генома. Вполне возможно, что в структуре ДНК имеется набор четко выраженных стартовых точек , на которых молекулы РНК-полимеразы не только инициируют рост цепей РНК, но и выбирают в качестве матрицы правильную цепь. [c.403]

Наиболее простое объяснение этих наблюдений состоит в следующем. В случае одноцепочечной ДНК РНК-полимераза может использовать для связывания и начала транскрипции любой участок цепи. Однако она практически не обладает сродством к большей части нативной двойной спи-рали ДНК. Немногочисленные же стартовые точки на двойной спирали ДНК, сродством к которым обладает РНК-полимераза, представляют собой, по-видимому, специальн ые участки с особой последовательностью пуриновых и пиримидиновых оснований, которая позволяет полимеразе раскрывать двойную спирал ь ДНК. Раскрыв эту спираль, РНК-полимераза может присоединиться к одной из двух комплементарных цепей и начать использовать ее в качестве матрицы для транскрипции. Эта особая последовательность оснований стартовой точки должна быть такой, что последовательность в неправильной цепи в пределах этой точки будет полностью исключать возможность использования РНК-полимеразой этой неправильной цепи для начала синтеза РНК. [c.403]

После того как на стартовой точке началась транскрипция, РНК-полимераза продолжает продвигаться [c.139]

Похожие результаты могут быть получены в экспериментах с использованием экзонуклеазы. Этот фермент действует на концевой участок ДНК и последовательно его деградирует. Если с ДНК связан белок, то при столкновении с ним действие нуклеазы прекращается. В данном случае также можно определить границы промотора, т. е. точки, расположенные по обе стороны от него, далее которых экзонуклеаза не может продвинуться. Таким образом, еще раз подтвердилось, что последовательность, связывающаяся с РНК-полимеразой, расположена примерно на 44 п. н. левее стартовой точки транскрипции. [c.143]

В совокупности эти результаты показывают, что РНК-полимераза связывается, причем асимметрично, с участком ДНК размером около 44-50 п. н., если считать от стартовой точки против хода транскрипции, и около 20п. н.-по ходу транскрипции. Последние 25-30 п. п. в связывающем участке, расположенные против хода транскрипции, менее прочно взаимодействуют с ферментом. Эта область связывается с ферментом достаточно хорошо, чтобы быть экранированной при мягкой обработке эндо- или экзонуклеазами, но не может выдерживать более жесткие условия обработки, используемые для получения целых фрагментов связанного ферментом участка. Приведенные данные хорошо согласуются с моделью, согласно которой существует единый связывающий сайт для РНК-полимеразы, в котором (как мы увидим) некоторые точки контакта имеют более важное значение, чем другие. [c.143]

Основной элемент промотора —. место связывания РНК-полимеразы, которое она занимает перед началом синтеза РНК- В состав промоторов могут входить также участки связывания белков-регуляторов. Размер участка связывания РНК-па1и.меразы соответствует ее длине и составляет примерно 70 п. н. Располагается этот участок относительно стартовой точки несимметрично по ходу транскрипции его граница отстоит от стартовой точки на 20 п. н,, а против хода — при.мерно на 50 п. н. (рнс. 85). [c.140]

Стартовая точка транскрипции отстоит у разных промоторов на 6—9 п. н. от последовательности Прибнова (рис. 85). Начальным нуклеотидом РНК чаще всего является диктуемый матрицей А или Q. Предпочтение пуринов, однако, неабсолютно, и есть несколько промоторов, на которых транскрипты начинаются с С или U, несмотря на наличие на расстоянии одного-двух нуклеотидов потенциального пуринового начала. У некоторых промоторов стартовая точка не строго фиксирована инициация происходит с двухтрех соседних нуклеотидов матрицы. [c.141]

Оператор лактозного оперона располагается сразу за стартовой точкой транскрипции. Долгое время считалось, что присоединение лактозного репрессора к про.мотору стерически мешает присоединению РНК-полимеразы. Однако недавно получены данные, свидетельствующие о том, что репрессор н РНК-полимеразы могут расположиться на промоторе рядом друг с другом. Поэтому приходится ду.мать о более изощренных механизмах репрессии, включающих специфические контакты репрессора с РНК-полимеразой. В лактозном опероне имеется два псевдооператора, сходных по нуклеотидной последовательности с оператором, но обладающих [c.150]

Стартовые точки транскрипции промоторов Рс и Рва о находятся на расстоянии 147 п. н. Репрессируя Рс, белок АгаС связывается оператором araOi, перекрывающимся с участком связывания РНК-полимеразы. Находясь в состоянии активатора, АгаС-белок связывается с участком ara , непосредственно примыкающим к участку связывания РНК-поли.меразы с промотором. Можно думать, что активация происходит за счет контакта с РНК-полимеразой. [c.152]

Синтез первичных транскриптов. Инициация синтеза обоих классов первичных транскриптов происходит в соседних участках генома — в области, которая насыщена регуляторными элементами транскрипции, а также включает участок оП репликации ДНК (рис. 158). Оба класса транскриптов не имеют единственной, строго фиксированной стартовой точки поэтому 5 -концы молекул мРНК внутри каждого класса несколько различаются по длине (особенно сильно такая микрогетерогенность выражена у поздних транскриптов). Тем не менее можно сказать, что промотор ранних мРНК имеет [c.300]

Все эти регуляторные элементы позволяют хозяйской РНК-полимеразе II осуществить эффективную транскрипцию ранних генов вскоре после попадания ДНК этого вируса в клеточное ядро. В результате процессинга ранних транскриптов (см. с. 302) образуются мРНК для ранних белков, а затем и сами эти белки. Один из них — Т-антиген — играет центральную роль в последующей перестройке транскрипции вирусного генома. Он вызывает ряд эффектов. Во-первых, взаимодействует с участками вирусной ДНК, связывающими Т-антиген (сильнее всего с участком и слабее всего с участком ]11 см. рис. 158). В результате угнетается транскрипция ранних генов, в том числе и гена, кодирующего Т-антиген, Таким образом, Т-антиген проявляет здесь свойства репрессора, синтез которого подчиняется транскрипционной аутогенной регуляции. Впрочем, транскрипция ранних генов на поздней стадии прекращается не полностью. Она продолжается, хотя и со значительно. меньшей эффективностью, но при этом стартовая точка транскрипции заметно смещается, так что ТАТА-элемент оказывается теперь внутри транскрибируемой последовательности (рис. 158). Механизм, обеспечивающий позднюю транскрипцию ранней области с новой стартовой точки, не расшифрован. [c.301]

Промоторные элементы провируса расположены в районе иЗ таким образом, возможность транскрипции провируса возникает после появления района иЗ впереди вирусного ДНК-генома, т. е. после возникновения LTR. Примерно за 25 п. и. до стартовой точки транскрипции(до л) имеется характерный ТАТА-элемент, за 75 п. и.— СААТ-элемент и за 100—300 п. н.— энхансер. У разных ретровирусов энхансер имеет разную силу , а у онкогенных ретровирусов сила энхансера может коррелировать со способностью вируса вызывать злокачественную транс( юрмацию клеток-мишеней. Для активирования энхансера необходимо его взаимодействие с клеточными белками-регуляторами в некоторых случаях, например у мышиного вируса рака молочных желез, эффективность энхансера регулируется гормонами (через посредство белков — рецепторов гормонов). [c.314]

Регулируемые терминаторы бактерий называют аттенюаторами (ослабителями). Впервые обнаружен и лучше других изучен аттенюатор триптофанового оперона Е. соИ. Этот оперон состоит из пяти генов, кодирующих ферменты биосинтеза триптофана. Регуляцию осуществляют две системы, чувствующие потребность клетки в триптофане. Первая система влияет на эффективность инициации на промоторе оперона. Репрессор триптофанового оперона в комплексе с триптофаном присоединяется к оператору, расположенному перед стартовой точкой транскрипции в районе —10 , и стерически препятствует РНК-полимеразе присоединяться к промотору. Таким образом, при избытке триптофана оперон репрессирован. В отсутствие триптофана репрессор теряет способность связываться с оператором, в результате чего оперон индуцируется. Эту систему дополняет регуляция в аттенюаторе, расгГоложенном на расстоянии 180 п. н. от стартовой точки транскрипции внутри <оидерной последовательности, предшествующей инициирующе.му кодону первого структурного гена. В условиях избытка триптофана лишь одна из десяти молекул РНК-полимеразы, начавших синтез РНК на триптофановом промоторе, преодолевает этот терминатор и переходит в область структурных генов. При уменьшении количества триптофана доля молекул РНК-полимеразы, преодолевающих аттенюатор, возрастает. [c.158]

Последовательности ТАТА и ЦААТ в зоне промотора способствуют правильному расположению РНК-полимеразы на матрице ДНК. Энхансеры, локализованные на значительном удалении от зоны промотора, участвуют в регуляции процесса транскрипции. Сразу после начала транскрипции первый нуклеотид с 5 -конца подвергается модификации (метилированию гуанина), которая называется кэпированием. Поэтому первый нуклеотид, стартовая точка гена, называется кэп-сайт. Сигнал ААТААА (последняя последовательность, кодируемая РНК-полимеразой) способствует блокированию З -конца мРНК. [c.459]

РНК-полимераза кишечной палочки в настоящее время получена в высокоочищен-ном виде, многие ее структурные и функциональные особенности изучены. Холофер-мент с мол. массой 500 ООО в определенных условиях диссоциирует на несколько субъединиц. Две из них получили название а-цепей, каждая с мол. массой 39 ООО, одна — Р-цепи (мол. масса 155 ООО), одна — Р -цепи (мол. масса 165 ООО) и одна — о -фактора (мол. масса 95 ООО). Холофермент без а-фактора называется кор -ферментом. а-Фактор инициирует синтез РНК- Холофермент без а-фактора может катализировать синтез РНК на матрице ДНК тогда, когда используется гетерологичная ДНК. Добавление же а-фактора в систему с гомологичной ДНК восстанавливает синтез. С началом синтеза РНК а-фактор высвобождается с транскрипционного комплекса и может быть снова использован для активации кор -фермента. а-Фактор узнает гены, с которых должна транскрибироваться РНК. В отсутствие ст-фактора кор -фермент начинает транскрипцию РНК с произвольных генов ДНК, а при наличии его — со специфической стартовой точки. [c.80]

Блок прибнова — каноническая последовательность ТАТААТО, находящаяся на расстоянии около 10 п. н. перед стартовой точкой транскрипции бактериальных генов. Представляет собой часть промотора, отвечающую за связывание РНК-полимеразы. [c.459]

Результаты, полученные при изучении инициации синтеза РНК РНК-полимеразой Е. соИ на ДНК-матрицах фагов 0X174 (репликативная форма), Т4 и Я, в опытах in vitro, дают основание думать, что для узнавания ферментом стартовых точек необходимо сохранение двуспиральной структуры ДНК- Данные, полученные в этих опытах, показали, что лишь ограниченное число молекул РНК-полимеразы может одновременно начать транскрипцию на фаговом геноме примерно одна молекула на тысячу нуклеотидных пар двухспиральной ДНК-матрицы. [c.403]

Недавно было обнаружено, что молекулы РНК-полимеразы узнают стартовые точки с помощью специального белкового компонента. В течение нескольких лет после открытия РНК-полимеразы не удавалось получить препарата РНК-полимеразы с высокой степенью чистоты. Наконец в 1968 г. удалось получить такие препараты РНК-полимеразы Е. oli, что дало возможность исследовать структуру фермента. Эти исследования показали, что молекула РНК-полимеразы состоит из трех разных типов полипептидных субъединиц а, Р но. Частичный агрегат а-и Р-полипептидов отвечает за рост цепи РНК, тогда как наличие в агрегате ff-полипептида необходимо только для инициации транскрипции на интактных двухспиральных ДНК-матрицах. [c.404]

После того как РНК-полимераза начала рост цепи РНК, о-субъеди-ница высвобождается из ферментного комплекса и рост цепи РНК продолжается в ее отсутствие. В настоящее время кажется вероятным, что в РНК-полимеразе Е. oli имеется лищь по одному типу а- и Р-субъединиц, которые вместе служат не только для транскрипции всех бактериальных генов, но и для транскрипции любой фаговой ДНК, которая может заразить эту бактерию. Однако представляется столь же вероятным, что в клетках Е. ali существует несколько разных типов ff-субъединиц, каждый из которых способен узнавать уникальную структуру разных стартовых точек, придавая, таким образом, индивидуальным молекулам РНК-полимеразы определенную степень дифференциации их специфичности в отношении инициации . В настоящее время кажется еще более [c.404]

Процесс образования копий РНК на ДНК при участии РНК-полимеразы более понятен, несмотря на то что этот фермент имеет более сложнз ю структуру. Мол. масса его около 500 000, и состоит он из пяти субъединиц из двух а-цепей с мол. массой 39 000, одной -цепи с мол. массой 155 000, одной -цепи с мол. массой 165 000 и одной а-цепи с мол. массой 95 ООО. Однако а-субъединица связана с ферментом слабо и не является необходимой для каталитической активности. Ее функция состоит в распознавании стартовой точки для начала транскрипции цепи ДНК- В отсутствие о-цепи полимераза as (известная как кор-фермент) начинает синтез РНК беспорядочно от многих точек вдоль обеих цепей ДНК- Фактор а определяет положение точек (возможно, он узнает какой-то стартовый сигнал в последовагельности ДНК), с которых должен начинаться синтез соответствующей мРНК, кодирующей последовательность аминокислот фермента, и благодаря этому фактору РНК-полимераза начинает транскрипцию только с этих точек. Было высказано предположение о существовании нескольких о-факторов, распознающих разные стартовые точки, но этот вопрос пока остается открытым. [c.19]

Репрессия фермента или группы ферментов в опероне вызывается связыванием специфической молекулы (репрессора) с ДНК, содержащей соответствующие гены. Как уже упоминалось на с. 831, репрессор специфически связывается с участком ДНК (оператором), расположенным рядом с другим участком (промотором), к которому присоединяется РНК-полимераза. Таким путем репрессор создает препятствие для полимеразы, и она не может достичь стартовой точки для начала транскрипции, так что мРНК не образуется. Подробный обзор по этому вопросу см. в работе [502]. [c.64]

Продукты транскрипции представляют собой дискретные молекулы, имеющие предопределенные 5 -и З -концы. Из этого следует, что инициирование и терминирование транскрипции должны происходить в определенных сайтах ДНК. Инициация предполагает образование комплекса между РНК-полимеразой и ДНК в участке, расположенном вблизи нуклеотида, с которого начинается транскрипция. Последовательность ДНК, необходимая для образования этого комплекса, называется промотором. Промотор может включать в себя как последовательности, непосредственно связывающиеся с инициирующим комплексом, так и те, которые прилегают к этому участку. (Распознавание этих последовательностей необходимо для инициации, но они не являются частью стабильного сайта связывания.) То место, с которого начинается включение первого нуклеотида в синтезирующийся транскрипт, называется стартовой точкой. [c.132]

Каким образом сигма-фактор влияет на способность минимального фермента ассоциировать с ДНК Проведенные ранее эксперименты указывали на то, что сигма-субъединица непосредственно не связывается с дуплексом ДНК. Однако возможно, что она способна взаимодействовать с ДНК, находящейся в суперспирализованном состоянии, хотя мы не имеем данных о том, может ли она сама узнавать специфические нуклеотидные последовательности. В то же время известно, что когда голофермент образует прочно связанный комплекс с промотором, сигма-фактор контактирует с ДНК в области начального плавления, в точке, расположенной непосредственно перед стартовой точкой транскрипции. Добавление сигма-фактора может изменить конформацию минимального фермента таким образом, что он менее эффективно распознает слабый участок связывания и уже в форме голофермента может специфически контактировать с участками прочного связывания. [c.135]

ДНК, предшествующая стартовой точке, называется последовательностью, расположенной против хода транскрипции ДНК после стартовой точки (которая образует транскрибируемую последовательность) называется последовательностью, расположенной по ходу транскрипции. Последовательность ДНК принято записывать так, что транскрипция происходит слева направо. Это соответствует обычному написанию мРНК в направлении от 5 -конца к З -концу. Часто последовательность ДНК записывается только для той цепи, с которой транскрибируется РНК. Положения оснований нумеруются в обоих направлениях, начиная от стартовой точки, которую обозначают как -ь 1. По ходу транскрипции происходит нарастание порядковых номеров оснований. Позиции оснований, расположенных против хода транскрипции, обозначаются со знаком минус, и значения номеров возрастают по мере удаления от стартовой точки. Используя эти обозначения, можно написать, что экранируемый РНК-полимеразой фрагмент расположен в пределах от — 20 до 4- 20. [c.141]

Против хода транскрипции от стартовой точки располагается область из 6 п. н., которая может быть обнаружена почти во всех промоторах. Эта последовательность не является строго постоянной, но всегда имеет большое сходство с последовательностью ТАТААТ, которая часто называется блоком Прибнова. Фактически как таковая последовательность ТАТААТ встречается довольно редко, но она является среднестатистической, или канонической, последовательностью, составленной из оснований, наиболее часто встречающихся в каждой позиции. [c.143]

Центр блока Прибнова обычно располагается примерно на расстоянии 10 п.н. от стартовой точки против хода транскрипции. Поэтому иногда этот блок обозначают просто как положение —10. В действительности положение гексануклеотидного участка варьирует от — 11 до [c.144]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология