Неповторяющиеся последовательности неповторяющаяся ДНК, уникальные

Таким образом, в рамках первоначального представления о неповторяющейся ДНК как состоящей из уникальных последовательностей генома это свойство более всего связано с наличием интронов. Задаваясь вопросом, являются ли структурные гены неповторяющимися, мы, следовательно, видим, что ответ неоднозначен ген как таковой в целом может быть уникальным, но его экзоны иногда имеют сходство с экзонами других генов. Поэтому, по крайней мере для некоторых генов, экзоны представляют собой слабо повторяющиеся последовательности, окруженные уникальными последовательностями интронов. [c.255]

Умеренно повторяющиеся последовательности, присутствующие в количестве менее чем 10 копий на гаплоидный геном, не образуют кластеров, а чередуются с неповторяющимися (уникальными) последовательностями. Они могут быть как короткими, так и весьма протяженными. Длинные диспергированные повторы состоят из 5000—7000 пар оснований и представлены в количестве 1000—100000 копий на гаплоидный геном. Они фланкированы с обоих концов прямыми повторами длиной в 300— 600 пар оснований (рис. 38.8). Во многих случаях длинные повторы транскрибируются РНК-полимеразой II в виде молекул мРНК, содержащих такие же кэпированные 5 -концы, как и мРНК. [c.70]

Уникальные, или неповторяющиеся, последовательности ДНК [c.69]

Более половины геномной ДНК эукариотических организмов принадлежит к классу уникальных, или неповторяющихся, последовательностей. Это утверждение (а также оценки, касающиеся распределения в геноме повторяющихся последовательностей ДНК) базируется на данных непрямых экспериментов с применением различных методик ДНК-РНК-гибридизации, позволяющих получить лишь приблизительную оценку. У дрожжей—низших эукариот—экспрессируется около 4000 генов. В типичной ткани млекопитающих (печень или почки) экспрессируется от 10000 до 15000 генов. При этом в каждой ткани происходит экспрессия специфического набора генов. Каким образом это достигается, по-прежнему остается одним из центральных вопросов современной биологии. [c.69]

Структурный ген может быть уникальным и состоять из последовательности ДНК, представляющей в геноме специфический белок и не похожей ни на какую другую последовательность генома. Такая последовательность, несомненно, будет входить в состав фракции неповторяющейся ДНК. [c.230]

Почти все охарактеризованные к настоящему времени геномы органелл представляют собой одну молекулу ДНК с уникальной последовательностью нуклеотидных оснований. Обычно ее можно выделить в виде кольцевой молекулы, хотя иногда при вьщелении возникают столь частые разрывы, что основная часть материала приобретает вид линейных фрагментов ДНК. Исключение составляют инфузории, у которых митохондриальная ДНК представлена линейной молекулой. Как правило, в каждой митохондрии содержится несколько копий ее генома. Поскольку в клетке имеется множество митохондрий, то на одну клетку может приходиться большое число геномов данной органеллы. Таким образом, несмотря на то что сам по себе геном органеллы уникален, он представляет собой повторяющуюся последовательность, относительно сходную с любой неповторяющейся ядерной последовательностью. [c.282]

ДНК эукариотического генома можно разделить на два класса последовательностей . Это уникальные, или неповторяющиеся, последовательности и повторяющиеся последовательности ДНК (повторы). К первому классу последовательностей ДНК относятся однокопийные гены, кодирующие белки. Класс повторяющихся последовательностей ДНК представлен повторами с копийностью от 2 до 10 на клетку. [c.69]

НЕПОВТОРЯЮЩАЯСЯ ДНК. Характеризуется кинетикой реассоциации, свойственной уникальным последовательностям. [c.523]

Совпадение этих величин означает, что медленно ре-натурирующая фракция состоит из неповторяющихся (уникальных) последовательностей генома после денатурации каждая одноцепочечная последовательность может [c.225]

Зависимость концентрации одноцепочечной ДНК от времени в процессе реакции ренатурации описывается гиперболической функцией (вывод формулы приводится в дополнении 9.1). График зависимости концентрации от времени при fej = 1 изображен на рис. 9.2. С помощью этого уравнения по времени необходимому для ренатурации половины исходного количества ДНК ( / q = 0,5), можно определять показатель реакции ренатурации ( oii/2)- Эта величина прямо пропорциональна числу нуклеотидов в неповторяющейся последовательности ДНК. Эта закономерность иллюстрируется на рис. 9.3 для нуклеиновых кислот, полученных из различных объектов. Другими словами, мы можем определить общий объем уникальной генетической информации, кодируемой ДНК, измеряя значение t i2 Более того, экспериментально определяя кривые ренатурации ДНК, мы можем установить присутствие в геноме повторяющейся генетической информации. [c.262]

Анализ гибридизации ДНК из клеток человека показал, что примерно 70% одноцепочечных фрагментов гибридизуется очень медленно, т. е. так, как и следует ожидать в случае большого набора уникальных (неповторяющихся) последовательностей (полная гибридизация присходит в течение нескольких дней). Однако остальные 30% цепей ДНК гибридизуется гораздо быстрее. Эти цени содержат последовательности, которые многократно повторены в геноме, и, следовательно, могут относительно быстро найти своего партнера. Большая часть такой ДНК не кодирует белки, приблизительно одну ее треть составляют тандемно повторяющиеся сателлитные последовательности, остальные две трети приходятся на рассеянную по геном) повторяющуюся ДНК. Эти диснергированные повторы, но-видимому, произошли из транспозируемых элементов, размножившихся в нашем геноме и достигших исключительно высокой степени конийности. [c.242]

Такого рода исследования показали, что геномы эукариот содержат последовательности ДНК разных типов с разной степенью повторяемости отдельных нуклеотидных последовательностей. Один тип ( частые повторы ) состоит из быстро реиа-турирующих последовательностей ДНК, представленных 10 — 10 копиями другой, промеоюуточньиХ класс состоит из последовательностей, повторяющихся Ю —10 раз существует класс умеренно повторяющихся (20—50 копий) и класс уникальных неповторяющихся) последовательностей, представленных 1—2 копиями. Таким образом, большая доля ДНК генома эукариот состоит из множества копий определенных последова- [c.452]

Есть еще одна группа повторяющихся последовательностей, которые, очевидно, расположены ие локально, а диффузно по всему геному. Об этом свидетельствуют результаты опытов, в которых измеряли степень реиатурации как функцию размера используемых фрагментов ДНК. Было обнаружено, что в большинстве случаев эти повторяющиеся последовательности распределены по всему геному и вставлены между уникальными (неповторяющимися) последовательностями ДНК. Обычно считается, что уникальная ДНК содержит как структурные гены, кодирующие белки, так и другие гены, функция которых иеиз [c.453]

Согласно другим данным, некоторые из повторяющихся последовательностей распределены по всему геному случайно. Об этом свидетельствует, например, тот факт, что при ренатурации фрагментов ДНК Дрозофилы образуются кольца ДНК, которые можно увидеть с помощью электронного микроскопа [278]. Кольца во время ренатурации могут образовываться в результате фрагментации внутри повторяющихся последовательностей. В хромосомах Хепориз может содержаться около -25% таких повторяющихся последовательностей. Данные, полученные при электронной микроскопии, свидетельствуют о том, что случайная реассоциация фрагментов ДНК приводит к образованию двухцепочечных участков, содержащих повторяющиеся нуклеотидные последовательности, с одноцепочечными хвостами . Последние обычно не спариваются, поскольку содержат уникальные последовательности, пришедшие из разных генов. У Хепори повторяющиеся фрагменты ДНК включают приблизительно 300 нуклеотидов, а неповторяющиеся, или уникальные, фрагменты, расположенные между ними, — приблизительно 800 нуклеотидов [275]. [c.298]

Бактериальный Г. содержит в осн. неповторяющиеся гены лишь немногие гены, напр, кодирующие рибосо-мальные РНК, присутствуют в бактериальном Г. в виде неск. копий. В Г. высших организмов по степени повторяемости выделяют три осн. типа нуклеотидных последовательностей высокоповторяющиеся (до 10 копий), умеренно повторяющиеся (10 -10 копий) и уникальные. Последние м.б. представлены одной или неск. копиями. В эту фракцию входит подавляющее число генов, кодирующих белки. Повторяющиеся последовательности обычно составляют в зависимости от вида организма 10-70% всего Г. Их, как правило, меньше у низкоорганизованных организмов и больше у высших. Выяснены ф-ции лишь очень малой части всех повторов. Особую фракцию Г. составляют мигрирующие генетические элементы. [c.519]

ЭТОМ чужеродная ДНК, не имеющая этих опознавательных метильных групп, разрущается рестриктирующими эндонуклеазами. В эукариотических ДНК присутствует большое число высокоповторяющихся коротких последовательностей, меньшее число более длинных умеренных повторов, которые, как полагают, играют регуляторную роль, и ряд уникальных (неповторяющихся) участков, представляющих собой, видимо, структурные гены. Эукариотические гены содержат вставочные нетрансли-руёмые нуклеотидные последовательности, называемые интронами, которые вставлены между транслируемыми участками, называемыми экзонами. С помощью недавно разработанных методов были определены нуклеотидные последовательности ряда генов и вирусных ДНК. [c.891]

Поведение ренатурировавшей неповторяющейся ДНК очень похоже на поведение исходного препарата ДНК до его денатурации. При проведении денатурации ренатури-ровавший препарат быстро плавится при Т л, значение которой чуть ниже значения Т л исходной нативной ДНК. Это означает, что реассоциация цепей прошла точно. Каждая уникальная последовательность сгибридизо-валась с полностью комплементарным ей участком. [c.228]

В другом случае структурный ген может быть уникальным в том смысле, что он действительно представляет собой последовательность ДНК, кодирующую специфический белковый продукт, но в геноме могут присутствовать и другие последовательности, сходные с этим геном и кодирующие сходные белки. Такая ситуация наблюдается, когда кодирующая последовательность дуплицируется с последующей дивергенцией ее копий и появлением разных белков. В зависимости от степени сходства между последовательностями ДНК, числа копий и точно не предсказуемых последствий ошибок спаривания при реассоциации такие последовательности могут обнаруживаться во фракциях как неповторяющейся, так и умеренно повторяющейся ДНК. Еще один возможный способ организации генома эукариот состоит в том, что структурные гены могут повторяться может существовать более одной копии последовательности, кодирующей специфический белок. Вследствие выро-жденности генетического кода последовательности ДНК, кодирующие один и тот же белок, в действительности могут быть неидентичными. Однако любая последовательность, представленная небольшим числом копий (более двух или трех), будет вести себя как составная часть фракции умеренно повторяющейся ДНК. (Понятно, что такие последовательности могут составлять только часть, этой фракции, поскольку известно, что основная часть умеренно повторяющейся ДНК состоит из отдельных последовательностей, слишком коротких, чтобы кодировать белки, и чередующихся с уникальной ДНК.) [c.230]

РНК- (или ДНК-) зонд участвует в реакции так, как если бы он просто входил в состав фракции последовательностей, с которой он транскрибировался. Эту фракцию выявляют, сравнивая кривую гибридизации радиоактивного зонда с кривой реассоциации всей ДНК. Поэтому значения при которых гибридизуется меченая РНК, могут быть использованы для определения частот повторяемости соответствующих последовательностей генома. Когда зондом служит индивидуальная мРНК, она гибридизуется при единственном значении СоЬ/г, зависящем от частоты повторяемости гена или генов, представляющих ее в геноме. Для уникального гена эта величина будет такой же, как для неповторяющейся ДНК, в то время как для повторяющихся генов будет наблюдаться соответствующее уменьшение значения При использовании популяции молекул мРНК каждая мРНК гибридизуется при определенном значении Со х/г так, что кривая в целом представляет собой сумму кривых гибридизации индивидуальных компонентов. Такую кривую можно разложить на составляющие ее компоненты так же, как и кривую реассоциации самой ДНК генома. [c.231]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология