Кислотные и основные связи белков

Как хорощо известно, белки состоят из аминокислот, связанных между собой пептидными связями. Определенная часть этих аминокислот имеет две кислотные или две основные группы. Пептидная связь-связывает, однако, лишь одну амино-и одну карбоксильную группу каждой аминокислоты. Поэтому в молекуле белка всегда содержится некоторое число свободных кислотных и щелочных групп. Этим группам белок и обязан своими амфотер-ными свойствами. Часть гипотетической пептидной цепи, содержащей свободные ионогенные группы, показана на, рис. 24. [c.159]

Дальнейшие исследования подтвердили это предположение. Для выяснения природы связи хлорофилл — белок изучали спектры комплексов хлорофилла с белками и более простыми пептидами (глицил-лей-цин, пептон, альбумин, протамины). Показано, что молекулы хлорофилла связаны химическими связями с кислотными и основными группами белка. В целом вопрос о типе связи хлорофилл — белок остается пока открытым. Еще нет метода, позволяющего определить точную ориентацию молекул пигмента и других молекул внутри хлоропласта. [c.167]

В интересах точности не следует утверждать, что биологическая активность определяется каким-либо одним типом функциональных групп (например, фенольными или аминными группами и т. п.) правильнее считать, что данная функциональная группа или определенная часть функциональных групп одного или, возможно, нескольких типов участвует в создании структуры, обусловливающей биологическую активность. Именно эти специфические структурные соотношения можно успешно исследовать при помощи физико-химических измерений. Во-первых, если нельзя показать, что при деблокировании первоначально экранированных функциональных групп биологическая активность восстанавливается, то следует при помощи физических методов установить, что денатурация не имела места. Во-вторых, следует выяснить степень молекулярной и электрохимической гетерогенности производных в ее связи с критерием гомогенности биологической активности. В-третьих, необходимо учесть возможные неспецифические влияния модификации белка на его физическую структуру. Если с одним молем белка вступает в реакцию только один моль реагента, в результате чего образуется совершенно неактивное соединение (как это наблюдается в случае ДФФ-химотрипсина), то можно утверждать, что активность белка обусловлена только одной, хотя и неизвестной до сих пор [141 в], функциональной группой или одним участком белковой молекулы. Однако если интенсивное замещение или блокировка только уменьшают активность, то этот эффект, повидимому, не является специфическим и объясняется общим изменением суммарного заряда или микроскопическим перераспределением. Следует принимать во внимание также и стерические эффекты. В настоящее время большое разнообразие относительно специфических химических реагентов позволяет производить исследование как электростатических, так и стерических эффектов. Это можно сделать, обрабатывая белок, например, такими двумя реагентами, как кетен и недокись углерода, один из которых образует новую нейтральную функциональную группу, а второй превращает основную функциональную группу в группу с кислотными свойствами. Подобным же образом для введения в одно и то же положение положительного или отрицательного заряда, а также для исследования стерических затруднений можно применять диазосоединения. Для такого рода исследований можно воспользоваться целым рядом аналогичных комбинаций. [c.352]

Дестабилизирующие эффекты в фермент-субстратном комплексе оказывают влияние на состояние преобразуемых групп субстратов. Однако в ферменте предусмотрены также функциональные группы, которые более тонко воздействуют на преобразуемые группы. Общий кислотно-основной катализ довольно обычен в ферментах, и с его помощью скорость реакции может увеличиваться в 1000 раз. В химотрипсине эту функцию выполняет зарядно-релейная система, которая посредством водородных связей обеспечивает протонный транспорт в нескольких стадиях реакции (рис. 11.1). В других ферментах, например в глутатионредуктазе, белок обладает активными группами (FAD и цистеиновая пара с окислительно-восстановительной активностью) для транспорта электронов через молекулу фермента (рис. 11.4). [c.281]

Ферментативный перенос фосфорильной группы осуществляют трансферазы (киназы), которые в качестве специализированного субстрата используют АТР. Во многих изученных случаях активация АТР в комплексе с ферментом не сопровождается переносом фосфорильной группы на фермент. Строго стереоспецифическая адсорбция АТР на ферменте позволяет каталитическим группам белка осуществить перенос фосфорильной группы с АТР на второй субстрат без ее предварительного переноса на белок. Роль каталитических групп фермента играют кислотно-основные заместители белковой молекулы. Механизмы таких реакций рассматриваются подробней в гл. V на примере гексокиназы и креатинкиназы. Однако для некоторых ферментов все-таки предполагается образование промежуточного соединения с переносом фосфорильной группы на белок. Поскольку связь в фоофосерине не является макроэргической, в подобных случаях предполагается образование фосфоимидазола, так как осуществление ферментом киназной функции требует сохранения макроэргической связи, к которым относится, например, Р М-связь в фосфоимидазоле и креатинфосфате. [c.151]

Полную последовательность 5-го сегмента РНК получили для двух штаммов — A/PR/8/34 [276, 294 и неопубликованные данные W. Min Jou, 1981] и A/NT/60/68 [107]. Сегмент 5 РНК состоит из 1565 нуклеотидов, включая в случае мРНК некодирующий 5 -участок из 45 нуклеотидов и некодирующий З -участок из 20 нуклеотидов. Кодирующая область из 1494 нуклеотидов кодирует 498 аминокислот, которые дают предсказанную м.м. 56 101 для NP, что очень близко по значению к молекулярной массе, рассчитанной по поведению NP в электрофорезе [58, 150, 204, 257]. Белок богат аргинином и имеет положительный заряд -Ы4 при pH 6,5. У него нет групп основных остатков, наличие которых можно было предположить для взаимодействия кислотных фосфатных остатков РНК с молекулами NP, и, следовательно, РНК ассоциирована со многими з частками молекулы NP, нейтрализуя заряды. На основании общей длины генома вируса гриппа. (13 588 нуклеотидов) и количества молекул NP, ассоциированных с одной вирусной частицей [54], можно рассчитать, что приблизительно 20 нуклеотидов взаимодействуют с одной белковой субъединицей. Можно также предположить, что РНК связана с наружной частью рибонуклеопротеидной структуры, так как она может замещаться поливинилсульфатом (84, 204] и чувствительна к расщеплению рибонуклеазой без разрушения структуры РНП [68.., [c.49]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология