Геном мыши, последовательности ДНК

При использовании метода картирования К-петель РНК замещает одну цепь ДНК, гибридизуясь с участками ДНК по обе стороны от промежуточной последовательности. Но сама промежуточная последовательность остается неизменной, сохраняя исходное двухцепочечное строение. В результате образуется структура, приведенная на рис. 20.4, где два участка, кодирующие РНК, в гибриде объединены, как это видно по двум вытесненным из гибрида одноцепочечным петлям ДНК. В месте соединения этих петель наружу вытесняется двухцепочечная петля ДНК, соответствующая промежуточной последовательности. В приведенном на рис. 20.5 примере виден единственный интрон р ° -глобинового гена мыши. (В этом гене также имеется и второй интрон, размеры которого слишком малы для того, чтобы он был виден в электронный микроскоп см. ниже.) [c.247]

На рис. 39.9 показана взаимосвязь канонических последовательностей в 1 -локусе мыши. В каппа-локусе за каждым Ух-геном следует последовательность со спейсером из 12 пар нуклеотидов. Перед каждым 1х-сегментом расположена каноническая последовательность, имеющая спейсер из 23 пар оснований. Последовательности, прилежащие к V- и 1-сегментам, находятся в Противоположных ориентациях. В лямбда-локусе обнаружена обратная организация за каждым геном следует каноническая последовательность, со спейсером из 23 нуклеотидов, в то же время перед каждым 1г -сегментом расположена последовательность, разделенная спейсером из 12 пар нуклеотидов. [c.509]

Из нормальных клеток мыши был выделен ген, гомологичный онкогену mos. Этот ген не обладал трансформирующей активностью в тех случаях, когда он был фланкирован последовательностями ДНК из нормальных клеток. Однако после соединения этого гена с вирусными последовательностями, обеспечивающими эффективную транскрипцию, была получена структура, обладающая трансформирующей активностью, не отличающейся от активности онкогена mos. Подобные результаты получены для гена, гомологичного ras, выделенного из нормальных клеток крысы. Далее было показано, что при удалении 5 -последовательности, фланкирующей ген мыши, гомологичный mos, этот ген приобретает трансформирующую активность. В этом случае трансформирующая активность оказывается в 1000 раз ниже, чем при трансформации тем же геном, но соединенным с регуляторными элементами вируса. Эта низкая, но все же достоверная трансформирующая активность, вероятно, объясняется встраиванием донорного гена под контроль некоего активного клеточного промотора. Эффективная экспрессия встроенного гена приводит к раковой трансформации клетки. [c.325]

Реакция гибридизации с использованием ДНК-зондов настолько чувствительна и избирательна, что с ее помощью можно идентифицировать последовательности, присутствующие в концентрации 1 молекула на клетку (рис. 4-70). Это позволяет определить, какое количество копий последовательности ДНК, комплементарной ДНК-зонду, присутствует в геноме клетки. Этот же метод весьма эффективен для поиска неидентичных, но родственных генов, например, после клонирования интересующих исследователя генов мыши или курицы, их последовательности могут быть использованы для поиска соответствующих генов в геноме человека. [c.238]

Как видно из таблицы, у дрожжей количество генетического материала примерно в 5 раз больше, чем у Е. соИ, а у человека (и мыши) — в 600 раз. Нужно сказать, однако, что у высших организмов гены нередко дублированы и в клетке присутствуют многократно повторяющ,иеся( последовательности ДНК. Функция таких повторов неизвестна (у некоторых амфибий содержание ДНК в расчете на одну клетку в 25 раз-, больше, чем у человека). Уотсон [10] высказал предположение, что-количество собственно генетического материала в клетках позвоночных по крайней мере в 20—50 раз выше, чем у Е. соИ. Следовательно, число, генов в клетке человека составляет величину порядка 10 . [c.28]

Кинетика ренатурации денатурированной ДНК мыши имеет качественно такой же вид, что и изображенная на фиг. 247 кинетика ренатурации ДНК теленка, за исключением того что в ДНК мыши выявляется 10%-ный компонент (сателлитная ДНК), ренатурирующий с еще более высокой скоростью, чем фракция избыточной ДНК теленка. Как видно из фиг. 246, 50%-ная ренатурация сателлитной ДНК мыши наблюдается при значении at = 0,001 моль-с, свидетельствуя о том, что молекулы этой фракции должны присутствовать в более чем 10 -кратном избытке в расчете на геном. Исследование ДНК самых различных высших организмов, относящихся как к растительному, так и к животному царствам, продемонстрировало, что присутствие в геноме избыточных последовательностей является универсальным явлением, хотя доля избыточной ДНК, а также степень избыточности варьируют у различных видов в очень широких пределах. Однако ии у одного из прокариотов или вирусов сколько-нибудь значительной избыточности выявить не удалось. [c.505]

Некоторые прерывистые гены имеют только один или всего несколько интронов. Пример хорошо изученного строения прерывистых генов-строение глобиновых генов (гл. 21). Два основных вида глобиновых генов, ос и р, имеют общий тип структуры, при котором два интрона занимают постоянные положения относительно кодирующей последовательности. Для Р-глобиновых генов млекопитающих характерно постоянство их строения, проиллюстрированное на рис. 20.16. В полипептидной цепи Р-глобина мыши, состоящей из 146 аминокислот, интроны расположены между кодонами, занимающими положения 30/31 и 105/106. [c.253]

В р-глобиновом гене мыши также были обнаружены три типа участков, расположенных аналогичным образом. Однако существенные различия между двумя промоторами состоят в том, что центральная последовательность в г инов(эм консервативный [c.152]

Метод трансфекции успешно применяется для введения генов в геном животных (рис. 38.14). Плазмиды, несущие интересующий исследователей ген, вводятся в зародышевый пузырек (ядро) ооцита мыши или в пронуклеус оплодотворенного яйца. Затем это яйцо имплантируется самке. Таким образом, были введены гены глобина и гибридные гены, содержащие промотор для металлотионеина, который сцеплен с кодирующей последовательностью тимидинкиназы. Промотор МТ ведет происхождение от природного гена мыши его присутствие можно определить по способности отвечать на обычную индукцию тяжелыми металлами или глюкокор-тикоидами (ответ определяют по активности тимидинкиназы). [c.501]

ПОЧТИ тождественна теоретической кривой, представленной на рис. 9.2. Так как теоретическая кривая получена на основе предположения о том, что скорость реакции второго порядка / j неизменна, это означает, что ренатурация фрагментированной ДНК Е. соИ характеризуется определенным значением kj. Что касается ДНК теленка, то, напротив, некоторые фрагменты ренатурируют со скоростью, много большей скорости ренатурации фрагментированной ДНК Е. oli, тогда как остальная ДНК (около 60%) ренатурирует много медленнее. На основе этих наблюдений можно заключить, что геном эукариот (в данном случае геном теленка) содержит как нуклеотидные последовательности, представленные в геноме лишь в единственном экземпляре, так и различные нуклеотидные последовательности, каждая из которых многократно повторена в геноме. Так, например, основываясь на кривой ренатурации, можно показать, что геном мыши содержит сложный набор нуклеотидных последовательностей, частота представленности которых в геноме схематически изображена на рис. 9.5. [c.264]

Во-вторых, геном мыши и человека содержит много V-генов зародышевой линии (примерно по 100 для Н- и L-цепей). И хотя их последовательности в каждой из групп (Н или L) высоко гомологичны, но есть и довольно заметные различия. Изменчивость У-элементов зародышевой линии и для Н-, и для L-цепей характеризуется кривой Ву—Кэбота, т. е. высоко неслучайна (рис. 5.3). В предьщущей главе мы уже рассказали, что такая картина неслучайной изменчивости создается только прямым антигенсвязывающим отбором, действующим на молекулу антитела, расположенную на поверхности В-лимфоцита. Этот вопрос обсуждался в предыдущей главе. [c.155]

Рис. 9-5. Точечная матрица, позволяющая сравнить ген Р-глобина человека с кДНК для Р-глобина человека А) и с геном Р-глобина мыши (Б) (задача 9-6). Указаны 5 -и З -концы этих последовательностей. На обеих матрицах последовательность гена человека одна и та же, кДНК человека (А) короче, чем ген мыши (Б), поэтому диагональные линии на двух матрицах имеют разные наклоны.

В эмбриональных клетках мыши гены, кодирующие константные области ц,-, у а-тяжелых цепей (и обозначаемых соответственно Ц и J, расположены в ряд, один за другим (рис. 33.32). Как оказалось, существует четыре гена константных участков у-Цепей, что полностью соответствует данным генетического анализа, выявившего четыре подкласса IgG. Рядом с геном локализуется набор расположенных тандемно генов J, кодирующих последний гиперва-риабельный участок вариабельной области. Полный ген тяжелой цепи IgM образутся путем транслокации гена к гену (рис. 33.33). В результате этой транслокации гены Гн, /н и соединяются в функционально единый ген. Вставочные последовательности между лидерным отрезком и на- [c.253]

Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3-10 , что соответствует 5—6% массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Повторы Alu могут находиться в интронах, на 5 -флангах генов и, наконец, в составе З -нетранслируемого участка мРНК- Нуклеотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК. Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых, Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретропозонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных про.межутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [c.226]

Впоследствии было установлено, что у мышей имеется несколько разных 1-сегментов в каждом пуле генов для иммуноглобулинов по одному ассоциировано с каждым С-геном в генном пуле А.-цепей и по четыре-в генных пулах и- и Н-цепей (каждый С-ген отделен от соседнего с ним 1-сегмента интроном). В период развития В-клеток в генных пулах и- и Н-цепей любой У-сегмент может объединиться с любым 1-сегментом, что увеличивает в четыре раза число У-областей, которые эти пулы могут производить. Кроме того, существуют некоторые различия в точном месте соединения У-), и это приводит к еще большему разнообразию аминокислотных последовательностей. Существенно то, что сайт соединения У-) кодирует часть третьей гипервариабель-ной области легкой цепи. [c.39]

Найти единственный нужный сегмент ДНК, содержащийся всего в одном гене среди огромного количества генетического материала клетки человеческого организма столь же трудно, как отыскать пресловутую иголку в стоге сена. Последовательности, которые являются специфическими для каждого отдельного гена, составляют всего одну миллионную часть всего генетического материала. Решение этой проблемы дает использование технологии рекомбинантных ДНК. Фрагменты ДНК человеческой клетки встраиваются в миллион быстро делящихся бактерий. Каждая из бактерий, которые выращиваются отдельно, дает целую колонию своих потомков. Затем находят колонию бактерий, содержанщх нужный ген. Для этого применяют методы диагностики, чувствительные к определенной функции гена. Каждая из быстро растущих колоний бактерий дает миллиарды одинаковых копий каждого гена. Поэтому дальше такой ген можно выделить из бактерий в химически чистом виде. Такой процесс называют клонированием. С помощью его к настоящему времени были очищены сегменты ДНК более 100 различных генов человека. Примерно столько же сегментов ДНК было выделено из генов других позвоночных, например мыши. Еще большее число генов выделено из простейших организмов, таких как дрожжи. [c.180]

Гибридизация ДНК - ДНК и ДНК - РНК. Если дуплексы ДНК, выделенные из клеток человека и мыши, денатурировать нагреванием по отдельности, а затем смешать и выдержать в течение многих часов при температуре ниже температуры плавления, то большая часть цепей мышиной ДНК отжигается с комплементарными цепями мышиной ДНК с образованием исходного дуплекса. Аналогичным образом большинство цепей ДНК человека воссоединяется с комплементарными цепями ДНК человека. Наряду с этим некоторое число одиночных цепей ДНК мыши будет связываться с одиночными цепями ДНК человека, в результате чего появляются гибридные дуплексы, в которых отдельные участки цепей ДНК мыши образуют двухцепочечные области с участками цепей ДНК человека (при наличии комплементарных пар оснований). Гибридные дуплексы возникают только при условии, что между ДНК двух разных видов существует комплементарное сходство в нуклеотидных последовательностях. Чем ближе родство двух видов, тем в большей степени их ДНК будут образовывать гибриды. Например, ДНК человека гораздо лучше образует гибриды с ДНК мыши, чем с ДНК дрожжей. При наличии комплементарных пар оснований возможно образование гибридных дуплексов ДНК — РНК. Например, в ходе транскрипции новосинтезируемая цепь РНК временно образует короткие отрезки гибридной двойной спирали ДНК — РНК (за счет спаривания ее оснований с основаниями матричной цепй ДНК). Гибридизационные тесты используют в биохимической генетике для определения того, насколько близки два вида для установления связи данной ДНК с какой-либо РНК для выделения и очистки генов и РНК и определения их нуклеотидных последовательностей. [c.300]

НОЧНЫХ (а также ДНК Е. соН) заключали в агар и определяли улавливание меченных радиоактивными атомами фрагментов ДНК, выделенной из клеток мыши или человека. В ходе этой работы было получено три важных результата. Во-первых, можно видеть, что только 18% добавленных фрагментов ДНК человека улавливается ДНК человека. Более того, только 22% добавленных фрагментов ДНК мыши подобным же образом улавливается мышиной ДНК. Отсутствие 100%-ного улавливания меченой ДНК из двух гомологичных организмов объяснялось тем, что более часто образование двойных спиралей происходит между самими добавленными фрагментами полинуклеотидной цепи, чем между ними и закрепленной ДНК. Следовательно, примерно 20% улавливания можно считать верхним пределом, свидетельствующим о полной гомологии закрепленных и добавленных видов ДНК. Во-вторых, можно видеть, что 6% добавленной ДНК человека улавливается мышиной ДНК и что 5% добавленной мышиной ДНК улавливается ДНК человека. Эти числа показывают, что ДНК человека и мыши имеют 6/22 = 0,27 или 5/18 = — 0,27 одинаковой полинуклеотидной последовательности. В-третьих, можно видеть, что по числу нуклеотидных последовательностей ДНК макака-резуса ближе к ДНК человека, а ДНК крысы стоит ближе к ДНК мыши, т. е. каждый из выводов полностью отвечает обычным таксономическим критериям. ДНК морской свинки и кролика так же далеки от ДНК человека, как ДНК крысы и хомячка. ДНК лосося еще более далека от ДНК человека и мыши, чем ДНК других млекопитающих. Наконец, агаром, содержащим ДНК человека илидмыши, улавливается ДНК Е. соН, но количество улавливаемой ДНК при этом не превышает того количества, которое улавливается агаром, совсем не содержащим закрепленной ДНК. Следовательно, человек и мышь практически не имеют одинаковых с Е. oli генов. [c.184]

Во многих случаях невозможно однозначно определить расположение границы экзон-интрон, основываясь исключительно на сравнении мРНК и гена. Сложность состоит в том, что на каждом конце интрона повторяется короткая последовательность, обычно составляющая от 1 до 4 п. н. На рис. 20.18 приведен участок р-глобиновой последовательности мыши (или кролика), в которой любая из четырех пар сайтов может соответствовать концам интрона. [c.255]

У млекопитающих повторяющаяся единица имеет существенно больший размер и включает транскрипционную единицу размером около 13 ООО п. н. и нетранскрибирующийся спейсер размером около 30 ООО п. н. Обычно гены располагаются в нескольких разбросанных кластерах, находящихся у человека и мыши в пяти и шести хромосомах соответственно. Возникает интересный вопрос каким образом механизмы коррекции, по-видимому функционирующие в пределах одного кластера и поддерживающие постоянство последовательностей рРНК, могут работать при наличии нескольких кластеров. [c.293]

Смотреть страницы где упоминается термин Геном мыши, последовательности ДНК: [c.583] [c.138] [c.15] [c.237] [c.309] [c.311] [c.452] [c.453] [c.456] [c.89] [c.140] [c.360] [c.224] [c.224] [c.174] [c.217] [c.433] [c.473] [c.477] [c.271] [c.441] [c.38] [c.32] [c.489] [c.522] [c.235] [c.256] [c.278] [c.315]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология