Дезоксинуклеозиды

Большая разница в величинах Д5+ объясняет чувствительность дезоксинуклеозидов к гидролизу. Влияние заместителей при С-5 в пиримидиновых нуклеозидах согласуется с этим механизмом [133] так, электроноакцепторные галогены ускоряют гидролиз. Это объяснение механизма гидролиза гликозидной связи использовано Робинсом [134] для создания метода стабилизации гликозидной связи в пуриновых 2 -дезоксинуклеозидах таким образом, [c.110]

Реакции, протекающие с соучастием соседних групп, использованы при синтезе дезоксинуклеозидов [c.259]

Нумерация атомов в углеводном фрагменте сохраняется та же, что и у свободных углеводов, т.е. ведется от гликозидного центра, но, чтобы отличить их от номеров атомов гетероцикла, они снабжены штрихами. Атом углерода, связанный с гетероциклом, является 1 -атомом, гидроксигруппы у рибонуклеотидов находятся в 2, 3 и 5 -положении, дезоксирибонуклеозиды, являющиеся компонентами ДНК, являются, строго говоря, 2 -дезоксинуклеозидами и содержат гидроксигруппы в 3 - и 5 -положении. [c.50]

В исходном варианте для изложенного метода определения последовательности нуклеотидов использовали дезоксинуклеозид-5 -трифосфат, меченный радиоактивными изотопами Щ или в а-положении трифосфатной группы. Радиоактивная метка попадала в каждое звено синтезируемой цепи, что обеспечивало высокую чувствительность метода. [c.282]

В реакциях ацилирования первичные гидроксильные группы более реакционноспособны, чем вторичные. Для избирательного ацилирования определенных гидроксильных групп углеводного остатка все другие необходимо защищать. Например, З -ацилирован-ные дезоксинуклеозиды получают действием галогенангидридов в пиридине на 5 -0-защищенные нуклеозиды с последующим удалением защитной группы [c.391]

Обмен оснований в дезоксинуклеозидах по схеме [c.426]

ДНК-полимеразы ж мн. Класс ферментов, катализирующих синтез ДНК из дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов. [c.137]

Опыт показывает, что термины почти постоянная величина (первое правило) и равенство (второе правило) только приблизительно правильны, поскольку обычно соблюдается лишь порядок величины и предсказывается ее знак тем не менее и этого оказывается достаточно для того, чтобы с помощью этих правил можно было отличить аномеры. Когда известна разность углов вращения для некоторой аномерной пары, то вклад вращения данного сахара может быть использован для определения конфигурации у аномерного атома углерода в молекуле. Правила изоротации были применены для определения конфигурации аномерного углерода у простых сахаров, гликозидов (включая сердечные гликозиды), олигосахаридов и полисахаридов (включая крахмал и целлюлозу) [2206] аномальные вращения отмечены для некоторых 2-дезоксинуклеозидов [132]. [c.448]

На рис. 14-19 показано, как через эти различные нуклеозид- и дезоксинуклеозид-трифосфаты энергия и строительные блоки передаются на определенные метаболические пути, где они используются для биосинтеза липидов, белков и в первую очередь для биосинтеза ДНК и РНК. [c.434]

Рис. 2.15. функционирование ДНК-полимераз. Двойная спираль ДНК состоит из двух полинуклеотидных цепей противоположной полярности (они антипа-раллельны ). Если свободная , не связанная с соседним нуклеотидом З -ОН группа находится у одной цепи на левом конце, то в другой цепи такая же группа находится на правом конце. Репликация ДНК катализируется ДНК-полиме-разами. Для функционирования такого рода ферментов необходимы 1) матрица, которая представляет собой одиночную цепь ДНК, 2) праймер-короткий отрезок реплицированной нуклеиновой кислоты и 3) смесь дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов. ДНК-полимеразы способны присоединять свободные нуклеотиды только к свободному З -ОН-концу нуклеотидной цепи. Таким образом, синтез протекает только в направлении 5 - 3, но не наоборот. [c.39]

Определены первичные структуры ДНК-полимеразы I из Е. oli, ДНК-полимеразы человека и крысы, ряда вирусных обратных транскриптаз и др. Гены нек-рых ДНК-полимераз клонированы и экспрессированы (встроены в генетич. аппарат) в Е. oli. Ингибиторы разл. ДНК-полимераз-гл. обр. аналоги 2 -дезоксинуклеозидов и 2 -дезоксинуклеотидов. Нек-рые из них (напр., З -азидо-З -дезокситимидин, или азидотимидин) применяют в противовирусной терапии, в т.ч. против СПИДа. [c.625]

Первым примером такого синтеза был синтез дезоксиуридина и тимидина, осуществленный в 1957 г. Тоддом и явившийся первой удачной попыткой синтеза природного дезоксинуклеозида. Он может быть представлен схемой [c.212]

Описанный синтез в своем настоящем виде слищком громоздок для препаративного использования однако он является первым синтезом дезоксирибонуклеозидов из рибонуклеозидов, который не связан с участием в превращениях гетероциклического ядра. Все приведенные методы синтеза дезоксинуклеозидов развиты лишь в самое последнее время и объективная их оценка, особенно с препаративной стороны, еще невозможна. [c.214]

Это было достигнуто изучением гидролиза ДНК в различных условиях. Ферментативный гидролиз ДНК в присутствии фосфодиэстеразы змеиного яда дает 5 -фосфаты дезоксинуклеозидов (I). Напротив, при кислотном гидролизе ДНК удалось выделить 3, 5 -дифосфаты пирими-динзедоксинуклеозидов (П). [c.247]

В ряду дезоксинуклеозидов осуществлен синтез дитимидин-динуклеотида ХСП (Т = остаток тимина) по приведенной выш схеме (R = бензил) [2381. [c.109]

Хотя в качестве продуктов реакции Гилберта-Джонсона можно ожидать как а-, так н р-нуклеозиды, долю каждого из образующихся продуктов можно изменить, меняя условия реакции. Это до некоторой степени объясняет то большое различие в условиях реакций, о которых сообщается в литературе и которое наводит новичка на мысль, что синтез есть больше искусство, чем наука. Наиболее эффективной добавкой, по-видимому, является бромид ртути(II), который не только повышает скорость реакции, но влияет также на стереохимию продуктов таким образом, что образуется больше р-нуклеозида. Это особенно важно в синтезе дезоксинуклеозидов, поскольку используемая галогеноза довольно нестабильна и любое повышение скорости реакции будет увеличивать выход обоих аномеров, хотя на практике в большей пропорции обычно образуется р-аномер. 3,5-Ди-0-(и-нитробензоил)-2-дезокси-а-О-эрыгро-пентафуранозилхлорид можно получить в кристаллическом виде, и его реакция с 2,4-диалкоксипиримидинами, как обнаружено, иногда дает преимущественно а-нуклеозиды с сохранением конфигурации. Это объясняют образованием интермедиата (11), который далее атакуется нуклеофилом по С-1. [c.81]

Первые полезные методики в этой области предложил Вит-тенбург [57] он же провел систематическое исследование по подбору оптимальных условий реакции. Установлено, что наилучшие результаты получаются в сухом инертном растворителе (например, в бензоле) в присутствии бромида ртути (И), хотя позднее было найдено, что применение ацетонитрила с бромидом ртути (И) в сочетании с молекулярными ситами позволяет получить даже более высокие выходы дезоксинуклеозидов (70% и выше) с высоким процентным содержанием р-нуклеозида [58]. Эти реакции проводят при 25°С в течение нескольких часов. Это опять та область, где для того, чтобы получать наилучшие результаты, требуется практический навык и чувство реакции . [c.82]

Есть определенные преимущества в создании хорошего синтетического метода для осуществления этого превращения. Получение дезоксинуклеозидов всегда более сложно, чем аналогичных рибонуклеозидов, поскольку дезоксисахар менее стабилен (и более дорог) и часто не удается избежать образования смеси а-и р-аномеров. Напротив, синтезы многих рибонуклеозидов идут быстро, количественно и дают только р-нуклеозид. Существуют три метода рибо--V дезоксирибо-превращения. Первый метод требует получения 0 ,2 -циклонуклеозида (52) по реакции уридина с дифенилкарбонатом [92]. Неочищенный продукт прямо бензои-лируют бензоилцианидом в апротонном растворителе и превращают далее в 2 -хлор-2 -дезоксинуклеозид (53) действием безводного хлорида водорода в ДМФА. В результате образуется исключительно рибопродукт, который может быть восстановлен гидри- [c.97]

Нуклеозиды с 2, 3 -ненасыщенными углеводными звеньями получены в результате катализируемых основаниями реакций элиминирования либо З -О-метансульфонил-, либо 02,3 -циклопроиз-водных 2 -дезоксинуклеозидов [124]. Недавний метод [124], использующий в качестве исходного материала более дешевые ри-бонуклеозиды, позволяет получать и пуриновые, и пиримидиновые нуклеозиды схема (34) . [c.106]

До недавнего времени нуклеозиды с 3, 4 -ненасыщенными углеводными звеньями получали только из 2 -дезоксинуклеозид-5 -уро-натов катализируемым основаниями элиминированием и восстановлением эфирной функции [124]. Соответствующие рибонуклеозиды получены в результате катализируемого основаниями элиминирования ацетальной функции 2, 3 -0-бензилиденнуклеозидальдеги-дов-5 с последующим восстановлением альдегидной группы бор-гидридом. Альтернативный синтез (97) с хорошим выходом осуществлен при обработке нуклеозида (96) ДБН в ацетонитриле при 80°С [124] схема (35) . [c.106]

Действие пероксида водорода или органических пероксидов на нуклеозиды приводит к Л -оксидам, некоторые из которых, как обнаружено, канцерогенны [146]. Так, реакция аденозина с 30%-ным пероксидом водорода в уксусной кислоте дает 1-Л -оксид (113). Для получения соответствующих производных пуриновых дезоксинуклеозидов из-за их кислотолабильности требуется применение моноперо ксифталевой кислоты. Цитидин-Л -З-оксид (114) образуется при действии на цитидин л-хлорпербензойной кислоты в уксусной кислоте. [c.112]

Имеются доказательства того, что происходит симметричный, но сложный процесс непрерывной репликации на обеих цепях. Раскручиванию двунитевой ДНК способствует связывание с многочисленными белковыми частицами, которые прикрепляются к родительской ДНК в выбранном месте инициации н им удается оставить разделенными комплиментарные цепи ДНК, готовые для нового синтеза. Далее определенная РНК-полимераза синтезирует короткую РНК, длиной 01 20 до 25 нуклеотидов, которая комплиментарна родительской ДНК и связывается с ее цепью. Эта РНК действует как затравка для действия большого объемистого фермента ДНК-полимераза 1П, который теперь создает новую цепь ДНК длиной примерно в 1000 остатков, являющуюся продолжением этой РНК. Такой синтез идет в направлении 5 3 путем конденсации дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов с З -концевой гидроксильной группой на обеих цепях родительской ДНК показано стрелками на схеме (3) . Поскольку фермент работает в условиях, близких к обратимости, это обеспечивает максимальный термодинамический контроль за правильностью выбора встраиваемых дезоксирибонуклеозидов путем спаривания их оснований с соответствующими основаниями в существующей цепи. Таким путем на каждой родительской пепи располагается ряд блоков, называемых фрагментами Оказаки. [c.199]

Для начала реакции в одной пробирке собирают исследуемую ДНК, два праймера, дезоксинуклеозид-трифосфаты четырех видов, фермент полимеразу, выделенную из термофильных микроорганизмов ТИегти5 адиаИсиз и буферную смесь, оптимальную для работы данной полимеразы. Полученную смесь прогревают в течение 1 мин при 94 °С, при этом комплементарные нити ДНК разъединяются. Этот этап называют денатурацией ДНК ( плавлением ). [c.94]

Колонка 0,8X60 см. Элюент 0,1 мМ раствор тетрабората натрия в 2 мМ растворе карбоната аммония с pH 10,2. Скорость подачи 2,8 мл/ч. Образец 50 мкл раствора, содержащего по 2 ОЕвео каждого из дезоксинуклеозидов и по 1 ОЕжо рибонуклеозидов [c.52]

В растениях основная часть ДНК синтезируется, по-видимому, между телофазой одного деления и профазой следующего. Имеется мало данных относительно механизма синтеза ДНК в растениях. Но в бактериях и животных обнаружен фермент, катализирующий образование ДНК из дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов. Этот фермент — ДНК-полимераза — получен в очищенном виде. Он катализирует реакцию п (дАТФ) [c.476]

Рис. 14-18. Л. Четыре нуклеозид-5 -трифосфа-та. Каждый из них содержит особое основание (показано на красном фоне). Б. В молекуле дезоксинуклеозид-5 -трифосфатов в положении 2 вместо гидроксила стоит атом водорода. Дезокситимидинтрифосфат служит предшественником остатков тимидиловой кислоты, входящих в состав ДНК. В РНК остатков тимидиловой кислоты нет вместо них здесь присутствуют остатки уридиловой кислоты (ее предшественником служит уридинтрифосфат).

Справочник химика 21

Химия и химическая технология