Инициации параметр

Остатки с низкими относительными статистическими весами значительно укорачивают среднюю длину спирали. Чтобы оценить спиральный потенциал данного белка, было использовано одно значение параметра инициации а = 5 10 (разд. А.4). Кроме того, были введены три различные значения х для всех типов остатков. Так, 5 -= 0,385 соответствовало остаткам, прерывающим спираль (В), 5 1, 00 — индифферентным к спирали (/) и з=1,5 — образующим спираль (Н) (табл. 6.1). Значения а и х получают по наклонам и температурным переходам зависимостей, описывающих переходы спираль — клубок в синтетических полипептидах, используя уравнения (А. 18) и (А.20). Спиральная конформация предсказывается для всех положений остатков I, для которых / , больше средней величины В результате получаются непрерывные потенциальные функции, поскольку уравнение (6.2) учитывает кооперативность модели Зимма — Брэгга, согласно которой спирали должны иметь определенную длину (рис. А. 1). Этот метод предсказания дает спиральные сегменты длиной около 10 остатков, что намного меньше длины, ожидаемой для данного значения а гомополимеров при 5= 1, т. е. Ь 1/"5 10 = 40 (уравнение (А.17)). Такое укорочение спирали является следствием включения остатков с низкими значениями 5. [c.139]

Малоцикловое усталостное разрушение металла рассматривается как трехстадийный процесс зарождение трещин, их распространение и разрушение конструктивного элемента. Долговечность конструкции по критерию инициации трещины устанавливается на основе анализа параметров диаграмм циклического упругопластического деформирования металла при реверсивном нагружении. [c.722]

Подобная же трудность возникает при сравнении полимерных растворов и магнетиков. В некотором формальном смысле параметром порядка является намагниченность системы спинов, число компонент которых п = 0. Это не очень помогает нашему пониманию ситуации. Более конкретное утверждение, основанное на идеях Эдвардса, состоит в следующем параметр порядка ц (г) полимерного раствора аналогичен квантовомеханическому оператору рождения (или уничтожения) [11]. Множитель ц (г) соответствует инициации цепи, т.е. ее краю, называемому началом, или ее терминации, т.е. краю, называемому концом цепи. [c.324]

Таким образом, наиболее важной характеристикой промоторов прокариот является соответствие их нуклеотидной последовательности консенсусу промоторов. Однако, как видно из проведенного анализа, сила промотора может существенно модулироваться такмли факторами, как ос - богатость района после точки инициации транскрипции (вклад этого параметра достаточно высок, как видио из таблицы 2). Кроме того, сила Гфомотора зависит от наличия прямых повторов и палиндромов [c.36]

Модифицированная модель Зимма— Брэгга. Аналогичным образом модель Зимма — Брэгга была применена Птицыным и сотр. [370], которые использовали для всех типов остатков один параметр инициации а = 5 10" и шесть различных значений Х , базирующихся на экспериментальных данных по синтетическим полипептидам. Значения З/ остатков, для которых отсутствовали экспериментальные данные, были выбраны по методу Льюиса и сотр. [368]. В последующих работах [371—374] для определения Ееличин 5 (табл. 6.1) привлекались также стереохимические данные. Модель [c.139]

Параметры инициации, полученные из данных по синтетическим полимерам, хорошо коррелируют с частотами встречаемости остатков на концах спирали. Чоу и Фасман [201] сравнили также параметры инициации а, полученные при рассмотрении переходов спираль — клубок (разд. А.5), с частотами встречаемости остатков на концах спиралей в глобулярных белках. Как и в работах Лифсона и Ройга [375], в данном случае было проведено усреднение по обоим [c.140]

Солодоращение ячменя требуется для инициации ферментативной активности зерна и первичного его преобразования (преобразования крахмала амилазой в сбраживаемые сахара, а также расщепления полисахаридов, содержащихся в клеточной стенке, под действием (3-глюканаз и ксиланаз). Процесс солодоращения можно рассматривать как проращивание зерен с последующей тепловой обработкой (сущ-кой) для прерывания этого процесса проращивания на некоторой ранней стадии. При разных условиях солодоращения и сущки получают разные виды солода, при этом важным параметром является уровень модификации солода, то есть степень расщепления крахмала и р-глюкана в ходе солодоращения. Еще одним важным параметром служит цвет солода, который зависит прежде всего от температуры сущки. Бледные типы солода, сушка которых осуществляется при относительно низких температурах (не более 80 °С), обычно используют для приготовления лагерного пива (низового брожения). Более темные типы солода (мюнхенский, карамельный и др.) получают сушкой при более высоких температурах и применяют для приготовления особых сортов пива. Такие солода придают пиву характерные вкусо-ароматические свойства и цвет. [c.64]

Обширное статистическое исследование структуры белков предприняли в 1974 г. П. Чоу и Г. Фасман [98, 99]. Как и в предшествующих аналогичных исследованиях, ставится задача предсказать вторичные структуры (а-спираль, -складчатый лист) и клубковое состояние и на этой основе описать третичную структуру. В стабилизации регулярных форм большая роль отводится пептидным водородным связям, которые и послужили критерием в определении границ вторичных структур в известных конформациях белков. Из частот появлений каждого аминокислотного остатка в а-спиралях (f ), их внутренних витках (faj), складчатых листах (f ) и клубках (f ,) рассчитаны соответствующие конформационные параметры Рц, P j, P и Р .. Метод определения этих параметров исключает учет в явном виде влияния взаимодействий между остатками. Значения Рц оказались близкими значениям s теории Зимма и Брэгга, полученным для поли-а-аминокислот. Из частотного анализа остатков на границах спиральных и -структурных областей найдены характеристики остатков, инициирующих и терминирующих вторичные структуры. Заряженные остатки с наибольшей частотой появляются на N- и С-концах спирали и, как правило, отсутствуют в -структурных областях. Частоты появления остатков на концах спиралей могут быть скоррелированы со значениями параметров инициации Зимма и Брэгга — а. П. Чоу и Г. Фасман предложили механизм свертывания белковой цепи в глобулу, согласно которому спиральная нуклеация начинает зарождаться в центре фрагмента с наибольшими у остатков значениями Р и затем распространяется в обоих направлениях вплоть до спиралеразрывающих остатков с малыми значениями Р [99]. Аналогичным образом происходит формирование -структурных нуклеаций. Авторы считают, что при P > Рц образование -структур становится более предпочтительным по сравнению с а-спиралями. Аминокислоты были классифицированы на две группы, состоящие из шести подгрупп, начиная с сильных а (или )-образуюпщх остатков и кончая a( )-paзpывaющими остатками. [c.258]

Рис. 4.3. Параметры матриц для расчета функции "СТАТСАЙТ" при распознавании на последовательности сигналов инициации трансляции системы Е.соИ (Golovanov et al., 1982 Голованов, 1987). Нулевые элементы матриц частот встречаемости заменены малой величиной 0,001

Этот подход значительно развил Уотерман (Waterman, 1986), естественным образом устранив указанные недостатки. Пусть набор из R последовательностей длины N изначально выровнен относительно какой-нибудь биологически определенной позиции. Это может быть, к примеру, точка инициации транскрипции для промоторов или место соединения экзона с интроном для сайтов сплайсинга. Такое выравнивание является, конечно, приблизительным. Цель алгоритма - выровнить последовательно так, чтобы похожие участки были бы расположены друг под другом. В качестве параметра, определяющего возможное относительное смещение участков, вводится ширина окна w. Рассмотрим фрагменты последовательности длиной W, начинающиеся с (j- l)-й буквы [c.146]

Теоретические исследования по биосинтезу белка по следних лет показали, что процесс трансляции можно описать с помощью кинетических параметров времен или скоростей инициации, элонгации и терминацни поли-пептидной цепи. Эти параметры определяют основные свойства белоксинтезирующей системы, а регуляция биосинтеза белка на уровне трансляции осуществляется путем изменения кинетических параметров. Иногда для характеристики процесса трансляции используют время инициации и время синтеза полилептвдной цепи (te). [c.277]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология