Критическая концентрация лиганда

В ряде различных способов, которые были придуманы для того, чтобы определить знак и оценить величину т, был использован один общий подход. В качестве эталона сравнения для замкнутой ДНК, в которой предполагали наличие сверхспирализации, использовали ту же ДНК, но с единственным разрывом в одной из цепей (аналогичную форме II ДНК вируса полиомы). Обычно условия в опыте варьируют таким образом, чтобы это приводило к изменению jSp у обеих форм, при этом измеряют какой-либо физический параметр, например скорость седиментации, вязкость, количество связанного лиганда или плавучую плотность. Можно ожидать, например, что депротонирование или связывание с этидием приведет к расплетанию двойной спирали, в результате чего iBq уменьшится. На рис. 24.6 показан типичный результат подобного опыта. С увеличением количества этн-дия, связанного с ДНК, коэффициенты седиментации открытой и замкнутой форм становятся одинаковыми, а затем снова расходятся. В той точке, где обе формы характеризуются одинаковыми значениями какого-либо из перечисленных выше физических параметров, они должны иметь одинаковую форму и содержать одинаковое количество связанных молекул лиганда. Мы будем называть количество связанного этидия в этой точке, приходящееся на пару оснований, критической концентрацией данного лиганда на ДНК. [c.397]

Допустим, что мы имеем одну и ту же ДНК и разные лиганды. Тогда а , = ор2 и 0 кр1 = < >2"кр2- Измерив отношение критических концентраций связанных лигандов, мы можем определить отношение отвечающих им значений угла, на который раскручивается двойная спираль ДНК при связывании с одной молекулой лиганда. Таким способом было [c.399]

По мнению Оргела, при наличии в исходном комплексе обычных связей такой подход группы затруднителен, так как повсеместно выступают гантели электронных облаков или Но если один из лигандов способен образовать дативную я-связь, то это приведет к оттягиванию соответствующего я-облака или у2-орбитали в сторону этого лиганда. Именно это оттягивание электронов и вызовет минимальную концентрацию электронной плотности по критическим направлениям или у -орби-талей со стороны лиганда В, необходимую для понижения энергии активации. [c.147]

Связывание актиномицина и АК идет ступенчато, через ряд промежуточных форм. Комплексообразование меняет конформацию ДНК. Рентгенографическое исследование показало, что ДНК в комплексе с профлавином имеет больший щаг спирали, чем у свободной ДНК и частично раскручивается [139]. Опыты со сверхскрученной (зирегсоИес ) кольцевой ДНК показали, что -В присутствии АК и актиномицина она раскручивается [140,, 141]. В такой ДНК основная правая спираль закручена в правую спираль более высокого порядка. Раскручивание сверхскрученной ДНК при образовании комплекса приводит вследствие топологических особенностей кольцевой структуры самой ДНК к изменениям геометрии всей макромолекулы. Установлено существование критической концентрации лиганда, отвечающей полному раскручиванию сверхспирали дальнейшее добавление красителя вызывает закручивание ДНК в обратном направлении с образованием левой сверхспирали. Эти факты обнаруживаются методом седиментации. [c.528]

Снижение избирательности сорбента при выделении макромолекул после превышения некоторой критической концентрации лиганда (когда сорбент начинает действовать как неспецифический ионообменник) впервые описано Кальдероном и др. [16]. При выделении ацетилхолинэстеразы аффинный сорбент теряет свою специфичность, если концентрация лиганда возрастает от 0,15-10" до 1,6-10 моль/л. Критические концентрации лиганда составляют, следовательно, 10 моль/л, что соответствует расстоянию между ближайшими соседними молекулами лиганда, равному 100 А, если предполагается равномерное распределение молекул лиганда внутри геля в узлах кубической решетки. Понятно, что при концентрации < 10 з моль/л молекулы лиганда находятся на достаточно больших расстояниях друг от друга, чтобы предотвра- [c.80]

Однако при определенной, критической концентрации метилфталевых кислот в оксидате образуется катализаторный ко.мплекс настолько прочный и лиганды так плотно экранируют центральный атом, что подход других лигапдов, изменение состава комплекса и окисление становятся невозможными. [c.86]

По-видимому, в нащем случае метилфталевые кислоты находясь-в оксидате в критической концентрации, блокируют катализатор, образуя с ним прочный, малоактивный комплекс. Но отравление катализатора— равновесный процесс [101. Лиганды, дезактивирующие катализатор, можно вытеснить пз комплекса, если последний с новыми-лигандами более активен и концентрация их достаточна для образования активного комплекса. Подобное явление мы наблюдали при добавках 0,13—0,24 мол.% метилфталевых кислот в начале процесса при самопроизвольном паконленни или искусственном внесении альдегидов. Последние, находясь в оксидате в количестве ме менее 5,0 мол.%, вытесняют метилфталевые кислоты из катализаторного комплекса (трудиорастворнмого в псевдокумоле), образуют новый, легко растворимый комплекс кобальта с альдегидами (зеленого цвета), переводят катализатор в активное состояние и дают толчок развитию процесса реакция протекает с высокой скоростью. [c.86]

Критическая концентрация ингибитора сильно зависит от структуры использованного соединения, в частности, от строения хелатного узла. Хелатные соединения меди, содержащие атом серы в халатном узле, обеспечивают более резкие переходы от автоускоренного режима к стационарному, чем хелаты, содержащие в составе хелатного узла атом азота и.пи кислорода [29]. Зависимость от природы катализатора может быть обусловлена изменением как константы кт, так и параметра б (доли молекулярного распада КООН). В случае различных азотсодержащих хелатпых соединений мели можно полагать, что изменение критической концентрации связано только с изменением к и поскольку стр5жтура лиганда в этом случае не влияет на скорость распада КООН, а следовательно, вероятнее всего и на величину 6. [c.132]

Теоретически выведенная взаимосвязь между количеством сорбируемого фермента, концентрацией аффинного лиганда и константами равновесия лиганд — фермент рассмотрена в гл. 3. Из рис. 3.3 следует, что для систем с низким сродством Кь = = 10 2 моль/л) концентрация привязанного аффинного лиганда представляет собой критический параметр для получения эффективного сорбента. На рис. 5.6 показана аффинная хроматография глюкокиназы на 2-амино-2-дезокси-о-глюкопиранозо-N-(6-амино-гексаноил) —сефарозе при четырех концентрациях связанного аффинанта [15]. Видно, что оптимальная концентрация аффинного лиганда равна 3,75 мкмоль/г (рис. 5.6,6) при более низких концентрациях фермент не отделяется от неактивного материала, в то время как при более высоких концентрациях необходимо увеличить концентрацию глюкозы в элюате и при этом глюкокиназа выходит в большем объеме элюата. При концентрации 10 мкмоль/г глюкокиназа не может быть элюирована даже при высоких концентрациях глюкозы она может быть снята только пропусканием 0,5 М хлорида калия. [c.75]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология