Кодирующие области

Для идентификации нужного гена человека используют четыре метода. В первом из них, функциональном картировании, на основе данных о генном продукте синтезируют зонды для скрининга кДНК-библиотеки. Положительный кДНК-клон, содержащий кодирующую область гена-мишени, используют для отбора геномных клонов и характеристики гена в целом. Второй подход, кандидатное картирование, основывается на выборе генов, которые по имеющимся [c.480]

В экспрессирующие векторы млекопитающих уже встроены гены самых разных белков и осуществлена их экспрессия в хозяйских клетках. Иногда выход продукта увеличивался, если между промотором и клонированным геном встраивали интрон. Механизм этого феномена неизвестен. Возможно, первичный транскрипт клонированного гена содержит скрытые сайты сплайсинга, по которым вырезается часть кодирующей области клонированного гена, а при наличии дополнительного интрона сплайсинг по ним происходит с меньщей вероятностью. [c.150]

В специфический хромосомный сайт Е8-клеток можно не только встроить трансген, кодирующий какую-то новую функцию, но и направленно разрушить этот сайт интеграцией с его кодирующей областью специфической последовательности (обычно селективного маркерного гена) (рис. 19.7). Одна из задач направленного нарущения ( нокаута ) гена состоит в исследовании влияния этого процесса на развитие организма и протекающие в нем физиологические процессы. Кроме того, есть надежда, что трансгенных животных с нарушением в определенном гене можно использовать как модель для изучения болезней человека на молекулярном уровне. [c.425]

Как установить, что вставка геномного клона содержит кодирующую область гена [c.482]

Использование перекрывающихся рамок считывания означает, что одна последовательность ДНК может кодировать два белка. Это немедленно ограничивает обычную гибкость, присущую кодирующей области, так как изменение основания в третьем положении не повреждает одного белка, но, вероятно, повредит другой белок. Мутации в перекрывающихся участках должны приводить [c.63]

Промежуток-между кодирующими областями варьирует от —1 до 40 оснований [c.118]

Каждая кодирующая область обладает своим собственным инициирую- [c.118]

Первая кодирующая область [c.119]

Вторая кодирующая область Инициация [c.119]

Цель биотехнологических экспериментов часто состоит в идентификации генов, кодирующих определенные белки (структурньЕх генов). У прокариот кодирующие домены структурных генов непрерывны, а у эукариот кодирующие области (экзоны) разделены некодирующими (интронами). Соответственно при клонировании генов про-и эукариот должны применяться разные стратегии. [c.62]

В левой части расположен ген lad, имеющий свой собственный промотор и, по-видимому, терминатор. Конец кодирующей области гена lad непосредственно прилегает к /ясР-промотору, который разделяется на [c.177]

Г ен, кодирующий цитохром Ь, известен под названием box или ob. Он существует в двух формах. Некоторые штаммы дрожжей имеют длинный ген, кодирующая область которого размером 1155 п. н. располагается на участке ДНК длиной около 6400 п. п. и имеет в своем составе шесть экзонов (обозначаемых как В1 -В6), в том числе несколько очень коротких. Другие штаммы имеют короткий ген, по длине равный примерно половине [c.258]

Было бы не удивительно, если бы количество ДНК, кодирующее определенную функцию, в 3-4 раза превышало ее ожидаемое количество в случае кодирования каждой функции одним-единственным геном. Анализируя число генов в гл. 18 и 19, мы пришли к выводу о наличии у млекопитающих примерно 30000-40 000 кодируемых генами функций. Если допустить, что это, по-видимому, соответствует 150 ООО генов, считая, что каждый ген в несколько раз длиннее своей кодирующей области и занимает участок ДНК, скажем, 5000 п. н., то мы получим величину около 10 п. н., что составляет около трети от размеров генома. [c.280]

С молекулярной точки зрения ген представляет собой специфическую нуклеотидную последовательность, транскрибируемую в РНК. Подавляющее большинство транскрибируемых последовательностей ДНК составляют так называемые структурные гены, на которых синтезируются мРНК. Конечным продуктом структурного гена является белок. У прокариот структурный ген представляет собой непрерывный участок молекулы ДНК. Транскрипция начинается со связывания РНК-полимеразы с промотором, и далее последовательно копируется весь структурный ген (кодирующая область) от первого нуклеотида до последнего с образованием функциональной мРНК (рис. 3.10). У эукари- [c.35]

Введение гена ингибитора П протеиназы картофеля в растения риса защищает их от розового стеблевого точильщика (Sesamia inferens), основного насекомого-вредителя для этой культуры заражение приводит к образованию полых стеблей и мертвых метелок без семян. Была сконструирована плазмида, содержащая ген ингибитора II протеиназы картофеля под контролем его собственного промотора и сигнала терминации транскрипции. Между промотором и кодирующей областью гена ингибитора был [c.393]

В том случае, если в каждом праймере содержатся рестрикционные сайты, клонируют ПЦР-продукт, несущий пойманный экзон, и используют последний в качестве зонда для скрининга кДНК-библиотеки. Зная нуклеотидную последовательность пойманного экзона, предпринимают поиск гомологичных ему последовательностей в базе данных. Если есть основания полагать, что пойманный экзон с большой вероятностью является частью гена данного заболевания, то характеризуют и секвенируют геномные клоны, охватывающие место расположения данного гена, и исследуют образцы ДНК больных и здоровых индивидов с целью выявления мутаций. Поскольку мутации, ответственные за патологию, не всегда бывают равномерно распределены по всем экзонам, чем больше размер сканированной кодирующей области предполагаемого гена, тем больше вероятность обнаружения мутации. [c.476]

Internet Line). Они созданы исходя из некоторых характерных для экзона особенностей. Одна из них - ожидаемая нуклеотидная последовательность кодирующей области. Если лаборатория оснащена оборудованием для широкомасштабного секвенирования, можно секвенировать геномные клоны, охватывающие область расположения искомого гена, и провести компьютерную обработку полученных данных с целью выявления экзонов. Нуклеотидную последовательность предполагаемого экзона можно использовать для поиска гомологичных ей последовательностей в генной базе данных или синтезировать на ее основе олигонуклеотидный зонд для скрининга кДНК-библиотеки. Наконец, как и в случае других методов идентификации экзонов в геномных клонах, необходимо доказать, что предполагаемый экзон является частью гена-мишени. [c.476]

В ДНК некоторых прокариот (археобактерии), в ядре и митохондриях эукариот кодирующие области прерываются большими некодирующими ДНК-последовательностями (до 5000 пар нуклеотидов) По предложению У Гилберта (1978) кодирующие области называют экзонами, или доменами, некодирующие — нитронами Например, в генах тяжелой Н-цепи иммуноглобулинов (1д) находится не менее 4 интронов и 5 экзонов, в гене яичного белка (овальбумина)7 интронов и 8 экзонов, из 3,5 биллионов пар нуклеотидов в ДНК гаплоидного генома человека кодирующими являются менее 10% Прерывистость генов у эукариот — явление обычное, хотя известны гены, в которых подобная прерывистость не обнаружена (в генах интерферона, гистонов) [c.161]

На самом деле эти пулы генов сложнее, чем показано на рис. 17-40. Вместо того чтобы кодироваться одним-единственным V-геном, как предполагалось вначале, каждая V-область полипептидной цепи кодируется двумя или тремя отдельными генными сегментами, которые объединяются в функциональный V-ген только тогда, когда происходит перестройка ДНК, соединяющая вместе V- и С-кодирующие области. Как мы увидим, такое объединение различных V-сегментов, приводящее к образованию гена V-области, существенно увеличивает разнообразие антигеи-связывающих участков. [c.38]

Рамка считывания, содержащая последовательную серию кодонов, соответствующих аминокислотной последовательности, называется открытой. До сих пор мы говорили о кодовых значениях, имея в виду открытую рамку считывания, начинающуюся с какой-то фиксированной точки. Но в чем состоит стартовый сигнал Точно так же, как нонсенс-кодоны используются для терминации белкового синтеза, другой набор кодонов служит для его запуска. Общим сигналом инициации является соответствующий метионину кодон AUG в комбинации с предшествующей ему последовательностью, нужной для прикрепления рибосом к мРНК. В некоторых случаях для инициации используется также кодон GUG, который вопреки коду транслируется как метионин, а не как ва-лин. Таким образом, кодирующая область состоит из кодона AUG (или GUG), следующей за ним серии триплетов, составляющих открытую рамку считывания, и оканчивается терминирующими кодонами UAA, UAG и UGA. [c.63]

В ходе этого процесса инициирующие кодоны взаимодействуют только с инициаторной аминоацил-тРНК (через малую субчастицу), тогда как триплеты, расположенные в пределах кодирующей области, взаимодействуют только с обычными аминоацил-тРНК (благодаря целой рибосоме). [c.75]

Бактериальные мРНК часто содержат несколько кодирующих областей, каждая из которых обладает собственной инициирующей последовательностью, способной непосредственно связывать 308-субчастицу. Иногда эти последовательности могут быть маскированы вторичной структурой мРНК, но, как правило, их фуи- [c.79]

В случае полицистронных бактериальных мРНК очередность событий показывает, что трансляция должна происходить последовательно-цистрон за цистроном. В тот момент, когда рибосомы прикрепляются к первому кодирующему участку, последующая кодирующая область, возможно, еще даже не транскрибировалась. К тому времени, когда второй сайт, связывающий рибосомы, только становится доступным, в первом цистроне трансляция уже достигает значительных размеров. [c.118]

Почти с самого начала изучения триптофанового оперона было известно, что помимо комплекса промотор— оператор в регуляции участвует еще и другой сайт. Его существование впервые было обнаружено в результате наблюдений, показавших, что делетирование последовательности, расположенной между оператором и кодирующей областью trpE, приводит к повышенной экспрессии структурных генов. Этот эффект не зависит от репрессии возрастают как базальный, так и дерепрессированный уровни транскрипции. Следовательно, происходящие при этом события совершаются после того, как РНК-полимераза покинула промотор (независимо от условий, существующих в момент инициирования транскрипции). [c.191]

Транскрипт промотора Ре содержит антисмысловую последовательность гена его, который обычно транскрибируется в противоположном направлении (т.е. в направлении от Pr). Антисмысловая последовательность его не транслируется с РЕ-транскрипта. но кодирующая область el транслируется очень эффективно (по сравнению со слабой трансляцией Рм-транскрипта, упоминавшейся ранее). В действительности репрессор синтезируется примерно в семь или восемь раз более эффективнее при экспрессии с промотора Ре, чем с промотора [c.217]

Таким образом, некоторые ключевые вопросы остались нерешенными. Какая часть геномной ДНК действительно связана с образованием белков в том смысле, что она соответствует гену, либо его кодирующей области, либо промежуточным или транскрибируемым фланки-pyюшJ м последовательностям Какое количество генов жизненно необходимо, а какое несущественно для выживания Какова функция (если она существует) ДНК, которая не входит в состав генов Какое влияние на функционирование генома оказывает значительное изменение его общего размера, как в случае родственных представителей класса амфибий [c.223]

Прерывание кодирующих областей характерно только для эукариот, но обнаружено не для всех эукариотических генов. Разумеется, к настоящему времени охарактеризо-вано еще недостаточное число генов для определения среднего соотношения между размером гена и мРНК. Поэтому до сих пор не понятно, в какой степени факт наличия интронов помогает объяснить парадокс величины [c.246]

Для аденовируса показано (рис. 20.6), что 5 -конец поздней мРНК действительно образуется в результате объединения трех очень коротких последовательностей РНК, соответствующих далеко отстоящим участкам вирусного генома. В этом примере состоящий из трех частей 5 -участок соответствует нетранслируемой лидерной последовательности, в то время как кодирующая область представлена основной частью мРНК. На рис. 20.7 приведены данные электронной микроскопии по организации вирусного генома. Строение показанного там гибрида указывает на то, что при наличии нескольких промежуточных последовательностей структуры на микрофотографии становятся запутанными и сложными для интерпретации. [c.248]

Локус oxi3 кодирует субъединицу 1 цитохромокси-дазы. Кодирующая область гена имеет размер 1530 п. н., располагаясь на участке ДНК длиной 10000 п.н. В состав локуса входит восемь экзонов, два из которых имеют очень небольшую длину. [c.258]

Если выделить молекулы РНК, соответствующие гену box, то они по размеру распадаются на ряд дискретных классов. Наиболее короткие молекулы составляют в длину около 3000 оснований и соответствуют мРНК. Они длиннее кодирующей области и включают 5 - и З -не-транслируемые области, не показанные на карте, приведенной на рис. 20.22. Молекулы больших размеров содержат один или более интронов. Самые большие молекулы размером 8500 оснований, по-видимому, представляют собой интактный первичный продукт транскрипции. Другие молекулы-это промежуточные продукты сплайсинга, в которых одни интроны уже удалены, а другие-еще нет. [c.258]

Существует ли какая-либо очевидная эволюционная взаимосвязь между разными функциями, кодируемыми интронами Открытые рамки считывания интронов содержат ряд сходных последовательностей, но до сих пор не ясно, имеют ли они какое-либо значение. Во всех кодирующих областях интронов частота использования определенных кодонов несколько отличается от частоты использования кодонов в экзонах. Поскольку не ясно, какие преимущества митохондрии извлекают из сохранения такой сложной системы экспрессии своих прерывистых генов, можно предположить, что когда-то существовал отдельный белок, участвующий в сплайсинге второго интрона гена box. Позже соответствующий ему ген мог быть транслоцирован в интрон, что привело к возникновению существующей в настоящее время структуры. Тем не менее остается справедливым утверждение, что, по-видимому, единственная цель кодируемой интроном функции состоит в удалении кодирующей последовательности из мРНК. [c.262]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология