Терминация цепи РНК

В основе метода секвенирования ДНК, разработанного Сэнгером и соавт. [Sanger et al., 1977а], называемого также методом секвенирования путем терминации цепи, лежал принцип ферментативного построения комплементарной цепи ДНК по существующей одноцепочечной матрице при происходящем в разных местах цепи ДНК ингибировании ее дальнейшего роста. [c.46]

Первые исключения из универсальности генетического кода были недавно обнаружены в митохондриях некоторых видов. Во всех случаях было замечено одно общее изменение кодон UGA читался так же, как UGG, и поэтому из кодона-терминатора превратился в кодон для триптофана. Другие изменения были специфическими для каждого вида. У дрожжей кодон UA и, возможно, все семейство UN кодирует треонин вместо лейцина. У млекопитающих AUA имеет то же значение, что AUG, и означает метионин вместо изолейцина. Кодоны AGA и AGG вызывают терминацию цепи, а не кодируют аргинин. Некоторые из этих изменений приводят к упрощению кода-в том смысле, что два кодона, которые имели разное значение, замещаются парой кодонов с одинаковым значением. [c.62]

После того, как синтезировано примерно восемь нуклеотидов молекулы РНК (стадия 4, рис. 9-65), о -субъединица диссоциирует, а вместо нее с молекулой фермента соединяется несколько факторов элонгации, необходимых для удлинения и терминации цепи. К факторам элонгации [c.144]

Преждевременная терминация цепи. Один из видов [3-талассемии возникает в результате замены одного основания в кодоне лизина AAG, приводящей к образованию стои-кодона UAG в 17-м положении. [c.154]

В ДНК закодированы не только сигналы инициации транскрипции, но также и сигналы терминации. Как происходит терминация роста цепи РНК, пока еще точно не установлено. Известно лишь, что некоторые сигналы терминации бактериальная РНК-полимераза распознает сама, тогда как для распознавания других сигналов необходимы дополнительные белки. Одним из таких белков, возможно, служит ро-фактор (р), индуцирующий терминацию цепей РНК in vitro [55]. р-Фактор Е. oli представляет собой белок с мол. весом 200 000, обладающий АТРазной активностью [55а]. [c.215]

Репликаза фага Q способна in vitro синтезировать цепи, полностью комплементарные как плюс-, так и минус-молекулам вирусной РНК. Система, однако, специфична для вирусной РНК и не может копировать никаких других полинуклеотидов. Возможно, что для инициации процесса репликации нужно, чтобы на З -конце имелись определенные последовательности. В пробирке репликация протекает с ошибками, такими, в частности, как преждевременная терминация цепи и неправильное спаривание оснований. В результате происходит образование мутантных форм РНК, что дает возможность получать молекулы РНК, размеры которой будут значительно меньше, чем у вирусной РНК, и которые будут при этом легко реплицироваться репликазной системой фага Q . Была установлена нуклеотидная последовательность одного из таких фрагментов, включающего всего лишь 114 нуклеотидов . [c.245]

Подобно температурочувствительным мутантам, amber- и o hre-мутанты могут быть получены практически для любого гена бактериофага. Мутантов с терминацией цепи, у которых утерянные гены не имеют жизненно важного значения для бактерий, можно распознать, обеспечив перенос генов либо путем скрещивания, либо путем вирус- [c.254]

В местах р-зависимой терминации РНК-полимераза делает паузы в отсутствие р-фактора, поэтому считается, что роль р-фак-тора заключается в вытеснении РНК из транскрипционного комплекса в местах пауз. Рассматриваются две модели. Согласно одной из них. фактор движется по синтезируемой РНК. а в местах пауз догоняет РНК-полимеразу и вытесняет РНК-продукт. Другая модель основана на том. что пирофосфат подавляет НТФазную активность р-фактора. Согласно этой модели, р-фактор движется за РНК-полимеразой без отставания, но при нормальной скорости элонгации ингибируется пирофосфатом, высвобождающимся прн синтезе РНК- Активация р-фактора происходит лишь в местах пауз, где синтез цепи РНК временно останавливается, что приводит к прекращению освобождения пирофосфата. [c.157]

Наиболее хорошо изучены супрессорные гены, подавляющие большое число различных мутаций, ведущих к преждевременной терминации цепи. Объяснить химическую природу этих генов удалось только частично при помощи опытов с переносом супрессорного геиа supF (su3) в ДНК бактериофага. Оказалось, что эта ДНК специфически 1ибридизуется с минорными видами тирозиновой тРН,К iтиооаинпмй [c.255]

Терш1национныс сигналы—см. Терминация транскрипции, Терминация цепи. [c.83]

Терминация цепи состоит в том, что по мере движения рибосомы вдоль мРНК возникает сигнал к завершению процесса образования пептида. Такими сигналами служат кодоны УАА, УАГ и УГА. В результате этого из рибосомы высвобождается полная полипептидная цепь и, вероятно, осуществляется диссоциация рибосомы на субчастицы и разрушается мРНК. [c.83]

Как мы уже упоминали, UAA, UAG и UGA (стоп-кодоны)обозначают терминацию цепи. Эти кодоны считываются не молекулами тРНК, а особыми белками - факторами терминации. Сигнал начала (инициации) синтеза белка более сложен. Нолипеп-тидные цепи у бактерий начинаются с модифицированной аминокислоты формилме-тионина (fMet). [c.76]

I является необходимым компонентом важнейшего метода определения последовательности ДНК, который называют методом терминации цепи . Для установления последовательности ДНК, как обсуждалось в гл. 9, необходимо получить серии радиоактивно меченых пере-крываюшихся фрагментов, причем в рамках каждой серии все фрагменты должны начинаться с одной общей точки и статистически распределяться по длине таким образом, чтобы на противоположном конце каждого фрагмента находилось основание одного определенного (для данной серии) типа-А, Т, О или С. В этом методе серии перекрывающихся фрагментов получают с помощью ДНК-полимеразы [c.114]

Рис. 13.9. Определение нуклеотидной последовательности фрагмента ДНК с помощью клонирования на фаге М13 и последующего использования метода терминации цепи с применением фрагмента Клёнова ДНК-по-

Поскольку в основе метода ферментативного секвенирования лежит построение новой комплементарной цепи ДНК по уже имеющейся, то большое значение приобретает подготовка молекул ДНК для осуществления этого процесса. Так, если для метода секвенирования ДНК химической деградацией было необходимо наличие одно- или двуцепочечного фрагмента, нe 5ш eгo на одном (гомогенном) из своих концов единственную метку, то для секвенирования ферментативным методом необходимо наличие немеченной матрицы ДНК и при этом желательно одноцепочечной. Хотя, справедливости ради, следует отметить, что матрица ДНК, несущая какую-либо метку (включая и радиоактивную), в большинстве случаев не окажет заметного влияния на заключительный радиоавтограф из-за большой разницы в размерах самой матрицы и вновь синтезированной в условиях терминации цепи ДНК. Что касается матрицы ДНК, один из концов которой несет метку в виде молекулы биотина, то в этом случае возможна ее сорбция на твердой фазе, например, на магнитных частицах со стрептавидином и проведение так называемого твердофазного секвенирования. При этом выхода биотинилированной метки в заключительный раствор терминирующей смеси, содержащей комплементарную цепь ДНК, меченную уже как-то по-другому и предназначенную для нанесения на секвенирующий гель, даже не произойдет. [c.48]

Третий ствол олицетворяет собой разделение по размеру меченых продуктов, образующихся как в ходе химической деградации в методе Максама-Гилберта, так и в результате специфической терминации цепи ДНК в методе Сэнгера, и осуществляется с помощью высоковольтного электрофореза в полиакриламидном геле высокого разрешения, позволяющего разделять фрагменты ДНК, отличающиеся между собой по длине всего на один нуклеотид, в достаточно широком диапазоне (рис. 14.3). [c.421]

Не все РНК-полимеразы прокариот представляют собой мультису ьединичные ферменты. РНК-полимеразы, кодируемые бактериофагами ТЗ и Т7 Е. соИ,— это одиночные полипептидные цепи средней длины ( 100 кДа). Эти ферменты высокоспецифичны в отношении промоторных сайтов, используемых для транскрипции определенного набора вирусных генов. Такие упрошенные ферменты обладают всеми активностями мультисубьединичных РНК-полимераз. Они катализируют синтез РНК на ДНК-матрицах и осуи стЕляют правильную терминацию цепей РНК. [c.123]

Рис. 27.9. Супрессия мутации, приводящей к терминации цепи, второй мутацией в молекуле тРНК.

Па матрице poly(AUAG) также получались только ди- и трипептиды, так как UAG-второй сигнал терминации цепи [c.74]

Каков биологический смысл сильной вы-рожденности генетического кода Один из возможных ответов состоит в том, что выро-жденность сводит к минимуму пагубное действие мутаций. Если бы код не был вырожден, 20 кодонов кодировали бы аминокислоты, а 44 вызывали бы терминацию цепи. [c.76]

Таким образом, вероятность превращения кодона в сигнал терминации была бы гораздо выгпе в случае невырожденного кода, чем в существующем коде. Важно учесть, что мутации, приводящие к образованию сигнала терминации цепи, обычно приводят к синтезу неактивных белков, тогда как замещение одной аминокислоты другой обычно относительно безвредно. Кроме того, вы-рожденность кода может иметь определенное значение постольку, поскольку она позволяет нуклеотидному составу ДНК меняться в широких пределах, не влияя на аминокислотную последовательность белков, кодируемых этой ДНК, ([G] + + [С])-содержание бактериальных ДНК колеблется от 30% до более 70%. Молекулы ДНК с сильно различающимся содержанием [G] + [С] могут кодировать одни и те же белки благодаря систематическому использованию различных синонимов. [c.76]

Рис. 142. Схема терминации синтеза (+) цепи фага <рХ174

Образование полипептидных связей на рибосомах обычно подразделяют на три процесса инициацию, элонгацию и терминацию [98]. Синтез белка начинается с инициирующего кодоиа чаще всего им является кодон метионина AUG. Кодон GUG, расположенный надлежащим образом в цепи мРНК, также может служить инициирующим кодоном. В этом случае он детерминирует метионин, а не валин. Для распознавания стартового сигнала важную роль может играть также последовательность оснований, предшествующая инициирующему кодону. На это указывает тот факт, что кодоны AUG и GUG встречаются не только в точках инициации. [c.231]

Смотреть страницы где упоминается термин Терминация цепи РНК: [c.205] [c.244] [c.254] [c.256] [c.887] [c.192] [c.196] [c.114] [c.116] [c.109] [c.103] [c.110] [c.110] [c.156] [c.268] [c.121] [c.58] [c.96] [c.16] [c.324] [c.217] [c.220] [c.236] [c.241] [c.251]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология