дезоксирибоза фосфат, расщепление

Нуклеотиды. Третий компонент нуклеиновых кислот — ортофос-форная кнслота — образует сложноэфирные связи со спиртовыми группами рибозы нли дезоксирибозы. Путем расщепления нуклеиновых кислот в контролируемых условиях удается выделить сложные эфиры нуклеозидов и фосфорной кислоты — нуклеотиды. Названия нуклеотидов производятся от названия гетероциклического основания, входящего в нх состав, с добавлением слова кислота цитидиловая кислота, адениловая кислота и т. д. В современной номенклатуре указываются также положения фосфатной группы или групп (аденозии-5 -фосфат, адеиознн-З -фосфат, дезоксиаденозии-5 -фосфат) часто используются однобуквенные сокращения для 5 -фосфатов — рА, рС, рС, ри, pN, р<1А, р<1С, р<1С, р<1и, pdN, для З -фосфатов — Ар, Ср, Ср, ир, Np, dAp, Ср, d p, dUp, dNp, для 2 -фосфатов —А(2 )р, С(2 )р, С(2 1р, и(2 )р, N(2 ) [c.301]

Фермент 2-кето-3-дезокси-6-фосфоглюконатальдолаза отличается о1 альдолаз фруктозодифосфата и дезоксирибозы, так как не действует на два последних субстрата тем не менее вторая часть пути, начиная с альдолазного расщепления, сходна с гликолитическим путем, тем более, что продукты расщепления 2-кето-3-дезокси-6-фосфоглюконата— пируват и глицеральдегид-З-фосфат претерпевают, очевидно, обычные превращения. [c.212]

НИЮ гуанинов по N-7 и аденинов по N-3 [22]. Гликозидная связь таких производных легко гидролизуется, и последующая щелочная обработка отщепляет фосфаты от свободной дезоксирибозы (схема (9) . Гуанин метилируется в 5 раз быстрее, чем аденин, и поэтому этот путь приводит, в основном, к расщеплению по гуанину (0 >А). Эта ситуация легко меняется на обратную, когда достигается сильное расщепление по аденину и слабое по гуанину, при использовании для гидролиза гликозидной связи слабокислых условий, в которых подавляется гидролиз 7-метилгуанозина. По- [c.190]

Первым этапом при проведении реакции химической деградации является ограниченная модификация определенных нуклеотидов под действием различных химических агентов. Концентрация агента и продолжительность его воздействия на молекулы ДНК подбирается с таким расчетом, чтобы в каждой молекуле произошла модификация только одного нуклеотида, а поскольку в реакционной смеси присутствует огромное количество таких молекул, то, согласно теории вероятности, все основания данного типа в секвенируемом фрагменте ДНК окажутся модифицированными. Следующие этапы удаления модифицированных оснований и 3-элиминации обоих фосфатов, окружающих дезоксирибозу, и разрыва цепи должны проходить уже количественно. Для каждого типа нуклеотидов или их комбинации проводят отдельные реакции ограниченной модификации и количественного расщепления. Таким образом, в результате четырех (или иногда трех, пяти или даже шести) типов реакций образуется смесь олигонуклеотидных молекул, различающихся по размеру на один нуклеотид и несущих на одном из концов метку, обычно радиоактивную. Следует отметить, что кроме [c.20]

В опытах на Е. соН и клетках асцитной опухоли установлено, что при добавлении к культуральной среде специфически меченной глюкозы распределение метки в рибозе и в дезоксирибозе не соответствовало действию механизма, предусматривающего участие дезоксирибоальдолазы, но было совместимо с предположением, что рибоза и дезоксирибоза имеют общего предшественника. При исследовании бактерий и животных получены данные, что рибоза нуклеозидов и нуклеотидов превращается в дезоксирибозу без расщепления углеродной цепи. Например, бесклеточные экстракты Е. соН превращают цитидин-5-фосфат в дезоксицитидин-5-фос-фат. Для этого превращения необходимо присутствие Mg, АТФ и НАД-Нг. [c.144]

Нуклеозид-3, 5 -циклофосфаты. Рибонуклеозид-3, 5 - и дез-оксирибонуклеозид-3, 5 -циклофосфаты (об их синтезе см. ) под действием кислот и оснований претерпевают расщепление фосфодиэфирной связи, которое во многих случаях, в зависимости от условий реакции и природы основания и углеводного остатка, сопровождается гидролизом N-гликозидной связи (стр. 495, 504). Первый из указанных процессов приводит к образованию смеси нуклеозид-3 - и -5 -фосфатов (с преобладанием З -изомеров) , второй— к смеси рибозо- (или дезоксирибозо-) фосфатов, дефосфо-рилирующихся в более жестких условиях [c.551]

Как указывалось выше, другой принцип установления последовательности мономеров в полинуклеотидной цепи основан на расщеплении ее на более мелкие блоки для этого необходимы методы расщепления цепи по месту определенных мономеров или их комбинаций. Химический метод такого расщепления основан на повышении лабильности фосфоэфирной связи в производных рибозо-или 2-дезоксирибозо-З-фосфата за счет перехода остатка сахара в альдегидную форму и последующей р-элиминации [c.68]

Хотя в настоящее время применяются достаточно мягкие условия получения апуриновых кислот (такие, как гидролиз [392] при 37° и pH 1,6 или обработка [393] ионообменными смолами), все же при этом имеет место также расщепление фосфодиэфирных связей, продукты получаются с гораздо меньшей длиной цепи и имеют молекулярный вес [394, 395] от 3500 до 15000 по сравнению с молекулярным весом в несколько миллионов, характерным для исходных полимеров. Как и при гидролизе в нейтральных растворах, главной причиной расщепления цепи является легкое отщепление фосфата из негликозидных звеньев дезоксирибозы. [c.428]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология