Параметры связывания, получаемые из спектров

Недостаток применения изотопа состоит в том, что обычно он отсутствует в биологических объектах. А преимущество в том, что его можно ввести в определенные места молекулы и, следовательно, он будет играть роль внешней метки. Если число таких мест невелико, спектр состоит из небольшого количества линий. В случае белков Р используется двумя путями 1) вводят Р в участок связывания белка и наблюдают резонанс °Р в зависимости от действия различных агентов — pH, температуры, лигандов и т. д. 2) используют фторированный лиганд и наблюдают сигнал от связанного и несвязанного лиганда. Таким образом можно изучить химический обмен, определить различные параметры связывания и получить некоторые данные о структуре места связывания. Изотоп который до настоящего времени имел лишь ограниченное применение при исследовании нуклеотидов, мембран и фосфолипидов, наверняка будет более широко использоваться в будущем. [c.515]

В случае некоторых молекул поглощение фотона сопровождается испусканием света с большей длиной волны (т. е. меньшей энергией). Испускание света называется флуоресценцией (или фосфоресценцией, если свечение долгоживущее). Спектры флуоресценции еще в большей степени, чем спектры поглощения, зависят от окружения. Для надежной регистрации параметров флуоресценции требуются меньшие количества вещества. В связи с этим использование флуоресцентной спектроскопии часто дает определенные преимущества по сравнению с измерением поглощения (хотя техника получения абсорбционных спектров более проста). Путем измерения флуоресценции можно получить сведения о конформации, местах связывания, взаимодействиях с растворителем, степени гибкости, межмолекулярных расстояниях и коэффициентах вращательной диффузии макромолекул. К тому же флуоресценцию можно использовать для локализации в живых кл етках тех веществ, которые невозможно обнаружить другими методами. [c.415]

Исходя из того, что одна молекула белка связывала от одного до двух свободных радикалов, авторы предположили, что в сывороточном альбумине имеется две различные аминогруппы, реагирующие с иминоксильными свободными радикалами. В случае присоединения парамагнитной метки к аминогруппе, расположенной на поверхности молекулы белка, получается спектр ЭПР со слабой иммобилизацией спин-метки. Другая аминогруппа, расположенная в глубине белковой глобулы, при связывании со спин-меткой дает спектр ЭПР сильно иммобилизованных свободных радикалов. В последнем случае свободный радикал, связанный ковалентной связью с молекулой белка, гидрофобно взаимодействует с близлежащим участком полипептидиой цепи. При кислотно-щелочной денатурации сывороточного альбумина, а также при переваривании спин-меченого белка пепсином широкие компоненты спектра ЭПР сильно иммобилизованных свободных радикалов исчезали, и сигнал ЭПР исследуемой системы приближался по своим параметрам к спектру ЭПР описанного (стр. 166) спин-меченого поли- -лизина. [c.167]

Проблема утилизации супертоксикантов сегодня стала действительно одной из серьезнейших проблем, которые стоят перед человечеством. При изучении процесса плазмохимической утилизации таких многофазных систем необходимо соблюдать несколько правил. Во-первых, необходимо прежде всего провести термодинамические расчеты таких систем и проследить возможность их нежелательного изменения при изменении внешних параметров, т.е. по сути провести термодинамическое моделирование процесса утилизации. Во-вторых, необходим контроль ситуации по электронным спектрам простых свободным радикала, в первую очередь по двухатомных радикалам, которые достаточно хорошо изучены, - это радикалы Сз, СК, РО, А10 и др. Возможна качественная диагностика по электронным спектрам многоатомных радикалов, таких как СРз, С Р, Сгр2 [1] и др. В-третьих, должны быть проработаны все стадии процесса независимо от вида супертоксикантов, т.е. процесс утилизации имеет гибкую схему. Так, например, для связывания хлорида водорода необходимо подавать в процесс нейтрализации либо гидрокарбонат натрия, либо карбонат кальция, в то время как для нейтрализации ртути желательно подавать сероводород, чтобы получить не растворимую в воде киноварь, которая к тому же является товарным продуктом.. Здесь мы не останавливаемся на тонкостях процесса работы с сероводородом и не рассматриваем альтернативные ситуации. [c.100]

Прямые доказательства участия молибдена в связывании субстрата и в каталитической фазе ферментативного цикла получены только для ксантиноксидазы. Отчетливое сходство между параметрами спектров ЭПР и субстратной специфичностью этого фермента и альдегидоксидазы приводит к выводу, что молибден находится и в связывающем центре альдегидоксидазы. Ограниченные данные по ЭПР позволяют предположить, что молибден участвует и в структуре связывающего центра нитратредуктазы из М. (1епИг111сапз, а также сульфитоксидазы млекопитающих и птиц. Исследования молибденовых комплексов как моделей ферментов сосредоточились в основном на комплексах с серусодержащими лигандами, особенно с цистеином, хотя и не получено надежных доказательств того, что в ферментах молибден действительно связан с серой. Молибден-цистеиновый комплекс проявляет редуктазную активность в отношении ряда субстратов, которые в то же время являются и субстратами нитрогеназы, однако в присутствии этих модельных комплексов обнаруживаются лишь следы аммиака от восстановления азота. Модельные комплексы существенно отличаются от ферментов и по количеству молибдена, который проявляет себя в спектрах ЭПР. Спектры ЭПР ферментов соответствуют до 50% общего содержания в них молибдена, тогда как модельные комплексы дают сигнал, соответствующий не более 4% содержащегося в них молибдена. Возможно, что конформация белка в области активного центра фермента стабилизирует каталитически активную мономерную структуру молибденового комплекса. Однако в отсутствие надежных структурных данных все это, как и различные схемы механизма нитрогеназной реакции, не более чем умозрительные предположения. [c.327]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология