Длина генетической карты

Мы считаем нужным разъяснить эту деталь она объясняет физический смысл отступлений от аддитивности вероятностей рекомбинации. Ясно, что длина генетической карты в условных единицах, полученная путем сложения малых участков, всегда справедлива. Для бактериофага известна длина молекулы ДНК [c.376]

Как уже упоминалось в разд. 2.1.2.4, длина генетической карты генома человека составляет примерно 25,8 морганид. Если считать, что в гаплоидном геноме содержится примерно 3,5-10 нуклеотидных пар, то 1 сМ соответствует 1,356-10 нуклеотидных пар (или 1356 т.п.н.). Однако, как будет обсуждаться ниже, распределение сайтов кроссинговера в различных хромосомах не является равномерным. [c.197]

Построение генетической карты сцепления человека с помощью метода, основанного на полиморфизме длины рестрикционных фрагментов [c.458]

Электронные микроскописты изучали маленькие ДНК онкогенных вирусов, т. е. вирусов, вызывающих рак. Генетические сведения об этих ДНК практически вообще отсутствовали, но работать с ними было удобно — маленькие ДНК не рвутся на куски, как это происходит с длинными молекулами, выделять которые в неповрежденном виде — очень трудная задача. Так вот, к величайшему удивлению своему, микроскописты обнаружили, что некоторые вирусные ДНК замкнуты в кольцо. Это наблюдение было сделано в начале 60-х годов. Стало ясно, что кольцевые генетические карты — штука вовсе не случайная. [c.89]

Справедливость триплетной теории была доказана в результате опытов [64], показавших, что в полисоме (стр. 281) отрезку формирующейся полипептидной цепи гемоглобина, содержащему 30 аминокислот, соответствует участок т-РНК длиной в 90 нуклеотидов. Точно такое же отношение, равное трем, было получено в генетических экспериментах, в которых удалось измерить на генетической карте длину определенного участка ДНК и сопоставить ее с длиной полипептидной цепи, соответствующей измеренному участку ДНК. [c.272]

Фаг весьма редко переносит одновременно два признака в некоторых случаях это даже совершенно исключено, что, впрочем, легко понять. Подсчитано, что бактериальный геном примерно в 100 раз длиннее, чем геном фага поэтому совместно могут передаваться разве что те гены, которые удалены друг от друга не более чем на одну сотую длины генома. Разумеется, для групп генов, лежащих еще ближе друг к другу, такая совместная передача более вероятна (отметим, кстати, что благодаря всему этому мы получаем превосходный масштаб для составления генетической карты бактериального генома). [c.160]

Насколько точно генетическая карта соответствует действительной длине генетического материала В гигантском масштабе хромосомы генетическая карта достаточно адекватно отражает соответствующую молекулярную структуру. Однако единица карты зависит от относительной частоты рекомбинации, которая может отличаться у каждого вида. Следовательно, генетические [c.42]

ДНК с известными генетически картированными делециями и добавками (рис. 7.11). Такой гетеродуплексный анализ позволяет построить физическую карту параллельно с генетической картой на рис. 7.7. Поскольку известна общая длина молекулы ДНК X (она составляет около 49 ООО н. п.), можно определить примерную величину каждого гена. [c.213]

В результате сравнительного изучения таких карт был подтвержден принцип линейного расположения генов и установлено, что последовательность расположения генов на цитологической карте точно соответствует их последовательности на генетической карте, составленной по данным кроссинговера. Но в то же время оказалось, что относительные расстояния между генами на этих картах совпадают не по всей длине хромосомы. Так, на генетической карте в центре хромосомы гены расположены более скученно, чем на цитологической. Это показывает, что единица перекреста— величина непостоянная, она изменяется по длине хромосомы. Величина перекреста, таким образом, зависит от участка хромосомы, особенно сильно она изменяется при удалении его от центромеры. [c.112]

Равновесная структура (мы еще ничего не можем сказать о динамической структуре) сложных генетических систем зависит только от гомозиготности хромосомных участков и длины их генетической карты. Это именно те параметры, которые мы можем оценить. Измерение длины карты — дело несложное. [c.322]

Генетическая карта на рис. 3.1 изображена в виде кольца, так как хромосома, которая в составе фаговой частицы является линейной, сразу после проникновения в клетку замыкается в кольцо (рис. 3.2). Концы хромосомы фага X, так называемые липкие концы, соединяются под действием бактериального фермента, и образуется пара непрерывных длинных переплетенных кольцевых цепей ДНК. В результате этого соединения группы генов лизиса и хвостового отростка сближаются. В конце литического цикла, когда новые фаговые хромосомы упаковываются в новые фаговые головки, концы хромосомы снова расходятся. [c.63]

V -— часть атомов Р , распавшихся в данный момент, а — относительная концентрация атомов Р (1 мг чистого Р имел бы активность 2,9 10 шСи), к — коэффициент эффективности разрыва хромосом при распаде Р . По аналогии с измерениями Стэнта и других к можно полагать равным 0,1. Тогда из кривых Вольмана и Жакоба мы можем определить величину No Qai — число пар нуклеотидных звеньев, приходящихся на участок О—Gal,—которая окажется равной 25-10 . Отсюда число пар нуклеотидных звеньев, приходящихся на длину генетической карты в 1 мин. (длина выражена через время перехода маркера), будет 10 . [c.340]

Приблизительную длину цистронов (или генов) гПА и гПВ можно вычислить, исходя из частот рекомбинации мутантных локусов, находящихся на разных концах этих цистронов. Оказалось, что расстояние между двумя наиболее удаленными друг от друга локусами гена А равно примерно 6 единицам карты, а соответствующее расстояние для гена В составляет около 4 единиц. Исходя из предполагаемой общей длины генетической карты фага Т4 и содержания ДНК в фаговой частице (мы уже использовали эти данные при определении минимальной величины единицы генетической - рекомбинации), можно рассчитать, что ген А соответствует (6Л500)-2-10 800, а ген В — (4/1500)-2-10 500 парам нуклеотидов в двойной спирали фаговой ДНК. Эта величина хорошо согласуется с примерным значением функциональной единицы, полученным а priori на основании принципов, изложенных в гл. VHI. [c.312]

Следует иметь в виду, что, хотя карта, приведенная на рис. 15-1, про-калибрирована в минутах, в недалеком будущем генетическую карту удастся, вероятно, представить непосредственно в микрометрах длины ДНК (общая ее длина составляет приблизительно 1100 мкМ) или в ты- сячах нуклеотидных единиц, называемых часто килобазами (кЬ). Общая длина ДНК составляет приблизительно 3800 кЬ ). [c.192]

Бурное развитие молекулярной генетики человека, начавшееся в 1980-х гг., стало возможным благодаря новаторским идеям Д. Ботштейна, Р. Уайта, М. Скол-ника и С. Дэвиса. Они обратили внимание, что полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ) человека порождает полиморфные аллели (маркерные локусы), поддающиеся картированию. Как писали авторы в своей статье, мы хотим предложить новый способ построения генетической карты сцепления человека. В его основе лежит создание при помоши технологии рекомбинантных ДНК случайных однокопийных ДНК-зондов, способных выявлять полиморфные нуклеотидные последовательности при гибридизации с индивидуальными ДНК, обработанными рестриктазой . Более того, они осознали, что, используя сцепление гена того или иного заболевания с маркерным локусом, можно определить хро- [c.458]

Измерение времени проникновения маркера в зиготу дает новый независимый метод изучения генетической карты бактерий. На рис. 108 изображен отрезок генной карты Е. oli, причем начало хромосомы, точка О, находится перед маркерами Т и L (как это следует из опытов с штаммом Hfr Хэйса). Масштаб длины при начертании генной карты выбран так, что 1 мин. изображается онреде-пенной длиной. Таким образом, полярность, или направлен- [c.319]

Наоборот, рекомбинанты к дикому типу будут превосходно жить на К12. Подсчет рекомбинантов ведется на нулевом фоне (в принципе) благодаря тому, что оба родительских фага — мутанты гП, отсюда и прекрасная чувствительность метода. Можно измерить число рекомбинантов, даже если вероятность события 10 . Собственно говоря, предел чувствительности ставится спонтанными ревертантами — возвратными мутациями к дикому типу. Из изученных Бензером свыше 3000 различных мутантов типа гП некоторая часть оказалась непригодной для рекомбинационных экспериментов из-за высокого уровня шумов (большого количества сионтанных ревертантов), одпако большинство мутаций, полученных облучением, действием химических мутагенов пли спонтанно, оказалось вполне стабильно. Эти мутации в количестве примерно 2000 и были расположены на генетической карте в линейной последовательности. Подробное изучение тонкой структуры генетического вещества обнаружило ряд важных обстоятельств. Вся область гП имеет длину в 8 единиц и распадается в а две функциональные области А и В. Бензер назвал их цистронами на основании того, что их можно различить с помощью is—trans-теста. Если инфицировать бактерию К12 двумя мутантами фага, из которых один поврежден в области А, второй поврежден в области В (оба являются гП-мутантамп), то вместе они способны развиваться на клетках К12. [c.377]

Затем был найден противоположный случай мутант P и его ревертант оказались разделенными на генетической карте расстоянием порядка половины протяженности всего цистрона. Соот-ветстпелно были найдены в картине отпечатков пальцев 2 различных полипентидных фрагмента, измененных по сравнению с белками дикого типа. В рассматриваемом случае расстояние между измененными звеньями полипептидной цепи близко к по-.ловине ее длины. Интересной представляется возможность исправить повреждение в белке, затрагиваюш ее его ферментативную активность, с помогцью второго изменения в достаточно удаленном звене цепи. На первый взгляд, подобный факт противоречит положению об активном центре фермента. Однако такое заключение является поверхностным. Активный центр фермента содержит функциональные группы, достаточно удаленные друг от друга по полипептидной цени, но сближаемые вследствие складывания цепи во вторичной и третичной структуре. Именно благодаря этому обстоятельству повреждение цепи, отражаюш,ееся на третичной структуре (например, введение заряженной боковой группы), может разрушить активный центр фермента, а новое изменение, восстанавливающее первоначальную третичную структуру, может произойти совсем в другом звене цепи. Возможность бесконечно варьи- [c.419]

Thr+ Leu+ Str достигает своего конечного плато, процент неселектируемых генов донора среди них также достигает постоянного уровня в пределах от 90% для гена azi до 25% для гена gal. Следовательно, при столкновении с F -бактерией и образовании с ней стабильного контакта каждая бактерия Hfr Н, очевидно, начинает перенос генов с определенной начальной точки О и продолжает перенос в порядке 0-thr-leu-azi-ton-la -gal. Таким образом, если принять, что скорость прохождения хромосомы постоянна на единицу длины, время вхождения каждого из этих генов в реципиентную Р"-клетку может служить мерой их генетической отдаленности, или, другими словами, представляет генетическую карту. После того как Вольман и Жакоб пришли к такому выводу, им вскоре стало понятно, почему высокая частота переноса у Hfr-штамма наблюдается только для ограниченной части его генома, а именно той части, которая расположена ближе к началу переноса О (0-проксимальные гены). По-видимому, разрыв конъюгировавшей пары бактерий, который можно индуцировать искусственно встряхиванием в смесителе, происходит также спонтанно (под действием срезываюш,их усилий, возникающих обычно в жидкой конъюгационной смеси) и приводит к спонтанному прерыванию процесса переноса. Если существует постоянная вероятность прерывания переноса k на 1 мин (а следовательно, на единицу длины переносимой хромосомы донора), то вероятность р переноса гена, расположенного на каком-то расстоянии от точки О, требующая для переноса этого гена х минут, может быть выражена как [c.226]

Можно грубо подсчитать, какую долю от всего генома фага Т4 составляет минимальное (отличие от нуля) расстояние, найденное Бензером. Как мы видели в гл. XII, длина кольцевой генетической карты фага Т4 равна примерно 1500 единицам, т. е. в 1500 раз превышает расстояние между двумя точками, для которых при стандартном скрещивании фагов комплементарные рекомбинанты появляются с частотой в 1%. Следовательно, две мутации гП, дающие 0,01% г+-рекомбинантов дикого типа, отстоят друг от друга на расстояние в 0,02 единицы, что составляет около [c.307]

Природа сигналов начала и конца транскрипции пока неясна. Было показано, что в ДНК многих видов имеются участки длиной 20—50 нуклеотидов, которые состоят почти исключительно из дезоксицитидиловых или из дезокситимидиловых остатков (d - и dT-кластеры) [4614]. В среднем один такой кластер приходится на несколько тысяч нуклеотидов, и они локализованы в основном (или исключительно) в одной цвпи ДНК — в той, которая транскрибируется. Например, в ДНК В. subtilis и фага ТЗ имеются только d -кластеры, расположен-йые в одной цепи в ДНК фага Т2 обнаружены только dT-кластеры, причем большинство из них также расположены в одной цепи. У фага % около % одной цепи (г) транскрибируется в направлении слева направо (по генетической карте), а остальная треть этой цепи не транскрибируется вообще. У другой цепи (L) транскрибируется только участок, составляющий пО длине 7з всей молекулы, причем этот участок комплементарен нетранскрибируемому участку цепи г, и, конечно, транскрипция этой части цепи осуществляется справа налево. В обоих случаях соответствующие гены и d -кластеры находятся вместе только в транскрибируемых участках. [c.22]

Рис. 12.3. Расположение на генетической карте десяти отЬег-мутаций белка головки фага Т4. Внизу показана длина полипептидов, синтезируемых при абортивной инфекции каждым из соответствующих мутантов в клетках рестриктивного хозяина. Длина полипептидов непосредственно коррелирует с положением

По критерию (2.15) была построена функция г (г вычислялось для каждой позиции ДНК) фага лямбда(рис.2.8), при этом положение пиков на графике соответствует предполагаемым границам между модулями. Сопоставим эти графики и современные представления о модульной структуре ДНК фага лямбда. На рис.2.8 функция г для фага лямбда сопоставлена с его генетической картой (Sanger et al.,1982). Можно выделить семь пиков функции г (длина окна равна 1000, конкретные значения г при изменении длины окна могут меняться,однако общая форма и положение пиков сохраняются), при этом положение пиков 3-7 соответствует следующим элементам функциональной организации фага лямбда. [c.64]

В главе 3 представлена упрощенная генетическая карта МНС мышей и человека (см. рис. 3.5). Гены комплекса делятся на три класса. У мышей гены I класса контролируют гомологичные а-полипептиды, которые эволюционно произошли, очевидно, от предкового гена в результате тандемной дубликации с последующей транслокацией по длине хромосомы. В комплексе с низкомолекулярным белком Рг-микроглобулином, который контролируется геном вне МНС, образуются поверхностно экспрессируемые молекулы I класса Н-2К, Н-20, Н-2Ь (рис. 10.5). В литературе в зависимости от контекста или склонности автора используется либо буквенное обозначение фенотипипического продукта (Н-2К, Н-20, Н-2Ь), либо выражение молекулы I класса МНС . [c.275]

При рассмотрении генетических карт обращает на себя внимание неравномерное распределение генов по длине хромосомы. На одних участках гены располагаются чаще,, чем на других,, а неко>-торые участки хромосом вообще генетически неактивны. [c.112]

Выделено много вставок (включений, инсерций) Тп/6 , о которых известны лишь их положения на карте, но неизвестны те гены, которые мутировали в результате вставки транспозона. Большинство их выделено как вставки вблизи какого-нибудь исследуемого гена (см. эксперимент 2). Чтобы можно было обозначать вставки ТпЮ в соответствии с их положением на карте и тогда, когда остается неизвестным, в каком именно гене произошла вставка, сделанное ранее Хонгом и Эймсом (Hong, Ames, 1971) предложение было видоизменено. Все такие вставки обозначают символом из трех букв, который начинается с буквы г. Вторая и третья буквы символа обозначают приблизительное положение вставки на карте в минутах. Вторая буква обозначает тот сегмент длиной 10 мин, в который попадает вставка. Сегменты эти нумеруются по часовой стрелке от минуты О (а = 0—10, Ь=10—20, с = 20—30 и т. д.). Третья буква точно таким же образом обозначает уже минуты карты внутри этих сегментов длиной в 10 мин. Например, вставка ТпЮ, локализованная вблизи гена hisW между минутами 47 и 48 генетической карты, обозначается как zeh-754 ТпЮ вставка ТпЮ вблизи локуса his на 44-й минуте обозначается как zee-2 Тп/6 . Номера аллелей приписываются таким вставкам последовательно независимо от второй и третьей букв символа. Таким образом, если более точное картирование приведет к необходимости изменить трехбуквенный символ вставки, то номер вставки все равно не изменится. В соответствии с этим правилом используются обозначения от zaa до zjj. Для обозначения вставок во внехромосомных элементах мы используем буквы zz, за которыми следует буква, обозначающая внехромосомный элемент. Символом zzf обозначаются вставки в плазмиде F. [c.13]

Цитологическая и генетическая карты для Х-хромосомы D. melanogaster сопоставлены на рис. 5.18. Общее соотношение генетических и цитологических расстояний для трех больших хромосом дрозофилы показано на рис. 5.19. Из этого сопоставления видно, что частота кроссинговера на разных участках хромосом неодинакова на единицу физической длины. Обычно кроссинговер [c.109]

В большинстве случаев эффективное использование техники гетерояуплексного картирования, которую мы только что описали, требует аккуратного измерения длин одно- и двухцепочечных участков ДНК. Измерение расстояния между различными петлями или особенностями гибридов позволяет построить физическую карту ДНК. Если генетическое значение делеции или локализация отдельных генов известны, физическая карта может быть использована для построения генетической карты. Метод является особенно мощным потому, что он позволяет локализовать гены, используя лишь выделенные транскрипты РНК, даже когда не удается обнаружить мутантные фенотипы. В принципе он позволяет картировать даже области ДНК, которые вовсе не были транскрибированы. Любой изолированный или синтезированный фрагмент ДНК может быть гибридизован с образованием двухцепочечной структуры и затем идентифицирован с помощью электронного микроскопа. Длины соответствующих участков можно измерить абсолютным методом, если в поле микроскопа имеется стандарт длины для калибровки увеличения. При некоторых условиях с помошью электронного микроскопа удается получить контурную длину ДНК, находящуюся в прекрасном соответствии с теми размерами, которые вычисляют исходя из известной геометрии двойной спирали. Однако контурная длина зависит от процедуры нанесения ДНК на подложку, которая поддерживает образец в микроскопе. Поэтому на практике для более точного измерения длин к каждому образцу добавляют молекулы ДНК известной длины и используют их в качестве внутреннего стандарта. [c.167]

Физические карты хромосом ценны в сочетании с их генетическими картами. Ранее генетическое картирование было возможно лишь в случаях, когда гены обладали легко определяемым фенотипом, что достаточно редко. Существенно расширило возможности генетического картирования введение в практику метода, основанного на явлении полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ). Это явление вызвано наличием в геномах индивидуальных особей множественных структурных различий. [c.294]

Смотреть страницы где упоминается термин Длина генетической карты: [c.484] [c.376] [c.376] [c.58] [c.444] [c.487] [c.490] [c.373] [c.290] [c.186] [c.213] [c.249] [c.112] [c.377] [c.308] [c.72] [c.83] [c.166] [c.52] [c.277] [c.352]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология