Урацил димеры

При облучении урацила в замороженном водном растворе кроме циклобутанового димера Х1а был выделен фотопродукт, не обладающий циклобутановой структурой, которому на основании ЯМР-, УФ- и ИК-спектров была приписана структура [c.639]

Механизм фотодимеризации. Присутствие кислорода в водном растворе при фотодимеризации урацила, а также ряда его замещенных (уридина, уридиловых кислот) снижает выход соответствующего димера Аналогичный эффект наблюдается при фотодимеризации урацила в ацетонитриле в присутствии изопрена Кислород и изопрен являются, как известно, тушителями триплетного состояния, и поэтому приведенные факты являются доводом в пользу того, что фотодимеризация протекает через нижнее возбужденное триплетное состояние Это же подтверждается и данными, полученными с помощью импульсного фотолиза водных растворов урацила Другим, правда косвенным, доводом в пользу этого положения является проведение фотодимеризации урацила с помощью фотосенсибилизации (известно, что при фотосенсибилизации возбуждается триплетное состояние). [c.640]

Т. е. темновым дезаминированием цитозина до урацила в составе смешанного димера. [c.235]

Инактивация РНК-содержаш их вирусов протекает с участием не только одних пиримидиновых димеров. Суш,ественный вклад в инактивацию вносят и гидраты оснований. Например, из РНК облученного вируса табачной мозаики выделены следующие фотопродукты пиримидиновые гидраты, два типа циклобутановых димеров и два фотопродукта неизвестной природы. При этом на один летальный удар приходилось 1,2 гидратов урацила, [c.281]

Рис. 24.45. Модель димера урацила, образованного под действием ультрафиолетового облучения. Тиминовый димер имеет примерно такую же структуру.

Данные по межмолекулярной ассоциации в паре азотистых оснований нуклеиновых кислот получены Суходубом и Янсоном [129], которые на масс-спектрометре исследовали пары следующих ассоциатов аденин-урацил, аденин-тимин, гуанин-цитозин, урацил-урацил, ти-мин-тимин, цитозин-цитозин, урацил-тимин. Наблюдаемые в парах молекулы оснований связаны друг с другом водородными связями, образуя циклические димеры. Из соотношения интенсивностей пиков димеров и мономеров для каждой пары определена величина, пропорциональная константе ассоциации. Из температурного хода интенсивностей пиков получены следующие значения энтальпии образования пар (в ккал/моль) 21 (гуанин-цитозин) 14,5 (аденин-урацил) 13 (аденин-тимин) 12 (цитозин-цитозин) 9,5 (урацил-урацил) и 9,0 (тимин-тимин). [c.94]

Фотодимеризация. Наряду с присоединением воды УФ-облуче-ние урацила приводит к реакции иного типа — присоединению второй молекулы пиримидина с образованием димера который, как было показано позднее, имеет циклобутановую структуру XI 2. 105. 0 0 О О [c.638]

Аналогичные димеры образуют при облучении уридин 9 -уридиловые кислоты динуклеозидмонофосфаты уридина и уридин в составе поли-и и РНК При облучении замороженных растворов урацила и его производных 9 фотодимеризация является основной реакцией. [c.638]

Подобно фотодимерам урацила, тиминовые димеры фотола-бильны. При облучении (А, < 290 ммк) водных растворов фотодимеров тимина и его производных они распадаются до исходных мономеров >68. Чувствительность фотоднмеров к облучению [c.653]

Фотодимеризация. При УФ-облучении в водном растворе цитозин, цитидин и цитидиловые кислоты не димеризуются При фотолизе замороженного раствора димер цитозина образуется с выходом 3—7%.Очевидно,фотодимеризация облегчает дезаминирование -поскольку при оттаивании замороженных растворов димер цитозина легко превращается в димер урацила 2. В замороженных растворах цитозин образует также с небольшим выходом смешанные фотодимеры с урацилом и тиминомЦитозиновые фотодимеры образуются, кроме того, наряду с фотогидратами при облучении растворов цитозиновых олиго- 208,224 полинуклеотидов 209, а также растворов ДНК и РНК [c.669]

Для димеров тимина [78] были предложены различные структуры. В результате цис- и траяс-расположения гетероциклических систем вокруг циклобутанового кольца мож1Ю себе представить четыре изомера этого димера. Облучение замороженного водного раствора 1,3-диметилтимнна дает два димера, которые можно разделить, причем один из них идентичен соединению, полученному исчерпывающим метилированием димера самого тимина [79]. Спектры ядерного магнитного резонанса не позволяют различить изомеры, так как протоны, присоединенные к атому Сд пиримидиновых циклов, независимо от изомера в магнитном поле эквивалентны, и поэтому, даже когда С.-.-иоложение является соседним, нельзя ожидать расщепления спинов [74]. Облучение смеси тимина и урацила дает смешанный димер [75]. [c.537]

Очевидным преимуществом этого метода является возможность закрепления РНК иа поверхности геля за счет урацил-урациловых димеров. Благодаря этому появляется возможность проводить РНК — РНК-гибри-дизацию или обращенную РНК — ДНК-гибридизацию (когда вместо ДНК фиксируется РНК). Первый вариант был использован Бриттеном [1], который связывал с гелем поли-У и гибридизировал ее с иоли-А. [c.150]

Несколько а,Р-ненасыщенных кетонов, как было показано, также димеризуются при облучении в твердом состоянии. Так, кумарин дает фотодимер типа голова к голове [683]. Урацил С, тимин Н и их производные, очевидно, фотодимеризуются, давая производные циклобутана / или аналогичные димеры голова к голове [685]. [c.436]

В присутствии других пиримидинов 5-бромурацил (X I) образует димер и смешанные димеры, а в живой культуре Е. соИ образуются димер, урацил и четыре других соединения [88]. Разнообразие фотохимических превращений, которое имеет место при фотолизе производных урацила, близких по строению к гербицидным пиримидинам, дает представление о сложности процессов, которые, как можно ожидать, протекают при фотолизе бромацила и изоцила. [c.349]

При облучении растворов нуклеотидов и ДНК образуются смешанные тимин-цитозиновый, тимин-урацило-вый и урацил-цитозиновый димеры. Смешанный тимин-цитозиновый димер практически не мон омеризуется под действием света и представляет собой гранс-изомер. На первый взгляд кажется странным образование в ДНК тимин-урацилового димера, поскольку известно, что урацил не входит в состав ДНК. Это противоречие объясняется следующей схемой [c.235]

В отличие от димеров гидраты разрушаются в темноте при повышенных температурах, при сдвигах pH как в щелочную, так и в кислую сторону, при повышении ионной силы раствора. Квантовый выход фото-гидратации урацила в растворе 0,002, в полиуридиловой кислоте 0,01. Есть все основания считать, что предшественником фотогидратов служат не триплетные, а ст-глетние возбужденные состояния пиримидиновых оснований, поскольку, во-первых, выход фотогидратации не зависит ох.длины волны света, в то время как вероятность конверсии в триплетное состояние зависит от нее во-вторых, триплетные тушители, влияя на скорость димеризации, оказываются неэффективными по отношению к гидратации в-третьих, избирательное заселение триплетных уровней оснований за счет миграции энергии не сопровождается гидратацией. [c.237]

Более лабилен квантовый выход отдельных реакций. Фотохимические реакции в полинуклеотидах нельзя рассматривать как сумму химических реакций мононуклеотидов, нуклеозидов и азотистых оснований. Наконец, фотохимия нуклеиновых кислот зависит не только от их состава, но и от конформации макромолекулы (микроокружения). Например, скорость гидратации цитозина и урацила в нативной ДНК и полиуридиладениловой кислоте намного меньше, чем в денатурированной ДНК и полиуридиловой кислоте соответственно. Вероятность образования димеров между пиримидиновыми основаниями ДНК зависит от природы соседних оснований. Димерообразование подавлено в бактериальных спорах, в сухой ДНК и замороженных растворах ДНК. Этот процесс подавляется также связыванием интерка-ляционных красителей. [c.244]

И соседняя (или соседние) молекула. Последней может быть биологическая молекула того же (димеры тимина, цитозина, урацила) или другого (димеры тимин-цитози-на, цитозин-урацила) типа, а также неорганические молекулы НгО, Ог (гидрат урацила, превращение —S—S->2SH в белках, протохлорофиллид-> хлорофиллид при биосинтезе хлорофилла). [c.368]

Повреждения в ДНК, вызванные ионизирующей радиацией, ультрафиолетовым светом и различными химическими соединениями, постоянно репарируются. Например, пиримидиновые димеры, индуцированные ультрафиолетовым светом, вырезаются специфической эндонуклеазой. Урацил, который образуется при спонтанном дезаминировании цитозина в ДНК, удаляется гликозидазой, которая дифференцирует урацил и тимин. [c.43]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология