Пептидные производные нуклеотидов

Ю. А. Овчинников, Е. И. Виноградова). Кроме того, был разработан общий метод синтеза различных типов г.пикопептидов (Н. К. Кочетков, В. А. Деревицкая), а также осуществлен синтез и детально изучены свойства аминоацильных и пептидных производных нуклеотидов и нуклеозидов (М. А. Прокофьев, 3. А. Шабарова). [c.515]

Хотя рибонуклеиновые кислоты, несомненно, состоят главным образом из нуклеотидов — производных аденина, гуанина, цитозина и урацила, полная расшифровка состава таких полимеров сопряжена с рядом трудностей. Возможное присутствие очень малых количеств ненуклеотидных компонентов до недавнего времени игнорировалось в значительной степени из-за удобства применения количественных расчетов по поглощению в ультрафиолетовой области. Кроме того, выбор между артефактом и подлинным компонентом не всегда легко сделать устойчивость или неустойчивость комбинации не является критерием ковалентного или нековалентного характера связывания с такими высокомолекулярными полиэлектролитами, как нуклеиновые кислоты. Теперь известно, что в некоторых рибонуклеиновых кислотах концевой аденозиновый остаток этерифицирован по 2 - или З -гидроксильной группе одной молекулой аминокислоты. (Аналогия с ацетильными производными аденозина позволяет предположить, что такие аминокислотные производные являются исключительно З -эфирами). Неоднократно отмечалось существование пептидных производных нуклеиновых кислот, и нельзя полностью пренебрегать возможностью присутствия в рибонуклеопротеидах некоторых относительно нестойких ковалентных связей между белком и нуклеиновой кислотой. Проблема минорных ненуклеотидных компонентов рибонуклеиновых кислот до некоторой степени дискуссионна и может быть разрешена соответствующим точным анализом нуклеиновой кислоты. [c.408]

Итак, в отличне от пептидных производных, двумерные кон-формацпонные карты которых позволяют найти положение и форму минимумов мономерной единицы, при решении подобных задач для производных нуклеотидов мы сразу же сталкиваемся с проблемой многих минимумов, и реш ение ее, вероятно, будет не просто. [c.411]

Пирофосфатным методом с выходом до 95% были получены [24, 25, 28—33] аминокислотные (пептидные) производные различных рибо- и дезоксирибонуклеозид-5 -фосфатов, а также тимидин-З -фосфата (см. табл. 3). При синтезе соответствующих производных серина в реакцию вводился метиловый эфир серина [30]. Так как аминогруппа серина является более сильной нуклеофильной группой, чем оксигруппа, основным продуктом реакции является эфир нуклеотидо-(Р- К)-серина. Этим методом можно получать [30] также 0-нуклеотидилоксиаминокислоты. Для этого используется эфир Ы-кбз-оксиаминокислоты и к реакционной смеси добавляется трибутиламин,- увеличивающий нуклеофильность оксигруппы [c.356]

Зависимость гидролитической устойчивости ну-к л е о т и д о п е п т и д я о й с в я зи от структуры аминокислотного фрагмента. Из сравнения скоростей гидролиза аминокислотных производных АМФ, различающихся структурой аминокислоты (А-5 -фен-ОСНз, А-5 -лей-ОСНз и А-5 -№-кбз-лиз-ОВ2), следует [41], что в кислой среде (0,05 н. НС1, 37°С) существенного влияния структуры радикала на устойчивость фосфоамидной связи нет. Несколько повышенная устойчивость Ы -кбз-лизинового производного объясняется стерическими препятствиями, связанными с наличием в радикале дополнительной карбобензоксигруппы (соединение напоминает пептидное производное, о гидролитической устойчивости которого см. ниже). Указанные выше аденилил-(5 Ы)-аминокислоты одинаково легко гидролизуются при pH < 3, значительно медленнее при pH 3—4 и практически не гидролизуются при pH > 5 (37°С, 24 час). На устойчивость фосфоамидной связи в нуклеотидил-(5 ->Ы)-аминокислотах существенное влияние оказывает дополнительная оксигруппа, находящаяся в радикале аминокислоты. Это влияние было обнаружено при изучении зависимости гидролиза эфира уридилил-(5 ->Ы)-серина от pH [30]. Оказалось, что это соединение, в отличие от соответствующего фенилаланинового производного, гидролизуется не только при низких значениях pH, но и при pH >9. Так, при pH 9,3 и 37°С фосфоамидная связь в сериновом производном УМФ расщепляется за 10 час на 607о [30]. [c.367]

Совершенно очевидно, что нарушение конформации активного центра фермента будет тем меньше, чем короче и проще амидный фрагмент в молекуле фосфоамида. Этот эффект мы отчетливо наблюдали, сравнивая степень ферментативного гидролиза пептидных, аминокислотных производных нуклеотидов и нуклеозид-5 -фосфамидов [44]. По-видимому, удлинение пептидной цепи в молекуле нуклеотидопептида создает пространственные затруднения протонизации амидного азота [c.383]

В лаборатории М. А. Прокофьева были разработаны методы синтеза соединений, моделирующих другой возможный тип нуклеотид-пептидных связе11 — амидный, нри котором возникают связи аминогрупп нуклеиновых оснований с карбоксильными группами аминокислот (через смешанные ангидриды), и карбодиимидный. Амидная связь, в отличие от фосфамидпой, устойчива в кислой и нейтральной средах. Соединения такого типа найдены в ряде природных объектов. Наконец, в той же лаборатории был разработан метод синтеза 0-аминоацильпых производных нуклеотидов, которые хорошо известны как промежуточные соединения в процессе синтеза белка. [c.524]

Аналогичным образом можно сместить равновесие в случае синтеза пептидных связей при сопряженном расщеплении пиро-фосфатных связей в АТФ, образовании активированной, макроэргической формы аминокислоты — аминоациладенилата. Пирофосфаты при нейтральном и щелочном значениях pH среды служат универсальными посредниками в превращениях энергии, необходимой для биохимических процессов. Однако создание больших концентраций пирофосфатных производных нуклеотидов невозможно нуклеотидпирофосфаты активно участвуют в синтезе полинуклеотидов и их высокие концентрации могут повлиять на неконтролируемый синтез полинуклеотидов. Необходимы склады для хранения запасов термодинамического потенциала в менее активной форме. [c.117]

Кобаламины, витамины группы Bja, относятся к производным внутреннего кобальтового комплекса нуклеотида бензимидазола и макроцикличес-кой корриновой системы. Они включают в свою молекулу 3-фосфорнын эфир 1-а-Л-рибофуранозил-5, 6-диметилбензимидазола (а-рибазола), связанный с Л -1-аминопропанолом-2, образующим пептидную связь с пропионовой кислотой положения 17 корриновой системы , все -положения гидрированных пиррольных циклов которой замещены метильными, а также семью карбоксиметильными и карбоксиэтильными заместителями, представленными в виде амидов кислот. Атом кобальта ковалентно и координационно связан в виде клешнеобразного , или хелатного , комплекса с циангруппой и с атомами азота гидрированных пиррольных колец и бензимидазола. [c.577]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология