Карта генома

Чтобы регулировать работу над различными аспектами всей программы, HGP распределяет финансы между разными исследовательскими группами. В большинстве случаев ответственность за создание генетических и физических карт конкретной хромосомы делят между собой крупные центры и небольшие лаборатории, которые сотрудничают друг с другом. Некоторые из наиболее крупных исследовательских институтов занимаются укомплектованием данных о генетических и физических картах генома. В результате молекулярно-генетических исследований генома человека появляется огромное количество новых данных о полиморфных зондах, STS-клонах, содержании генетических, физиче- [c.478]

Международная программа, целью которой является построение генетической и физической карт генома человека и определение полной нуклеотидной последовательности ДНК. [c.557]

Сравнивая между собой последовательность ДНК дикого типа и его мутантного аллеля, можно точно локализовать мутационный сайт и установить природу мутации. Таким методом определяется соответствие между генетической картой (целиком основанной на мутационных сайтах) и физической картой (составленной на основе нуклеотидной последовательности ДНК). В конечном итоге карту какого-либо участка генома можно выразить в нуклеотидах ДНК, а не в относительных единицах карты, принятых в формальной генетике. Действительно, теперь можно идентифицировать гены по их белковому продукту и даже иногда только по нуклеотидной последовательности. Таким образом, при построении карты генома мы [c.43]

Рис. 16.3. Карта генома Т4 является кольцевой. В геноме протяженностью 165 000 пар оснований наблюдается обширное группирование генов с родственными функциями.

Рис. 16.6. Карта генома фага лямбда. Видно, что гены с родственными функциями сгруппированы в кластеры. Геном содержит около 46 500 пар оснований.

Построение рестрикционной карты генома дает возможность разработать стратегию определения последовательности нуклеотидов в генах, представляющих особый интерес. В результате действия нескольких различных ферментов образуются сравнительно мелкие перекрывающиеся фрагменты, содержащие не более нескольких сотен нуклеотидов. Эти фрагменты могут быть выделены в чистом виде, и в них может быть установлена последовательность нуклеотидов. Затем, зная взаимно перекрывающиеся участки последовательностей, можно восстановить последовательность нуклеотидов в крупных фрагментах и в геноме в целом. [c.272]

Рис. 12.11. Идентифицированные РНК-тран-скрипты комплементарных цепей ДНК человеческого митохондриального генома. Кольцевая карта генома линеаризована по точке начала репликации ДНК. Обозначения цепей отражают направление их транскрипции.

В течение долгих лет картирование человеческого генома продвигалось очень медленно. Появление методов генетики соматических клеток положило начало новой эры. Дополнительное ускорение в решении этой задачи было достигнуто благодаря применению генно-инженерных подходов. В настоящее время не существует принципиальных технических препятствий для получения полной карты генома человека. Однако вследствие огромного размера изучаемой ДНК этот процесс, конечно, займет многие годы. Установление функции всех последовательностей и понимание принципов организации генома видится в отдаленном будущем (см. табл. 18.7). [c.316]

Нет сомнения, что в ближайшие годы карта генома человека станет полной более того, обсуждается принципиальная возможность определения полной нуклеотидной последовательности человеческого генома. Однако уже сейчас, опираясь на имеющиеся данные, можно сделать ряд существенных заключений. [c.46]

Карта генома вируса гриппа А [216]. [c.35]

Как уже упоминалось в разд. 2.1.2.4, длина генетической карты генома человека составляет примерно 25,8 морганид. Если считать, что в гаплоидном геноме содержится примерно 3,5-10 нуклеотидных пар, то 1 сМ соответствует 1,356-10 нуклеотидных пар (или 1356 т.п.н.). Однако, как будет обсуждаться ниже, распределение сайтов кроссинговера в различных хромосомах не является равномерным. [c.197]

На рис. 1 приведена карта генома фага X, на которой указаны координаты (в долях от длины генома Я,+) многих фаговых генов. Под картой приведены некоторые делеции и замещения. Изменение размера ДИК фага К с делецией или замещением (в кЬ) приводится под названием затронутой области (например, область иммунности i21 на 2,45 кЬ короче замененной области у фага А.+). Под линией, изображающей замещение, указан размер этой не принадлежащей фагу X последовательности (в кЬ). Приведены также координаты концов делеций и замещений на карте фага X. [c.161]

Цель настоящей книги — рассказать читателям об имеющихся на сегодняшний день успехах в методических подходах, которые применяются для построения физической карты генома различных организмов. Такие карты необходимы для анализа структуры и выяснения механизмов функционирования генома. Определенные успехи в выявлении локусов, кодирующих наследственные патологии, обусловлены существенным повышением чувствительности тестов, используемых в анализе человеческих мутаций. Мы старались изложить описываемые нетоды в такой форме, чтобы они были доступны любому сотруднику из исследовательской или диагностической лаборатории. Кроме того, в книгу включены две главы, посвященные описанию новых зондов и методических приемов, используемых для геномной локализации наследственных заболеваний человека, анализ которых до сих пор проводился без участия молекулярных генетиков, [c.6]

С помощью метода Саузерна можно составить рестрикционную карту генома в участке исследуемого гена и установить, несет ли данный ген какие-либо дефекты. Так, разработаны эффективные методы синтеза искусственных ДНК-зондов, которые используются в [c.36]

Pu . 2.15. Карта генома фага Я. [c.98]

Рис. 2.19. Физические карты генома векторных фагов Я, предназначенных для клонирования крупных фрагментов ДНК.

Pu . 14.11. Карта генома вируса папилломы быка типа 1. [c.367]

Рис. 14.15. Транскрипционная карта генома аденовирусов Ad2 и Ad5.

Для развития в культуре клеток ген ЕЗ не обязателен. Это доказано с помощью различных мутантов по области 79-86 ед. карты генома Ad2 и Ad5. [c.373]

Существование генетической рекомбинации в митохондриях дрожжей (см. ниже) позволило создать генетическую карту генома митохондрий, которая была сопоставлена с физической картой при изучении возникающих естественным путем делеций митохондриального генома (называемых петит-мутациями). Участок, занимаемый каждым геном, определяли по положению на карте соответствующей мРНК. [c.285]

Карта генома фага Ми показана на рис. 36.13. Внедренный геном Ми имеет тот же порядок генов, что и свободная фаговая ДНК, которая имеет линейную форму. (Следует отметить существующее отличие от фага лямбда, свободная линейная ДНК которого при инфекции образует кольцевую молекулу в результате интеграции образуется линейный профаг, порядок генов которого является пермутированным относительно порядка генов свободной ДНК фага.) Линейные геномы фага Ми не содержат ни липких концов, ни повторов поэтому не ясно, каким образом осуществляется согласованное действие концов во время интеграции. Возможно, что реакция зависит от гомологии, которая встречается на расстоянии примерно 100 пар оснований от каждого конца. Существование механизма, узнающего специфические концы интегрированной последовательности фага Ми, было обнаружено при открытии способности этого фага вырезаться. Реакция происходит только в том случае, если профаг Ми приобретает ISl-элемент. Механизм вырезания неизвестен, однако установлено, что в него вклю- [c.469]

Таким образом, трехфакторные скрещивания позволяют установить порядок расположения трех генов в хромосоме и определить частоты рекомбинаций между ними. Такой способ анализа, впервые разработанный Стертевантом, послужил основой для построения всех генетических карт. Генетическая карта генома Drosophila melanogaster, построенная Стертевантом и другими сотрудниками лаборатории Моргана, изображена на рис. 5.10. [c.137]

Фаг X также представляет собой хороший пример того, как можно использовать фрагменты, образующиеся при рестрикции (рестрикты) для описания структуры генома вируса. На рис. 9.6 можно видеть число и размеры фрагментов ДНК, образующихся при действии нескольких различных рестриктаз на геном этого фага. Последовательность фрагментов, образующихся при действии определенной рестриктазы, можно определить с помощью сочетания нескольких методов, цель которых состоит в построении карты сайтов рестрикции генома фага X. На рис. 9.7 схематически изображена карта сайтов E o RI и Hin dlll на фоне генетической и физической карт генома фага X. [c.271]

Рис. 12.7. Физическая карта генома фХ174. Показана локализация цистронов, кодирующих известные белки фХ174. Обратите внимание на перекрывание цистронов А и расположенного внутри него В, а также цистронов

Для анализа структуры гена альбумина дефектных мыщей был использован метод Саузерн-блоттинга. В данном случае вместо РНК анализируется ДНК Изолированную ДНК сначала обрабатывают рестрицирующими нуклеазами, затем полученные фрагменты разделяют по размеру гель-электрофорезом и выявляют комплементарные ДНК-зонду альбумина с помощью переноса и гибридизации, как это описано для РНК (см. рис. 4-72). Повторяя эту процедуру с различными рестрицирующими нуклеазами, можно получить детальную рестрикционную карту генома в участке альбуминового гена (см. разд. 4.6.2). Анализируя эту карту, можно ответить на вопрос, несет ли альбуминовый ген у дефектных животных перестройки, например, делеции или инсерции коротких фрагментов ДНК. [c.240]

Чтобы облегчить эти и некоторые другие исследования, в настояшее время ведется усиленная работа по созданию детальной ПДРФ-карты генома человека, на которой будут отмечены тысячи маркеров, от- [c.342]

В настоящее время предпринимаются попытки сконструировать карту генома человека. Несколько сотен маркеров на ДНК, равномерно распределенных по всем хромосомам,- это вехи , необходимые для диагностики моногенных заболеваний, которые могут помочь определить вклад специфических генов в развитие мультифак-ториальных заболеваний. [c.33]

Секвенирование клеточных геномов. Разработка автоматических секвенаторов существенно ускорила ироцесс анализа последовательностей и позволила приступить к секвенированию клеточных геномов, для которых предварительно составляют физические карты. Как правило, секвенируют по отдельности фрагменты геномной ДНК размером 40—200 т.п.н., клонированные с помошью космид, A-векторов, а также векторов типа YA , ВАС или РАС (см. с. 271). Для этого ДНК каждой вставки дробят случайным образом и субклоны секвенируют наугад. Далее составляют контиги, объединение которых завершает анализ фрагмента. Последовательная привязка фрагментов к физической карте генома позволяет контролировать процесс его секвенирования. Уже известна полная нуклеотидная последовательность нескольких клеточных геномов [c.309]

Важнейшую роль в структурных исследованиях генома играет изучение его полиморфизма. Этот раздел молекулярной генетики является основой для понимания принципов молекулярной эволюции, механизмов возникновения патологических мутаций, для оценки факторов риска при воздействии потенциальных токсических агентов окружающей среды на человеческий организм, наконец, для понимания основ различной индивидуальной восприимчивости лекарств. Эти исследования получили новый импульс с открытием полиморфных мини- и микросателлитов, которые позволили осуществить тонкое генетическое картирование генома и в конечном счете создать интегрированные карты генома, объединяющие физические и генетические карты генома человека в единую систему. Это в свою очередь привело к развитию методов позиционного клонирования, которые позволяют быстро клонировать гены, начав с исследования их сегрегации в семьях. [c.7]

В последние годы созданы более со-верщенные генетические карты генома человека с использованием маркерных генов и последних достижений молекулярной генетики. [c.34]

Рис. 12.33. Карта генома вируса гепатита В и структурная организация области, кодирующей НВ8А .

Упаковка вирусного генома в вирионы происходит слева направо по отношению к принятой карте генома (см. рис. 14.15) и зависит от специфичной г/мс-действующей последовательности аденовирусной ДНК. Данный домен упаковки (pa kaging domain) картирован в положении 194-358 пн от левого конца генома Ad5, и в его состав входят пять повторяющихся сегментов с усредненной последовательностью [c.375]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология