Двойная спираль левая

Рис. 1.5. Строение ДНК. А — схема двойной спирали Б — правая спираль — В-форма ДНК (обратите внимание на регулярную спираль, образуемую сахаро-фосфатным скелетом молекулы) В — левая спираль — г-форма ДНК (ломаная линия соединяет фосфатные группировки) Г — нуклеотид (дезоксиаденозин-5 -фосфат)

Приведенные экспериментальные данные относятся к обычно исследуемой в растворе линейной, незамкнутой ДНК. У вирусов, а также в клетках бактерий на некоторых стадиях их развития обнаруживается кольцевая замкнутая форма ДНК. В такой ДНК, представляющей собой обычную двойную спираль, каждая из комплементарных нитей является непрерывной замкнутой на себя. Поэтому полное число оборотов одной нити относительно другой не может меняться ни при каких изменениях условий, сохраняющих целостность сахаро-фосфатного остова обеих нитей. Проведенные исследования показали, что при комнатной температуре двойная спираль кольцевой ДНК закручена как целое в суперспираль (с плотностью один виток суперспирали на 120—300 пар оснований) противоположного знака, т.е. в левую. При нагревании происходит тепловое расширение кристалла ДНК и уменьшение степени закрученности двойной спирали. Это приводит к уменьшению суперспирализации. При дальнейшем нагревании происходит раскручивание двойной спирали и образование суперспирали того же знака (правой). Иными являются и характеристики плавления кольцевой замкнутой ДНК. Температура плавления такой ДНК приблизительно на 20° выше, чем для линейной молекулы (см. рис. 4.6). Это происходит потому, что расплавленные нити в кольцевой молекуле остаются закрученными относительно друг друга и энтропия расплавленного состояния меньше, чем для линейной молекулы. Кроме того, ширина интервала плавления замкнутой кольцевой ДНК в 2—3 раза больше, чем ширина интервала плавления линейной молекулы. [c.75]

ПОЛИ (и)] существуют только в правой А-форме, в основных чер тах подобной А-форме ДНК. В то же время принципиально возможно существование и левых двойных спиралей РНК (2-РНК). [c.37]

Рис. 2.15. функционирование ДНК-полимераз. Двойная спираль ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей противоположной полярности (они антипа-раллельны ). Если свободная , не связанная с соседним нуклеотидом З -ОН группа находится у одной цепи на левом конце, то в другой цепи такая же группа находится на правом конце. Репликация ДНК катализируется ДНК-полиме-разами. Для функционирования такого рода ферментов необходимы 1) матрица, которая представляет собой одиночную цепь ДНК, 2) праймер-короткий отрезок реплицированной нуклеиновой кислоты и 3) смесь дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов. ДНК-полимеразы способны присоединять свободные нуклеотиды только к свободному З -ОН-концу нуклеотидной цепи. Таким образом, синтез протекает только в направлении 5 - 3, но не наоборот. [c.39]

На рис. IX.22 изображена сверхспирализованная молекула ДНК, у которой двойная спираль правая, а сверхспирализация отрицательная (сверхспираль левая). [c.224]

Дезоксирибонуклеиновая кислота в клеточном ядре образует двойную спираль, представляющую собой 2 гигантские полинуклеотидные цепи, закрученные правильными витками вокруг одной общей оси (рис. 108). На рисунке (левая часть) обозначают 1—Н, 2—О, 3—Р, 4—N в цепочке фосфорного эфира, 5—С и N в основаниях. [c.398]

Правый микроскоп является отсчетным. Он жестко установлен на стойке станины и направлен на миллиметровую шкалу, нанесенную на матовом стекле и жестко скрепленную со столиком компаратора. Шкала освещается снизу зеркальцем. В поле зрения микроскопа видны вертикальные штрихи с цифрами вверху (рис. 50). Это — увеличенное изображение миллиметровой шкалы. Далее имеется горизонтальная шкала с десятью делениями и круглая шкала в левой части поля зрения окуляра. Эта шкала поворачивается при вращении маховичка справа на головке отсчетного микроскопа. Она имеет 100 делений. Для отсчета необходимо вращением маховичка добиться, чтобы штрих миллиметровой шкалы располагался между линиями двойной спирали, как показано на рис. 50. После этого производится отсчет. Записывается число целых миллиметров, десятые доли миллиметра отсчитывают на горизонтальной шкале отсчетного микроскопа. Записывается число слева от штриха миллиметровой шкалы, который был совмещен с двойной спиралью. [c.95]

ДНК может формировать несколько типов двойных спиралей. В настоящее время уже известно шесть форм (от А до Е и Z-форма). Большая часть структурных вариантов ДНК может существовать только в строго контролируемых условиях эксперимента. Эти варианты различаются 1) числом пар оснований, приходящихся на один виток двойной спирали 2) расстоянием между плоскостями пар оснований и углом, который они образуют с осью спирали 3) диаметром спирали 4) направленностью (правая, левая) двойной спирали (табл. 37. 1). [c.54]

Ранее, при рентгеноструктурном анализе целой нуклеосомы было показано, что правая двойная спираль ДНК закручена, вокруг гистонового кора в виде левой суперспирали с внутренним диаметром 70 А и длиной 55 А [404, 409, 412]. Это нашло подтверждение в исследовании структуры изолированного октамера, на поверхности которого была обнаружена бороздка белковой суперспирали [417, 418]. Она имеет внешний диаметр 65 A, шаг 28 А и левую закрутку, что полностью отвечает параметрам суперспирали ДНК в нуклеосоме. Таким образом, поверхности гистонового кора и закручиваемой вокруг него двойной спирали ДНК соотносятся между собой так же, как поверхности винта и гайки. Между тем, образование нуклеосомы вряд ли представляет собой ввинчивание белкового октамера в строго детерминированную нуклеотидную структуру. Этому препятствуют, во-первых, наличие на спиральной бороздке нуклеосомного сердечника чередующихся возвышений и впадин и, во-вторых, то обстоятельство, что суперспираль молекулы ДНК в свободном состоянии не является стабильной формой, хотя, по-видимому, и относится к низкоэнергетическим конформациям. Более вероятно, что образование нуклеосомы происходит путем накручивания лабильной двойной спирали ДНК на [c.111]

Некоторые твердые тела, как, например, кварц и двойная сернокислая соль лития и калия, обладают способностью вращать плоскость поляризации света, только находясь в кристаллическом состоянии. Эти вещества образуют кристаллы, которые являются зеркальными изображениями друг друга и не могут быть совмещены. Другими словами, они относятся друг к другу так, как не имеющий плоскости симметрии предмет относится к своему изображению в зеркале. Точно такое же различие существует между формами правой и левой руки или между одинаковыми спиралями, закрученными в различные стороны. Такого рода кристаллы называются энантиоморфными кристаллами (рис. 17). [c.154]

Нет, разумеется, у нее были нормальные пары ГЦ и даже кусочек образовывал отрезок двойной спирали, но на виток спирали приходилось не 10, а 12 пар оснований. Но главное не это. Главное, что спираль была не правая, как в В-форме, а левая [c.136]

Аппарат (рис. 35) состоит из сдвоенной измерительной бюретки /, помещенной в кожух с дистиллированной водой, и пипетки медленного сжигания 2. В пипетку вставляют две стеклянных трубки, в концы которых впаяна в виде петли спираль из платиновой проволоки (длина 40—50 мм, диаметр 0,5 мм). Верхняя часть пипетки имеет двойные стенки, между которыми пропускается вода для охлаждения. Пипетка защищена металлической сеткой. Проволоку накаливают переменным током напряжением 12 в. Температуру накала регулируют реостатом. Емкость измерительной бюретки 100 мл. Левая часть бюретки (емкостью 80 мл) имеет градуировку 20, 40, 60 и 80 мл (с точностью 0,05 мл). Правая часть бюретки (емкостью 20 мл) градуирована с ценой делений 0,05 мл. Бюретка соединена трехходовым краном / с пипеткой медленного сжигания 2 и трубкой для отбора пробы газа. Все детали аппарата укрепляются на деревянном штативе. [c.97]

Главным структурным н функциональным звеном клетки мышцы является саркомер (рис. 11.5)—цилиндрическое образование диаметром 1,5 МКМ и длиной 2 мкм, которое содержит около 2 Х 2000 тонких и 1000 толстых белковых нитей. В левой части рис. 11.5 показано образование толстой нити из приблизительно 200 молекул миозина. Тонкая нить образуется путем ассоциации 2 X 175 мономеров глобулярного актина, 2 X 25 молекул тропомиозина и 2 X 25 звеньев трехкомпонентного белка тропонина. Нить актина представляет собой двойную спираль (разд. 5.1) с периодом идентичности от 360 [c.284]

Двойные спирали ДНК в Л-, В- и С-формах — правые. Позднее Рич и сотрудники открыли левую двойную спираль ДНК. Так как она зигзагообразна, эта форма была названа Z-формой. Впервые Z-форма была получена для двуспиральпых гексамв-ров ГЦ [c.225]

В работе [46] исследо-довалась двуспиральная Поли-дезоксиИЦ (И — инозин). Рентгенограммы Ыа-соли при 75% о. в. и спектры КД указывают на необычную конформацию спирали — возможно левую, в отличие от всех известных двойных спиралей, с восемью мономерами на каждый оборот. Не исключено, однако, что здесь фигурирует все же правая спираль, но в иной конформации. Недавно было показано, что вывод о левой спирали ошибочен [193]. [c.500]

Обычно сверхспирализованные молекулы принимают форму, показанную на рис. 23. Количественно сверхспирализация характеризуется величиной х = Ьк — N у . Подобно тому как самой двойной спирали приписывается определенный знак (положительный для правой спирали и отрицательный для левой), так и сверхспирализация может в принципе быть положительной или отрицательной. На рис. 23 двойная спираль правая, как и положено для ДНК, а сверхспирализация отрицательна. [c.91]

Важную группу полисахаридов составляют гликозаминогликаны, к которым относятся гиалуроновая кислота, хондроитинсульфаты и кератансульфат. Было показано, что в ориентированных пленках молекулы этих соединений в зависимости от типа присутствующих катионов могут принимать целый ряд взаимо-превращаемых конформаций [12]. Эти конформации представляют собой группу левых спиралей, упакованных антипараллельно и отличающихся в основном степенью растянутости. Наиболее сжатой является одна из конформаций гиалуроновой кислоты, в которой одна молекула закручена вокруг другой с образованием двойной спирали [13] во всех остальных случаях молекулы упакованы бок о бок . В некоторых случаях удалось детально выяснить строение молекул, что для волокнистых веществ, в отличие от кристаллических, очень трудно сделать удалось даже выявить положение молекул воды и геометрию участков молекул, координированных вокруг катионов [14]. Важными вехами на пути понимания конформационных принципов строения полисахаридных цепей стали а) первый пример установления с помощью, рентгеноструктурного анализа упорядоченной конформации разветвленного полисахарида (внеклеточного полисахарида Е. oli) это позволило предположить, что наличие ветвлений играет важную роль при ориентации боковых цепей антипараллельно основной цепи и стабилизации таким образом конформации молекул полисахарида посредством нековалентных взаимодействий [15] б) первое изучение этим же методом структуры кристаллического гликопротеина, которое показало упорядоченность конформации его углеводной части [16]. Ко времени опубликования работы [16] определение строения (F -фрагмента иммуноглобулина G) не было доведено до конца, однако уже можно было сделать ряд важных выводов, которые будут рассмотрены ниже. [c.283]

P-D-l—З -Ксиланы могут образовывать двойные и тройные спирали, причем такие комплексы стабилизируются межмолекулярными водородными связями и ван-дер-ваальсовыми взаимодействиями. Фрей и Престон [104], проведя рентгеноструктурные исследования, нашли двойную спираль с п = 2 (или, в случае левой спирали, п = —2 — см. рис. 7.186) и трансляцией вдоль оси d = = 5,85 А в сухих образцах и 6,12 А — во влажных. [c.352]

ДНК, комплементарного к цепи 50 первых нуклеотидов т-РНК аланина иллюстрируется на рис. 128. Синтезируются четыре цепи нуклеотидов изображенные в верхней части рисунка горизонтальными линиями. Каж дая из четырех цепей содержит по 20 нуклеотидов. Цепи построены так что верхняя правая линия соответствует 20 нуклеотидам ДНК, компле ментарньш к первым 20 нуклеотидам т-РНК аланина, верхняя левая линия соответствует двадцати следующим. Две нижние горизонтальные линии верхней части рисунка символизируют также отрезки ДНК по 20 нуклеотидов каждый, из них 20 - - 10 нуклеотидов комплементарны к соответствующим 30 нуклеотидам двух верхних цепей. В целом получается жестко связанная 30 парами комплементарных нуклеотидов система четырех цепей ДНК со свободными концами по 10 нуклеотидов в верхней и в нижней цепи. Имеются два разрыва фосфатных связей, отмеченные стрелками. Действием фермента лигазы эти разрывы зашиваются , и на их месте возникают фосфатные мосты. Таким образом, четыре первоначально взятых полинуклеотида превращаются в две цепи, в средней части комплементарно связанные друг с другом. Осталось с помощью полимеразы и набора свободных нуклеотидов комплементарно достроить оба свободных конца молекулы, и двойная спираль из 50 полинуклеотидов готова. Одна из ее цепей комплементарна к 50 первым нуклеотидам т-РНК, другая — комплементарна к первой. [c.695]

Рис. 5-59. При габридизации ДЬЖ ш vitro двойные спирали ДЬЖ образуются заново из ранее разделившихся цепей. Восстановление спиралей зависит от случайного соударения двух комплементарных целей. Вольшинство таких соударений безрезультатно (как это видно из левой части рисунка), но некоторые из них приводят к спариванию на коротком участке комплементарных оснований (т, е, к нуклеации спирали). За этим следует быстрое засгегавание молнии и двойная спираль готова. Посредством такого процесса - методом проб и ошибок каждая цепь ДНК может найти себе комплементарного партнера среди миллионов неподходящих цепей. По-видимому, общая рекомбинация всегда инициируется именно

Пионерская работа Уилкинса и Франклин показала, что молекулы ДНК могут давать различную дифракционную картину в рентгеновских лучах в зависимости от содержания воды и солей. Модель, предложенная Уотсоном и Криком, соответствовала значениям параметров структуры, полученным на основе рентгенограммы так называемой В-формы ДНК, изображенной на рис. 4.9. Модель В-формы ДНК, представленная на рис. 4.12, характеризуется плоскопараллельным расположением пар нуклеотидных оснований внутри двойной спирали. Плоскости оснований почти перпендикулярны оси спирали и отстоят друг от друга на 3,4 А. Этой повторяющейся единице соответствуют яркие меридиональные дуги в верхней и нижней частях рентгенограммы, изображенной на рис. 4.9. Диаметр спирали почти в точности равен 20 А, а соседние пары нуклеотидных оснований повернуты друг относительно друга на 36°. В результате на один виток спирали приходится десять пар оснований. На рисунке изображена спираль с правым направлением вращения. Рентгенограмма ДНК, однако, не дает информации, достаточной для того, чтобы судить, является спираль правой или левой. При построении своей модели Уотсон и Крик выбрали направление вращения произвольно. [c.113]

Структура полисахаридов, образующих матрикс, существенно более лабильна.Карра-генаны представляют собой двойные спирали, при этом на один виток каждой цепи приходятся три дисахаридных остатка. Молекула гиалуроновой кислоты образует левую одиночную спираль с четырьмя дисахаридными остатками на один виток. На рис. 4.3,5 одна цепь изображена в цвете. Структура стабилизирована водородными связями, образующимися между цепочками. В волокне гиалуроновой кислоты соседние спирали связаны между собой солевыми мостиками и водородными связями. Нарушения регулярности в такой структуре, вызванные либо встраиванием каких-либо других сахаридов, либо ветвлением, существенно влияют на всю конформацию полисахарида. По-видимому, именно эти нарушения обусловливают механическую податливость волокон или гелей, которые образует гиалуроновая кислота. [c.198]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология