Пиримидиновые нуклеотиды спектры

В ранней работе по спектрам ЯМР нуклеозидов и нуклеотидов был сделан вывод о преобладании конформации в пуриновых нуклеозидах и У в пиримидиновых нуклеозидах, однако [c.132]

Возможность образования такой водородной связи может быть легко продемонстрирована на молекулярных моделях нуклеозидов с анга-конформацией. Впервые предположение о таком взаимодействии было выдвинуто для объяснения различия УФ-спектров в сильнощелочной среде уридина и уридин-З -фосфата, с одной стороны, и уридин-2 -фосфата, с другой стороны Прямых доказательств образования такого рода водородной связи до сих пор не получено. Расстояние между атомами кислорода 2-экзо-О и 2 -экзо-0 в кристаллах пиримидиновых рибонуклеозидов и рибонуклеотидов , полученное на основании данных рентгенографии, превышает расстояние, требуемое для образования водородной связи. Однако это не удивительно, так как в кристаллической решетке и тот и другой атомы кислорода находятся в непосредственной близости с функциональными группами соседних молекул нуклеотида такие межмолекулярные взаимодействия могут преобладать в данном случае над внутримолекулярными взаимодействиями, существующими в разбавленных растворах. [c.141]

Основными хромофорами нуклеиновых кислот являются пуриновые (аденин и гуанин) и пиримидиновые цитозин и тимин у ДНК, цитозин и урацил у РНК) азотистые основания нуклеотидов. Все эти соединения, как и соответствующие нуклеозиды и нуклеотиды, обнаруживают длинноволновую границу поглощения при А=300 нм. За поглощение света ответственна в основном я-электронная система колец (я —я -переходы). Полосы поглощения оснований (максимум около 260 нм), сформированные п — я -переходами, характеризуются высокой молярной экстинкцией. Некоторый вклад в общее поглощение, особенно в длинноволновой части спектра, вносят п — я -переходы с участием не-поделенной пары электронов гетероатомов азота и кислорода. Участие п — я -переходов наиболее существенно в малополярных растворителях и проявляется в спектрах поглощения в виде плеч в области 280 — 320 нм. Выраженное влияние на положение максимума спектра поглощения оснований и прежде всего на относительную энергию я — я - и п — я -переходов оказывают заместители в пуриновом и пиримидиновом кольцах. Наибольший эффект при этом вызывают заместители при углеродном атоме во втором и четвертом положении у пиримидинов и втором и шестом положении у пуринов. [c.222]

Аналогичным образом, только применение ионообменных материалов дает возможность снизить содержание ионов аммония в крови, образующегося вследствие дезаминирования аминокислот, пуриновых и пиримидиновых нуклеотидов. Сравнительный анализ применения для извлечения ионов аммония из крови показал, что из исследованного спектра ионообменных смол и неорганических силикатных и цир-конийсиликатных материалов следует рекомендовать Гфименение цирконий алюмосиликата С-36, имеющего оптимальное сочетание высокой равновесной емкости и достаточной проницаемости для иона аммония. Одной из возможных областей его применения, кроме прямой гемоперфузии, может бьггь система регенерации диализата в аппарате Искусственная почка , включающем ферментативный реактор для разложения мочевины. [c.565]

Имеющиеся косвенные доказательства существования водородной связи между карбонильной группой при С-2 пиримидинового кольца и водородом гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы можно разбить на две группы. Одна группа — это данные о различии физических свойств или химической реакционной способности для пиримидиновых нуклеозидов и их производных, в которых имеется гидроксильная группа при С-2 (например, уридин, уридин-З -фосфат, уридин-5 -фосфат) и производных, в которых эта гидроксильная группа отсутствует (например, 2 -дезоксиури-дин, уридин-2 -фосфат, алкилурацилы). Помимо уже упоминавшихся данных по УФ-спектрам производных уридина сюда относятся данные о различии констант ионизации для производных цитозина этих двух групп отличия в спектрах ЯМР пиримидиновых нуклеотидов 33, а также различие в скоростях протекания некоторых реакций рибо- и дезоксирибонуклеозидов (например, фотохимической гидратации производных цитидинакаталитического гидрирования и гидроксиламинолиза 9 производных уридина). [c.141]

Пиримидиновые основания, имея ароматическую систему связей, обладают характерным поглощением в ультрафиолето вой части спектра, причем характер кривой заметно отличается для различных пиримидиновых оснований. Это дает возможность по спектру поглощения в ультрафиолетовой области делать выводы о строении пиримидинового основания и нуклеотида, в состав которого оио входит. [c.182]

Теперь стало очевидным, что конформация рибозы не зависит от того, является ли основание в нуклеотиде или нуклео-зиде пурином или пиримидином. Это опровергает выводы работы [11], в которой из анализа спектров ЯМР утверждалось, что во всех пуриновых нуклеозидах конформация сахара Сг — эндо, а в пиримидиновых — Сз — эндо. [c.170]

Для пуриновых и пиримидиновых оснований такое протекание реакции с азотистой кислотой было доказано еще в прошлом веке возможность проведения аналогичных реакций с нуклеозидами была продемонстрирована в 1910 г.а с нуклеотидами — в 1932 г. Однако детальное исследование кинетики реакции с азотистой кислотой удалось провести лишь недавнотак как это было связано с техническими трудностями, вызываемыми постоянным изменением состава реакционной смеси (окислением нитрита, изменением pH и т. д.). Для получения воспроизводимых кинетических данных необходимо постоянно добавлять нитрит и кислоту или применять достаточно концентрированные буферные растворы. Скорость реакции удобно контролировать спектрофотометрически, поскольку продукты реакции заметно отличаются по своим УФ-спектрам от исходных соединений. Удовлетворительные результаты были получены также с помощью ионообменной хроматографии применение для этой цели хроматографии на бумаге менее надежно. [c.417]

По-видимому, введение метильной группы по С-5 в ядро цитозина оказывает аналогичное влияние на фотохимическое поведение цитозиновых производных. 5-Метил- и 5-оксиметилцитидины, а также их нуклеотиды более устойчивы к действию УФ-излучения, чем сам цитидин (квантовый выход превращения их при фотолизе 10 ). Фотопродукты этих соединений при нагревании их растворов или при выдерживании в кислой среде не регенерируют исходные соединения, т. е., по-видимому, фотопродукты не являются фотогидратами. УФ-Спектры этих фотопродуктов свидетельствуют о сохранении пиримидинового цикла 220. [c.668]

Спектры нуклеотидов очень похожи на спектры исходных пуриновых или пиримидиновых оснований, например спектр нуклеотида цитидиловой кислоты очень похож на спектр цитозина. Однако спектр нуклеиновой кислоты не представляет собой спектр суммы составляющих ее нуклеотидов. В типичных препаратах ДНК интенсивность поглощения может быть на 40% ниже, чем интенсивность, наблюдаемая в случае смеси соответствующих нуклеоти-доз94, 95 эффект известен под названием гипохромного эффек- [c.112]

Еще более ярко выраженные различия в спектрах ЭПР облученных полимеров и мономеров были обнаружены Шэн Пэй-гэнем и др. [74,75] в случае нуклеиновых кислот и нуклеотидов. В нуклеотидах — мономерах, из которых построены высокополимерные нуклеиновые кислоты, после облучения появляются широкие сигналы ЭПР с характерной СТС (см., например, рис. 96). Нуклеиновые кислоты после облучения всегда дают синглетные симметричные сигналы ЭПР значительно меньшей интенсивности (см. рис. 97) Кислородного эффекта в этом случае не обнаруживается. Повидимому, упорядоченное плоско-параллельное расположение ароматических пуриновых и пиримидиновых оснований в структуре нуклеиновых кислот благоприятствует делокализации и обмену неспаренных электронов. [c.189]

Согласно общепринятому мнению, ДНК — основная внутриклеточная мишень при летальном и мутагенном действии коротковолнового УФ-излучения. Это, в частности, подтверждается совпадением максимума в спектрах действии фотобиологических эффектов (260-265 нм) с максимумом в спектре поглощения ДНК. Основными хромофорами ДНК являются азотистые основания нуклеотидов, причем квантовые выходы фотонревращений пиримидиновых компонентов примерно на порядок выше, чем пуриновых. Поглощение азотистыми основаниями квантов УФ-света (максимум поглощения при 260 нм) приводит к образованию их электронно-возбужденных синглетных и триплетных состояний, которые возникают преимущественно в результате п - т1 -переходов. [c.435]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология