Капсид определение

Четыре компонента вируса существуют в виде частиц различного размера. Это означает, что один и тот же капсидный белок может упаковать каждую РНК в характерную именно для нее частицу. Такой способ упаковки отличается от способа упаковки отрезков нуклеиновой кислоты одного размера в капсиды определенной формы. Однако и у вирусов, имеющих только одну правильную форму капсида, в процессе сбор и могут возникать измененные формы капсида. Речь идет о частицах-монстрах, головка которых длиннее обычной. Таким образом, белку (или белкам) капсида присуща способность собираться в структуру определенного типа, но точный размер и форма этих структур не инвариантны. Во многих случаях существуют также белки сборки, которые не входят в состав оболочки головки, но способствуют правильной сборке частицы. Клеточные геномы также используют белки, функция которых-направлять сборку других белков (см. гл. 29). [c.347]

Для структуры капсида характерны определенные типы симметрии, особенно полиэдрическая и спиральная. Полиэдр — это многогранник. Наиболее распространенная полиэдрическая форма у вирусов — икосаэдр, у которого имеется 20 треугольных граней, 12 углов и 30 ребер. На рис. 2.17, А мы видим правильный икосаэдр, а на рис. 2Л7, Б— вирус герпеса, в частице которого 162 капсомера организованы в икосаэдр. [c.34]

Недавно методом контролируемого щелочного гидролиза было показано, что в родственном фаге fl [578] имеется и второй белок капсида, который содержит аргинин и гистидин и играет определенную роль в прикреплении кончика фаговой палочки к выростам бактериальной клетки. Возможно, что этот белок эквивалентен А-белку РНК-содержащих фагов [392]. [c.89]

После того как количество вновь синтезированной фаговой ДНК достигает определенного уровня (примерно через 8 мин после инфицирования), синтез некоторых ранних ферментов прекращается и начинается синтез белков капсида. Еще один поздний продукт — это фаговый лизоцим. Полные вирусные частицы начинают появляться примерно через 15 мин после инфицирования. Когда их концентрация достигает максимума, клетка разрывается и фаги высвобождаются В последние годы изучению механизмов созревания уделялось очень много внимания. Вопрос этот будет обсуждаться в следующем разделе. Играет ли роль лизоцим фага в такого рода лизисе изнутри и разрыве клетки хозяина — все еще неизвестно. [c.259]

Капсиды вирионов состоят из отдельных структурных субъединиц (полипептидные цепи), объединенных в симметричные группы по кубическому или спиральному типу симметрии (рис. 23, а, б). Объединения единиц с кубическим типом симметрии называются морфологическими единицами, или капсомерами, которые могут быть обнаружены при электронной микроскопии. Капсиды построены из определенного числа капсомеров, характерного для каждой группы вирусов с кубическим типом симметрии. Например, у аденовирусов (рис. 24, а, б) капсид построен из 252 капсомеров. У вирионов со спиральным типом симметрии структурные [c.32]

В данном разделе описаны методы определения типа, содержания и размера нуклеиновой кислоты вирусных частиц, а также числа и молекулярной массы индивидуальных белков, образующих капсид. [c.33]

Определяя объем на глаз, легко собирать фракции по 0,5— г- 2 мл этим методом удобно пользоваться, если нужно собрать пиковые фракции, а в точном определении скорости седиментации необходимости нет. На рис, 2.4, а приведен результат. подобного раскапывания градиента объемом 36 мл на 2-мл фракции в градиенте центрифугировали вирус, меченный р 5]-метионином. Здесь А —пик инфекционных частиц (1555), а В (80 5) —пик пустых капсидов. [c.63]

Каждая из этих последовательностей превращений идет в строго определенном порядке. Все белки капсида синтезируются одновременно во второй половине цикла заражения. Таким образом, строгой последовательности сборки головки, отростка и нитей отростка способствуют структурные особенности самих промежуточных продуктов. Ни один из этих процессов ассоциации не может идти с заметной скоростью, пока не закончится предыдущий. Возможно, часть [c.173]

Вирусная оболочка (или капсид) построена в общих чертах из относительно небольших белковых молекул, имеющих правильную форму и способных поэтому собираться в устойчивые оболочки определенных размеров. Процесс этот осуществляется за счет образования водородных связей, ионных и гидрофобных взаимодействий, а не обычных химических связей. Структурные особенности вирусных белков, обусловливающие такое высокое специфическое связывание идентичных, а иногда и неидентичных молекул, по-видимому, не менее сложны, чем у ферлюнтов или ряда других белков, таких, как авидин или антитела [357], связывающихся со своими субстратами и другими малыми или большими молекулами с высокой степенью сродства и специфичности. Эта способность к специфическому связыванию обусловлена специфической конформацией белка, которая в свою очередь определяется последовательностью образующих белки аминокислот. Именно по этой причине выяснение аминокислотной последовательности вирусных белков и представляет громадный интерес. Работа по изучению вирусных белков проводилась в целом ряде лабораторий на множестве различных вирусов. Первичная структура вирусных белков представляет интерес не только потому, что с ней связана функциональная активность белков, [c.63]

Хотя сами по себе вирионы пикорнавирусов не содержат липидов, в клеточных фракциях они часто связаны с мембранами, и для разрушения этой связи обычно применяют детергент в концентрации 17о. Если не удалить клеточные мембраны, то на следующих стадиях очистки не удается освободить вирус от примесей. Использовались самые разные детергенты, начиная с мягкого неионного детергента нонидета Р-40 (N1 -40) и кончая ДД -Na или саркозилом. По-видимому, наиболее разумно использовать мягкие детергенты, так как пустые капсиды и вирионы некоторых вирусов (например, определенных штаммов полиовируса типа 3) могут разрушаться более сильно действующими агентами. Мы, как правило, используем 1%-ный НР-40. [c.59]

Максимальный размер фрагментов ДНК, которые можно клонировать в фазмидах, обычно несколько меньше допустимой величины встройки для векторов на основе ДНК фага Я (этот размер легко высчитать, зная величину вектора см. 2.2.2). Фазмиду выделяют из клеток в виде плазмиды, гидролизуют определенной рестриктазой и лигируют с продуктами неполного гидролиза изучаемой ДНК, после чего проводят упаковку ДНК в капсиды фага Я. [c.109]

В этом разделе мы рассмотрим ряд методов определения концентрации вируса в различных препаратах. При необходимости определение инфекционного титра проводят методом бляшек (см. разд. 6.1), который позволяет наилучшим образом охарактеризовать вирусный препарат. Недостаток данного метода состоит в том, что он требует довольно много времени. Во многих случаях приблизительный титр определяют по проценту инфицированных клеток методом иммунофлуоресцентного окрашивания на Т-антиген (для этого сравнивают значения, полученные при инфицировании культур тестируемым препаратом и препаратом, титр которого известен). С помощью реакции гемагглютинации (см. разд. 6.2) так же, как и путем измерения оптической плотности или электронной микроскопии препаратов, можно определить общее количество вирусных частиц, в том числе пустых капсидов, псевдовирионов (содержащих вместо вирусной ДНК фрагментированную ДНК клетки-хозяина) и ДИЧ [12]. По соотношению между БОЕ и ГАЕ можно сделать вывод о наличии дефектных частиц в препаратах вируса. Для хороших заготовок вируса это соотношение составляет около 5-105—10 [13]. С большей точностью дефектные и другие нестандартные вирионы можно выявить, экстрагируя вирусную ДНК из небольшого объема заготовки (или лизата) и исследуя ее с помощью рестрикционного анализа или электрофореза (см. разд. 6.3). [c.235]

Локализация полипептидов в вирионе установлена в экспериментах по иодированию поверхностных белков, а также при сравнении белкового состава сердцевин вирионов и интактных частиц. Обработка химотрипсином в определенных условиях лриводит к частичному удалению наружного капсида [35, 38, 40, 130]. Белки оЗ, д,1С и а1 удаляются последовательно в результате ступенчатого расш.епления с образованием промежуточных продуктов. По-видимому, они являются компонентами наружного капсида. Именно в эти белки включается метка при иодировании интактных вирионов (но не сердцевины), и это еще раз свидетельствует об их поверхностной локализации 169, 179]. [c.276]

Подавлять синтез ДНК способны и реовирусные частицы, инактивированные УФ-светом, но ни пустые капсиды (верхний компонент градиента), ни сердцевины такого эффекта не вызывают [155, 267.] Вначале предполагали, что подавление синтеза ДНК связано с вирусными белками aNS или аЗ. Для них обоих характерно высокое сродство к ДНК в определенных (но не во всех [123]) условиях in vitro [268]. Важный вклад в решение проблемы ингибирования синтеза ДНК внесли генетические исследования. Известно, что реовирус типа 3 подавляет синтез ДНК в клетках L, а типа 1 — нет. Это обстоятельство позволило картировать ген, ответственный за подавление, используя реассортанты реовирусов, которые содержали различные комбинации генов двух указанных реовирусов. Этот подход показал, что способность подавлять синтез ДНК связана с белком al (вирусный гемагглютинин), который кодируется геном S1 [254]. [c.293]

У известных в настоящее время вирусов капсида построена до двум типам симметрии кубическому и спиральному. Большинство вирусов имеет кубический тип симметрии Белковая оболочка таких вирусов состоит из шаровидных капсомеров, образующих различные комбинации равносторонних треугольников, которые, определенным образом сочетаясь друг с другом, образуют замкнутую сферическую поверхность. К этой группе относят пи-корнавирусы, реовирусы, паповавирусы, аденовирусы, гер-песвирусы и др. [c.5]

В определенных условиях при медленном охлаждении раствора денатурированного нагреванием белка происходит ренативация — восстановление исходной (нативной) конформации (см. рис. 1.20, 4). Это подтверждает, что характер укладки пептидной цепи определяется первичной структурой белка. Процесс образования нативной конформации белка самопроизвольный, т. е. эта конформация отвечает минимуму свободной энергии молекулы. Можно сказать, что пространственная структура белка закодирована в аминокислотной последовательности пептидных цепей. Это означает, что все идентичные по чередованию аминокислот полипептиды (например, пептидные цепи миоглобина) будут принимать идентичную же конформацию. Однако из этого правила есть исключения. Капсид (оболочка) вируса кустистости томатов содержит белок, построенный из субъединиц А, В и С первичная структура этих субъединиц идентична, а конформация различна. Известны идентичные олигопептидные последовательности (около 5 аминокислотных остатков), которые в одних белках образуют а-спирали, в других — р-струк-туры. Таким образом, нативная конформация каждого участка пептидной цепи зависит не только от его первичной структуры, но и от ближайшего окружения. [c.36]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология