Основания антикодон

Вместе с тем третьи основания аргининовых кодонов (А, и и С) образуют довольно слабые водородные связи (показаны черным цветом) с остатком I в антикодоне. Изучение этих и других ко-дон-антикодоновых пар привело Френсиса Крика к выводу о том, что третье основание большинства кодонов имеет определенную степень свободы при образовании пары с соответствующим основанием антикодонов той же специфичности, т.е., как образно выразился сам Крик, третьи основания таких кодонов качаются . Крик сформулировал четыре положения, совокупность которых известна под названием гипотезы качания (wobble hypothesis). [c.951]

Рис. 91. Относительные положения и направления N-гликозидных связей нуклеозидных остатков при спаривании первого основания антикодона (слева) с третьим основанием кодона (справа) (по F. Н. ri k, J. Mol., 1966, V. 19, p. 548-555)

Если смотреть на L-образную молекулу тРНК вверх антикодоном с внешней стороны угла, то группы трех оснований антикодона, способные к спариванию посредством водородных связей, обращены более или менее по правую сторону от плоскости, содержащей обе ветви молекулы (см. рис. 22). Первое основание антикодона (положение нестрогого спаривания при кодон-антикодоновом взаимодействии) находится на самой верхушке антикодоновой ветви молекулы, а два других основания антикодона и два последующих основания петли спускаются от него по спирали, как винтовая лестница, слева вниз направо. [c.159]

Два первых основания кодона всегда образуют прочные уотсон-криковские пары с соответствующими основаниями антикодона и вносят наибольший вклад в специфичность кодирования. [c.951]

Молекулы транспортной РНК относительно невелики (около 70 нуклеотидных единиц) и поэтому подвижны в клеточной среде. Они содержат два важных активных центра 1) связывающий центр, который специфичен для данной аминокислоты, и 2) последовательность из трех остатков оснований антикодон), способную образовывать водородные связи с тремя комплементарными остатками кодон) информационной РНК. [c.282]

Точка X обозначает Г углеродный атом рибозы, а пунктирная линия — связь, соединяющую этот атом с атомом азота в кольце основания антикодона. Остальные точки со сплошными линиями обозначают положения первых углеродных атомов и их связей с азотом в кольце основания кодона для различных пар оснований, перечисленных внизу справа. (Для простоты пары, содержащие в кодоне И, опущены.) Гипотеза неоднозначного соответствия предполагает, что при взаимодействии третьего положения кодона с антикодоном допустимы три отдаленных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартной пары Уотсона -- Крика вверх, вниз и вправо. Три приближенных нестандартных положения, отклоняющихся от стандартного положения влево, недопустимы. [c.448]

Третье основание антикодона Третье основание кодона [c.448]

Основание антикодона, спаривающееся с третьим основанием кодона Третье основание кодона [c.156]

Другой характер носит вторичная структура неспаренных участков, таких как петли и акцепторный еССА-конец. Здесь часто имеется односпиральное расположение нескольких остатков, поддерживаемое межплоскостными взаимодействиями ( стэкинг ) оснований. Структура антикодоновой петли представляет особый интерес (рис. 20) три основания антикодона и два последующих основания, примыкающие к нему с З -стороны, находятся в едином стэкинге друг с другом и образуют однотяжевую правозакрученную спираль со своеобразными параметрами, так что первое основание антикодона помещается на самой [c.36]

НЫМ концом составляет 7,6—7,8 нм. Все три основания антикодона на вершине одной из ветвей обрашены на внутреннюю сторону угла L-образной молекулы. [c.38]

Структура антикодоновой петли, описанная в А. IIL 2, характеризуется спиральным xpiioM отрезка цепи, включающего три остатка антикодона и следующие за ним (по направлению к З -концу) остатки параметры спирали близки к таковым одной цепи стандартной двойной спирали РНК, ее основания находятся в стэкинге, а три основания антикодона оказываются обращенными своими группами, ответственными за спаривание посредством водородных связей, наружу (см. рис. 20). Таким образом, антикодон готов образовать двуспиральный комплекс с комплементарной последовательностью без существенной перестройки своей пространственной структуры. [c.159]

Информация, заложенная в ДНК и РНК, реализуется в процессе синтеза белка. Механизмы передачи информации от ДНК на РНК понятны и очевидны, так как цепь нуклеотидов характерна для обеих структур, а матричный синтез предусматривает полную идентичность их последовательностей. Но каким же образом передается информация от РНК, содержащей всего четыре нуклеотида, на белок, содержащий 20 различных аминоьсислот Если бы каждый нуклеотид передавал информацию на синтез одной аминокислоты, то всего кодировалось бы 4 аминокислоты. Не может код состоять из двух нуклеотидов, так как в этом случае можно было бы охватить не более 16 аминокислот (4 = 16). Работами М. Ниренберга и соавторов было установлено, что для кодирования одной аминокислоты требуется не менее трех последовательно расположенных нуклеотидов, называемых триплетами или кодонами. При этом между отдельными кодонами нет промежутков, и информация записана слитно, без знаков препинания. Число сочетаний 4 дает основание полагать, что 20 аминокислот кодируются 64 кодонами. Экспериментально установлено, что таких кодонов меньше, всего 61. Оставшиеся три кодона не несут в себе информации, однако два из них используются в качестве сигналов терминации. Выявлена также интересная особенность взаимодействия кодона с антикодоном. Оказалось, что первое и второе азотистые основания кодона образуют более прочные связи с комплементарными основаниями антикодона. Что же касается третьего основания, то эта связь менее прочная, более того, основание кодона может спариваться с другим, не комплементарным основанием антикодона. Этот феномен называют механизмом неоднозначного соответствия или качания. В соответствии с этим урацил антикодона может взаимодействовать не только с аденином, но и с гуанином кодона. Гуанин антикодона способен связываться не только с цитозином, но и с урацилом кодона. Это указывает на возможность нескольких кодонов кодировать одну и ту же аминокислоту. И действительно, было установлено, что ряд аминокислот кодируется двумя и более антикодонами (табл. 29.1). Из таблицы видно, что только две аминокислоты — метионин и триптофан — кодируются при помощи одного кодона. Число кодонов для остальных аминокислот варьирует от двух (для аргинина, цистеина и др.) до шести (для лейцина и серина). Тот факт, что одной и той же аминокислоте соответствует несколько кодонов, называется вырожденностью [c.462]

Первое основание ряда антикодонов (если читать в направлении 5 - 3 ) позволяет им читать больше одного кодона для данной аминокислоты. Если первое основание антикодона С или А, то такой антикодон способен читать только один кодон если это U или G, то такой антикодон может прочитать два разных кодона. Если качающимся нуклеозидом антикодона является I или некоторые другие модифицированные остатки, то антикодон может прочитать три различных кодона. Таким образом, I в первом положении антикодона позволяет этому антикодону узнать максимальное число кодонов для любой данной аминокислоты. Описанные выше взаимоотно- [c.951]

Между тем при взаимодействии между третьими основаниями кодона и антикодона в силу неоднозначного соответствия возможно образование пары между третьим нуклеотидом кодона и более чем одним типом основания антикодона. И ходя из анализа молекулярной структуры оснований с помощью молекулярных моделей. Крик заключил, что неоднозначное соответствие в третьем положении допускает образование нестандартных пар оснований между Г и У, И и У и между И и А (фиг. 222). Следовательно, третье азотистое основание в антикодоне тРНК может узнавать определенный спектр оснований в третьем положении кодона мРНК такие спектры для пяти азотистых оснований антикодона выглядят следующим образом [c.448]

Поскольку антикодон комплементарен кодону, то первое основание в антикодоновой последовательности пи-щется согласно существующим правилам-в направлении от 5 -конца к З -концу. При написании кодоновой последовательности по этим правилам третье основание кодона взаимодействует с первым основанием антикодона. Поэтому комбинация [c.95]

Первое основание антикодона определяет, считывает ли данная молекула тРНК один, два или три типа кодонов С и А узнают по одному кодону, и и О - по два кодона, I - три кодона. Итак, одна из причин вырожденности генетического кода заключается в неточности, или неоднозначности, спаривания ( качании ) третьего основания кодона. Именно в этом мы усматриваем основную причину распространенности необычного нуклеозида инозина в антикодонах. Инозин увеличивает число кодонов, которые способна считывать данная молекула тРНК (рис. 27.8). [c.95]

Эта гипотеза постулирует, что образование пары кодон-антикодон в двух первых положениях кодона всегда происходит по каноническим правилам, но в третьем положении возможно качание (неоднозначное соответствие). Объясняется это тем, что конформация антикодоновой петли тРНК допускает значительную подвижность первого основания антикодона. Некоторые пары оснований, предусмотренные гипотезой неоднозначного соответствия, приведены на рис. 7.10. [c.95]

Другой пример взаимодействия, не предсказанный гипотезой, заключается в том, что бактериальная инициаторная fMet-тРНК способна узнавать как кодон AUG, так и кодон GUG. Это вынуждает третье основание антикодона взаимодействовать не по правилам. [c.97]

В готовой цепи нуклеиновой кислоты нуклеотиды (подобно аминокислотам в белках) могут претерпевать ковалентную модификацию, приводящую к изменению активности данной нуклеиновой кислоты. Такие посттранскрипционные модификации особенно свойственны молекулам тРНК, в которых обнаруживается много модифицированных нуклеотидов (рис. 5-9). Некоторые из них оказывают влияние на конформацию и на спаривание оснований антикодона, что облегчает узнавание соответствующего кодона мРНК молекулой тРНК. [c.259]

По каким правилам происходит узнавание кодона антикодоном в тРНК Проще всего предположить, что каждое из оснований кодона образует уотсон-криковскую пару оснований с комплементарным основанием антикодона. Тогда кодон и антикодон должны полностью соответствовать друг другу с учетом анти параллельности (на схеме штрих обозначает комплементарное основание) [c.94]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология