Аминокислоты вирусных белков

Вирус табачной мозаики (ВТМ). Из всех вирусов наиболее хорошо изучен растительный вирус табачной мозаики. Тем не менее сведения, которыми мы располагаем в настояш,ее время, вероятно, еще далеко не достаточны для полного описания его строения. Физические исследования показали, что ВТМ представляет собой тонкий стержень длиной 3000 А и диаметром 150 А. Вес такой частицы равен 39- 10 . Из этого числа 5% приходится на РНК, константа седиментации которой равна 27S, а молекулярный вес 2,0 10 . Если бы цепь РНК вируса полностью вытянуть, она была бы в 10 раз длиннее вирусной частицы. Остальные 95% вируса приходятся на белок, который состоит из 2130 идентичных субъединиц. В состав каждой субъединицы, имеющей молекулярный вес 17 420, входит 158 аминокислот. Белок вируса табачной мозаики является третьим белком после инсулина и рибонуклеазы, для которого полностью установлена последовательность аминокислот. Каждая белковая субъединица представляет собой единую полипептидную цепь, на N-конце которой находится ацетилированный серии. Это один из редких случаев особой модификации N-конца полипептидной цепи. Различные штаммы этого вируса отличаются по аминокислотному составу белка. У всех исследованных штаммов белковая часть содержит только один остаток цистеина. В некоторых штаммах отсутствуют метионин и гистидин. [c.359]

Белки вирусов имеют обычный набор аминокислот и не отличаются в этом отношении от белков животного, растительного и бактериального происхождения. Характерной особенностью вирусных белков является устойчивость к действию протеолитических ферментов, что, но-видимому, обусловлено спецификой структуры вирусной частицы. Белок вирусных нуклеопротеидов, как правило, состоит из ряда субъединиц. Например, у вируса табачной мозаики (ВТМ) число белковых субъединиц с мол. в. 18 ООО достигает приблизительно 2100, а у Х-вируса картофеля белковая часть построена из 500 субъединиц с мол. в. 74 ООО. [c.467]

Другой подход к проблеме кодирования заключался в использовании мутантов вируса табачной мозаики, полученных в искусственных условиях. При обработке вирусной РНК азотистой кислотой цитозин превращается в урацил, а аденин — в гуанин. Белок вирусов, образованный при участии РНК, обработанной азотистой кислотой, отличается от белка необработанного вируса в том отношении, что в нем некоторые аминокислоты замещены другими. Сравнивая изменения аминокислот с известными изменениями нуклеотидов, которые обусловлены действием азотистой кислоты, можно расшифровать код. [c.488]

Как правило, реконструированные частицы, получаемые путем объединения белковой оболочки с вирусной РНК, обработанной азотистой кислотой, не обладают инфекционной способностью. Следовательно, в большинстве случаев дезаминирование оснований под действием азотистой кислоты приводит к летальным мутациям. В некоторых случаях мутации не легальны и белок мутантного вируса отличается от нативного белка по аминокислотному составу. Например, известен нитритный мутант, у которого на местах, занятых в нативном вирусе пролином, аспарагиновой кислотой и треонином, находятся соответственно лейцин, аланин и серии. В белке ВТМ С-концевая последовательность аминокислотных остатков имеет вид -Гли-Про-Ала-Тре. Протеолитический фермент карбоксипептидаза отщепляет от С-конца при каждом акте отщепления одну аминокислоту. [c.364]

Последовательность расположения 164 аминокислот в белке ВТМ установлена полностью [80]. Значительные успехи достигнуты и в изучении последовательности нуклеотидов в РНК этого вируса [81, 82]. Согласно имеющимся данным, различные штаммы ВТМ отличаются как по содеря анию аминокислот в их белковом компоненте [54], так и по последовательности нуклеотидов в их РНК [26, 45]. Белок, по-видимому, является всего лишь защитной оболочкой для инфекционной вирусной РНК. [c.153]

Эксперименты по частичному секвенированию аминокислот четырех подтипов показали, что в протеине отсутствует сигнальный пептид, и что он погружен в вирусную мембрану гидрофобной областью на N-конце. N-конец NA не модифицирован в результате ее синтеза [15]. В этом плане NA отличается от других белков вирусного шипа, таких, как НА (см. выше) или белок G VSV 100]. [c.117]

Сферические вирусы. Молекулярный вес мелких сферических вирусных частиц равен 5- 10 —10- 10 , а молекулярный вес входящей в их состав РНК — около 2 10 . Следовательно, вирусная частица содержит 6000 нуклеотидов и не менее 25 ООО аминокислотных остатков. Таким образом, отношение числа оснований к числу аминокислот равно приблизительно Д- Предположение об индивидуальном кодировании каждой аминокислоты вируса не совместимо со столь малым значением этой величины. Следовательно, белок должен состоять из идентичных белковых субъединиц. Так же как и вирус табачной мозаики, сферические вирусы устойчивы к действию рибонуклеазы. Следовательно, белковые субъединицы образуют оболочку, защищающую нуклеиновую кислоту вируса. Полагают, что эти субъединицы расположены не хаотически, а в каком-то определенном порядке. [c.365]

Еще одним вирусным белком, аминокислотная последовательность которого была исследована, является белок оболочки вируса fd — мелкого ДНК-содержащего палочкообразного вируса, необычные свойства которого будут рассмотрены ниже [52]. Белок оболочки вируса М имеет наименьшие размеры из всех известных структурных белков. Он состоит всего лишь из 49 аминокислот, не содержит аргинина, гистидина и цистеина (цистина) и имеет следующую аминокислотную последовательность [c.88]

При анализе аминокислотного состава белков Т-4 бактериофага Е. oil был установлен крайне интересный факт, состоящий в том, что аминокислотный состав этого вирусного белка почти идентичен аминокислотному составу белков самих кишечных бактерий [127]. Это удивительное сходство аминокислотного набора заставляет думать, что вирусный белок образуется путем перегруппировки аминокислот хозяина и что превращение белка хозяина в вирусный белок может не сопровождаться дезаминированием или другими процессами глубокого распада аминокислот. Однако, с другой стороны, было показано, что Н Нз, добавленный к среде, на которой происходит размножение ука-за шого вируса, проникает в вирус, тогда как бактериальный азот вирусом не используется [128]. Это как будто дает основание считать, что вирусный белок бактериофага образуется за счет веществ, находящихся в питательной среде, а не за счет бактериального белка. Однако опыты с радиоактивным фосфором показали, что около 75% входящего в состав данного вируса фосфора состоит из радиоактивного фосфора среды, а для построения остальных 25% используется бактериальный фосфор. Очень трудно интерпретировать эти разноречивые данные. Не исключена возможность того, что бактерия-хозяин доставляет ферменты, необходимые для синтеза белков вируса [128]. [c.399]

Первым вирусным белком, для которого удалось определить полную последовательность аминокислот, явился белок оболочки ВТМ. При этом в данпых двух лабораторий были небольшие различия и незначительные ошибки, которые теперь устранены (фиг. 13) (9, 10, 160, 5131. Белок ВТМ представляет собой одноцепочечную структуру, которая построена из 158 аминокислот, содержит [c.74]

Рис. 3-43. Структура сферического вируса. Во многих вирусах идентичные белковые субъединицы упаковываются с образованием сферической оболочки, которая заключает вирусный геном, состоящий из РНК или ДНК. Но геометрическим соображениям симметричным образом могут упаковаться не более 60 субъединип. Однако если допустимы небольшие отклонения от регулярности, то можно использовать больше субъединиц для образования более крупного капсида. Например, вирус кустистой карликовости томата (TBSV) имеет форму сферы около 33 нм в диаметре. На электронной микрофотографии и на схеме (Б) можно видеть, что он состоит из более, чем 60 субъединиц. Предполагаемый способ сборки и трехмерная структура по данным рентгеноструктурного анализа этого вируса представлены на В. Вирусная частица состоит из 180 идентичных копий капсидного белка (насчитывающих по 386 аминокислот) и генома РНК, включающего 4500 нуклеотидов. Чтобы сформировать такой крупный капсид, белок должен быть способен упаковываться тремя несколько различными способами (обозначены разным пветом). (Рисунки

Полную последовательность 5-го сегмента РНК получили для двух штаммов — A/PR/8/34 [276, 294 и неопубликованные данные W. Min Jou, 1981] и A/NT/60/68 [107]. Сегмент 5 РНК состоит из 1565 нуклеотидов, включая в случае мРНК некодирующий 5 -участок из 45 нуклеотидов и некодирующий З -участок из 20 нуклеотидов. Кодирующая область из 1494 нуклеотидов кодирует 498 аминокислот, которые дают предсказанную м.м. 56 101 для NP, что очень близко по значению к молекулярной массе, рассчитанной по поведению NP в электрофорезе [58, 150, 204, 257]. Белок богат аргинином и имеет положительный заряд -Ы4 при pH 6,5. У него нет групп основных остатков, наличие которых можно было предположить для взаимодействия кислотных фосфатных остатков РНК с молекулами NP, и, следовательно, РНК ассоциирована со многими з частками молекулы NP, нейтрализуя заряды. На основании общей длины генома вируса гриппа. (13 588 нуклеотидов) и количества молекул NP, ассоциированных с одной вирусной частицей [54], можно рассчитать, что приблизительно 20 нуклеотидов взаимодействуют с одной белковой субъединицей. Можно также предположить, что РНК связана с наружной частью рибонуклеопротеидной структуры, так как она может замещаться поливинилсульфатом (84, 204] и чувствительна к расщеплению рибонуклеазой без разрушения структуры РНП [68.., [c.49]

Белок РВ1 содержит много кластеров основных аминокислот в участках, которые, очевидно, лишены вторичной структуры (т. е. аминокислотные остатки, которые начинаются от 187, 207, 429 и 479 [58]). Эти кластеры содержат 3—4 аргинина и лизин, расположенные в непосредственной близости без прерывания аминокислотными остатками. Такие кластеры основных аминокислот подобны присутствующим в белке РВ2, но более выражены, чем кластеры в белке NP штамма РЕ/8 [62, 68] и белке М [67]. Кластеры основных аминокислот обнаружены в а-спиральных участках молекулы белка. Поскольку белок РВ1, вероятно, взаимодействует с матрицей вирусной РНК во время инициации транскрипции, эти кластеры основных остатков могут играть существенную роль в катализе этого процесса. Было высказано предположение о существовании подобных взаимодействий РНК — белок через кластеры основных аминокислот для белка РВ2 вируса гриппа [36], белка NP вируса гриппа [68], нуклеокапсида вируса леса Семлики [29], белка VP1 SV40 [63] и вируса полиомы [60] и антигена кора вируса гепатита [52]. [c.254]

Сегмент 7 РНК вируса гриппа В/Ьее/40 содержит 1191 нуклеотид. После 5 -некодирующего участка из 24 нуклеотидов следует открытая рамка считывания, простирающаяся от первого кодона возможной инициации белкового синтеза в нуклеотидах 25—27 до терминального кодона в нуклеотидах 769—771. Этот участок может кодировать белок, состоящий из 248 аминокислот, что соответствует по размеру оцененной молекулярной массе белка М. Начиная с нуклеотида 513, следует второй открытый участок — рамка считывания -Ь2, простирающаяся до терминирующего кодона в нуклеотидах 1095—1097. В нуклеотидах 1171—1175 располагается тракт из пяти адениновых остатков. Этот участок, возможно, представляет сайт полиаденилирования для вирусных мРНК, как и в случае вируса гриппа А [86]. Полиаденилирование в этом сайте должно давать М1 мРНК из примерно 1175 вирусных нуклеотидов. [c.279]

Аминокислотный состав вирусных белков определяют следующим образом 1) выделяют вирус, не содержащий значительных примесей других белков 2) удаляют вирусную РНК 3) гидролиэугот белок (обычно с помощью 6 н. НС1) для расщепления его на аминокислоты 4) фракционируют и определяют отдельные аминокислоты. Триптофан определяют отдельно, при помощи специального метода. [c.76]

Как уже указывалось выше, удалось синтезировать in vilro инфекционную РНК фага Qp. Кроме того, были синтезированы структурный белок и белок созревания фага R17 и других бактериофагов. Неболылие вирусы растений были реконструированы из их белка и РНК. Если бы все это удалось осуществить для одной вирусной системы, то мы были бы в состоянии синтезировать in vitro полную инфекционную вирусную частип у из [нуклеотидов и аминокислот с помощью соответствующих ферментов, рибосом, транспортных РНК и запаса АТФ. [c.144]

Смотреть страницы где упоминается термин Аминокислоты вирусных белков: [c.139] [c.236] [c.244] [c.340] [c.131] [c.465] [c.249] [c.289] [c.27] [c.281] [c.281] [c.358] [c.464] [c.182] [c.199] [c.301] [c.350] [c.152] [c.27] [c.53]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология