также константы связывания

Промотор — это участок ДНК, в котором происходит в самом начале присоединение РНК-полимеразы к ДНК значения констант связывания, характеризующих присоединение РНК-полимеразы к промоторам, очень велики. Сильное влияние на скорость ассоциации и инициации могут оказывать специальные регуляторные белки. Один из них — сАМР-рецепторный белок ( AP)—имеет важное значение для Ia -оперона. Он также связывается в промоторном участке (рис. 15-3). [c.202]

Каждая группа характеризуется микроскопической константой связывания (К ), равной б-Ю" (которую можно назвать также истинной константой связывания, так как она относится к карбоксильной группе, не взаимодействующей с другими группами). Интуитивно ясно, что в отношении связывания протонов раствор дианиона дикарбоновой кислоты должен вести себя точно так же, как раствор моноаниона I —СОО вдвое большей концентрации. Если это действительно так, то для характеристики обоих центров связывания достаточно знать одну истинную константу. Тем не менее, как это ни странно, константы образования /<1 и Кй, соответствующие связыванию первого и второго протонов, оказываются неодинаковыми /<1 = 10-Ю" Кг =2,5-Ю". Этот факт обусловлен так называемым статистическим эффектом. На первой стадии протон может присоединиться к любой из двух карбоксильных групп, и образующиеся при этом молекулы будут неразличимы [c.257]

Пиррол дает в спектре ПМР два мультиплета с центрами при 6,33 млн-1 (шкала б) (а — Н) и 6,14 млн- (р — Н) и широкий сигнал около 7,25 млн- (протон КН-группы) [17]. Сигналы группы СН становятся значительно более четкими при замещении атома водорода группы ЫН на дейтерий в присутствии калиевой соли пиррола все сигналы делаются очень острыми. Как и в других ароматических системах, сигналы несколько изменяются с концентрацией и температурой вследствие межмолекулярного связывания, а в ароматических и полярных средах —в результате ассоциации с растворителем. Константы спин-спинового взаимодействия приведены в табл. 17.1.1 определены также константы [c.337]

Хорошо известно также, что амиды образуют комплексы с другими соединениями, способными образовывать водородные связи. Взаимодействие с фенолами (в особенности), аминами и тиолами изучено количественно константы связывания приведены в обзоре [149]. Амиды образуют также водородные связи с три-хлорметаном процесс конкурирует с димеризацией и препятствует связыванию амидов с другими веществами [188]. Количественно степень образования водородной связи можно связать как с кислотностью донора, так и с основностью акцептора. Например, фе- [c.442]

Увеличение Кр, и Кр по сравнению с Кр,, согласно схеме (4), может быть обусловлено двумя причинами во-первых, повышением стерического фактора реакции роста за счет одновременной координации мономера и радикала молекулой КО и, во-вторых, снижением энергии активации за счет поляризации переходного состояния вследствие делокализации неспаренного электрона в циклическом активированном комплексе А. Для выяснения этого вопроса необходимо измерение истинной энергии активации роста в присутствии КО. Подобные измерения осложнены, поскольку в настоящее время неизвестны точные значения констант связывания мономера и радикала КО, а также их температурная зависимость. [c.67]

Во-первых, гетерогенностью антител по физико-химическим свойствам, в том числе по сродству к антигену. Во-вторых, сложностью определения общего количества антител, а также отдельных фракций. В-третьих, в случае поливалентных антигенов возможностью образования комплексов сложного состава, в том числе циклической структуры, в которых проявляется кооператив-ность Взаимодействия активных центров антител. Все это не позволяет применить традиционные методы для расчета истинных значений констант связывания. Более надежные данные могут быть получены для моноклональных антител и их РаЬ-фрагментов, так как в этом случае могут быть выделены индивидуальные антитела в гомогенном виде. [c.41]

Константы связывания субстрата с мицеллами могут быть также получены из измерений растворимости субстрата как функции концентрации детергента [102, 104, 149—151]. В этом случае считается, что увеличение растворимости в присутствии детергента полностью определяется образованием комплекса субстрат — мицелла состава 1 1. По относительным растворимостям в присутствии ПАВ и б добавок детергента можно определить количество субстрата, связанного с ПАВ, а отсюда и константу связывания К [c.243]

Константы связывания К субстрата с мицеллами оценивались также по данным скорости прохождения субстрата через колонку с адсорбентом типа молекулярных сит в зависимости от концентрации детергента [97, 101, 11 ]. Исходя из параметров колонки Уг И Уо (объемы носителя, неподвижной жидкой фазы и движущейся жидкой фазы соответственно), а также из измерения удерживаемого объема Уе, константы пропорциональности к между количеством растворенного вещества на единицу объема носителя и равновесной концентрации мономерного субстрата в жидкости и константы, характеризующей свойства молекулярного сита Кь, можно вывести уравнение (15) [97] [c.244]

Данные по влиянию функциональных мицелл и некоторых других систем на скорость гидролиза эфиров собраны в табл. 11. Величины каталитических эффектов и констант связывания в этих системах, а также важность гидрофобных взаимодействий свидетельствуют о возможности использования таких функциональных агрегатов как моделей для изучения ферментативного катализа и структуры белков. [c.308]

ЗОМ обсуждены механизмы денатурации белков ионами металлов-посредников и ингибирования ферментов, а также проблема использования ионов металлов в качестве структурных зондов, с помощью которых может быть определена доступность и реакционная способность потенциальных лигандных групп белка. Повышенная реакционная способность потенциально способного к координации атома в белке по сравнению с его реакционной способностью в модельных системах заставляет предположить наличие рядом с ним в молекуле белка второго донора электронов, которого нет в используемых моделях. И наоборот, относительно пониженная реакционная способность потенциального места связывания свидетельствует о стерических затруднениях и (или) конформационных изменениях, сопутствующих связыванию. Для тех беЛ Ков, которые, будучи изолированными, находятся в состоянии с самой низкой свободной энергией, все такие конформационные изменения будут связаны с положительными вкладами в свободную энергию связывания, и поэтому будет наблюдаться более низкая кажущаяся константа связывания, чем та, которая была бы найдена в отсутствие конформационного изменения. [c.275]

Допустим, что эта проблема также решена и константа связывания антител в процессе выделения не изменилась. И в этом случае еще нет оснований считать результаты, полученные по калибровочному графику, истинными. Как известно, иммунный ответ организма на антиген индивидуален. Поэтому даже в том случае, если для приготовления стандарта использовался большой пул сывороток, велика вероятность, что среднеэффективная константа связывания антител в измеряемой сыворотке будет отлична от этой величины для стандарта, что опять будет приводить к неправильному определению концентрации. В связи с изложенным вопрос о точном определении концентрации антител является весьма проблематичным и на практике он ставится крайне редко. [c.261]

Вследствие доступности и важности белков сыворотки крови, особенно сывороточного альбумина, их чаше всего выбирают в качестве модели при изучении процессов связывания. Из анализа Скэтчарда известно, что связывание с белками является многоступенчатым равновесием, т. е. включает ряд центров связывания, у которых сродство к лиганду может быть различным. Вполне возможно, что суммарный результат и общая константа связывания могут оказаться различными для двух энантиомеров. Более того, исходя из часто демонстрируемой ферментами субстратной энантиоселективности можно предположить, что у других белков также возможно наличие центров сорбции, обладающих высоким сродством и энантиомерно-дифференцирующей способностью. [c.132]

Определяя константы связывания звеньев полиэлектроли-тов в ионные пары /Сг.хар и /Сг,хар, а также функцию кооперативности реакции ф(0) и ф (0) для конкретных систем, можно сопоставлять эти системы по эффективности кооперативного взаимодействия. [c.240]

Для уменьшения диссоциации окрашенных роданидных ком плексов часто применяются неводные растворители. Синий роданидный комплекс кобальта и желтый роданидный комплекс ниобия настолько диссоциируют в водных растворах, что колориметрическое их определение в обычных условиях нецелесообразно. Неводные растворители не просто уменьшают степень диссоциации роданидных комплексов, т. е. не только увеличивают степень связывания металла в окрашенный комплекс. Уменьшаются также константы всех ступеней диссоциации. Поэтому при том же общем избытке реактива все равновесия сдвигаются в сторону образования комплексов с большим числам координированных роданид-ионов обычно в ацетоне или при экстракции образуются тетра- и гексародани-ды. Молярные коэффициенты оветопоглощения этих комплеисов значительно выше. Поэтому чувствительность определения, например, ниобия увеличивается приблизительно в 2 раза, а железа — даже более чем на один порядок. Наконец, при образовании координационно-насыщенных комплексов в неводной среде мало влияют колебания концентрации реактива. [c.248]

Следует заметить, что закрепление инициатора в зоне адсорбционного слоя ПМЧ искусственным образом, независимо от его олярности, приводит к резкому изменению скорости его распада [206]. Локализация реакции разложения инициатора в адсорбционном слое может быть достигнута путем использования инициаторов, обладающих ярко выраженными поверхностно-активными свойствами, или химическим связыванием пероксидных инициирующих групп с поверхностью ПМЧ. Последний способ может быть реализован при эмульсионной сополимеризации виниловых мономеров с ненасыщенными пероксидами, например с метакрило-еым эфиром а-гиДроксиэтил-грег-бутилпероксидом (МЭП), причем пероксидные группы в зависимости от способа синтеза латекса могут быть равномерно распределены по объему частицы или преимущественно сконцентрированы на ее поверхности [207]. В табл. 5.3 приведены данные по разложению пероксидных сополимеров в виде латекса и в растворе хлорбензола, а также константы распада мицеллообразующего поверхностно-активного пероксида П1 в водном растворе. и его аналога IV, не проявляющего склонности к мицеллообразованию [207]. Из приведенных данных видно, что адсорбционный слой латексной частицы или мииелляр-ное состояние вещества оказывает решающее влияние на кинетику распада инициатора. Следует отметить факт разложения чрезвычайно устойчивых диалкильных пероксидных групп с высокими скоростями в латексных системах при относительно низких температурах. Этот факт может быть связан только с локализацией пероксидных групп в зоне адсорбционного слоя. Из рис 5,4 видно, что после разложения поверхностных пероксидных групп распад [c.122]

Хотя гемоглобин при высоком давлении кислорода почти так же хорошо связывает его, как и миоглобин, при низких давлениях он связывает Ог значительно хуже миоглобина и поэтому передает его миоглобину в мышцах, как это и нужно. Более того, потребность в кислороде будет наибольшей в тканях, которые уже использовали кислород и одновременно выработали СОа. Диоксид углерода понижает pH, а это еще больше увеличивает способность гемоглобина передавать кислород миоглобину. Влияние рЙ, так называемый эффект Бора, а также прогрессивное увеличение констант связывания кислоро да в гемоглобине обусловлены специфическими взаимодействиями между субъединицами. Миоглобин ведет себя проще, поскольку оц состоит только из одной субъединицы. Очевидно, что оба эти вещества необходимы для осуществления процесса транспорта. кислорода. Оксид углерода, РРз и некоторые, другие вещества токсичны, потому что они свя-зыва-ются с атомами железа гемоглобина прочнее, чем Ог. Они действуют как дон курентные ингибиторы. [c.642]

В обеих моделях математические операции по учету отдельных факторов, влияюп их на свобо2Сную энергию геля с поперечными связями, включают некоторые упро-ш ения, ограничиваюш ие область применения моделей. В случае модели Райса — Гарриса уравнения содержат величины, которые нельзя измерить экспериментально. Например, степень образования ионных пар определяется с помощью удельной константы связывания которую нельзя измерить экспериментально. Нельзя опытным путем проверить также предположение о том, что эффективная диэлектрическая константа в геле принимает [c.10]

Взаимодействие такого рода называют кооперативным-, в этом случае график зависимости т оличества связанного Оз от напряи ения кис. го-рода будет иметь форму сигмоидной кривой, а не гиперболы (фиг. 107). Сходные кривые получаются также для процесса образования комплекса гемоглоб ина с СО, с той литпь разницей, что константы связывания здесь примерно в сто раз болыпе. [c.384]

Кроме произведения растворимости большое значение имеют также константы ионизации соответствующей слабой кислоты. Чем эти константы меньше, тем сильнее понижается концентрация осаждающего иона вследствие связывания его Н+-ионами и тем большую величину pH нужно создать для практически полного осаждения соли. Например, поскольку угольная кислота Ki = = 4,5-10" , К2 = 4,8-10" ) значительно слабее щавелевой кислоты К =5,6-10-2, /(2 = 5Д. 10-5), дpJJ осаждении Са + в виде СаСОз требуется более высокое значение pH раствора, чем при осаждении его в виде СаС204, хотя значения произведений растворимости этих [c.168]

В заключение остановимся на реакции химических гаптенов и комплексных антигенов с химической детерминантой с антителами. Известно, что взаимодействие антигена с антителом обусловливается силами, действующими только на очень близком расстоянии. Так, например, активный центр антитела превосходит по своим размерам гаптенную детерминанту всего на 0,3—0,5 нм. На таком расстоянии связь мож т быть обусловлена гидрофобным взаимодействием, электростатическими силами, силами ван дер Ваальса, водородными связями или диполь-дипольным взаимодействием. Каждому гаптену в зависимости от его структуры свойственны те или иные типы связей (табл. 8). При взаимодействии антител против р-азобензойной кислоты со специфичными антителами константа связывания равна 1,0. Если уменьшить (замена гексилом) или полностью исключить (замена ме-тильной группой) гидрофобные взаимодействия, обусловленные бензольным кольцом, то константа связывания уменьшается в 500—1000 раз. Если ослабить электростатические силы, связанные с отрицательным зарядом карбоксильной группы, введением добавочных радикалов в бензольное кольцо или заменой карбоксила на АзОз, то константа связывания также уменьшается в 7—1000 раз. [c.47]

Структура и знак заряда детергента также влияют на каталитический эффект мицелл при гидролизе ортоэфиров. Детально изучено влияние 21 анионного, 2 цвиттерионных и неионного детергентов на скорость реакций гидролиза метилортобензоата [144]. Каталитическая эффективность анионных ПАВ уменьшается при удалении анионной группы от конца углеводородной цепи, а также при замене сульфатной группы на сульфонатную и в особенности на оксиэтилсульфатную группу (табл. 6). В отличие от анионных детергентов неионные и цвиттерионные замедляют гидролиз метилортобензоата, однако ингибирующий эффект невелик [144]. Подобные специфичности субстрата и катализатора обусловлены различиями в константах связывания и реакционных способностях между различными субстратами и детергентами. [c.266]

Катионные детергенты, содержащие в гидрофильной аммониевой группе фенильные заместители с повышенной электронной плотностью (фенил, бромистые 2,4-диметоксифенил- и 2,4-диметоксибензилдиметиламмоний), оказались более эффективными катализаторами гидролиза 2,4- и 2,6-динитрофенилфосфатов, чем БЦТА [136. Константы скорости этих реакций псевдопервого порядка возрастают уже при весьма низких концентрациях ПАВ (вблизи ККМ), и константы связывания мицеллы с субстратом определяются по уравнению (106). Наличие ароматических заместителей в молекуле ПАВ приводит к увеличению констант связывания и каталитического эффекта, однако скорость реакции в мицеллярной фазе, по-видимому, существенно не изменяется. Эти наблюдения показывают важность электростатических и гидрофобных взаимодействий, л также природы мицеллярной поверхности в связывании субстрата. Из этих опытов следует также, что [c.285]

Критическое значение для безошибочного синтеза белка имеет также правильное кодон-антикодоновое взаимодействие. Для различных кодон-антикодоновых взаимодействий значения констант связывания могут различаться, поскольку пары образуются между различными основаниями. Поэтому частота неправильного спаривания индивидуальна для каждой кодон-антикодоновой пары. Например, замена аргинина на цистеин в бактериальном белке флагеллине происходит с частотой приблизительно 1 на 10 триплетов, кодирующих аргинин. (Все неправильные включения в рассматриваемом примере происходят, по всей видимости, из-за ошибок при распознавании кодона, так как неверное ацилирование тРНК в данном случае маловероятно.) [c.114]

Для определения из экспериментальных данных (полученных в виде зависимостей Акаж от с) констант связывания К я К , а также величины (пропорциональной истинной константе скорости в мицеллярной фазе), уравнение (7) преобразуется к виду [c.229]

Сдвиг кажущейся величины рКд ионогенного реагента под действием поверхностного заряда мицеллы также играет значительную роль в кинетических мицеллярных эффектах. Предельная вел -чина этого эффекта определяется отношением констант связывания ионной и электронейтральной форм реагента [ см., например, уравнение (15)]. Оценка вклада элекгростатаческого взаимодействия однозарядного иона с зарядом мицелпы ионогенного ПАВ в связывание приводит к значению порядка от 10 до 100 [c.239]

Рис. 14,2 представляет собой семейство кривых, полученных для иллюстрации влияния увеличивающейся гидрофобности субстрата, что математически эквивалентно увеличению константы связьшания Кд при увеличении концентрации ПАВ, Общая форма кривых на рис. 14.2 может быть интерпретирована как наложение двух противоположных эффектов. Как только концентрация ПАВ стала больше ККЛ 1, в слое Штерна мицелпярной фазы быстро увеличиваются относительные концентрации органических субстратов и гидрофильных ионов. Чем больше константа связывания Кд, тем больше концентрационные эффекты, тем больше увеличение скорости и тем больше скорость, достигаемая при пониженной концентрации ПАВ. Положение максимума также сдвигается к более низким концентрациям ПАВ при увеличении К , поскольку на эти концентрационные эффекты накладывается противоположно направленное влияние непрерывного уменьшения в слое Штерна концентрации реагирующего противоиона. Общая концентрация нереагируюшего противоиона по— [c.254]

Многие из соединений группы тетрапиррола могут выполнять роль фотосенсибилизаторов в процессах перехода кислорода из основного триплетного состояния в синглетное. Поскольку двойные связи конъюгированных ароматических систем, а также ненасыщенные боковые заместители способны взаимодействовать с кислородом в синглетном состоянии, целесообразно — по меньшей мере в тех случаях, когда неизвестны химические свойства компонентов анализируемой смеси, — осуществлять хроматографическое разделение в отсутствие света (обычно достаточно обернуть колонку или хроматографическую каме-ру алюминиевой фольгой) и защищать вещество от воздействия света до и после хроматографирования. Кроме того, ароматический характер тетрапирролов способствует как одноэлектронному окислению циклической части молекулы, так и аутоокислению периферических заместителей, протекающему через промежуточное образование радикалов типа бензила. Когда молекулы адсорбированы на большой поверхности неподвижной фазы, скорость указанных реакций может существенно возрасти под действием света или окислителей, например присутствующих в растворителях пероксидов. Таким образом, как и в случае большинства других хроматографических экспериментов, для разделения рассматриваемых соединений следует использовать растворители подходящей квалификации. В силу того что тетрапирролы обладают высоким сродством к ионам металлов, необходимо позаботиться о том, чтобы растворители и сорбент не содержали примесей ионов тяжелых металлов, способных образовывать комплексы с хроматографируемыми соединениями. На практике, когда проводят выделение достаточно больших количеств вещества, это свойство тетрапирролов, как правило не создает особых проблем. Однако при работе на аналитическом уровне, особенно если соединения экстрагированы из природных источников, будь то биологические ткани или геологические образцы, необходимо отдавать себе отчет в том, что присутствие ионов металлов может привести к некоторому искажению хроматографической картины. Не существует никаких других удобных и общих способов избежать этого, кроме как свести к минимуму вероятность контактов образца с ионами металлов или металлами в ходе его экстракции, подготовки к анализу и хроматографирования (следует отметить, что даже никелированный шпатель может оказаться источником загрязнения образца). Поскольку константы связывания порфиринов с ионами металлов часто соизмеримы по своей величине с константами, характерными для таких хелатирующих агентов, как ЭДТА, использование последних при низкой концентрации с [c.203]

Распространение конформационных волн через регуляторные области К межет также сопровождаться изменением конформации этих областей и, следовательно, изменением констант связывания регуляторных белков с этими областями, что имеет особенно важное значение для регуляции фукнциональной активности ДНК. [c.349]

Имеющийся в продаже гепарин содержит 2 компонента— высокоаффинный и низкоаффинный, которые, вероятно, связываются с одной и той же областью молекул антитромбина III. Однако высокоаффинный гепарин обладает в 10 раз большей антикоагулянтной активностью, а также более высокой константой связывания, чем низкоаффинный. N-Десульфирование или модификация IdUA-остатков гепарина снижает его антикоагулянтную активность. [c.317]

Наличие сильной отрицательной кооперативности. На первых этапах насыщения активных центров субстратом каталитическая активность быстро возрастает, а затем, при насыщении субстратом примерно 50% активных центров, резко замедляется, вследствие чего это явление и получило название реакционная способность половины от числа активных центров . Для таких ферментов характерно существование двух типов констант связывания субстрата активными центрами, с сильным и слабым сродством, а также низкое (<1) значение коэффициента Хилла. [c.107]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология